Podridão radicular de fitóftora em soja : identificação de um gene recessivo de resistência e validação de SNPs para emprego em seleção assistida por marcadores moleculares

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Camolese, Adriano Consoni
Orientador(a): Arias, Carlos Alberto Arrabal [Orientador]
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Soja
Resistência a doenças e pragas
Marcadores biológicos
Phytophthora
Plantas
Disease and pest resistance
Breeding
Biological markers
Soybean - Genetic aspects
Link de acesso: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/9498
Resumo: Resumo: Phytophthora sojae é causador da doença conhecida como Podridão Radicular de Fitóftora (PRF) A cultivar BRSMG 752S é resistente à doença e estudos preliminares apontam a existência de um gene em seu genoma O gene de resistência a P sojae Rps1k tem sido um dos mais efetivos e empregado no controle da doença A herança da resistência da cultivar BRSMG 752S foi avaliada a partir de seu cruzamento com nove genótipos portadores de diferentes genes de resistência já descritos, sendo possível concluir que o locus rps da BRSMG 752S não está em nenhum dos locus testados e que se trata de um gene/alelo recessivo Adicionalmente, estudos foram conduzidos visando à descoberta, validação e otimização de marcadores SNPs ligados ao gene Rps1k para emprego em seleção assistida em larga escala Os SNPs 474659 e 474671 obtidos a partir de dados de re-sequenciamento, foram selecionados para validação utilizando 18 genótipos de soja, previamente fenotipados com diferentes raças de P sojae permitindo a determinação da presença ou ausência do gene Rps1k Outras 17 linhagens elites do Programa de Melhoramento Genético (PMG) também foram genotipadas A partir da combinação dos dados de fenotipagem e genotipagem foi possível selecionar o ensaio 7221 garantindo uma acuracidade de seleção para o gene Rps1k acima de 88% Trinta e um genótipos foram caracterizados como portadores do gene Rps1k Os ensaios de genotipagem 7221 e 894 foram otimizados para utilização em genotipagem de larga escala via qPCR
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Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia MolecularAbstract: Phytophthora root rot (PRR) of soybean is caused by Phytophthora sojae The cultivar BRSMG 752S is resistant to disease and preliminary studies indicate the existence of a single gene in their genome The resistance gene Rps1k to P sojae has been one of the most effective against the disease Genetic studies were performed involving crosses between the resistant cultivar BRSMG 752S with nine genotypes containing different resistance Rps genes previously described Based on the crosses it was possible conclude that the resistance locus present at cultivar BRSMG 752S is none of tested locus and is a single recessive gene Moreover, were performed studies to discovery and validate SNPs markers linked to Rps1k to be used in high throughput molecular markers assisted selection The SNPs 474659 and 474671 based on resequencing, were selected for validation with 18 soybean genotypes, previously phenotyped with different races of P sojae allowing determining the presence or absence of the gene Rps1k Other 17 elite lines derived from the genetic breeding program also were genotyped By combining phenotyping and genotyping data, it was possible to select the 7221 ensuring more than 88% of selection accuracy for Rps1K Thirty one genotypes were characterized as having the Rps1k gene The genotyping assays based on SNPs, 7221 and 894, were optimized for use in high throughput genotyping by qPCRporSojaResistência a doenças e pragasMarcadores biológicosPhytophthoraPlantasDisease and pest resistanceBreedingBiological markersSoybean - Genetic aspectsPodridão radicular de fitóftora em soja : identificação de um gene recessivo de resistência e validação de SNPs para emprego em seleção assistida por marcadores molecularesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisMestradoGenética e Biologia MolecularCentro de Ciências BiológicasPrograma de Pós-graduação em Genética e Biologia MolecularEMBRAPA-1-1reponame:Repositório Institucional da UELinstname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)instacron:UELinfo:eu-repo/semantics/openAccess3040vtls000204146SIMvtls000204146http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls00020414664.00SIMhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls0002041464420.pdf123456789/2402 - Mestrado - Genética e Biologia MolecularORIGINAL4420.pdfapplication/pdf3404030https://repositorio.uel.br/bitstreams/7deea78d-26db-4665-98a0-75681731cb12/download9fd5d578996ea5fa41a37c9787e293c8MD51LICENCElicence.txttext/plain263https://repositorio.uel.br/bitstreams/e55a4d22-c0b5-4a55-a084-a34d79e54bf3/download753f376dfdbc064b559839be95ac5523MD52TEXT4420.pdf.txt4420.pdf.txtExtracted texttext/plain125442https://repositorio.uel.br/bitstreams/29c2ea16-b5b3-498d-9829-4c8636f2248e/download3dbcca43c3dd3c617ca89df26f64f290MD53THUMBNAIL4420.pdf.jpg4420.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3818https://repositorio.uel.br/bitstreams/b64e3d64-f102-4a97-9ab7-ba31d124d552/download5afb934ed6a1bcf82ad3f116e1be96d7MD54123456789/94982024-07-12 01:20:07.152open.accessoai:repositorio.uel.br:123456789/9498https://repositorio.uel.brBiblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bibliotecadigital.uel.br/PUBhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/OAI/oai2.phpbcuel@uel.br||opendoar:2024-07-12T04:20:07Repositório Institucional da UEL - 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description Resumo: Phytophthora sojae é causador da doença conhecida como Podridão Radicular de Fitóftora (PRF) A cultivar BRSMG 752S é resistente à doença e estudos preliminares apontam a existência de um gene em seu genoma O gene de resistência a P sojae Rps1k tem sido um dos mais efetivos e empregado no controle da doença A herança da resistência da cultivar BRSMG 752S foi avaliada a partir de seu cruzamento com nove genótipos portadores de diferentes genes de resistência já descritos, sendo possível concluir que o locus rps da BRSMG 752S não está em nenhum dos locus testados e que se trata de um gene/alelo recessivo Adicionalmente, estudos foram conduzidos visando à descoberta, validação e otimização de marcadores SNPs ligados ao gene Rps1k para emprego em seleção assistida em larga escala Os SNPs 474659 e 474671 obtidos a partir de dados de re-sequenciamento, foram selecionados para validação utilizando 18 genótipos de soja, previamente fenotipados com diferentes raças de P sojae permitindo a determinação da presença ou ausência do gene Rps1k Outras 17 linhagens elites do Programa de Melhoramento Genético (PMG) também foram genotipadas A partir da combinação dos dados de fenotipagem e genotipagem foi possível selecionar o ensaio 7221 garantindo uma acuracidade de seleção para o gene Rps1k acima de 88% Trinta e um genótipos foram caracterizados como portadores do gene Rps1k Os ensaios de genotipagem 7221 e 894 foram otimizados para utilização em genotipagem de larga escala via qPCR
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