Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia)

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Oliveira, Vanessa Cristina Sales
Orientador(a): Cioffi, Marcelo de Bello lattes
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de São Carlos
Câmpus São Carlos
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/20016
Resumo: Crocodylia is an order that has undergone very few morphophysiological, biogeographic and genetic changes over time, despite having originated between the end of the Triassic and the beginning of the Jurassic, approximately 200 million years ago. This order is divided into three families: Crocodylidae, Gavialidae, and Alligatoridae, with representatives distributed on practically all continents, except for Europe and Antarctica, thus being geographically delimited by temperature. According to phylogenetic studies, crocodilians form a monophyletic group together with dinosaurs, pterosaurs, and birds, therefore suggesting a closer relationship with birds than with the rest of Archosauria. Despite this proximity, the fact that both taxa have a certain karyotypic variability and the importance of having access to these data to better understand the evolutionary history of these animals, studies on cytogenomic characterization in reptiles and especially in crocodilians, are still quite outdated, following a completely different path from its sister group. Therefore, this thesis presents the analyzes carried out with different cytogenomic techniques on representative species of two of the three families – Alligatoridae and Crocodylidae – to enable a better understanding of the processes involved in the genomic and chromosomal evolution of their species. We characterize for the first time cytogenetic and molecular data for all Alligatoridae species, observing a notable chromosomal conservatism among Caimaninae species, consistent with the dichotomy observed between the Caimaninae and Alligatorinae subfamilies, and demonstrate the role of rearrangements in the evolutionary history of these species. The Crocodylidae data demonstrate that despite not being as conserved as alligators, they have a karyotype closer to the ancestral karyotype of Crocodylia than other families, and showed how rearrangements are involved in the changes that gave rise to the current diversity of karyotypes in crocodilians.
id SCAR_d8ff7e660d8f9dbe8a466993fb464ba0
oai_identifier_str oai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/20016
network_acronym_str SCAR
network_name_str Repositório Institucional da UFSCAR
repository_id_str
spelling Oliveira, Vanessa Cristina SalesCioffi, Marcelo de Bellohttp://lattes.cnpq.br/0242034365085727http://lattes.cnpq.br/2780450938194570https://orcid.org/0000-0001-8638-05152024-07-16T18:51:39Z2024-07-16T18:51:39Z2024-03-22OLIVEIRA, Vanessa Cristina Sales. Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia). 2024. Tese (Doutorado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2024. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/20016.https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/20016Crocodylia is an order that has undergone very few morphophysiological, biogeographic and genetic changes over time, despite having originated between the end of the Triassic and the beginning of the Jurassic, approximately 200 million years ago. This order is divided into three families: Crocodylidae, Gavialidae, and Alligatoridae, with representatives distributed on practically all continents, except for Europe and Antarctica, thus being geographically delimited by temperature. According to phylogenetic studies, crocodilians form a monophyletic group together with dinosaurs, pterosaurs, and birds, therefore suggesting a closer relationship with birds than with the rest of Archosauria. Despite this proximity, the fact that both taxa have a certain karyotypic variability and the importance of having access to these data to better understand the evolutionary history of these animals, studies on cytogenomic characterization in reptiles and especially in crocodilians, are still quite outdated, following a completely different path from its sister group. Therefore, this thesis presents the analyzes carried out with different cytogenomic techniques on representative species of two of the three families – Alligatoridae and Crocodylidae – to enable a better understanding of the processes involved in the genomic and chromosomal evolution of their species. We characterize for the first time cytogenetic and molecular data for all Alligatoridae species, observing a notable chromosomal conservatism among Caimaninae species, consistent with the dichotomy observed between the Caimaninae and Alligatorinae subfamilies, and demonstrate the role of rearrangements in the evolutionary history of these species. The Crocodylidae data demonstrate that despite not being as conserved as alligators, they have a karyotype closer to the ancestral karyotype of Crocodylia than other families, and showed how rearrangements are involved in the changes that gave rise to the current diversity of karyotypes in crocodilians.Crocodylia é uma ordem que sofreu pouquíssimas mudanças morfofisiológicas, biogeográficas e genéticas ao longo do tempo, apesar de terem se originado entre o fim do Triássico e o início do Jurássico, há aproximadamente 200 milhões de anos. Esta ordem encontra-se dividida em três famílias: Crocodylidae, Gavialidae e Alligatoridae, com representantes distribuídos em praticamente todos os continentes, com exceção da Europa e Antártida, sendo assim delimitados geograficamente pela temperatura. De acordo com estudos filogenéticos, os crocodilianos formam um grupo monofilético junto com dinossauros, pterossauros e aves, sugerindo, portanto, uma relação mais próxima com as aves do que com o restante dos Archosauria. Apesar desta proximidade, de ambos os táxons possuírem certa variabilidade cariotípica e da importância de termos acesso a estes dados para fim de maior compreensão sobre a história evolutiva destes animais, estudos sobre caracterização citogenômica em répteis e especialmente em crocodilianos ainda sãos defasados, seguindo um caminho completamente diferente do seu grupo irmão. Desta forma, a presente tese apresenta as análises realizadas com diferentes técnicas citogenômicas em espécies representativas de duas das três famílias - Alligatoridae e Crocodilydae – a fim de possibilitar uma melhor compreensão dos processos envolvidos na evolução genômica e cromossômica de suas espécies. Caracterizamos pela primeira vez dados citogenéticos e moleculares para todas as espécies de Alligatoridae, observando um notável conservadorismo cromossômico entre as espécies de Caimaninae, condizente com a dicotomia observada entre as subfamílias Caimaninae e Alligatorinae, e demonstramos o papel dos rearranjos na história evolutiva destas espécies. Os dados de Crocodylidae demonstram que apesar de não serem tão conservados como os jacarés e aligátores, eles possuem um cariótipo mais próximo ao cariótipo ancestral de Crocodylia do que as outras famílias, e evidenciaram como os rearranjos estão envolvidos nas mudanças que deram origem a atual diversidade de cariótipos em crocodilianos.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)88887.464458/2019-00, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes)Processo 200401/2022-0, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)porUniversidade Federal de São CarlosCâmpus São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvUFSCarAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessCitogeneticaCrocodyliaEvoluçãoCytogeneticsFishEvolutionCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICAEvolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia)Chromosomal evolution in crocodylia (Animalia, Reptilia)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisreponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARTEXTTese Vanessa_Final de Final.pdf.txtTese Vanessa_Final de Final.pdf.txtExtracted texttext/plain102571https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/d00bc36b-437e-43ce-95d4-e05755380556/download943e92066bb90a56009fdda0f1b695a0MD53falseAnonymousREADTHUMBNAILTese Vanessa_Final de Final.pdf.jpgTese Vanessa_Final de Final.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg5493https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/f3778f4f-85bb-433f-b08a-0ec3a21d17bc/downloadbf9bf0ce369f4f6442cc702b064c2aebMD54falseAnonymousREADORIGINALTese Vanessa_Final de Final.pdfTese Vanessa_Final de Final.pdfTese Vanessa Final de Finalapplication/pdf3529503https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/f2438394-b4c7-4c68-9f78-b664a18ef5ad/download5870c4299c9f4b4cd39c8985dcfa52c7MD51trueAnonymousREADCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8810https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/3ddc0b9f-f94a-4ad8-ac5b-c96c4f03bf7e/downloadf337d95da1fce0a22c77480e5e9a7aecMD52falseAnonymousREAD20.500.14289/200162025-02-06 02:27:40.92http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilopen.accessoai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/20016https://repositorio.ufscar.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestrepositorio.sibi@ufscar.bropendoar:43222025-02-06T05:27:40Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false
dc.title.por.fl_str_mv Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia)
dc.title.alternative.por.fl_str_mv Chromosomal evolution in crocodylia (Animalia, Reptilia)
title Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia)
spellingShingle Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia)
Oliveira, Vanessa Cristina Sales
Citogenetica
Crocodylia
Evolução
Cytogenetics
Fish
Evolution
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
title_short Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia)
title_full Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia)
title_fullStr Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia)
title_full_unstemmed Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia)
title_sort Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia)
author Oliveira, Vanessa Cristina Sales
author_facet Oliveira, Vanessa Cristina Sales
author_role author
dc.contributor.authorlattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/2780450938194570
dc.contributor.authororcid.por.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0001-8638-0515
dc.contributor.author.fl_str_mv Oliveira, Vanessa Cristina Sales
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Cioffi, Marcelo de Bello
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/0242034365085727
contributor_str_mv Cioffi, Marcelo de Bello
dc.subject.por.fl_str_mv Citogenetica
Crocodylia
Evolução
topic Citogenetica
Crocodylia
Evolução
Cytogenetics
Fish
Evolution
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
dc.subject.eng.fl_str_mv Cytogenetics
Fish
Evolution
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
description Crocodylia is an order that has undergone very few morphophysiological, biogeographic and genetic changes over time, despite having originated between the end of the Triassic and the beginning of the Jurassic, approximately 200 million years ago. This order is divided into three families: Crocodylidae, Gavialidae, and Alligatoridae, with representatives distributed on practically all continents, except for Europe and Antarctica, thus being geographically delimited by temperature. According to phylogenetic studies, crocodilians form a monophyletic group together with dinosaurs, pterosaurs, and birds, therefore suggesting a closer relationship with birds than with the rest of Archosauria. Despite this proximity, the fact that both taxa have a certain karyotypic variability and the importance of having access to these data to better understand the evolutionary history of these animals, studies on cytogenomic characterization in reptiles and especially in crocodilians, are still quite outdated, following a completely different path from its sister group. Therefore, this thesis presents the analyzes carried out with different cytogenomic techniques on representative species of two of the three families – Alligatoridae and Crocodylidae – to enable a better understanding of the processes involved in the genomic and chromosomal evolution of their species. We characterize for the first time cytogenetic and molecular data for all Alligatoridae species, observing a notable chromosomal conservatism among Caimaninae species, consistent with the dichotomy observed between the Caimaninae and Alligatorinae subfamilies, and demonstrate the role of rearrangements in the evolutionary history of these species. The Crocodylidae data demonstrate that despite not being as conserved as alligators, they have a karyotype closer to the ancestral karyotype of Crocodylia than other families, and showed how rearrangements are involved in the changes that gave rise to the current diversity of karyotypes in crocodilians.
publishDate 2024
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2024-07-16T18:51:39Z
dc.date.available.fl_str_mv 2024-07-16T18:51:39Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2024-03-22
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv OLIVEIRA, Vanessa Cristina Sales. Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia). 2024. Tese (Doutorado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2024. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/20016.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/20016
identifier_str_mv OLIVEIRA, Vanessa Cristina Sales. Evolução cromossômica em crocodylia (Animalia, Reptilia). 2024. Tese (Doutorado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2024. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/20016.
url https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/20016
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
Câmpus São Carlos
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFSCar
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
Câmpus São Carlos
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFSCAR
instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron:UFSCAR
instname_str Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron_str UFSCAR
institution UFSCAR
reponame_str Repositório Institucional da UFSCAR
collection Repositório Institucional da UFSCAR
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/d00bc36b-437e-43ce-95d4-e05755380556/download
https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/f3778f4f-85bb-433f-b08a-0ec3a21d17bc/download
https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/f2438394-b4c7-4c68-9f78-b664a18ef5ad/download
https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/3ddc0b9f-f94a-4ad8-ac5b-c96c4f03bf7e/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 943e92066bb90a56009fdda0f1b695a0
bf9bf0ce369f4f6442cc702b064c2aeb
5870c4299c9f4b4cd39c8985dcfa52c7
f337d95da1fce0a22c77480e5e9a7aec
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.sibi@ufscar.br
_version_ 1851688760140365824