Identificação e mapeamento de marcadores associados a locos de resistência a virose do mosaico dourado em feijão caupi (Vignaunguiculata (L.) Walp.)

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2011
Autor(a) principal: Rodrigues, Marciene Amorim lattes
Orientador(a): Santana, José Raniere Ferreira de
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual de Feira de Santana
Programa de Pós-Graduação: Mestrado Acadêmico em Biotecnologia
Departamento: DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Mapeamento genético
Marcadores moleculares
Cowpea golden mosaic virus
Vigna unguiculata
Palavras-chave em Inglês:
Genetic mapping
Molecular markers
Área do conhecimento CNPq:
CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
CIENCIAS BIOLOGICAS
Link de acesso: http://tede2.uefs.br:8080/handle/tede/1074
Resumo: The objective of this work was the identification of markers linked to resistant genes to the cowpea golden mosaic virus (CGMV) through AFLP markers and the development and validation of SCAR markers linked to the resistance genes. For the study, the F2 population (286 individuals) resulting from the cross between IT97K-499-35, resistant genitor, and Canapu T16, susceptible, was used. The methodologies of Bulked Segregant Analysis and AFLP were used to identify markers linked to the resistance gene. The program JoinMap version 2.0 was used for construction of the map, adopting a minimum LOD of 3.0, a maximum recombination frequency of 0.45, and the Kosambi mapping function. Among the 196 combinations of AFLP primers tested, three markers linked to the resistance gene to CGMV were identified. The markers presented distances of 4.3 cM (E.AAC/M.CCC515), 14.2 cM (E.AGG/M.CTT280), and 16.8 cM (E.AAA/M.CAG352) of the resistance gene to golden mosaic, with the first two flanking it. The LOD scores were 50.4, 24.4, and 28.7, respectively. Eight SCAR markers were developed from the AFLP markers E.AAC/M.CCC515 and E.AAA/M.CAG352. In the eight combinations of SCAR primers tested among resistant and susceptible individuals of the F2 population, it was not possible to obtain the same segregation observed in the AFLP analysis. Efforts to develop SCAR markers efficient in detecting the resistance gene from AFLP markers obtained in the mapping of the gene that confers resistance to CGMV continue being done.
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spelling Santana, José Raniere Ferreira de5515544854904405135452http://lattes.cnpq.br/6547881854777229Rodrigues, Marciene Amorim2020-05-03T22:46:06Z2011-03-14RODRIGUES, Marciene Amorim. Identificação e mapeamento de marcadores associados a locos de resistência a virose do mosaico dourado em feijão caupi (Vignaunguiculata (L.) Walp.). 2011. 60 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Biotecnologia)- Universidade Estadual de Feira de Santana, Feira de Santana, 2011.http://tede2.uefs.br:8080/handle/tede/1074The objective of this work was the identification of markers linked to resistant genes to the cowpea golden mosaic virus (CGMV) through AFLP markers and the development and validation of SCAR markers linked to the resistance genes. For the study, the F2 population (286 individuals) resulting from the cross between IT97K-499-35, resistant genitor, and Canapu T16, susceptible, was used. The methodologies of Bulked Segregant Analysis and AFLP were used to identify markers linked to the resistance gene. The program JoinMap version 2.0 was used for construction of the map, adopting a minimum LOD of 3.0, a maximum recombination frequency of 0.45, and the Kosambi mapping function. Among the 196 combinations of AFLP primers tested, three markers linked to the resistance gene to CGMV were identified. The markers presented distances of 4.3 cM (E.AAC/M.CCC515), 14.2 cM (E.AGG/M.CTT280), and 16.8 cM (E.AAA/M.CAG352) of the resistance gene to golden mosaic, with the first two flanking it. The LOD scores were 50.4, 24.4, and 28.7, respectively. Eight SCAR markers were developed from the AFLP markers E.AAC/M.CCC515 and E.AAA/M.CAG352. In the eight combinations of SCAR primers tested among resistant and susceptible individuals of the F2 population, it was not possible to obtain the same segregation observed in the AFLP analysis. Efforts to develop SCAR markers efficient in detecting the resistance gene from AFLP markers obtained in the mapping of the gene that confers resistance to CGMV continue being done.O objetivo desse trabalho foi a identificação de marcadores associados aos genes de resistência ao vírus do mosaico dourado do feijão caupi (CGMV) por meio do mapeamento de marcadores AFLP e o desenvolvimento e validação de marcadores SCAR ligados aos genes de resistência. Para o estudo, foi utilizada a população de 286 indivíduos F2 resultante do cruzamento entre IT97K-499-35, genitor resistente, e Canapu T16, suscetível. Foram utilizadas as metodologias de ‘Bulked segregant analysis’ e AFLP para identificar marcadores ligados ao gene de resistência. O programa JoinMap versão 2.0 foi usado para construção do mapa, adotando-se LOD mínimo de 3,0, frequência máxima de recombinação de 0,45, e função de mapeamento Kosambi. Dentre as 196 combinações de primers AFLP testadas, foram identificados três marcadores ligados ao gene de resistência ao CGMV. Os marcadores apresentaram distâncias de 4,3 cM (E.AAC/M.CCC515), 14,2 cM (E.AGG/M.CTT280) e 16,8 cM (E.AAA/M.CAG352) do gene de resistência ao mosaico dourado, com os dois primeiros flanqueando-o. Os LODs foram 50,4, 24,4 e 28,7, respectivamente. Foram desenvolvidos oito marcadores SCARs a partir das marcas AFLP E.AAC/M.CCC515 e E.AAA/M.CAG352. Nas oito combinações de primers SCARs testados entre indivíduos resistentes e suscetíveis da população F2, não foi possível obter a mesma segregação observada na análise AFLP. Esforços para desenvolver marcadores SCARs eficientes em detectar o gene de resistência a partir das marcas AFLP obtidas no mapeamento do gene que confere resistência ao CGMV continuam sendo realizados.Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2020-05-03T22:46:06Z No. of bitstreams: 1 Disseratação_Marciene Amorim Rodrigues.[1].pdf: 1219975 bytes, checksum: eee2f455c35fb9e878e2d0a6432a26fe (MD5)Made available in DSpace on 2020-05-03T22:46:06Z (GMT). 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