Diagnóstico e estudo molecular de cepas brasileiras de rotavírus suíno espécies B e H

• Ano de defesa: 2024
• Autor(a) principal: Molinari, Bruna Letícia Domingues
• Orientador(a): Alfieri, Amauri Alcindo [Orientador]
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Suínos; Doenças; Diarréia em suíno; Rotavírus; Swine; Diarrhea in swine; Diseases
• Link de acesso: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/13136

Resumo: A gastroenterite em leitões lactentes e recém-desmamados representa a principal causa de morbidade e mortalidade durante o período neonatal A síndrome é caracterizada por infecção entérica multifatorial e multietiológica Entre as causas infecciosas, o rotavírus (RV) é o principal agente etiológico viral Por serem mais frequentes, as espécies de rotavírus A (RVA) e C (RVC) são as mais estudadas No entanto, surtos de diarreia causados por espécies de rotavírus B (RVB) em leitões lactentes estão sendo relatados em rebanhos de suínos das regiões sul e centro-oeste do Brasil Por sua vez, a espécie de rotavírus H (RVH) foi descrita apenas recentemente na suinocultura brasileira Os objetivos deste estudo foram avaliar a presença de cepas de RV em um surto de diarreia em leitões lactentes e recém-desmamos que ocorreu em uma granja com programa de vacinação contra patógenos entéricos, incluindo RVA, e realizar a caracterização molecular das cepas de RVB e RVH identificadas Para isso, três estudos independentes foram realizados O objetivo do primeiro estudo foi determinar as sequências de nucleotídeos (nt) e de aminoácidos (aa) dos genes que codificam as proteínas VP6, VP7, VP4 e NSP4 de seis cepas de campo identificadas como RVH (BR59, BR6, BR61, BR62, BR63 e BR64) no surto de diarreia A partir da cepa de RVH suína, SKA-1, primers específicos foram selecionados para amplicação dos genes citados acima Com base nas altas identidades encontradas entre as sequências de nt (~99%) dos genes VP6, VP4, VP7 e NSP4 entre cinco das cepas estudadas (BR59 a BR63), é possível considerá-las pertencentes a mesma linhagem de RV, denominada RVH / BRA-1 Em contraste, uma vez que a amostra fecal BR64 apresentou uma diferença relativamente alta (81,6% e 83,4% de identidade para nt e aa, respectivamente) na sequência referente à proteína VP7, quando comparada com as outras cinco amostras, a mesma foi denominada cepa RVH / BRA-2 No segundo estudo, com o objetivo de triar todas as amostras diarreicas (n = 5) obtidas no surto para RVA, B, C e H, realizou-se RT-PCR com primers específicos para cada espécie De acordo com os testes, RVC (78%) foi mais prevalente nas infecções singulares (34%) e mistas (44%), seguido pelo RVA (46%), RVB (32%) e RVH (18%) A análise filogenética de três cepas de RVA permitiu a caracterização de dois genotipos G / P distintos, representados por G5P[13] e G9P[23], diferentemente do G5P[7] presente em vacinas comerciais Independentemente da espécie de RV, as infecções mistas (54%) foram mais prevalentes do que as infecções por um único agente RVB e RVH foram detectados apenas em associação com outros grupos de RV, sugerindo uma ação secundária dessas espécies no surto relatado Finalmente, no terceiro estudo, com base na qualidade do produto amplificado por RT-PCR, a amostra fecal de RVB identificada como BR62, foi selecionada para análises moleculares adicionais As sequências de nt e aa do gene VP7 foram determinadas e a análise comparativa desta cepa com as cepas dos outros 21 genotipos de VP7 previamente identificados mostraram que a cepa suína brasileira pertence a um novo genotipo, G22, e parece estar circulando em diferentes partes do mundo Os estudos reforçam o papel dos RV como importantes agentes causadores de diarreia demonstram a variabilidade genética entre as espécies Além disso, esta é a primeira detecção do genotipo de RVB, G22, em rebanhos suinícolas brasileiros