Caracterização e distribuição de retrotransposons Ty1-copia e Ty3-gypsy nos cromossomos de espécies do gênero Hypochaeris (Asteraceae)

• Ano de defesa: 2024
• Autor(a) principal: Farias-Missão, Diana Cristina Lavoratto
• Orientador(a): Ruas, Claudete de Fátima [Orientador]
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Citogenética vegetal; Compostas; Cariótipos; Cromossomos; Plantas; Plant cytogenetics; Compositae; Chromosomes; Evolution (Biology); Plants
• Link de acesso: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/13529

Resumo: O gênero Hypochaeris (Asteraceae) apresenta distribuição disjunta na região Mediterrânea e na América do Sul Estudos de biogeografia mostram uma conexão clara entre evento de dispersão à longa distância do nordeste da África ao sul da América do Sul e explosivo processo de radiação adaptativa em diferentes habitats no continente sul-americano A região mediterrânea, onde são conhecidas 15 espécies, representa o centro de diversidade morfológica, citológica, molecular e taxonômica de Hypochaeris, enquanto, a América do Sul concentra cerca de 5 espécies, igualmente diversas morfologicamente Os retrotransposons compõem um grupo de DNA repetitivo disperso, abundante no genoma de plantas e sua diversidade, organização e distribuição nos cromossomos têm grandes implicações na evolução dos genomas Com o objetivo de compreender os mecanismos de evolução genômica e cariotípica de Hypochaeris e investigar a participação dos retrotransposons no processo evolutivo de espécies do gênero, foram investigados os retrotransposons do grupo LTR, Ty1-copia e Ty3-gypsy, pela análise de fragmentos parciais do gene da transcriptase reversa (rt) Utilizando primers degenerados e sem degeneração, fragmentos do gene rt foram isolados via PCR e caracterizados para oito espécies de Hypochaeris, incluindo uma de origem mediterrânea e H angustifolia, co-irmã do grupo sul-americano O número de sequências obtidas foi de 96 e 16, para Ty1-copia e Ty3-gypsy, respectivamente Os dois grupos de elementos foram altamente heterogêneos, tanto entre, quanto dentro de espécies Entretanto, o grau de heterogeneidade foi maior para elementos Ty1-copia, possivelmente, devido à evolução mais recente dos retrotransposons Ty3-gypsy em Hypochaeris Constatou-se correlação positiva entre heterogeneidade de sequências rt-copia e tamanho do genoma para espécies sul-americanas A distribuição física dos elementos Ty3-gypsy foi determinada para a espécie sul-americana H chillensis, por meio de técnica de hibridação in situ (FISH) Estes elementos encontram-se dispersos de forma desigual nos cromossomos, com maior concentração nos braços longos dos cromossomos 3 e 4, região pericentromérica no braço longo do cromossomo 2, além de forte sinal adjacente à constrição secundária no par 2 Nossos dados sugerem também que os retrotransposons Ty1-copia e Ty3-gypsy evoluíram diferencial e independentemente, dentro do gênero Hypochaeris