Expressão de genes envolvidos com o desenvolvimento do botão floral do algodoeiro (Gossypium hirsutum H.) por meio de RT-PCR e RT-qPCR
| Ano de defesa: | 2012 |
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| Instituição de defesa: |
Universidade Estadual da Paraíba
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| Programa de Pós-Graduação: |
Programa de Pós-Graduação em Ciências Agrárias - PPGCA
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| Departamento: |
Ciências Agrárias
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| Palavras-chave em Português: | |
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Resumo: | The use of public database, generated from genome projects, such as NCBI, CottonDB, SUCEST FORESTs, among others, is of great importance for molecular studies, especially those related to gene expression, since, in possession of sequences deposited, it is possible to isolate new genes or prospect and know their role in various ontogenetic stages. In plants, a stage of great demand for knowledge is related to reproduction. Currently, several studies with Arabidopsis thaliana involving identification and characterization of genes associated with reproductive organs, especially the bud phenology, has enabled major advances in our understanding of functions and can correlate them with other species. For plant species possessing large commodities such as cotton, these results are relevant, considering that several studies developed with this aim culture studies that enhance the expression quantitative trait dependent physiology of reproduction. In this study, we investigated the temporal and spatial expression of genes that are expressed in cotton bud by semiquantitative RT-PCR and qPCR. We selected four genes with a history of expression in floral buds (cottonbud7, cottonbud8, and cottonbud9 cottonbud10) and used for primer design. Tissue samples of flower buds (2-8 mm, 10-12 mm and 14-20 mm), leaves, stems and roots were collected and used for total RNA extraction and cDNA synthesis. The results of gene expression analyzes showed expression of selected genes in all tissues investigated, though genes cottonbud7 cottonbud10 and showed a stable expression in all phases investigated bud. It was observed further that the cottonbud10 showed a slightly higher expression in floral bud, when compared to other genes. The analysis of gene expression via cottonbud10 qPCR corroborate the results obtained with the RT-PCR. The results obtained in this study provide information about genes to promising research projects involving the improvement program for cotton. |
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2015-09-25T12:21:26Z2026-03-04T11:38:52Z2013-10-012012-08-22BATISTA, Vandré Guevara Lyra. Expressão de genes envolvidos com o desenvolvimento do botão floral do algodoeiro (Gossypium hirsutum H.) por meio de RT-PCR e RT-qPCR. 2012. 44 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Agrárias) - Universidade Estadual da Paraíba, Campina Grande, 2012.https://repositorio.uepb.edu.br/handle/123456789/7535524004014012P5The use of public database, generated from genome projects, such as NCBI, CottonDB, SUCEST FORESTs, among others, is of great importance for molecular studies, especially those related to gene expression, since, in possession of sequences deposited, it is possible to isolate new genes or prospect and know their role in various ontogenetic stages. In plants, a stage of great demand for knowledge is related to reproduction. Currently, several studies with Arabidopsis thaliana involving identification and characterization of genes associated with reproductive organs, especially the bud phenology, has enabled major advances in our understanding of functions and can correlate them with other species. For plant species possessing large commodities such as cotton, these results are relevant, considering that several studies developed with this aim culture studies that enhance the expression quantitative trait dependent physiology of reproduction. In this study, we investigated the temporal and spatial expression of genes that are expressed in cotton bud by semiquantitative RT-PCR and qPCR. We selected four genes with a history of expression in floral buds (cottonbud7, cottonbud8, and cottonbud9 cottonbud10) and used for primer design. Tissue samples of flower buds (2-8 mm, 10-12 mm and 14-20 mm), leaves, stems and roots were collected and used for total RNA extraction and cDNA synthesis. The results of gene expression analyzes showed expression of selected genes in all tissues investigated, though genes cottonbud7 cottonbud10 and showed a stable expression in all phases investigated bud. It was observed further that the cottonbud10 showed a slightly higher expression in floral bud, when compared to other genes. The analysis of gene expression via cottonbud10 qPCR corroborate the results obtained with the RT-PCR. The results obtained in this study provide information about genes to promising research projects involving the improvement program for cotton.A utilização de banco de dados públicos, gerados a partir de projetos genoma, como o NCBI, CottonDB, SUCEST, FORESTs, entre outros, é de grande relevância para estudos moleculares, especialmente aos relacionados a expressão gênica, uma vez que, de posse das sequências depositadas, é possível prospectar ou isolar novos genes e conhecer sua função em várias fases ontogenéticas. Em plantas, uma das fases de grande demanda de conhecimento é a relacionada com a reprodução. Atualmente, vários estudos com Arabidopsis thaliana envolvendo identificação e caracterização de genes associados aos órgãos reprodutores, especialmente a fenologia do botão floral, tem possibilitado grandes avanços no conhecimento de funções, podendo correlacioná-las em outras espécies. Para espécies vegetais detentoras de grandes commodities, como algodão, tais resultados são relevantes, considerando que várias pesquisas desenvolvidas com essa cultura visam estudos que potencializem a expressão de características quantitativas dependentes da fisiologia de reprodução. Neste trabalho, investigou-se a expressão temporal e espacial de genes que se expressam em botão floral de algodoeiro por meio de RTPCR semiquantitativa e qPCR. Foram selecionados quatro genes com histórico prévio de expressão em botão floral (cottonbud7, cottonbud8, cottonbud9 e cottonbud10) e utilizados para desenho de primers. Amostras de tecidos de botões florais (2-8 mm; 10-12 mm e 14-20 mm), folhas, hastes e raízes foram coletadas e utilizadas para a extração de RNA total e síntese de cDNA. Os resultados das análises de expressão gênica mostraram expressão dos genes selecionados em todos os tecidos investigados, contudo os genes cottonbud7 e cottonbud10 apresentaram estabilidade da expressão em todas as fases investigadas do botão floral. Pôde-se observar ainda, que o cottonbud10 apresentou nível de expressão levemente superior em botão floral, quando comparado aos demais genes. As análises de expressão do gene cottonbud10 via qPCR corroboram com os resultados obtidos com o RT-PCR. Os resultados obtidos neste trabalho, fornecem informações sobre genes promissores para trabalhos de pesquisa envolvendo o programa de melhoramento do algodão.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESapplication/pdfUniversidade Estadual da ParaíbaPrograma de Pós-Graduação em Ciências Agrárias - PPGCAUEPBBRCiências AgráriasCNPQGenética vegetalAlgodoeiroGenBankExpressão de genes envolvidos com o desenvolvimento do botão floral do algodoeiro (Gossypium hirsutum H.) por meio de RT-PCR e RT-qPCRPrecocious exhibition to the cow s milk and occurrence of Diabetes mellitus type 1 in Campina Grande PBinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisSantos, Roseane Cavalcanti doshttp://lattes.cnpq.br/6140411868197365Campos, Magnólia de Araújohttp://lattes.cnpq.br/0904596179326111Fernandes, Pedro Dantashttp://lattes.cnpq.br/4411670211010251Lima, Liziane Maria dehttp://lattes.cnpq.br/7350753350522784http://lattes.cnpq.br/7818823172874534Batista, Vandré Guevara Lyrainfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Estadual da Paraíba (UEPB)instname:Universidade Estadual da Paraíba (UEPB)instacron:UEPBORIGINALPDF - Vandre Guevara Lyra Batista.pdfapplication/pdf915279https://repositorio.uepb.edu.br/bitstreams/f0036834-22b1-43b8-b2a4-cbdaecb4ab13/downloaddb4c1c0fb945a68ca720e9082f021bfcMD51trueAnonymousREADTHUMBNAILPDF - Vandre Guevara Lyra Batista.pdf.jpgPDF - Vandre Guevara Lyra Batista.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3355https://repositorio.uepb.edu.br/bitstreams/370a6861-108a-40d0-afa4-66889c932f0d/downloadc076cd43ba7ea29f6525671920615bb5MD52falseAnonymousREADLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81324https://repositorio.uepb.edu.br/bitstreams/908be09e-e9d4-4542-aaae-ddf65137f48a/downloadea12793326f265c7d8ea2bcdd2c49d6fMD53falseAnonymousREAD123456789/753552026-05-06T11:33:46.041145Zopen.accessoai:repositorio.uepb.edu.br:123456789/75355https://repositorio.uepb.edu.brRepositório InstitucionalPUBhttp://dspace.bc.uepb.edu.br/oai/requestsibuepb@setor.uepb.edu.bropendoar:2026-05-06T11:33:46Repositório Institucional da Universidade Estadual da Paraíba (UEPB) - Universidade Estadual da Paraíba (UEPB)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 |
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