Polimorfismos em genes de reparo do DNA e risco para leucemias agudas infantis e do lactente

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2018
Autor(a) principal: Louzada Neto, Orlando Soares
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade do Estado do Rio de Janeiro
Centro Biomédico::Instituto de Biologia Roberto Alcantara Gomes
Brasil
UERJ
Programa de Pós-Graduação em Biociências
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/18037
Resumo: Leucemias agudas infantis (LA-i; até 24 meses de idade) e do lactente (LA-l; até 12 meses de idade) são caracterizadas por alta frequência de rearranjos envolvendo o gene Lysine specific Methyltransferase 2A (KMT2A, anteriormente denominado MLL), importante regulador epigenético tanto no desenvolvimento fetal quanto na hematopoiese definitiva. Os rearranjos no KMT2A (KMT2A-r) ocorrem em leucemia linfoblástica aguda (LLA) e leucemia mieloide aguda (LMA). Os danos ao DNA fetal causados pela exposição materna a xenobióticos durante a gravidez são reconhecidos pelos sistemas de reparo por excisão de bases (BER), por excisão de nucleotídeos (NER) e por junção de extremidades não homólogas (NHEJ). Este último, passível de erro, está envolvido na geração de rearranjos cromossômicos, incluindo KMT2A-r. Para testar a hipótese de que variantes gênicas dos sistemas de reparo de DNA modificam o risco para LA-i e LA-l, foi avaliada a associação de rs25487 (XRCC1), rs11615 (ERCC1), rs3212986 (ERCC1), rs5751129 (XRCC6), rs6869366 (XRCC4) e rs28360071 (XRCC4) com KMT2A-r e o risco de leucemia nestas duas condições. Utilizando amostras de crianças até 24 meses de idade e dados do BCSGIAL (2000-2013), os genótipos de 277 casos (LLA = 164; LMA = 113) e 300 controles foram determinados por PCR ou PCR-RFLP. A expressão gênica do XRCC4 na medula óssea foi avaliada por qPCR. O Equilíbrio de Hardy-Weinberg foi verificado pelo software GenPop Web 4.5.1, os cálculos de Odd ratio (OR) foram realizados no SPSS Statistics 22.0 e as análises dos resultados de expressão gênica no GraphPad Prism 5. O rs3212986 demonstrou proteção para LA-i (modelo recessivo: p = 0,013; ORa = 0,15; IC: 0,03-0,67; modelo CCxAA: p < 0,010; ORa = 0,13; IC: 0,03-0,58), enquanto rs25487 demonstrou risco global para LMA (modelo recessivo, p < 0,001; ORa 6,30; IC: 3,25- 12,2). O polimorfismo rs28360071 demonstrou risco para LLA-i e LLA-l em crianças que possuem KMT2A-r (modelo IIxID, p = 0,014; ORa 2,23; IC: 1,17-4,25; p = 0,031, ORa = 2,27; IC: 1,07-4,82, respectivamente). Nenhuma associação estatisticamente significante foi encontrada para as demais variantes. Observou-se maior expressão de XRCC4 na medula óssea de pacientes com LLA, embora esta variação não ocorra em função dos diferentes genótipos de rs28360071. O software Human Splicing Finder 3.1 previu a ativação de um sítio doador de splicing no intron 3 associado ao alelo de deleção, possivelmente modificando a proteína codificada e sua função. Estes dados sugerem uma possível relação entre os polimorfismos rs25487 e rs3212986 e leucemias agudas, enquanto o polimorfismo rs28360071 está associado à LLA com KMT2A-r.
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Os danos ao DNA fetal causados pela exposição materna a xenobióticos durante a gravidez são reconhecidos pelos sistemas de reparo por excisão de bases (BER), por excisão de nucleotídeos (NER) e por junção de extremidades não homólogas (NHEJ). Este último, passível de erro, está envolvido na geração de rearranjos cromossômicos, incluindo KMT2A-r. Para testar a hipótese de que variantes gênicas dos sistemas de reparo de DNA modificam o risco para LA-i e LA-l, foi avaliada a associação de rs25487 (XRCC1), rs11615 (ERCC1), rs3212986 (ERCC1), rs5751129 (XRCC6), rs6869366 (XRCC4) e rs28360071 (XRCC4) com KMT2A-r e o risco de leucemia nestas duas condições. Utilizando amostras de crianças até 24 meses de idade e dados do BCSGIAL (2000-2013), os genótipos de 277 casos (LLA = 164; LMA = 113) e 300 controles foram determinados por PCR ou PCR-RFLP. A expressão gênica do XRCC4 na medula óssea foi avaliada por qPCR. O Equilíbrio de Hardy-Weinberg foi verificado pelo software GenPop Web 4.5.1, os cálculos de Odd ratio (OR) foram realizados no SPSS Statistics 22.0 e as análises dos resultados de expressão gênica no GraphPad Prism 5. O rs3212986 demonstrou proteção para LA-i (modelo recessivo: p = 0,013; ORa = 0,15; IC: 0,03-0,67; modelo CCxAA: p < 0,010; ORa = 0,13; IC: 0,03-0,58), enquanto rs25487 demonstrou risco global para LMA (modelo recessivo, p < 0,001; ORa 6,30; IC: 3,25- 12,2). O polimorfismo rs28360071 demonstrou risco para LLA-i e LLA-l em crianças que possuem KMT2A-r (modelo IIxID, p = 0,014; ORa 2,23; IC: 1,17-4,25; p = 0,031, ORa = 2,27; IC: 1,07-4,82, respectivamente). Nenhuma associação estatisticamente significante foi encontrada para as demais variantes. Observou-se maior expressão de XRCC4 na medula óssea de pacientes com LLA, embora esta variação não ocorra em função dos diferentes genótipos de rs28360071. O software Human Splicing Finder 3.1 previu a ativação de um sítio doador de splicing no intron 3 associado ao alelo de deleção, possivelmente modificando a proteína codificada e sua função. Estes dados sugerem uma possível relação entre os polimorfismos rs25487 e rs3212986 e leucemias agudas, enquanto o polimorfismo rs28360071 está associado à LLA com KMT2A-r.Early age acute leukemia (e-AL; up to 24 months old) and infant acute leukemia (i-AL; up to 12 months old) have a high frequency of chromosomal rearrangements envolving Lysine specific methyltransferase 2A gene (KMT2A, previously termed as MLL), which has an important role on epigenetics both in fetal development and definitive hematopoiesis. KMT2A rearrangements (KMT2A-r) occur both in acute lymphoblastic leukemia (ALL) and acute myeloid leukemia (AML). Single strand breaks and double strand breaks caused by parental exposition to xenobiotics compounds during pregnancy are repaired by base excision repair (BER), nucleotide excision repair (NER) and non-homologous end-joining (NHEJ) systems. NHEJ is an error-prone repair system enrolled in chromosomal translocations, including KMT2A-r. To test the hypothesis that genetic variants on DNA repair systems modify the risk for e-AL and i-AL, we investigated rs25487 (XRCC1), rs11615 (ERCC1), rs3212986 (ERCC1), rs5751129 (XRCC6), rs6869366 (XRCC4) and rs28360071 (XRCC4) in association with KMT2A-r and leukemia risk to these two conditions. Using data from BCSGIAL (2000-2013), 277 cases (ALL = 164; AML = 113) and 300 controls up to 24 months old were genotyped by PCR or PCR-RFLP. Bone marrow XRCC4 expression was evaluated by qPCR. Hardy-Weinberg equilibrium was calculated using GenPop Web 4.5.1, Odds ratio (OR) were calculated using SPSS Statistics 22.0, and gene expression was analyzed on GraphPad Prism 5. We have found that rs3212986 (recessive model: p = 0.013; aOR = 0.15; CI: 0.03-0.67; CCxAA model: p < 0.010; ORa = 0.13; CI: 0.03-0.58) has a protective effect for e-AL; and rs25487 demonstrated a global increased risk for AML (recessive model: p < 0,001; aOR 6.30; CI: 3.25-12.2). The rs28360071 variant increases the risk to e-ALL and i-ALL in children harboring KMT2A-r (II x ID model: p = 0.014; aOR 2.23; CI: 1.17-4.25; p = 0.031 aOR = 2.27; CI: 1.07-4.82, respectively). The remaining variants did not showed any statistical significance with the risk. ALL patients showed a higher bone marrow expression level of XRCC4 mRNA, but there was no differences regarding rs28360071 genotypes. Human Splicing Finder 3.1 software predicted that the deletion allele is potentially associated with the activation of a donor cryptic splice site in intron 3, which could contribute to protein structure and function modifications. These data point to a relationship between rs25487 and rs3212986 polymorphisms and acute leukemia, and an association of rs28360071 and ALL with KMT2A-r.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESUniversidade do Estado do Rio de JaneiroCentro Biomédico::Instituto de Biologia Roberto Alcantara GomesBrasilUERJPrograma de Pós-Graduação em BiociênciasTeixeira, Ana Maria Rossinihttp://lattes.cnpq.br/0370020634398898Albano, Rodolpho Mattoshttp://lattes.cnpq.br/1268859650338952Santos-Rebouças, Cíntia Barroshttp://lattes.cnpq.br/5415426502606671Pombo-de-Oliveira, Maria do Socorrohttp://lattes.cnpq.br/3085057149388157Simão, Tatiana de Almeidahttp://lattes.cnpq.br/4257729756468950Louzada Neto, Orlando Soares2022-07-12T13:23:31Z2018-07-12info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfLOUZADA NETO, Orlando Soares. Polimorfismos em genes de reparo do DNA e risco para leucemias agudas infantis e do lactente. 2018. 134 f. Dissertação (Mestrado em Biociências) – Instituto de Biologia Roberto Alcantara Gomes, Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2018.http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/18037porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJinstname:Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)instacron:UERJ2024-02-26T14:39:25Zoai:www.bdtd.uerj.br:1/18037Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bdtd.uerj.br/PUBhttps://www.bdtd.uerj.br:8443/oai/requestbdtd.suporte@uerj.bropendoar:29032024-02-26T14:39:25Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ - Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)false
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