Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis
| Ano de defesa: | 2019 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de São Carlos
Câmpus São Carlos |
| Programa de Pós-Graduação: |
Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Palavras-chave em Inglês: | |
| Área do conhecimento CNPq: | |
| Link de acesso: | https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/11844 |
Resumo: | Serratia marcescens is a member of Enterobacteriaceae familly with intrinsic resistance to various antimicrobial groups. In this study, 54 strains of Serratia marcescens isolated from patients admitted to the intensive care unit of a tertiary hospital in Tocantis, Brazil, were characterized phenotypically and genetically. A large part of S. marcescens isolates (n = 13, 24.07%) were classified as multidrug-resistant (MDR), with a high level of resistance to β-lactam antibiotics, aminoglycosides, quinolones, tigecycline and colistin. Our data confirmed the presence of genes in S. marcescens, which confer resistance to beta-lactam antibiotics, including carbapenems. PCR analyzes showed that all the isolates (n = 54, 100%) harbored the blaKPC-2 and blaTEM genes, 7 (12.96%) were positive for blaCTX-M-15.8 (14.81%) for the blaOXA-1 gene. The beta-lactamases genes blaVIM-1 and blaNDM-1, blaSHV and blaIMP-2 and the gene conferring resistance to colistin mcr-1 were not found. The ERIC-PCR technique was used to determine the clonal relationships between the strains. The results showed a high genetic similarity between the lines, indicating that S. marcescens circulating in this UTI are highly genetically related. The resistance pattern presented by S. marcescens clinical isolates and the potential transmission of these clones, observed in our study, is very worrying, since it is suggested that they are important disseminators of hospital infections. Therefore, measures that eliminate the sources of resistance development and the reservoirs of these bacteria are of extreme importance for the control of these infections. |
| id |
SCAR_e9554721a1eccfca20c2b1c07246ff36 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/11844 |
| network_acronym_str |
SCAR |
| network_name_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Rezende, Graziela SilvaCunha, Anderson Ferreira dahttp://lattes.cnpq.br/0329741640375661Pranchevicius, Maria Cristina da Silvahttp://lattes.cnpq.br/4772148921558977http://lattes.cnpq.br/3650718046971641417746f3-e607-47f8-90f2-6cc0cc9028682019-09-17T17:43:48Z2019-09-17T17:43:48Z2019-02-20REZENDE, Graziela Silva. Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis. 2019. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2019. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/11844.https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/11844Serratia marcescens is a member of Enterobacteriaceae familly with intrinsic resistance to various antimicrobial groups. In this study, 54 strains of Serratia marcescens isolated from patients admitted to the intensive care unit of a tertiary hospital in Tocantis, Brazil, were characterized phenotypically and genetically. A large part of S. marcescens isolates (n = 13, 24.07%) were classified as multidrug-resistant (MDR), with a high level of resistance to β-lactam antibiotics, aminoglycosides, quinolones, tigecycline and colistin. Our data confirmed the presence of genes in S. marcescens, which confer resistance to beta-lactam antibiotics, including carbapenems. PCR analyzes showed that all the isolates (n = 54, 100%) harbored the blaKPC-2 and blaTEM genes, 7 (12.96%) were positive for blaCTX-M-15.8 (14.81%) for the blaOXA-1 gene. The beta-lactamases genes blaVIM-1 and blaNDM-1, blaSHV and blaIMP-2 and the gene conferring resistance to colistin mcr-1 were not found. The ERIC-PCR technique was used to determine the clonal relationships between the strains. The results showed a high genetic similarity between the lines, indicating that S. marcescens circulating in this UTI are highly genetically related. The resistance pattern presented by S. marcescens clinical isolates and the potential transmission of these clones, observed in our study, is very worrying, since it is suggested that they are important disseminators of hospital infections. Therefore, measures that eliminate the sources of resistance development and the reservoirs of these bacteria are of extreme importance for the control of these infections.Serratia marcescens é um membro da família Enterobacteriaceae com resistência intrínseca a vários grupos antimicrobianos. Neste estudo, 54 cepas de Serratia marcescens isoladas dos pacientes internados na unidade de terapia intensiva de um hospital terciário do Tocantis, Brasil, foram caracterizadas fenotipicamente e geneticamente. Uma grande parte dos isolados de S. marcescens (n = 13, 24.07%) foram classificados como multidroga-resistentes (MDR), com alto nível de resistência aos antibióticos β-lactâmicos, aminoglicosídeos, quinolonas, tigeciclina e colistina. Nossos dados confirmaram a presença de genes em S. marcencens, que conferem resistência aos antibióticos beta-lactâmicos, inclusive aos carbapenêmicos. Análises de PCR mostraram que todos os isolados (n = 54, 100%) abrigaram os genes blaKPC-2 e blaTEM, 7 (12.96%) foram positivos para blaCTX-M-15, 8 (14.81%) para o gene blaOXA-1. Os genes das beta-lactamases blaVIM-1 e blaNDM-1, blaSHV e blaIMP-2 e o gene que confere resistencia à colistina mcr-1 não foram encontrados. A técnica ERIC-PCR foi empregada para determinar as relações clonais entre as cepas. Os resultados mostraram uma alta similaridade genética entre as linhagens, indicando que as S. marcescens circulantes nessa UTI são altamente relacionados geneticamente. O padrão de resistência apresentado pelos isolados clínicos de S. marcescens e o potencial de transmissão desses clones, observado em nosso estudo é muito preocupante, pois sugere-se que são importantes disseminadores de infecções hospitalares. Portanto, medidas que propiciem a eliminação de fontes de desenvolvimento de resistência e dos reservatórios dessas bactérias são de extrema importância para o controle dessas infecções.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)CAPES: Código de Financiamento 001porUniversidade Federal de São CarlosCâmpus São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvUFSCarMultidroga-resistentesGenesSerratia marcescensMultidrug-resistantCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICACaracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de TocantisPhenotypic and molecular characterization of antimicrobial susceptibility in Serratia marcencens isolated from patients in a tertiary hospital in the state of Tocantisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis60060009d9fa5c-2a23-45d0-8b2a-97cdb5ef416binfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARORIGINALREZENDE_Graziela_2019.pdfREZENDE_Graziela_2019.pdfapplication/pdf2542735https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/f51bfb98-d3f2-4fce-bd1c-57c37fb796fb/download1f6858f317c00f7d9b8981e357ae21e6MD57trueAnonymousREADcarta.jpegcarta.jpegimage/jpeg165779https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/340e06c7-e998-47d9-bf46-ebcd5bc6a6f8/download503c65d9ff9e9d7b3f42659b7fb82b1cMD53falseAnonymousREADTHUMBNAILREZENDE_Graziela_2019.pdf.jpgREZENDE_Graziela_2019.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg7285https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/7bbee493-1601-4709-aabf-99aa276ebbe1/downloadf386e98a835f492319cf5be1dcf1e048MD511falseAnonymousREADcarta.jpeg.jpgcarta.jpeg.jpgIM Thumbnailimage/jpeg9388https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/d9a2b9ef-e031-4fa5-8bc1-d8913eb0d25f/download47538b82d77cbd444dc09d9a23f6a5f9MD512falseAnonymousREADTEXTREZENDE_Graziela_2019.pdf.txtREZENDE_Graziela_2019.pdf.txtExtracted texttext/plain103573https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/e1973ea7-81c4-4387-ba82-47e9c7c351e9/downloadd149ab73b10bff28825cdb79985ea902MD510falseAnonymousREAD20.500.14289/118442025-02-05 18:17:30.871Acesso abertoopen.accessoai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/11844https://repositorio.ufscar.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestrepositorio.sibi@ufscar.bropendoar:43222025-02-05T21:17:30Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false |
| dc.title.por.fl_str_mv |
Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis |
| dc.title.alternative.eng.fl_str_mv |
Phenotypic and molecular characterization of antimicrobial susceptibility in Serratia marcencens isolated from patients in a tertiary hospital in the state of Tocantis |
| title |
Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis |
| spellingShingle |
Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis Rezende, Graziela Silva Multidroga-resistentes Genes Serratia marcescens Multidrug-resistant CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
| title_short |
Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis |
| title_full |
Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis |
| title_fullStr |
Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis |
| title_full_unstemmed |
Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis |
| title_sort |
Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis |
| author |
Rezende, Graziela Silva |
| author_facet |
Rezende, Graziela Silva |
| author_role |
author |
| dc.contributor.authorlattes.por.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/3650718046971641 |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Rezende, Graziela Silva |
| dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Cunha, Anderson Ferreira da |
| dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/0329741640375661 |
| dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
Pranchevicius, Maria Cristina da Silva |
| dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/4772148921558977 |
| dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
417746f3-e607-47f8-90f2-6cc0cc902868 |
| contributor_str_mv |
Cunha, Anderson Ferreira da Pranchevicius, Maria Cristina da Silva |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Multidroga-resistentes Genes |
| topic |
Multidroga-resistentes Genes Serratia marcescens Multidrug-resistant CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
| dc.subject.eng.fl_str_mv |
Serratia marcescens Multidrug-resistant |
| dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
| description |
Serratia marcescens is a member of Enterobacteriaceae familly with intrinsic resistance to various antimicrobial groups. In this study, 54 strains of Serratia marcescens isolated from patients admitted to the intensive care unit of a tertiary hospital in Tocantis, Brazil, were characterized phenotypically and genetically. A large part of S. marcescens isolates (n = 13, 24.07%) were classified as multidrug-resistant (MDR), with a high level of resistance to β-lactam antibiotics, aminoglycosides, quinolones, tigecycline and colistin. Our data confirmed the presence of genes in S. marcescens, which confer resistance to beta-lactam antibiotics, including carbapenems. PCR analyzes showed that all the isolates (n = 54, 100%) harbored the blaKPC-2 and blaTEM genes, 7 (12.96%) were positive for blaCTX-M-15.8 (14.81%) for the blaOXA-1 gene. The beta-lactamases genes blaVIM-1 and blaNDM-1, blaSHV and blaIMP-2 and the gene conferring resistance to colistin mcr-1 were not found. The ERIC-PCR technique was used to determine the clonal relationships between the strains. The results showed a high genetic similarity between the lines, indicating that S. marcescens circulating in this UTI are highly genetically related. The resistance pattern presented by S. marcescens clinical isolates and the potential transmission of these clones, observed in our study, is very worrying, since it is suggested that they are important disseminators of hospital infections. Therefore, measures that eliminate the sources of resistance development and the reservoirs of these bacteria are of extreme importance for the control of these infections. |
| publishDate |
2019 |
| dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2019-09-17T17:43:48Z |
| dc.date.available.fl_str_mv |
2019-09-17T17:43:48Z |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2019-02-20 |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.citation.fl_str_mv |
REZENDE, Graziela Silva. Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis. 2019. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2019. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/11844. |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/11844 |
| identifier_str_mv |
REZENDE, Graziela Silva. Caracterização fenotípica e molecular da susceptibilidade antimicrobiana em Serratia marcescens isoladas de pacientes em um hospital terciário do estado de Tocantis. 2019. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2019. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/11844. |
| url |
https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/11844 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.relation.confidence.fl_str_mv |
600 600 |
| dc.relation.authority.fl_str_mv |
09d9fa5c-2a23-45d0-8b2a-97cdb5ef416b |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos Câmpus São Carlos |
| dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv |
| dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFSCar |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos Câmpus São Carlos |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFSCAR instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) instacron:UFSCAR |
| instname_str |
Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
| instacron_str |
UFSCAR |
| institution |
UFSCAR |
| reponame_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| collection |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/f51bfb98-d3f2-4fce-bd1c-57c37fb796fb/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/340e06c7-e998-47d9-bf46-ebcd5bc6a6f8/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/7bbee493-1601-4709-aabf-99aa276ebbe1/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/d9a2b9ef-e031-4fa5-8bc1-d8913eb0d25f/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/e1973ea7-81c4-4387-ba82-47e9c7c351e9/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
1f6858f317c00f7d9b8981e357ae21e6 503c65d9ff9e9d7b3f42659b7fb82b1c f386e98a835f492319cf5be1dcf1e048 47538b82d77cbd444dc09d9a23f6a5f9 d149ab73b10bff28825cdb79985ea902 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositorio.sibi@ufscar.br |
| _version_ |
1851688830489329664 |