Diversidade genética de isolados brasileiros de Phakopsora pachyrhizi (Sydow & Sydow)

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2016
Autor(a) principal: Bermejo, Gabriela Rastelli
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual do Norte do Paraná
Brasil
UENP/CLM::CCA
UENP
PPAGRO
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
SSR
Link de acesso: https://repositorio.uenp.edu.br/handle/123456789/280
Resumo: A ferrugem asiática da soja (FAS) causada pelo fungo biotrófico obrigatório Phakopsora pachyrhizi Syd. & P. Syd., é uma das principais doenças que acomete a cultura da soja [Glycine max (L.) Merr.], causando perdas na sua produção em diversas áreas produtoras do mundo. A resistência específica ao fungo P. pachyrhizi foi encontrada, até o momento, em e seis locus, denominados Rpp1, Rpp1b, Rpp2, Rpp3, Rpp4, Rpp5 e Rpp6. No entanto esse locus não conferem resistência completa ao patógeno, dificultando a criação de uma cultivar eficiente. Sendo assim, o conhecimento sobre a variabilidade genética existente nas populações de P. pachyrhizi e de isolados são fundamentais para que programas de melhoramento genético possam realizar um planejamento estratégico eficiente contra o fungo causador da ferrugem asiática da soja. Diante disso, o objetivo deste trabalho foi ampliar análises iniciadas por Darben et al. (2012), a partir do uso de marcadores dominantes e co-dominantes para estimar a diversidade molecular entre os isolados monourediniais de P. pachyrhizi bem como para uma população de esporos do fungo. Após sucessivos ciclos de cultura monouredinial em folha destacada, foram obtidos DNA de 6 isolados monourediniais e de uma população, coletados em regiões produtoras de soja no país. A amplificação dos sete pares de primers AFLP revelou uma diversidade genética média entre pares de 21,88%-77,98% (Nei), sendo a maior diversidade em pares encontrada entre o isolado LLRV212 (MT) e a população (PR). A maior similaridade encontrada foi de 80,35% entre os isolados LCA4A12 (MG) e LLRV212 (MT). O Isolado LGO112 (GO) apresentou 30 marcas únicas e não se agrupou no cluster formado pelos demais. Em termos de seleção de inóculo, os dados moleculares indicaram esse material como um importante material a ser considerado para análise fenotípica de virulência e agressividade. Os cinco primers SSR amplificados não apresentaram polimorfismo. É possível sugerir que ao menos cinco dos sete materiais testados representem fontes de inóculos geneticamente distintas. Será agora fundamental observar se a variação molecular corresponde em algum grau a variação fenotípica observada na resposta de plantas diferenciadoras de soja diante dos diferentes materiais do fungo.
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Sendo assim, o conhecimento sobre a variabilidade genética existente nas populações de P. pachyrhizi e de isolados são fundamentais para que programas de melhoramento genético possam realizar um planejamento estratégico eficiente contra o fungo causador da ferrugem asiática da soja. Diante disso, o objetivo deste trabalho foi ampliar análises iniciadas por Darben et al. (2012), a partir do uso de marcadores dominantes e co-dominantes para estimar a diversidade molecular entre os isolados monourediniais de P. pachyrhizi bem como para uma população de esporos do fungo. Após sucessivos ciclos de cultura monouredinial em folha destacada, foram obtidos DNA de 6 isolados monourediniais e de uma população, coletados em regiões produtoras de soja no país. A amplificação dos sete pares de primers AFLP revelou uma diversidade genética média entre pares de 21,88%-77,98% (Nei), sendo a maior diversidade em pares encontrada entre o isolado LLRV212 (MT) e a população (PR). A maior similaridade encontrada foi de 80,35% entre os isolados LCA4A12 (MG) e LLRV212 (MT). O Isolado LGO112 (GO) apresentou 30 marcas únicas e não se agrupou no cluster formado pelos demais. Em termos de seleção de inóculo, os dados moleculares indicaram esse material como um importante material a ser considerado para análise fenotípica de virulência e agressividade. Os cinco primers SSR amplificados não apresentaram polimorfismo. É possível sugerir que ao menos cinco dos sete materiais testados representem fontes de inóculos geneticamente distintas. Será agora fundamental observar se a variação molecular corresponde em algum grau a variação fenotípica observada na resposta de plantas diferenciadoras de soja diante dos diferentes materiais do fungo.Asian soybean rust (ASR) caused by obligate biotrophic fungus Phakopsora pachyrhizi Syd. & P. Syd., Is a major disease that affects the culture of soybean [Glycine max (L.) Merr.], Causing losses in production in many producing areas of the world. The specific resistance to P. pachyrhizi fungus was found, so far, in six locus, called Rpp1, Rpp1b, Rpp2, Rpp3, Rpp4, Rpp5 and Rpp6. However this locus does not confer full resistance to the pathogen, hindering the development of effective cultivars. Therefore, knowledge of the genetic variability in populations of P. pachyrhizi and isolates are essential for breeding programs can perform an efficient strategic planning against the fungus that causes Asian soybean rust. Therefore, the objective of this study was to extend analysis initiated by Darben et al. (2012), from the use of dominant and co dominant markers to estimate the molecular diversity between monourediniais isolates of P. pachyrhizi and to a population of spores of the fungus. After successive cycles monouredinial culture in a separate leaves were obtained DNA six isolated monourediniais and one population collected in soybean producing regions in the country. The amplification seven pairs of AFLP primers showed an average genetic diversity was between pairs from 21.88% -77.98% (NIS), the greater diversity in pairs found between the isolated LLRV212 (MT) and the population (PR). The highest similarity was found between 80.35% LCA4A12 isolated (MG) and LLRV212 (MT). The Isolated LGO 112 (GO) presented 30 unique brands and not clumped together in the cluster formed by the other. In terms of inoculum selection, molecular results indicated this material as a major material to be considered for virulence phenotype analysis and aggressiveness. The five amplified SSR primers showed no polymorphism. It is possible to suggest that at least five of the seven tested materials represent sources of genetically distinct inoculations. It will now be essential to observe the molecular variation corresponds to some degree the phenotypic variation observed in soybean plants differentiated response on the different materials of the fungus.Coordenadoria de Aperfeiçoamento de Pessoal de Ensino Superior (CAPES)Universidade Estadual do Norte do ParanáBrasilUENP/CLM::CCAUENPPPAGROCarvalho, Mayra Costa da Cruz Gallo dehttps://orcid.org/0000-0002-1559-3828http://lattes.cnpq.br/2844751503530944Carvalho, Mayra Costa da Cruz Gallo dehttps://orcid.org/0000-0002-1559-3828http://lattes.cnpq.br/2844751503530944Carvalho, Sandremir dehttps://orcid.org/0000-0002-4830-5722http://lattes.cnpq.br/8684697240694261Podanosqui, Adriana Maria Polizelhttp://lattes.cnpq.br/2507513800168563Matsumoto, Leopoldo Sussumuhttps://orcid.org/0000-0001-5102-545Xhttp://lattes.cnpq.br/0857955043436449Marcelino-Guimarães, Francismar Corrêahttps://orcid.org/0000-0002-5828-7249http://lattes.cnpq.br/4585015105548818Bermejo, Gabriela Rastelli2024-10-02T19:32:51Z2024-10-02T19:32:51Z2016-03-30info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfBERMEJO, Gabriela Rastelli. Diversidade genética de isolados brasileiros de Phakopsora pachyrhizi (Sydow & Sydow). Orientadora: Mayra Costa da Cruz Gallo de Carvalho. 2016. 36 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia) – Centro de Ciências Agrárias, Campus Luiz Meneghel, Universidade Estadual do Norte do Paraná, Bandeirantes, 2016.https://repositorio.uenp.edu.br/handle/123456789/280porreponame:Repositório da Universidade Estadual do Norte do Paraná (UENP)instname:Universidade Estadual do Norte do Paraná (UENP)instacron:UENPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2024-10-02T16:33:36Zoai:repositorio.uenp.edu.br:123456789/280Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.uenp.edu.br/server/oai/request?verb=Identifyrepositorio@uenp.edu.bropendoar:2024-10-02T16:33:36Repositório da Universidade Estadual do Norte do Paraná (UENP) - Universidade Estadual do Norte do Paraná (UENP)false
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