Propriedades biológicas e análise parcial do RNA1 codificador da replicase de isolados do Bean rugose mosaic virus

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2010
Autor(a) principal: Barboza, Antonio Augusto Lazarini, 1981-
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual de Maringá
Departamento de Agronomia
Programa de Pós-Graduação em Agronomia
Maringá, PR
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Feijoeiro - Vírus
Soja - Doenças e pragas
Feijão - Doenças e pragas
Feijão - Cultivo
632.8
Ciências Agrárias
Agronomia
Link de acesso: http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/9298
Resumo: Orientador: Prof. Dr. Eliezer Rodrigues de Souto
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spelling Propriedades biológicas e análise parcial do RNA1 codificador da replicase de isolados do Bean rugose mosaic virusFeijoeiro - VírusSoja - Doenças e pragasFeijão - Doenças e pragasFeijão - Cultivo632.8Ciências AgráriasAgronomiaOrientador: Prof. Dr. Eliezer Rodrigues de SoutoTese (doutorado em Agronomia) - Universidade Estadual de Maringá, 2010Resumo: O Bean rugose mosaic virus (BRMV) pertence ao gênero Comovirus, possui genoma constituído de duas moléculas de RNA fitas simples, senso positivo, denominadas de RNA1 e RNA2 e apresenta gama de hospedeiras restrita, nas quais induz sintomas sistêmicos de mosaico, bolhosidade e deformação foliar no feijoeiro. Plantas de soja e de feijão apresentando sintomas característicos de infecção por BRMV foram coletadas no Paraná. Os isolados foram mantidos em casa de vegetação em plantas de feijoeiro cv. Rio Tibagi. Os isolados foram purificados, permitindo a constatação da presença de três picos de leitura de absorbância que puderam ser correlacionados aos componentes virais de Comovirus. Ensaios de Elisa indireto apontaram para diferenças na concentração relativa individual de cada isolado, a qual se manteve inalterada mesmo nas infecções mistas. O RNA dos isolados foi extraído e um protocolo de semi-nested RT-PCR foi utilizado na amplificação de um fragmento de 700pb do RNA1, o qual foi clonado e sequenciado. Comparações com outras sequências do Genbank indicaram uma identidade de 79% dessa seqüência com o RNA1 do Bean pod mottle virus. Através da identificação da tríade de aminoácidos GDD, que é conservada nas replicases dos vírus de RNA senso positivo, foi identificada a região conservada da RNA polimerase, codificada pelo RNA1 do BRMV. A análise filogenética permitiu a classificação do BRMV como membro da família Secoviridae, agrupando-o próximo ao BPMV, bem como de outros comovírus de leguminosas. A sequência da região 3’ do RNA1 do BRMV encontra-se depositada no GenBank sob o código de acesso GU205154 ou gi?284807373?Abstract: Bean rugose mosaic (BRMV) is a member of the Comovirus genus. The virus genome consists of two molecules of single strand RNA, positive sense, called RNA1 and RNA2. BRMV has a restricted host range, causing systemic symptoms such as blistering and leaf deformation on beans. Soybean and bean plants showing characteristic symptoms of BRMV infection were collected in Paraná state. The isolates were maintained in ‘Rio Tibagi’ bean plants in greenhouse conditions. The virus purified preparation gave three peaks of absorbance readings that could be correlated to the comoviruses particle components. Indirect ELISA tests pointed to replication differential rates for each virus isolate that remained constant even after virus mixed infections. The RNA of both isolates was extracted and a protocol for semi-nested RT-PCR was used to amplify a RNA1 fragment of 700bp, that was cloned and sequenced. Comparisons of the nucleotide sequence with others from the Genbank showed 79% identity with RNA1 of Bean pod mottle virus. The identification of the RNA polymerase coded by BRMV RNA1 was confirmed through the GDD amino acid triad that is conserved in the RNA replicase of all positive sense viruses. The phylogenetic analysis allowed the classification of BRMV as a member of the Secoviridae family. BRMV could be situated next to BPMV, among other comoviruses infecting leguminosae plants. The sequence of the 3’ RNA1 region of BRMV is deposited in the GenBank under the accession number GU205154 or gi?284807373?66 f. : il. color., figs., tabs.Universidade Estadual de MaringáDepartamento de AgronomiaPrograma de Pós-Graduação em AgronomiaMaringá, PRSouto, Eliezer Rodrigues de, 1961-Andrade, Carlos Alberto de BastosMangolin, Claudete AparecidaAlmeida, Álvaro Manuel RodriguesBianchini, AnésioBarboza, Antonio Augusto Lazarini, 1981-2025-09-15T18:02:58Z2025-09-15T18:02:58Z2010info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfBARBOZA, Antonio Augusto Lazarini. Propriedades biológicas e análise parcial do RNA1 codificador da replicase de isolados do Bean rugose mosaic virus. 2010. 66 f. Tese (doutorado em Agronomia) - Universidade Estadual de Maringá, 2010, Maringá, PR.http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/9298info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM)instname:Universidade Estadual de Maringá (UEM)instacron:UEM2025-09-15T18:16:44Zoai:localhost:1/9298Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.uem.br:8080/oai/requestrepositorio@uem.bropendoar:2025-09-15T18:16:44Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) - Universidade Estadual de Maringá (UEM)false
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