Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2020
Autor(a) principal: Lima Junior, Rodolfo Dantas
Orientador(a): Zampieri, Dávila de Souza
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/79202
Resumo: Melon is one of the cucurbits with great nutritional value appreciated worldwide, but its production is subject to several problems at the post-harvest level. Contamination of the fruit by fungi of the genus Fusarium can cause rot capable of compromising its consumption and consequently its commercialization. Cryptic species of fungi of this genus have become a challenge in the process of identification and control of diseases in melons due to the great similarity that exists at the morphological level. In order to promote a rapid identification and differentiation of cryptic species of phytopathogens in melon, this work used high resolution mass spectrometry together with univariate and multivariate analysis methods, for the pilot study of the possibility of differentiating lipid profiles of isolates of fungi of the Fusarium equiseti-incarnatum species complex, in front or not of healthy melon samples. The obtained data were able to distinguish the isolates belonging to the same species complex from a lipid fingerprinting pattern, indicating lipids candidate for biomarkers responsible for differentiating the isolates and which remained distinguishable after joint analysis with the lipid profile of Cucumis melo L. The statistically relevant lipids obtained from analyzes by PLS-DA, VIP and ANOVA one-way were categorized as glycerophospholipids (GP) and sphingolipids (SP), using LIPID MAPS® as a database. This study reports the first application of lipid fingerprinting by flow injection analysis in mass spectrometry for the differentiation of cryptic species of melon phytopathogenic fungi from a robust and reproducible analytical methodology combined with chemometric methods.
id UFC-7_40fb392ce4fd702192910bdfbfe094cb
oai_identifier_str oai:repositorio.ufc.br:riufc/79202
network_acronym_str UFC-7
network_name_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
repository_id_str
spelling Lima Junior, Rodolfo DantasZocolo, Guilherme JuliãoZampieri, Dávila de Souza2024-12-19T16:53:38Z2024-12-19T16:53:38Z2020LIMA JUNIOR, Rodolfo Dantas. Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS. 2020. 56 f. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2020.http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/79202Melon is one of the cucurbits with great nutritional value appreciated worldwide, but its production is subject to several problems at the post-harvest level. Contamination of the fruit by fungi of the genus Fusarium can cause rot capable of compromising its consumption and consequently its commercialization. Cryptic species of fungi of this genus have become a challenge in the process of identification and control of diseases in melons due to the great similarity that exists at the morphological level. In order to promote a rapid identification and differentiation of cryptic species of phytopathogens in melon, this work used high resolution mass spectrometry together with univariate and multivariate analysis methods, for the pilot study of the possibility of differentiating lipid profiles of isolates of fungi of the Fusarium equiseti-incarnatum species complex, in front or not of healthy melon samples. The obtained data were able to distinguish the isolates belonging to the same species complex from a lipid fingerprinting pattern, indicating lipids candidate for biomarkers responsible for differentiating the isolates and which remained distinguishable after joint analysis with the lipid profile of Cucumis melo L. The statistically relevant lipids obtained from analyzes by PLS-DA, VIP and ANOVA one-way were categorized as glycerophospholipids (GP) and sphingolipids (SP), using LIPID MAPS® as a database. This study reports the first application of lipid fingerprinting by flow injection analysis in mass spectrometry for the differentiation of cryptic species of melon phytopathogenic fungi from a robust and reproducible analytical methodology combined with chemometric methods.O melão é uma das cucurbitáceas com grande valor nutricional apreciada no mundo inteiro, porém sua produção está sujeita a diversos problemas a nível de pós-colheita. A contaminação do fruto por fungos do gênero Fusarium pode causar podridões capazes de comprometer seu consumo e consequentemente sua comercialização. Espécies crípticas de fungos desse gênero têm se tornado um desafio no processo de identificação e controle de doenças no melão devido à grande semelhança existente a nível morfológico. Com o intuito de promover uma rápida identificação e diferenciação de espécies crípticas de fitopatógenos em melão, este trabalho utilizou a espectrometria de massas de alta resolução juntamente a métodos de análise univariada e multivariada, para o estudo piloto da possibilidade de diferenciação de perfis lipídicos de isolados de fungos do complexo de espécies Fusarium equiseti-incarnatum, frente ou não a amostras de melão sadio. Os dados obtidos foram capazes de distinguir os isolados pertencentes a um mesmo complexo de espécie a partir de um padrão de fingerprinting lipídico, indicando lipídios candidatos a biomarcadores responsáveis por diferenciar os isolados e que permaneceram diferenciáveis após análise conjunta com o perfil lipídico de Cucumis melo L. Os lipídios estatisticamente relevantes, obtidos a partir de análises por PLS-DA, VIP e ANOVA one-way foram categorizados como glicerofosfolipídios (GP) e esfingolipídios (SP), utilizado o LIPID MAPS® como base de dados. Este estudo reporta a primeira aplicação do fingerprinting de lipídios por análise via flow injection em espectrometria de massas para a diferenciação de espécies crípticas de fungos fitopatógenos de melão a partir de uma metodologia analítica robusta e reprodutível aliada a métodos quimiométricos.Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MSDifferentiation of Fusarium cryptic species fungi causing melon rot (Cucumis melo L.): a lipid fingerprinting approach via ESI-QTOF-MSinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisEspectrometria de massasFingerprinting lipídicoQuimiometriaMelãoFusarium sp.Mass spectrometryLipid fingerprintingChemometricsMelonFusarium sp.CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICAinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)instname:Universidade Federal do Ceará (UFC)instacron:UFChttps://orcid.org/0000-0001-5245-9575http://lattes.cnpq.br/4655407121755208https://orcid.org/0000-0002-2702-7268http://lattes.cnpq.br/2943243250811648https://orcid.org/0000-0001-8835-0184http://lattes.cnpq.br/46265604390536902024-12-19ORIGINAL2020_dis_rdlimajunior.pdf2020_dis_rdlimajunior.pdfapplication/pdf1470092http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/79202/3/2020_dis_rdlimajunior.pdf6375ab05df48151b94161aa57f1496b7MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/79202/4/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD54riufc/792022024-12-19 13:53:39.953oai:repositorio.ufc.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufc.br/ri-oai/requestbu@ufc.br || repositorio@ufc.bropendoar:2024-12-19T16:53:39Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC) - Universidade Federal do Ceará (UFC)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS
dc.title.en.pt_BR.fl_str_mv Differentiation of Fusarium cryptic species fungi causing melon rot (Cucumis melo L.): a lipid fingerprinting approach via ESI-QTOF-MS
title Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS
spellingShingle Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS
Lima Junior, Rodolfo Dantas
CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA
Espectrometria de massas
Fingerprinting lipídico
Quimiometria
Melão
Fusarium sp.
Mass spectrometry
Lipid fingerprinting
Chemometrics
Melon
Fusarium sp.
title_short Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS
title_full Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS
title_fullStr Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS
title_full_unstemmed Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS
title_sort Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS
author Lima Junior, Rodolfo Dantas
author_facet Lima Junior, Rodolfo Dantas
author_role author
dc.contributor.co-advisor.none.fl_str_mv Zocolo, Guilherme Julião
dc.contributor.author.fl_str_mv Lima Junior, Rodolfo Dantas
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Zampieri, Dávila de Souza
contributor_str_mv Zampieri, Dávila de Souza
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA
topic CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA
Espectrometria de massas
Fingerprinting lipídico
Quimiometria
Melão
Fusarium sp.
Mass spectrometry
Lipid fingerprinting
Chemometrics
Melon
Fusarium sp.
dc.subject.ptbr.pt_BR.fl_str_mv Espectrometria de massas
Fingerprinting lipídico
Quimiometria
Melão
Fusarium sp.
dc.subject.en.pt_BR.fl_str_mv Mass spectrometry
Lipid fingerprinting
Chemometrics
Melon
Fusarium sp.
description Melon is one of the cucurbits with great nutritional value appreciated worldwide, but its production is subject to several problems at the post-harvest level. Contamination of the fruit by fungi of the genus Fusarium can cause rot capable of compromising its consumption and consequently its commercialization. Cryptic species of fungi of this genus have become a challenge in the process of identification and control of diseases in melons due to the great similarity that exists at the morphological level. In order to promote a rapid identification and differentiation of cryptic species of phytopathogens in melon, this work used high resolution mass spectrometry together with univariate and multivariate analysis methods, for the pilot study of the possibility of differentiating lipid profiles of isolates of fungi of the Fusarium equiseti-incarnatum species complex, in front or not of healthy melon samples. The obtained data were able to distinguish the isolates belonging to the same species complex from a lipid fingerprinting pattern, indicating lipids candidate for biomarkers responsible for differentiating the isolates and which remained distinguishable after joint analysis with the lipid profile of Cucumis melo L. The statistically relevant lipids obtained from analyzes by PLS-DA, VIP and ANOVA one-way were categorized as glycerophospholipids (GP) and sphingolipids (SP), using LIPID MAPS® as a database. This study reports the first application of lipid fingerprinting by flow injection analysis in mass spectrometry for the differentiation of cryptic species of melon phytopathogenic fungi from a robust and reproducible analytical methodology combined with chemometric methods.
publishDate 2020
dc.date.issued.fl_str_mv 2020
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2024-12-19T16:53:38Z
dc.date.available.fl_str_mv 2024-12-19T16:53:38Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv LIMA JUNIOR, Rodolfo Dantas. Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS. 2020. 56 f. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2020.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/79202
identifier_str_mv LIMA JUNIOR, Rodolfo Dantas. Diferenciação de espécies crípticas de fungos do gênero Fusarium causadores de podridão do pedúnculo do melão (Cucumis melo L.): uma abordagem em fingerprinting lipídico via ESI-QTOF-MS. 2020. 56 f. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2020.
url http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/79202
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
instname:Universidade Federal do Ceará (UFC)
instacron:UFC
instname_str Universidade Federal do Ceará (UFC)
instacron_str UFC
institution UFC
reponame_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
collection Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
bitstream.url.fl_str_mv http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/79202/3/2020_dis_rdlimajunior.pdf
http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/79202/4/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 6375ab05df48151b94161aa57f1496b7
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC) - Universidade Federal do Ceará (UFC)
repository.mail.fl_str_mv bu@ufc.br || repositorio@ufc.br
_version_ 1847792968488976384