ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE)
| Ano de defesa: | 2013 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | , |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas
|
| Departamento: |
Biologia Evolutiva
|
| País: |
BR
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Palavras-chave em Inglês: | |
| Área do conhecimento CNPq: | |
| Link de acesso: | http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/982 |
Resumo: | The most part of the eukaryote genomes is constituted for repetitive DNA or multiple copies DNA, which has already been considered as “junk”, may be associated to the heterochromatin. In this study three Astyanax scabripinnis populations from Pindamonhangaba and Guaratinguetá (SP, Brazil) rivers and stream and one population from Maringá (PR, Brazil) were analyzed about the nucleolar organizing region (NORs), As51 satellite DNA, 18S and 5S rDNA location. Moreover, repetitive sequences were isolated and mapped through Cot-1 technique, which showed homology with UnaL2, a LINE type retrotransposon. The fluorescent in situ hybridization (FISH), with the isolated built retrotransposon probe, evidenced disperse labeled and stronger in centromeric and telomeric chromosomes regions, co-located and interspersed with the 18S DNAr and As51, proven by the fiber-FISH technique. The B chromosome of those populations showed very conspicuous labeled with the LINE probe, also co-located with the As51 sequences. The NORs were actives in a single site of a homologue pair in all three populations, with no evidence that the transposable elements and repetitive DNA have influence in its regulation at the performed analyzes level. |
| id |
UEPG_167df9be72a44c77573e94cf8e4ce77f |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:tede2.uepg.br:prefix/982 |
| network_acronym_str |
UEPG |
| network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Artoni, Roberto FerreiraCPF:13854979800http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728593H6Moreira Filho, OrlandoCPF:55060870804http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783301E9Almeida, Mara Cristina deCPF:12342029802http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4707588P3Sczepanski, Thais SaadCPF:04115849959http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4744223Z1CPF:07262673920http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4388269Z4Barbosa, Patrícia2017-07-21T20:00:01Z2014-04-082017-07-21T20:00:01Z2013-02-08BARBOSA, Patrícia. ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE). 2013. 65 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Evolutiva) - UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA, Ponta Grossa, 2013.http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/982The most part of the eukaryote genomes is constituted for repetitive DNA or multiple copies DNA, which has already been considered as “junk”, may be associated to the heterochromatin. In this study three Astyanax scabripinnis populations from Pindamonhangaba and Guaratinguetá (SP, Brazil) rivers and stream and one population from Maringá (PR, Brazil) were analyzed about the nucleolar organizing region (NORs), As51 satellite DNA, 18S and 5S rDNA location. Moreover, repetitive sequences were isolated and mapped through Cot-1 technique, which showed homology with UnaL2, a LINE type retrotransposon. The fluorescent in situ hybridization (FISH), with the isolated built retrotransposon probe, evidenced disperse labeled and stronger in centromeric and telomeric chromosomes regions, co-located and interspersed with the 18S DNAr and As51, proven by the fiber-FISH technique. The B chromosome of those populations showed very conspicuous labeled with the LINE probe, also co-located with the As51 sequences. The NORs were actives in a single site of a homologue pair in all three populations, with no evidence that the transposable elements and repetitive DNA have influence in its regulation at the performed analyzes level.A maior parte do genoma dos eucariotos é constituída por DNA repetitivo ou DNA de múltiplas cópias, o qual já foi considerado “lixo”, podendo estar associado à heterocromatina. Neste estudo foram analisadas três populações de Astyanax scabripinnis provenientes de rios e córregos de Pindamonhangaba e Guaratinguetá (SP, Brasil) e uma população da cidade de Maringá (PR, Brasil) quanto a localização das regiões organizadoras de nucléolo (RONs), DNA satélite As51, DNA ribossomal (DNAr) 18S e DNAr 5S. Ainda, foram isoladas e mapeadas sequências repetitivas por meio da técnica de Cot-1, que mostrou homologia com UnaL2, retrotransposon do tipo LINE. A hibridação in situ fluorescente (FISH), com sonda construída para o retrotransposon isolado, evidenciou marcações dispersas e mais concentradas em regiões centroméricas e teloméricas dos cromossomos, co-localizadas e interespaçadas com DNAr 18S e As51, comprovada pela técnica de fiber-FISH. O cromossomo B das populações mostrou marcações bastante conspícuas com a sonda LINE, também co-localizada com sequências As51. As RONs apresentaram-se ativas em sítios únicos de um par homólogo nas três populações, não havendo indícios de que elementos transponíveis e DNA repetitivo tenham influência na sua regulação ao nível das análises realizadas.Made available in DSpace on 2017-07-21T20:00:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Patricia Barbosa.pdf: 1571215 bytes, checksum: daac7b661ca93cbfd05ca0e7cda85213 (MD5) Previous issue date: 2013-02-08Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorapplication/pdfporUNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSAPrograma de Pós-Graduação em Ciências BiológicasUEPGBRBiologia EvolutivaDNArretrotransposonDNA satéliteFISHcromossomo BrDNAretrotransposonsatellite DNAFISHchromosome BCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA::BIOLOGIA MOLECULARELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPGinstname:Universidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG)instacron:UEPGORIGINALPatricia Barbosa.pdfapplication/pdf1571215http://tede2.uepg.br/jspui/bitstream/prefix/982/1/Patricia%20Barbosa.pdfdaac7b661ca93cbfd05ca0e7cda85213MD51prefix/9822017-07-21 17:00:01.046oai:tede2.uepg.br:prefix/982Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://tede2.uepg.br/jspui/PUBhttp://tede2.uepg.br/oai/requestbicen@uepg.br||mv_fidelis@yahoo.com.bropendoar:2017-07-21T20:00:01Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG - Universidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG)false |
| dc.title.por.fl_str_mv |
ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE) |
| title |
ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE) |
| spellingShingle |
ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE) Barbosa, Patrícia DNAr retrotransposon DNA satélite FISH cromossomo B rDNA retrotransposon satellite DNA FISH chromosome B CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA::BIOLOGIA MOLECULAR |
| title_short |
ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE) |
| title_full |
ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE) |
| title_fullStr |
ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE) |
| title_full_unstemmed |
ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE) |
| title_sort |
ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE) |
| author |
Barbosa, Patrícia |
| author_facet |
Barbosa, Patrícia |
| author_role |
author |
| dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Artoni, Roberto Ferreira |
| dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv |
CPF:13854979800 |
| dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728593H6 |
| dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
Moreira Filho, Orlando |
| dc.contributor.advisor-co1ID.fl_str_mv |
CPF:55060870804 |
| dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783301E9 |
| dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
Almeida, Mara Cristina de |
| dc.contributor.referee1ID.fl_str_mv |
CPF:12342029802 |
| dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4707588P3 |
| dc.contributor.referee2.fl_str_mv |
Sczepanski, Thais Saad |
| dc.contributor.referee2ID.fl_str_mv |
CPF:04115849959 |
| dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4744223Z1 |
| dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
CPF:07262673920 |
| dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4388269Z4 |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Barbosa, Patrícia |
| contributor_str_mv |
Artoni, Roberto Ferreira Moreira Filho, Orlando Almeida, Mara Cristina de Sczepanski, Thais Saad |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
DNAr retrotransposon DNA satélite FISH cromossomo B |
| topic |
DNAr retrotransposon DNA satélite FISH cromossomo B rDNA retrotransposon satellite DNA FISH chromosome B CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA::BIOLOGIA MOLECULAR |
| dc.subject.eng.fl_str_mv |
rDNA retrotransposon satellite DNA FISH chromosome B |
| dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA::BIOLOGIA MOLECULAR |
| description |
The most part of the eukaryote genomes is constituted for repetitive DNA or multiple copies DNA, which has already been considered as “junk”, may be associated to the heterochromatin. In this study three Astyanax scabripinnis populations from Pindamonhangaba and Guaratinguetá (SP, Brazil) rivers and stream and one population from Maringá (PR, Brazil) were analyzed about the nucleolar organizing region (NORs), As51 satellite DNA, 18S and 5S rDNA location. Moreover, repetitive sequences were isolated and mapped through Cot-1 technique, which showed homology with UnaL2, a LINE type retrotransposon. The fluorescent in situ hybridization (FISH), with the isolated built retrotransposon probe, evidenced disperse labeled and stronger in centromeric and telomeric chromosomes regions, co-located and interspersed with the 18S DNAr and As51, proven by the fiber-FISH technique. The B chromosome of those populations showed very conspicuous labeled with the LINE probe, also co-located with the As51 sequences. The NORs were actives in a single site of a homologue pair in all three populations, with no evidence that the transposable elements and repetitive DNA have influence in its regulation at the performed analyzes level. |
| publishDate |
2013 |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2013-02-08 |
| dc.date.available.fl_str_mv |
2014-04-08 2017-07-21T20:00:01Z |
| dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2017-07-21T20:00:01Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.citation.fl_str_mv |
BARBOSA, Patrícia. ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE). 2013. 65 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Evolutiva) - UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA, Ponta Grossa, 2013. |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/982 |
| identifier_str_mv |
BARBOSA, Patrícia. ELEMENTOS GENÔMICOS REPETITIVOS NO COMPLEXO Astyanax scabripinnis (TELEOSTEI, CHARACIDAE). 2013. 65 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Evolutiva) - UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA, Ponta Grossa, 2013. |
| url |
http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/982 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA |
| dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas |
| dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UEPG |
| dc.publisher.country.fl_str_mv |
BR |
| dc.publisher.department.fl_str_mv |
Biologia Evolutiva |
| publisher.none.fl_str_mv |
UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG instname:Universidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG) instacron:UEPG |
| instname_str |
Universidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG) |
| instacron_str |
UEPG |
| institution |
UEPG |
| reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG |
| collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG |
| bitstream.url.fl_str_mv |
http://tede2.uepg.br/jspui/bitstream/prefix/982/1/Patricia%20Barbosa.pdf |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
daac7b661ca93cbfd05ca0e7cda85213 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG - Universidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG) |
| repository.mail.fl_str_mv |
bicen@uepg.br||mv_fidelis@yahoo.com.br |
| _version_ |
1863182566330204160 |