Geração de iPSCs derivadas de pacientes com TEA e desenvolvimento de organoides cerebrais para a investigação das alterações funcionais associadas às variantes no gene SCN2A

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Santos, John Lenon de Souza lattes
Orientador(a): Souza, Bruno Solano de Freitas
Banca de defesa: Sampaio, Gabriela Louise de Almeida, Cofré, Axel Helmut Rulf, Macambira, Simone Garcia, Fullam, Juliana Perrone Bezerra de Menezes, Souza, Bruno Solano de Freitas
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal da Bahia
Programa de Pós-Graduação: Pós-Graduação em Patologia Humana e Patologia Experimental (PGPAT) 
Departamento: Faculdade de Medicina da Bahia
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/42687
Resumo: INTRODUÇÃO: Os transtornos do espectro autista (TEA) são um grupo de condições que impactam a interação social, comunicação e comportamento. Nos últimos anos, diversas mutações em vários genes têm sido associadas ao TEA. Entre esses genes, variantes patogênicas do SCN2A têm mostrado uma forte correlação estatística com o TEA. O gene SCN2A é responsável por codificar a subunidade alfa do canal de sódio voltagem-dependente Nav1.2, altamente presente em neurônios piramidais excitatórios durante o desenvolvimento cerebral. Esses neurônios são fundamentais para a organização cortical, excitabilidade e sinaptogênese, sendo alvos comuns de várias variantes genéticas que podem contribuir para o fenótipo do TEA. Há uma demanda científica significativa para o desenvolvimento de estudos e modelos que auxiliem no estabelecimento de correlações genótipo/fenótipo. Nos últimos anos, as células-tronco de pluripotência induzida (iPSCs) e seus derivados, incluindo organoides cerebrais, têm sido propostas como ferramentas essenciais para esse propósito. Este trabalho propõe como hipótese que modelos baseados em organoides cerebrais, utilizando iPSCs de pacientes com TEA, podem contribuir significativamente para a análise de correlações genótipo/fenótipo em diferentes contextos e mutações, incluindo as variantes do gene SCN2A. MÉTODOS E RESULTADOS: Neste estudo, foram gerados e caracterizados quatro clones de iPSCs a partir de células mononucleares do sangue periférico (PBMCs) de duas pacientes com TEA portadoras de variantes patogênicas no gene SCN2A. As iPSCs foram rigorosamente caracterizadas através dos seguinte ensaios: (i) RT-PCR, citometria de fluxo e análises de imunofluorescência confirmaram a expressão de marcadores de pluripotência; (ii) o ensaio de formação de corpos embrioides demonstrou a capacidade de diferenciação nas três camadas germinativas; (iii) a análise de sequenciamento confirmou a presença das variantes SCN2A; (iv) a análise de STR autenticou as linhagens celulares; e (v) a análise de cariótipo demonstrou a integridade cromossômica das linhagens celulares. Finalmente, foram gerados organoides cerebrais a partir dessas células, fornecendo uma plataforma robusta para investigações futuras dos mecanismos fisiopatológicos do TEA, especialmente aqueles envolvendo SCN2A. Foi realizada uma revisão da literatura sobre o papel do modelo de organoides cerebrais derivados de iPSCs, utilizados para recapitular aspectos críticos do desenvolvimento cerebral humano, permitindo a análise de variações genéticas específicas e suas influências nos caminhos moleculares e celulares. Em conjunto, a análise demonstra que mutações em genes de risco para TEA, como SCN2A, convergem em um fenótipo comum de desenvolvimento neuronal assíncrono, afetando tanto neurônios excitatórios quanto inibitórios. Além disso, os organoides cerebrais, por sua composição celular, organização e estado de maturação permitem a investigação de fatores ambientais e suas interações com variantes genéticas no TEA, mostrando a relevância deste modelo para entender a complexa neurobiologia do TEA. CONCLUSÃO: Os resultados dos estudos apresentados indicam que organoides cerebrais derivados de iPSCs são ferramentas valiosas para investigar os mecanismos genéticos e ambientais subjacentes ao TEA, especialmente em relação ao gene SCN2A. Esses modelos oferecem uma oportunidade única para estabelecer correlações genótipo/fenótipo e desenvolver abordagens terapêuticas mais eficazes. O uso de organoides cerebrais pode ajudar a esclarecer os mecanismos de desenvolvimento do TEA e contribuir para o avanço da medicina personalizada, proporcionando novas perspectivas para o tratamento e a compreensão desta condição complexa.
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Nos últimos anos, as células-tronco de pluripotência induzida (iPSCs) e seus derivados, incluindo organoides cerebrais, têm sido propostas como ferramentas essenciais para esse propósito. Este trabalho propõe como hipótese que modelos baseados em organoides cerebrais, utilizando iPSCs de pacientes com TEA, podem contribuir significativamente para a análise de correlações genótipo/fenótipo em diferentes contextos e mutações, incluindo as variantes do gene SCN2A. MÉTODOS E RESULTADOS: Neste estudo, foram gerados e caracterizados quatro clones de iPSCs a partir de células mononucleares do sangue periférico (PBMCs) de duas pacientes com TEA portadoras de variantes patogênicas no gene SCN2A. As iPSCs foram rigorosamente caracterizadas através dos seguinte ensaios: (i) RT-PCR, citometria de fluxo e análises de imunofluorescência confirmaram a expressão de marcadores de pluripotência; (ii) o ensaio de formação de corpos embrioides demonstrou a capacidade de diferenciação nas três camadas germinativas; (iii) a análise de sequenciamento confirmou a presença das variantes SCN2A; (iv) a análise de STR autenticou as linhagens celulares; e (v) a análise de cariótipo demonstrou a integridade cromossômica das linhagens celulares. Finalmente, foram gerados organoides cerebrais a partir dessas células, fornecendo uma plataforma robusta para investigações futuras dos mecanismos fisiopatológicos do TEA, especialmente aqueles envolvendo SCN2A. Foi realizada uma revisão da literatura sobre o papel do modelo de organoides cerebrais derivados de iPSCs, utilizados para recapitular aspectos críticos do desenvolvimento cerebral humano, permitindo a análise de variações genéticas específicas e suas influências nos caminhos moleculares e celulares. Em conjunto, a análise demonstra que mutações em genes de risco para TEA, como SCN2A, convergem em um fenótipo comum de desenvolvimento neuronal assíncrono, afetando tanto neurônios excitatórios quanto inibitórios. Além disso, os organoides cerebrais, por sua composição celular, organização e estado de maturação permitem a investigação de fatores ambientais e suas interações com variantes genéticas no TEA, mostrando a relevância deste modelo para entender a complexa neurobiologia do TEA. CONCLUSÃO: Os resultados dos estudos apresentados indicam que organoides cerebrais derivados de iPSCs são ferramentas valiosas para investigar os mecanismos genéticos e ambientais subjacentes ao TEA, especialmente em relação ao gene SCN2A. Esses modelos oferecem uma oportunidade única para estabelecer correlações genótipo/fenótipo e desenvolver abordagens terapêuticas mais eficazes. O uso de organoides cerebrais pode ajudar a esclarecer os mecanismos de desenvolvimento do TEA e contribuir para o avanço da medicina personalizada, proporcionando novas perspectivas para o tratamento e a compreensão desta condição complexa.INTRODUCTION: Autism spectrum disorders (ASD) are a group of conditions that impact social interaction, communication, and behavior. In recent years, numerous mutations in various genes have been associated with ASD. Among these genes, pathogenic variants in SCN2A have shown a strong statistical correlation with ASD. The SCN2A gene encodes the alpha subunit of the voltage-gated sodium channel Nav1.2, which is highly expressed in excitatory pyramidal neurons during brain development. These neurons are crucial for cortical organization, excitability, and synaptogenesis, and are common targets of various genetic variants that may contribute to the ASD phenotype. There is a significant scientific demand for the development of studies and models that help establish genotype-phenotype correlations. In recent years, induced pluripotent stem cells (iPSCs) and their derivatives, including brain organoids, have been proposed as essential tools for this purpose. This work hypothesizes that brain organoid models, using iPSCs from patients with ASD, can significantly contribute to the analysis of genotype-phenotype correlations in different contexts and mutations, including SCN2A variants. METHODS AND RESULTS: In this study, four iPSC clones were generated and characterized from peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of two patients with ASD carrying pathogenic variants in the SCN2A gene. The iPSCs were rigorously characterized through the following assays: (i) RT-PCR, flow cytometry, and immunofluorescence analyses confirmed the expression of pluripotency markers; (ii) the embryoid body formation assay demonstrated the capacity for differentiation into the three germ layers; (iii) sequencing analysis confirmed the presence of SCN2A variants; (iv) STR analysis authenticated the cell lines; and (v) karyotype analysis demonstrated the chromosomal integrity of the cell lines. Finally, brain organoids were generated from these cells, providing a robust platform for future investigations into the pathophysiological mechanisms of ASD, especially those involving SCN2A. A literature review on the role of brain organoid models derived from iPSCs was conducted, highlighting their use in recapitulating critical aspects of human brain development and allowing the analysis of specific genetic variations and their influences on molecular and cellular pathways. Collectively, the analysis demonstrates that mutations in ASD risk genes, such as SCN2A, converge on a common phenotype of asynchronous neuronal development, affecting both excitatory and inhibitory neurons. Furthermore, brain organoids, due to their cellular composition, organization, and maturation state, allow the investigation of environmental factors and their interactions with genetic variants in ASD, underscoring the relevance of this model for understanding the complex neurobiology of ASD. CONCLUSION: The results of the presented studies indicate that brain organoids derived from iPSCs are valuable tools for investigating the genetic and environmental mechanisms underlying ASD, particularly regarding the SCN2A gene. These models offer a unique opportunity to establish genotype-phenotype correlations and develop more effective therapeutic approaches. The use of brain organoids can help elucidate the mechanisms of ASD development and contribute to the advancement of personalized medicine, providing new perspectives for the treatment and understanding of this complex conditionporUniversidade Federal da BahiaPós-Graduação em Patologia Humana e Patologia Experimental (PGPAT) UFBABrasilFaculdade de Medicina da BahiaAutism Spectrum DisorderSCN2AiPSCsBrain organoids.Ciências BiológicasTranstorno do Espectro AutistaSCN2AiPSCsOrganoides cerebraisGeração de iPSCs derivadas de pacientes com TEA e desenvolvimento de organoides cerebrais para a investigação das alterações funcionais associadas às variantes no gene SCN2ADoutoradoinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionSouza, Bruno Solano de FreitasSampaio, Gabriela Louise de AlmeidaCofré, Axel Helmut RulfMacambira, Simone GarciaFullam, Juliana Perrone Bezerra de MenezesSouza, Bruno Solano de Freitashttp://lattes.cnpq.br/5288688355134819Santos, John Lenon de Souzainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFBAinstname:Universidade Federal da Bahia (UFBA)instacron:UFBAORIGINALTesedeJohnFINALcorrigidaREVISAOBibliotecaJohn.pdfTesedeJohnFINALcorrigidaREVISAOBibliotecaJohn.pdfapplication/pdf12181564https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/42687/1/TesedeJohnFINALcorrigidaREVISAOBibliotecaJohn.pdff28b847899b32b426e8b570f4faeccdeMD51open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1720https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/42687/2/license.txtd9b7566281c22d808dbf8f29ff0425c8MD52open accessri/426872025-08-08 12:23:01.227open accessoai:repositorio.ufba.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufba.br/oai/requestrepositorio@ufba.bropendoar:19322025-08-08T15:23:01Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA)false
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