Rotavírus grupos A, B e C em leitões lactentes : frequência de diagnóstico e avaliação molecular de rotavírus atípicos

• Ano de defesa: 2024
• Autor(a) principal: Médici, Kerlei Cristina
• Orientador(a): Alfieri, Amauri Alcindo [Orientador]
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Leitão (Suíno); Doenças; Diarréia em suíno; Rotavírus; Virologia veterinária; Veterinary virology; Diarrhea; Piglet
• Link de acesso: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/8594

Resumo: O Rotavírus é um dos principais agentes etiológicos das diarréias em leitões lactentes em todo o mundo Devido à facilidade na identificação, com freqüência, apenas o grupo A de rotavírus é incluído nos estudos epidemiológicos da rotavirose em leitões O objetivo desse estudo foi avaliar a freqüência de diagnóstico de rotavírus grupos A, B e C em episódios de diarréia em leitões lactentes e realizar análises filogenéticas em estirpes de rotavírus grupos B e C identificadas no Brasil Para a definição da amostragem foi utilizado como critério de inclusão o resultado prévio obtido pela técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE), tendo sido selecionadas 144 amostras fecais que apresentaram resultados inconclusivos em PAGE A identificação dos grupos A, B e C foi realizada por meio de técnicas de RT-PCR Para o grupo A foram utilizados primers consensuais para G (VP7) e P (VP4) tipos O diagnóstico do grupo B foi realizado por meio de semi nested-PCR que amplifica um fragmento com 434 pb do gene 8 (NSP2) O grupo C foi identificado por meio da amplificação por RT-PCR de um produto com 27 pb do gene 5 (VP6) Das 144 amostras analisadas apenas 41 (28,5%) foram negativas, simultaneamente, para os três grupos de rotavírus Infecções singulares foram identificadas em 58 (4,3%) amostras sendo que em 34 (23,6%) amostras foi identificado o grupo A, em 19 (13,2%) o grupo B e em 5 (3,5%) amostras o grupo C Em 45 (31,2%) amostras prevaleceram as infecções mistas com dois e até mesmo os três grupos de rotavírus Rotavírus dos grupos B e C foram identificados com maior freqüência (42,4%) em infecções mistas Onze produtos amplificados a partir de amostras positivas para o rotavírus grupo C e três para o grupo B foram seqüenciados em ambos os sentidos Com relação ao grupo C, nove seqüências puderam ser analisadas A identidade de nucleotídeos entre elas variou de 81,3% a 94,3% Três produtos apresentaram identidade próxima (91,3%-93,9%) ao protótipo Cowden de origem suína As outras seis amostras formaram um novo ramo, distinto daqueles formados pelas estirpes de origem suína, bovina e humana disponíveis em bases públicas de dados Os três produtos, amplificados a partir de amostras fecais de leitões positivas para o rotavírus grupo B, apresentaram entre si identidade de 9,1% a 91,8% e formaram um ramo distinto daqueles formados pelas estirpes de origem humana e de rato, evidenciando que as estirpes puderam ser diferenciadas de acordo com o seu hospedeiro de origem As taxas de diagnóstico positivo identificadas nesse trabalho ratificam a importância da rotavirose nos episódios de diarréia em leitões lactentes no Brasil A expressiva freqüência de diagnóstico dos grupos B e C, tanto em infecções singulares quanto mistas, sugere que a taxa de infecção de leitões por esses vírus esta sendo subestimada As análises moleculares demonstraram a heterogeneidade das estirpes brasileiras de rotavírus suíno grupo C no Brasil Foi possível ainda a caracterização de um novo cluster de rotavírus grupo B, ainda não descrito na literatura, composto pelas amostras brasileiras de origem suína, e que possibilitou diferenciar as estirpes de origem humana e de rato disponíveis em bases públicas de dados com aquelas de origem suína