Análise de expressão diferencial de genes: uma solução computacional para identificação de biomarcadores de tumores gástricos em humanos

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2019
Autor(a) principal: Rossetto, Marcos Vinicius
Orientador(a): Silva, Scheila de Avila e
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Neoplasias gástricas
Estômago - Tumores
Marcadores bioquímicos
Biotecnologia
Palavras-chave em Inglês:
Gastric neoplasms
Stomach - Tumors
Biochemical markers
Biotechnology
Link de acesso: https://repositorio.ucs.br/11338/8780
Resumo: O Câncer é a segunda maior doença causadora de mortes mundialmente, sendo o câncer gástrico o terceiro mais fatal. Neste contexto, o presente trabalho tem por objetivo a identificação de possíveis biomarcadores em tumores de câncer gástrico humano, por meio do desenvolvimento de uma ferramenta computacional dedicada a exploração e visualização da expressão gênica diferencial e da análise de sobrevivência de pacientes clínicos. Na realização desta pesquisa, utilizou-se dados de microarranjos disponibilizados no banco de dados público GEO com os seguintes códigos: GSE33335, GSE54129. Utilizando os conjuntos de dados, foram aplicados testes estatísticos na busca de genes estatisticamente diferencialmente expressos. Foram encontrados 39 genes com expressão diferencial entre o grupo de tecido tumoral e tecido não tumoral adjacente. Dentro desse grupo de genes diferencialmente expressos, foram selecionados os 3 genes com o menor p-value. Estes genes foram submetidos a ferramenta C-Gemis (desenvolvimento próprio) para o enriquecimento dos dados utilizando os dados do repositório TCGA. Essa análise indicou que o gene SIDT2 apresentou potencial como biomarcador para câncer gástrico do subtipo difuso da classificação de Laurén. [resumo fornecido pelo autor]
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