Processamento de imagens hiperespectrais para diferenciação dos agentes causais da antracnose e ramulose do algodoeiro.
| Ano de defesa: | 2016 |
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| Orientador(a): | |
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| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Campina Grande
Brasil Centro de Tecnologia e Recursos Naturais - CTRN PÓS-GRADUAÇÃO EM ENGENHARIA AGRÍCOLA UFCG |
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/28066 |
Resumo: | Esse trabalho descreve um novo método para diferenciação de forma precisa e rápida dos fungos C. gossypii (CG) e C. gossypii var. cephalosporioides (CGC) crescidos em meio de cultura utilizando imagens hiperespectrais NIR e análise multivariada de reconhecimento de padrões. Foram empregados 5 isolados de CG e 46 de CGC. . Os diferentes isolados de CG e CGC foram cultivados em meio Czapek-agar com 12 h de fotoperíodo durante 15 dias. As medidas espectrais foram realizadas entre 1000 a 2500 nm, com 256 bandas, com uma câmera de alta performance com lente de 50 mm. Os modelos de reconhecimento de padrão foram desenvolvidos com as estratégias de APSLDA e SIMCA. As amostras foram separadas usando o algoritmo de seleção de amostras em três conjuntos com o número de amostras: 3, 1 e 1 para CG e 20, 8, 18 para CGC, totalizando 23 (Teste), 9 (Validação) e 19 (Predicão) que somam 51 amostras dos fungos CG e CGC. Os resultados de predição evidenciaram um erro tipo II para o conjunto CG no modelo SIMCA. Enquanto com o APS-LDA não ocorreram erros de classificação. No conjunto CGC com um número de 18 amostras de predição não foram verificados erros do tipo I e II empregando as estratégias do APS-LDA e SIMCA. Uma validação paralela dos resultados obtidos com APS-LDA foi realizada com análise de BoxPlot com as variáveis selecionadas pelo APS. Os resultados foram concordantes sem evidência de outlies. Portanto, um novo procedimento HSI e APS-LDA para diferenciação dos agentes etiliológicos CG e CGG é proposto com as vantagens de maior capacidade analítica com múltiplas análises e menor custo observando-se grandes números de amostras, rapidez e facilidade de implementação. |
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Processamento de imagens hiperespectrais para diferenciação dos agentes causais da antracnose e ramulose do algodoeiro.Processing of hyperspectral images to differentiate the causal agents of cotton anthracnose and ramulose.Processamento de imagens hiperespectraisImagens hiperespectraisAlgodoeiroAntracnose - algodoeiroRamulose - algodoeiroCultura do algodoeiroCultura do algodãoTaxonomia de fungosMicrorganismosHiperespectroscopiaAnálise multivariadaFungosHyperspectral image processingHyperspectral imagingCottonAnthracnose - cotton plantRamulose - cotton plantCotton cropCotton cultureTaxonomy of fungiMicroorganismsHyperspectroscopyMultivariate analysisFungiEngenharia de AgrícolaEsse trabalho descreve um novo método para diferenciação de forma precisa e rápida dos fungos C. gossypii (CG) e C. gossypii var. cephalosporioides (CGC) crescidos em meio de cultura utilizando imagens hiperespectrais NIR e análise multivariada de reconhecimento de padrões. Foram empregados 5 isolados de CG e 46 de CGC. . Os diferentes isolados de CG e CGC foram cultivados em meio Czapek-agar com 12 h de fotoperíodo durante 15 dias. As medidas espectrais foram realizadas entre 1000 a 2500 nm, com 256 bandas, com uma câmera de alta performance com lente de 50 mm. Os modelos de reconhecimento de padrão foram desenvolvidos com as estratégias de APSLDA e SIMCA. As amostras foram separadas usando o algoritmo de seleção de amostras em três conjuntos com o número de amostras: 3, 1 e 1 para CG e 20, 8, 18 para CGC, totalizando 23 (Teste), 9 (Validação) e 19 (Predicão) que somam 51 amostras dos fungos CG e CGC. Os resultados de predição evidenciaram um erro tipo II para o conjunto CG no modelo SIMCA. Enquanto com o APS-LDA não ocorreram erros de classificação. No conjunto CGC com um número de 18 amostras de predição não foram verificados erros do tipo I e II empregando as estratégias do APS-LDA e SIMCA. Uma validação paralela dos resultados obtidos com APS-LDA foi realizada com análise de BoxPlot com as variáveis selecionadas pelo APS. Os resultados foram concordantes sem evidência de outlies. Portanto, um novo procedimento HSI e APS-LDA para diferenciação dos agentes etiliológicos CG e CGG é proposto com as vantagens de maior capacidade analítica com múltiplas análises e menor custo observando-se grandes números de amostras, rapidez e facilidade de implementação.This work describes a new method for identification and classification as the precise and rapid C. gossypii (CG) and C. gossypii var. cephalosporioides (CGC) grown in culture medium using hyperspectral NIR images and multivariate pattern recognition. Five isolates were employees of CG and 46 of CGC. The different isolates of CG and CGC were cultured in Czapek agar with 12 h photoperiod for 15 days. The spectral measurements were performed between 1000 and 2500nm, with 256 bands with a highperformance camera with a 50 mm lens. The pattern recognition models were developed APS LDA and SIMCA strategies. The samples were separated using the sample selection algorithm in three sets the number of samples: 3, 1 and 1 for CG and 20, 8, 18 to CGC, totaling 23 (Test), 9 (Validation) and 19 (PREDICTION ) totaling 51 samples of CG and CGC fungi. The prediction results showed a type II error for the CG set in the SIMCA model. As with the APS-LDA there were misclassifications. CGC conjunction with a number of 18 prediction samples were not observed errors of type I and II using the strategies APS-LDA and SIMCA. A parallel validation of the results obtained with APS-LDA was performed with BoxPlot analysis with the variables selected by the APS. The results were consistent with no evidence of outlies. Therefore, a new procedure HSI and APS-LDA for identification and classification of etiliológicos agents CG and CGG is proposed with the advantages of greater analytical capacity with multiple analyzes, lower cost observing large numbers of samples, speed and ease of implementation.Universidade Federal de Campina GrandeBrasilCentro de Tecnologia e Recursos Naturais - CTRNPÓS-GRADUAÇÃO EM ENGENHARIA AGRÍCOLAUFCGGOMES, Josivanda Palmeira.GOMES, J. P.http://lattes.cnpq.br/2132187008397683MEDEIROS, Everaldo Paulo de.MEDEIROS, E. P.ARAÚJO, Alderi Emídio de.FIGUEIREDO NETO, Acacio.AZEVEDO, Marcia Rejane de Queiroz Albuquerque.OLIVEIRA, Líbia de Sousa Conrado.AIRES, Priscila Simone Ribeiro.2016-062022-11-28T23:29:06Z2022-11-282022-11-28T23:29:06Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesishttp://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/28066AIRES, Priscila Simone Ribeiro. Processamento de imagens hiperespectrais para diferenciação dos agentes causais da antracnose e ramulose do algodoeiro. 2016. 85f. (Tese de Doutorado) Programa de Pós-Graduação em Engenharia Agrícola, Centro de Tecnologia e Recursos Naturais, Universidade Federal de Campina Grande - Paraíba - Brasil, 2016. Disponível em: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/28066porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UCBinstname:Universidade Católica de Brasília (UCB)instacron:UCB2022-11-28T23:43:41Zoai:localhost:riufcg/28066Repositório InstitucionalPRIhttps://repositorio.ucb.br/oai/requestsara.ribeiro@ucb.bropendoar:2022-11-28T23:43:41Repositório Institucional da UCB - Universidade Católica de Brasília (UCB)false |
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Esse trabalho descreve um novo método para diferenciação de forma precisa e rápida dos fungos C. gossypii (CG) e C. gossypii var. cephalosporioides (CGC) crescidos em meio de cultura utilizando imagens hiperespectrais NIR e análise multivariada de reconhecimento de padrões. Foram empregados 5 isolados de CG e 46 de CGC. . Os diferentes isolados de CG e CGC foram cultivados em meio Czapek-agar com 12 h de fotoperíodo durante 15 dias. As medidas espectrais foram realizadas entre 1000 a 2500 nm, com 256 bandas, com uma câmera de alta performance com lente de 50 mm. Os modelos de reconhecimento de padrão foram desenvolvidos com as estratégias de APSLDA e SIMCA. As amostras foram separadas usando o algoritmo de seleção de amostras em três conjuntos com o número de amostras: 3, 1 e 1 para CG e 20, 8, 18 para CGC, totalizando 23 (Teste), 9 (Validação) e 19 (Predicão) que somam 51 amostras dos fungos CG e CGC. Os resultados de predição evidenciaram um erro tipo II para o conjunto CG no modelo SIMCA. Enquanto com o APS-LDA não ocorreram erros de classificação. No conjunto CGC com um número de 18 amostras de predição não foram verificados erros do tipo I e II empregando as estratégias do APS-LDA e SIMCA. Uma validação paralela dos resultados obtidos com APS-LDA foi realizada com análise de BoxPlot com as variáveis selecionadas pelo APS. Os resultados foram concordantes sem evidência de outlies. Portanto, um novo procedimento HSI e APS-LDA para diferenciação dos agentes etiliológicos CG e CGG é proposto com as vantagens de maior capacidade analítica com múltiplas análises e menor custo observando-se grandes números de amostras, rapidez e facilidade de implementação. |
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