Predição, análise e validação de RNAs não codificadores (ncRNAs) em Bacillus thuringiensis

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Appel, Renan José Casarotto
Orientador(a): Vilas-Bôas, Gislayne Fernandes Lemes Trindade [Orientador]
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Bioinformática
Genômica
Controle biológico
Bacillus thuringiensis
Genética molecular
Bioinformatics
Genomics
Bacillus thurigiensis
Molecular genetics
Link de acesso: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/13182
Resumo: Resumo: A visão clássica do dogma central da biologia molecular passou por mudanças de paradigma na virada deste século, quando avanços, principalmente em análises de bioinformática, contribuíram para a descoberta de que muito do que era transcrito nos organismos eram regiões não traduzidas em proteínas, e que apresentariam função biológica Tais transcritos foram denominados como RNAs não codificadores (ncRNAs) Motivados por tais descobertas, novos métodos computacionais dedicados à ncRNAs foram propostos, possibilitando estudos de ocorrência e distribuição em genomas de diversos microrganismos Bacillus thuringiensis (Bt), uma bactéria com características entomopatogênicas, é utilizada em todo o mundo no controle de pragas e vetores de doenças e ainda não foi analisada com respeito a estas moléculas A maioria dos processos ligados à virulência, capacidade necrotrófica e esporulação desta bactéria dependem de sistemas quorum sensing, porém, estas vias não estão totalmente elucidadas e ncRNAs podem estar atuando junto às mesmas Desta forma, este trabalho objetivou identificar, analisar e validar ncRNAs em três linhagens dessa espécie As sequências completas de cromossomos e plasmídeos dos genomas das linhagens Bt47, HD-1 e HD73 foram selecionados Ao todo, foram identificados 27111 possíveis ncRNAs; sendo 1874 candidatos considerados significativos, distribuídos em 177 famílias distintas encontradas principalmente em regiões presentes nas três linhagens As moléculas identificadas estão envolvidas em processos regulatórios complexos principalmente relacionados à virulência, patogenicidade, resistência e sobrevivência da bactéria A família epsC teve sua expressão validada no genoma Os resultados alcançados evidenciam que mesmo bactérias muito relacionadas filogeneticamente podem apresentar diferentes respostas às modificações ambientais, apresentando diferentes padrões de expressão; e ainda levam a uma nova linha de investigação para a compreensão de mecanismos fisiológicos em B thuringiensis
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being 1874 candidates considered significant, distributed in 177 different families found mainly in regions present in the three strains The molecules identified are involved in complex regulatory processes mainly related to the virulence, pathogenicity, resistance and survival of the bacterium The epsC family had the expression validated in the genome The results show that even highly phylogenetically related bacteria may present different responses to environmental modifications, presenting different expression standards; and still lead to a new line of investigation for the understanding of physiological mechanisms in B thuringiensisporBioinformáticaGenômicaControle biológicoBacillus thuringiensisGenética molecularBioinformaticsGenomicsBacillus thurigiensisMolecular geneticsPredição, análise e validação de RNAs não codificadores (ncRNAs) em Bacillus thuringiensisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisMestradoGenética e Biologia MolecularCentro de Ciências BiológicasPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular-1-1reponame:Repositório Institucional da UELinstname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)instacron:UELinfo:eu-repo/semantics/openAccess152971vtls000225916SIMvtls000225916http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls00022591664.00SIMhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls0002259167206.pdf123456789/2402 - Mestrado - Genética e Biologia MolecularORIGINAL7206.pdfapplication/pdf2876997https://repositorio.uel.br/bitstreams/cce1aabe-89d2-414c-be3a-3049f7cf8e07/download8775b6131cbad21faec72633c79051a9MD51LICENCElicence.txttext/plain263https://repositorio.uel.br/bitstreams/7a87227e-0aae-43c7-94b6-b5059ba7ec81/download753f376dfdbc064b559839be95ac5523MD52TEXT7206.pdf.txt7206.pdf.txtExtracted texttext/plain200870https://repositorio.uel.br/bitstreams/649cab61-aa0b-421c-b60f-9578fe27645a/download1cfee5eb7f471e6ad04bf1b6bc944f44MD53THUMBNAIL7206.pdf.jpg7206.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3653https://repositorio.uel.br/bitstreams/2be39520-64e2-4d71-9633-e6f58d86a201/download017367311d39cd11eefcdf2a794265ceMD54123456789/131822024-07-12 01:20:08.455open.accessoai:repositorio.uel.br:123456789/13182https://repositorio.uel.brBiblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bibliotecadigital.uel.br/PUBhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/OAI/oai2.phpbcuel@uel.br||opendoar:2024-07-12T04:20:08Repositório Institucional da UEL - Universidade Estadual de Londrina (UEL)false
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