Desenvolvimento de biossensores raciométricos bioluminescentes de ph e metais divalentes baseados na engenharia da região sensível ao pH nas luciferases de vagalumes

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2017
Autor(a) principal: Gabriel, Gabriele Verônica de Mello
Orientador(a): Viviani, Vadim R lattes
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de São Carlos
Câmpus São Carlos
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/12296
Resumo: Bioluminescence, the emission of visible light by living organisms is widely used in biosensors. Firefly luciferases and genes are among the most used reporter gene in bioluminescent biosensors. Firefly luciferases are pH-sensitive, exhibiting a red shifted bioluminescence spectra on the presence of metals, high temperatures and acidic pH, being this last property considered unusual for the most analytical applications. Nowadays most luminescent biosensors to metals and pH are fluorescent, and few of them are ratiometric based on spectral changes. Bioluminescent biosensors despite been less common, have same advantages as low background and does not need UV light irradiation, bring no photodamage to the cell. The aim of this project was: (I) study the applicability of the use of Macrolampis sp2 firefly luciferase and other pH-sensitive luciferases as spectral intracellular ratiometric pH biosensor; (II) apply these pH ratiometric biosensors in mammalian cells to investigate its physiology in real time and (III) developing, by engineering the pH sensor region of Macrolampis sp2 firefly luciferase, a ratiometric biosensor specific to metals. We obtained a relation between the pH and the ratio of the bioluminescence at green and red region of the spectra, allowing estimate ratiometrically the intracellular pH of bacteria and mammalian cells. Besides that, we confirmed its use to cellular image of pH and observed that occurs an alkalinization of the cytosol and nucleus during cell division and apoptosis. We demonstrate the applicability of firefly luciferases, in special the luciferase of Macrolampis sp2, as a ratiometric biosensor to metals and intracellular pH. The existence of a linear relationship between the concentrations of metals like cadmium, mercury and zinc, and the ratio of the bioluminescence at green and red region of the spectra, allowed also estimate ratiometrically, for the first time, concentrations of metals less than 100 μM, enabling the use of firefly luciferases as bioavailability indicator to toxic and potential toxic metals.
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Firefly luciferases are pH-sensitive, exhibiting a red shifted bioluminescence spectra on the presence of metals, high temperatures and acidic pH, being this last property considered unusual for the most analytical applications. Nowadays most luminescent biosensors to metals and pH are fluorescent, and few of them are ratiometric based on spectral changes. Bioluminescent biosensors despite been less common, have same advantages as low background and does not need UV light irradiation, bring no photodamage to the cell. The aim of this project was: (I) study the applicability of the use of Macrolampis sp2 firefly luciferase and other pH-sensitive luciferases as spectral intracellular ratiometric pH biosensor; (II) apply these pH ratiometric biosensors in mammalian cells to investigate its physiology in real time and (III) developing, by engineering the pH sensor region of Macrolampis sp2 firefly luciferase, a ratiometric biosensor specific to metals. We obtained a relation between the pH and the ratio of the bioluminescence at green and red region of the spectra, allowing estimate ratiometrically the intracellular pH of bacteria and mammalian cells. Besides that, we confirmed its use to cellular image of pH and observed that occurs an alkalinization of the cytosol and nucleus during cell division and apoptosis. We demonstrate the applicability of firefly luciferases, in special the luciferase of Macrolampis sp2, as a ratiometric biosensor to metals and intracellular pH. The existence of a linear relationship between the concentrations of metals like cadmium, mercury and zinc, and the ratio of the bioluminescence at green and red region of the spectra, allowed also estimate ratiometrically, for the first time, concentrations of metals less than 100 μM, enabling the use of firefly luciferases as bioavailability indicator to toxic and potential toxic metals.Bioluminescência, a emissão de luz fria e visível por organismos vivos é amplamente utilizada em biossensores. Luciferases de vagalumes e seus genes estão entre os genes repórteres mais utilizados em biossensores bioluminescentes. Luciferases de vagalumes são sensíveis ao pH, apresentando um deslocamento do espectro de bioluminescência para o vermelho na presença de metais, em temperaturas elevadas e pH ácido, sendo esta última propriedade considerada sem utilidade para a maioria das aplicações analíticas. Atualmente a maioria dos biossensores luminescentes para metais e pH são fluorescentes, poucos deles são raciométricos baseados nas mudanças espectrais. Biossensores bioluminescentes apesar de serem menos comuns, possuem algumas vantagens como baixo background e não necessitam de irradiação com luz UV, não causando fotodanos às células. Os objetivos desse projeto foram: (I) investigar a aplicabilidade de uso da luciferase do vagalume Macrolampis sp2 e outras luciferases pH-sensitivas como biossensor espectral raciométrico intracelular de pH; (II) aplicar esses biossensores raciométricos de pH em células de mamíferos para investigar sua fisiologia em tempo real e (III) desenvolver, por engenharia da região sensora de pH da luciferase de Macrolampis sp2, um biossensor raciométrico específico para metais. Obtivemos uma relação entre o pH e a razão da bioluminescência nas regiões do verde e do vermelho do espectro, permitindo estimar raciometricamente o pH intracelular de bactérias e células de mamíferos. Além disso, confirmamos seu uso para imagem celular de pH, e observamos que ocorre uma alcalinização do citosol e núcleo durante os processos de divisão celular e apoptose. Demonstramos a aplicabilidade das luciferases de vagalumes, em especial a luciferase de Macrolampis sp2, como biossensor raciométrico para metais e pH intracelular. A existência de uma relação linear entre a concentração de metais como cádmio, mercúrio e zinco, e a razão da bioluminescência nas regiões do verde e do vermelho do espectro, permitiu também estimar raciometricamente pela primeira vez concentrações de metais menores que 100 μM, possibilitando o uso de luciferase de vagalumes como indicador de biodisponibilidade de metais tóxicos e potencialmente tóxicos.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)FAPESP: 2014/04477-9FAPESP: 2015/22603-4FAPESP: 2016/15946-5CAPES: código de financiamento - 001porUniversidade Federal de São CarlosCâmpus São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvUFSCarAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessLuciferases de vagalumesGene repórterBiossensor para metaisBiossensor de pHBiossensores bioluminescentes raciométricosFirefly luciferasesReporter geneMetal biosensorpH biosensorBioluminescent ratiometric biosensorsCIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICACIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICADesenvolvimento de biossensores raciométricos bioluminescentes de ph e metais divalentes baseados na engenharia da região sensível ao pH nas luciferases de vagalumesDevelopment of bioluminescent raciometric biossensors of pH and divalent metals based on the engineering of ph-sensitive region in firefly luciferasesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis6006001afb2bf6-82fd-4187-9f36-84ab970144a9reponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARORIGINALTese-Gabriele_Gabriel.pdfTese-Gabriele_Gabriel.pdfTese Versão Completaapplication/pdf4796378https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/a321ee08-bc21-45c3-a391-868b0317d270/downloadb47c6fae3bd085c69ed8a81c74a9be4dMD51trueAnonymousREAD2018-12-01Declaracao_orientador_2020.pdfDeclaracao_orientador_2020.pdfCarta_Comprovanteapplication/pdf606311https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/871d80b8-d321-4114-95f8-d65176500109/download796addb5f5db6d9b3d36b81b1c2c06f5MD53falseAnonymousREAD2018-12-01CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/62eeea65-69db-4356-bcd3-647046ac7719/downloade39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34MD54falseAnonymousREAD2018-12-01TEXTTese-Gabriele_Gabriel.pdf.txtTese-Gabriele_Gabriel.pdf.txtExtracted texttext/plain205490https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/c8b16570-68bd-4d2c-94a4-88b415a4e081/downloaddbb45a51c4d16c496ec22c0738e2419dMD59falseAnonymousREAD2018-12-01Declaracao_orientador_2020.pdf.txtDeclaracao_orientador_2020.pdf.txtExtracted texttext/plain1https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/e47848f3-490d-4d0d-8a4f-cfdd2735e8af/download68b329da9893e34099c7d8ad5cb9c940MD511falseAnonymousREAD2018-12-01THUMBNAILTese-Gabriele_Gabriel.pdf.jpgTese-Gabriele_Gabriel.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6686https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/053d623f-2146-49a2-8e02-92b6b610b410/downloada98d674c50b53fea9df8568d314d9b14MD510falseAnonymousREAD2018-12-01Declaracao_orientador_2020.pdf.jpgDeclaracao_orientador_2020.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg11526https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/ffb2bd23-6487-49a4-b240-0e4f62e5568b/download4a640fa4be5ddde50171916f8474212bMD512falseAnonymousREAD2018-12-0120.500.14289/122962025-02-05 19:23:38.998http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilopen.accessoai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/12296https://repositorio.ufscar.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestrepositorio.sibi@ufscar.bropendoar:43222025-02-05T22:23:38Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false
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