Diversidade e identificação do potencial antagonista de fungos endofíticos cultiváveis de variedades de Capsicum chinense Jacquin

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: Nobre, Janaina da Costa Nogueira
Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/0479858840376122
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas
Brasil
UFAM
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/8173
Resumo: Os microrganismos que habitam o interior das plantas, conhecidos como endófitos, têm sido explorados para diversas aplicações devido à sua produção de importantes compostos químicos como enzimas, alcalóides, antibióticos, anticancerígenos e outros metabólitos diferentes. Capsicum chinense é uma espécie de pimenteira encontrada em todas as regiões do Brasil e que apresenta uma expressiva variabilidade de frutos em diferentes formatos e cores, duas dessas variedades são bastante apreciadas para consumo na região Norte, território que se destaca também como centro de diversidade da espécie de pimentas C. chinense, as variedades típicas dessa região são as pimentas murupi e de cheiro, objetos de interesse deste estudo, pois são condimentos bastante utilizados na culinária local. O objetivo deste trabalho foi o isolamento, identificação e a avaliação do potencial antagônico de fungos endofíticos obtidos de Capsicum chinense. Os frutos foram coletados em Presidente Figueiredo, município localizado na Região Metropolitana de Manaus. Os isolados foram obtidos pela técnica de fragmentação dos tecidos vegetais, que foram plaqueados em meio Batata Dextrose Agar (BDA), a 28 ºC, e após obtenção de colônias purificadas os fungos foram avaliados quanto a sua ação antibacteriana contra as cepas de Staphylococcus aures, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Pseudomonas aeruginosa e contra fitopatógenos do gênero Colletotrichum spp, causadores de antracnose em amostras do guaranazeiro. Para obtenção dos extratos os isolados foram cultivados em meio BDA, fragmentos miceliais foram triturados e transferidos para Erlenmayers de 500 mL contendo 300 mL de acetato de etila. Para avaliação da atividade antibacteriana foi realizado o ensaio de difusão em disco e as atividades antifúngicas analisadas em testes de confrontos diretos. Foram isolados 157 fungos endofíticos das duas variedades de pimentas, 15,6% dos fragmentos do endocarpo e 2% de sementes, devido número de fungos isolados, eles foram inicialmente agrupados em seis grupos com base em suas características morfológicas. Diferentes endófitos exibiram diferentes níveis de bioatividade contra os patógenos utilizados nesse estudo. No ensaio de atividade antibacteriana, quatro isolados, onde dois deles foram identificados como Diaporthe sp. e Diaporthe phaseolorum, mostraram-se ativos frente à Staphylococcus aureus. No confronto direto entre os fungos endofíticos e os patógenos, três endófitos pertencentes à espécie Neoscytalidium dimidiatum e uma linhagem de Diaporthe phaseolorum foram eficazes na supressão do fitopatógeno (GP131) da cultura do guaraná com taxa de antagonismo de 80%, sendo a mais alta taxa de antagonismo foi do endófito Neoscytalidium dimidiatum que inibiu os dois fitopatógenos (GP131 e ISO6/R4) analisados nesse estudo. Na avaliação dos extratos fúngicos contra os fitopatógenos foram observados isolados de Diaporthe sp. com compostos ativos que inibiram o desenvolvimento dos Colletrotrichum cf. gloeosporioides e Colletotrichum siamense.
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Capsicum chinense é uma espécie de pimenteira encontrada em todas as regiões do Brasil e que apresenta uma expressiva variabilidade de frutos em diferentes formatos e cores, duas dessas variedades são bastante apreciadas para consumo na região Norte, território que se destaca também como centro de diversidade da espécie de pimentas C. chinense, as variedades típicas dessa região são as pimentas murupi e de cheiro, objetos de interesse deste estudo, pois são condimentos bastante utilizados na culinária local. O objetivo deste trabalho foi o isolamento, identificação e a avaliação do potencial antagônico de fungos endofíticos obtidos de Capsicum chinense. Os frutos foram coletados em Presidente Figueiredo, município localizado na Região Metropolitana de Manaus. Os isolados foram obtidos pela técnica de fragmentação dos tecidos vegetais, que foram plaqueados em meio Batata Dextrose Agar (BDA), a 28 ºC, e após obtenção de colônias purificadas os fungos foram avaliados quanto a sua ação antibacteriana contra as cepas de Staphylococcus aures, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Pseudomonas aeruginosa e contra fitopatógenos do gênero Colletotrichum spp, causadores de antracnose em amostras do guaranazeiro. Para obtenção dos extratos os isolados foram cultivados em meio BDA, fragmentos miceliais foram triturados e transferidos para Erlenmayers de 500 mL contendo 300 mL de acetato de etila. Para avaliação da atividade antibacteriana foi realizado o ensaio de difusão em disco e as atividades antifúngicas analisadas em testes de confrontos diretos. Foram isolados 157 fungos endofíticos das duas variedades de pimentas, 15,6% dos fragmentos do endocarpo e 2% de sementes, devido número de fungos isolados, eles foram inicialmente agrupados em seis grupos com base em suas características morfológicas. Diferentes endófitos exibiram diferentes níveis de bioatividade contra os patógenos utilizados nesse estudo. No ensaio de atividade antibacteriana, quatro isolados, onde dois deles foram identificados como Diaporthe sp. e Diaporthe phaseolorum, mostraram-se ativos frente à Staphylococcus aureus. No confronto direto entre os fungos endofíticos e os patógenos, três endófitos pertencentes à espécie Neoscytalidium dimidiatum e uma linhagem de Diaporthe phaseolorum foram eficazes na supressão do fitopatógeno (GP131) da cultura do guaraná com taxa de antagonismo de 80%, sendo a mais alta taxa de antagonismo foi do endófito Neoscytalidium dimidiatum que inibiu os dois fitopatógenos (GP131 e ISO6/R4) analisados nesse estudo. Na avaliação dos extratos fúngicos contra os fitopatógenos foram observados isolados de Diaporthe sp. com compostos ativos que inibiram o desenvolvimento dos Colletrotrichum cf. gloeosporioides e Colletotrichum siamense.The microorganisms that inhabit the interior of plants, known as endophytes, have been explored for several applications due to their production of important chemical compounds such as enzymes, alkaloids, antibiotics, anticancer and other different metabolites. Capsicum chinense is a species of pepper found in all regions of Brazil and which presents an expressive variability of fruits in different shapes and colors, two of these varieties are quite appreciated for consumption in the North region, a territory that also stands out as a center of diversity in pepper species C. chinense, the typical varieties of this region are murupi and scented peppers, objects of interest in this study, as they are condiments widely used in local cuisine. The objective of this work was the isolation, identification and evaluation of the antagonistic potential of endophytic fungi obtained from Capsicum chinense. The fruits were collected in Presidente Figueiredo, a municipality located in the Metropolitan Region of Manaus. The isolates were obtained by the technique of fragmentation of plant tissues, which were plated in Potato Dextrose Agar (PDA), at 28 ºC, and after obtaining purified colonies the fungi were evaluated for their antibacterial action against Staphylococcus aures strains, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae and Pseudomonas aeruginosa and against phytopathogens of the genus Colletotrichum spp, causing anthracnose in guaranazeiro samples. To obtain the extracts, the isolates were grown in PDA medium, mycelial fragments were crushed and transferred to Erlenmayers of 500 mL containing 300 mL of ethyl acetate. The disk diffusion assay was performed to assess antibacterial activity and the antifungal activities were analyzed in direct confrontation tests. 157 endophytic fungi were isolated from the two varieties of peppers, 15.6% of the fragments of the endocarp and 2% of seeds, due to the number of isolated fungi, they were initially grouped into six groups based on their morphological characteristics. Different endophytes exhibited different levels of bioactivity against the pathogens used in this study. In the antibacterial activity test, four isolates, where two of them were identified as Diaporthe sp. and Diaporthe phaseolorum, showed to be active against Staphylococcus aureus. In the direct confrontation between endophytic fungi and pathogens, three endophytes belonging to the species Neoscytalidium dimidiatum and a strain of Diaporthe phaseolorum were effective in suppressing the phytopathogen (GP131) of the guaraná culture with an antagonism rate of 80%, being the highest rate of antagonism was the endophyte Neoscytalidium dimidiatum that inhibited the two phytopathogens (GP131 and ISO6 / R4) analyzed in this study. In the evaluation of fungal extracts against phytopathogens, isolates from Diaporthe sp. with active compounds that inhibited the development of Colletrotrichum cf. gloeosporioides and Colletotrichum siamense.FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do AmazonasUniversidade Federal do AmazonasInstituto de Ciências BiológicasBrasilUFAMPrograma de Pós-Graduação em BiotecnologiaAzevedo, João Lúcio dehttp://lattes.cnpq.br/2302429651674634Costa Neto, Pedro de Queirozhttp://lattes.cnpq.br/9441888603413825Freitas, Adriana Dantas Gonzaga dehttp://lattes.cnpq.br/3694117633635449Yuyama, Kamila Tomokohttp://lattes.cnpq.br/3560544474696690Nobre, Janaina da Costa Nogueirahttp://lattes.cnpq.br/04798588403761222021-03-20T15:04:02Z2021-01-20info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfNOBRE, Janaina da Costa Nogueira. Diversidade e identificação do potencial antagonista de fungos endofíticos cultiváveis de variedades de Capsicum chinense Jacquin. 2021. 69 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2021.https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/8173porhttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAMinstname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)instacron:UFAM2021-03-21T05:03:43Zoai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/8173Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://200.129.163.131:8080/PUBhttp://200.129.163.131:8080/oai/requestddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.bropendoar:65922021-03-21T05:03:43Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)false
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