Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2019
Autor(a) principal: Barroso, Wallady da Silva
Orientador(a): Silva, André Luis Coelho da
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/80224
Resumo: Ribosome inactivating proteins (RIPs) are toxins with enzymatic activity rRNA- N-glycosidase. These proteins inhibit protein synthesis by specifically cleaving the adenine residue 4324 (A 4324 ) from ribosomal RNA 28S of the ribosomal subunit 60S. This process stops the protein synthesis, leading to cell death. RIPs can be classified in type 1, 2 e 3. The main goal of this work was to isolate e characterize Jatropha podagrica Hook RIP and test its different in vitro biological activities. After collecting, cleaning the seeds, producing a flour and removing the lipids, the best protein extraction condition and purification protocols were determined. For the crude extracts (CE) the best buffer were Tris-HCl 20 mM pH 7,4. After that, a proteins precipitation with (NH 4 ) 2 SO 4 at 60% saturation was performed and denominated Fr0/60. The Fr0/60 was used for size exclusion chromatography (Sephadex G-100). After chromatography, it was obtained only one type 1 RIP, named podagrin. The podagrin showed rRNA-N-glycosidase activity and when submitted to dichroism circular analysis, podagrin presented a conformational pattern with predominance of  sheet secondary structures. It was also performed with podagrin an anti-helminth assay, against Ascaridia galli. The most efficient concentration was 5 mg/mL of podagrin, with a 100% mortality of the parasite after 72 h. With these data, it is possible to conclude that podagrin is a type 1 RIP.
id UFC-7_9cb11df587b2b778221bb51ec5357cd8
oai_identifier_str oai:repositorio.ufc.br:riufc/80224
network_acronym_str UFC-7
network_name_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
repository_id_str
spelling Barroso, Wallady da SilvaAndrade, Fábia KarineSilva, André Luis Coelho da2025-03-29T12:57:59Z2025-03-29T12:57:59Z2019BARROSO, Wallady da Silva. Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook. 2025. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia de Recursos Naturais) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2019.http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/80224Ribosome inactivating proteins (RIPs) are toxins with enzymatic activity rRNA- N-glycosidase. These proteins inhibit protein synthesis by specifically cleaving the adenine residue 4324 (A 4324 ) from ribosomal RNA 28S of the ribosomal subunit 60S. This process stops the protein synthesis, leading to cell death. RIPs can be classified in type 1, 2 e 3. The main goal of this work was to isolate e characterize Jatropha podagrica Hook RIP and test its different in vitro biological activities. After collecting, cleaning the seeds, producing a flour and removing the lipids, the best protein extraction condition and purification protocols were determined. For the crude extracts (CE) the best buffer were Tris-HCl 20 mM pH 7,4. After that, a proteins precipitation with (NH 4 ) 2 SO 4 at 60% saturation was performed and denominated Fr0/60. The Fr0/60 was used for size exclusion chromatography (Sephadex G-100). After chromatography, it was obtained only one type 1 RIP, named podagrin. The podagrin showed rRNA-N-glycosidase activity and when submitted to dichroism circular analysis, podagrin presented a conformational pattern with predominance of  sheet secondary structures. It was also performed with podagrin an anti-helminth assay, against Ascaridia galli. The most efficient concentration was 5 mg/mL of podagrin, with a 100% mortality of the parasite after 72 h. With these data, it is possible to conclude that podagrin is a type 1 RIP.Proteínas inativadoras de ribossomos (RIPs) são toxinas que possuem atividade enzimática rRNA-N-glicosidase. Essas proteínas inibem a síntese proteica clivando especificamente o resíduo da adenina 4324 (A 4324 ) do RNA ribossomal 28S da subunidade ribossomal maior 60S. Esse processo para a maquinaria celular de síntese proteica, levando à morte celular. As RIPs podem ser classificadas nos tipo 1, 2 e 3. O objetivo deste trabalho foi detectar, purificar e caracterizar a RIP de Jatropha podagrica Hook. Em adição, testar as suas diferentes atividades biológicas in vitro. Após os processos de coleta, limpeza das sementes, produção da farinha e delipidação das mesmas, foi realizada a extração de proteínas de J. podagrica e estabelecidas as melhores condições de extração e purificação da RIP podagrina. Foram realizadas extrações com diferentes tampões e pHs. A condição de extração com maior quantidade de proteínas solúveis foi a realizada em tampão Tris-HCl 20 mM pH 7,4, seguida de precipitação com (NH 4 ) 2 SO 4 60%. A fração 0/60 (Fr0/60) foi então utilizada em cromatografia de exclusão molecular Sephadex G-100. Após o processo cromatográfico foi obtido uma RIP tipo 1 pura denominada de podagrina. A podagrina possui atividade rRNA-N-glicosidase com padrões de estrutura secundária, avaliados por dicroísmo circular, com predominância de folhas-. A podagrina foi ainda avaliada quanto sua ação anti-helmíntica, contra Ascaridia galli, apresentando a maior eficiência na concentração de 5 mg/mL, sendo a taxa de mortalidade de 100% após 72h de ensaio. Com os resultados, é possível concluir que a podagrina é uma RIP tipo 1.Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hookinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisProteínas inativadoras de ribossomosJatropha podagrica HookPodagrinaRibosome inactivation proteinJatropha podagrica HookPodagrinCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)instname:Universidade Federal do Ceará (UFC)instacron:UFChttps://orcid.org/0000-0001-8026-5778http://lattes.cnpq.br/1499537335717268https://orcid.org/0000-0003-0685-6398http://lattes.cnpq.br/3701975151596050https://orcid.org/0000-0001-5452-8992http://lattes.cnpq.br/52715815013969802025-03-29ORIGINAL2019_dis_wsbarroso .pdf2019_dis_wsbarroso .pdfapplication/pdf991191http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/80224/3/2019_dis_wsbarroso%20.pdfccd2177e8f858c91399e1a7bcdfad302MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/80224/4/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD54riufc/802242025-03-29 09:58:01.372oai:repositorio.ufc.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufc.br/ri-oai/requestbu@ufc.br || repositorio@ufc.bropendoar:2025-03-29T12:58:01Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC) - Universidade Federal do Ceará (UFC)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook
title Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook
spellingShingle Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook
Barroso, Wallady da Silva
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Proteínas inativadoras de ribossomos
Jatropha podagrica Hook
Podagrina
Ribosome inactivation protein
Jatropha podagrica Hook
Podagrin
title_short Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook
title_full Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook
title_fullStr Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook
title_full_unstemmed Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook
title_sort Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook
author Barroso, Wallady da Silva
author_facet Barroso, Wallady da Silva
author_role author
dc.contributor.co-advisor.none.fl_str_mv Andrade, Fábia Karine
dc.contributor.author.fl_str_mv Barroso, Wallady da Silva
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Silva, André Luis Coelho da
contributor_str_mv Silva, André Luis Coelho da
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
topic CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Proteínas inativadoras de ribossomos
Jatropha podagrica Hook
Podagrina
Ribosome inactivation protein
Jatropha podagrica Hook
Podagrin
dc.subject.ptbr.pt_BR.fl_str_mv Proteínas inativadoras de ribossomos
Jatropha podagrica Hook
Podagrina
dc.subject.en.pt_BR.fl_str_mv Ribosome inactivation protein
Jatropha podagrica Hook
Podagrin
description Ribosome inactivating proteins (RIPs) are toxins with enzymatic activity rRNA- N-glycosidase. These proteins inhibit protein synthesis by specifically cleaving the adenine residue 4324 (A 4324 ) from ribosomal RNA 28S of the ribosomal subunit 60S. This process stops the protein synthesis, leading to cell death. RIPs can be classified in type 1, 2 e 3. The main goal of this work was to isolate e characterize Jatropha podagrica Hook RIP and test its different in vitro biological activities. After collecting, cleaning the seeds, producing a flour and removing the lipids, the best protein extraction condition and purification protocols were determined. For the crude extracts (CE) the best buffer were Tris-HCl 20 mM pH 7,4. After that, a proteins precipitation with (NH 4 ) 2 SO 4 at 60% saturation was performed and denominated Fr0/60. The Fr0/60 was used for size exclusion chromatography (Sephadex G-100). After chromatography, it was obtained only one type 1 RIP, named podagrin. The podagrin showed rRNA-N-glycosidase activity and when submitted to dichroism circular analysis, podagrin presented a conformational pattern with predominance of  sheet secondary structures. It was also performed with podagrin an anti-helminth assay, against Ascaridia galli. The most efficient concentration was 5 mg/mL of podagrin, with a 100% mortality of the parasite after 72 h. With these data, it is possible to conclude that podagrin is a type 1 RIP.
publishDate 2019
dc.date.issued.fl_str_mv 2019
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2025-03-29T12:57:59Z
dc.date.available.fl_str_mv 2025-03-29T12:57:59Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv BARROSO, Wallady da Silva. Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook. 2025. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia de Recursos Naturais) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2019.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/80224
identifier_str_mv BARROSO, Wallady da Silva. Purificação, caracterização físico-química e bioatividade de uma proteína inativadora de ribossomos de Jatropha podagrica Hook. 2025. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia de Recursos Naturais) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2019.
url http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/80224
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
instname:Universidade Federal do Ceará (UFC)
instacron:UFC
instname_str Universidade Federal do Ceará (UFC)
instacron_str UFC
institution UFC
reponame_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
collection Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
bitstream.url.fl_str_mv http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/80224/3/2019_dis_wsbarroso%20.pdf
http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/80224/4/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv ccd2177e8f858c91399e1a7bcdfad302
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC) - Universidade Federal do Ceará (UFC)
repository.mail.fl_str_mv bu@ufc.br || repositorio@ufc.br
_version_ 1847793080444387328