Avaliação do perfil de sensibilidade antimicrobiana e detecção de genes de resistência em bactérias gram-negativas isoladas de pacientes com covid-19 assistidos num hospital terciário da região norte do Ceará

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Oliveira, Maria Walcleanes Magalhães de
Orientador(a): Barbosa, Francisco César Barroso
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/76460
Resumo: Patients with COVID-19 may be at risk of concomitant bacterial infections, including hospital acquired multidrug resistant (MDR) gram-negative bacteria, and prompt administration of antibiotics in accordance with antimicrobial susceptibility reports is essential to reduce severity, complications and morbidity and mortality. The aim of this study was to evaluate the antimicrobial sensitivity profile and detect the presence of resistance genes in gram -negative bacilli (GNB) isolated from patients diagnosed with COVID -19 treated at a tertiary hospital in the Northern Region of Ceará. Microbiological data from patients with bacterial co -infections were collected by the Hospital Infection Control Committee of the aforementioned hospital from April/2021 to March/2022 and a total of 46 GN B were isolated. Bacterial identification and sensitivity profile were performed by the automated system VITEK®2 (bioMérieux) and molecular analysis to detect the genes bla KPC, bla NDM-1, bla OXA-23 and bla OXA-48 was performed by Chain Reaction Polymerase (PCR), followed by electrophoretic run in agarose gel Of the total GNB analyzed, the highest frequency was Klebsiella pneumoniae (n = 18; 39.1%), followed by Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa with 12 (26.1%) isolates of each. Regarding hospitalization, 58.7% were in the Intensive Care Unit (ICU) sector and half of the isolates were characterized as agents of Healthcare -Associated Infections (HAIs). For antimicrobial sensitivity, the highest resistance rate was found for Imipenem (60.9%), followed by Piperacillin/Tazobactam (54.3%). However, 58.7% of GNB were sensitive to Aztreonam. Among the genes encoding ESBLs, bla KPC was the most frequent, detected in 31 (67.4%) of the isolates prevalent in K. pneumoniae, and bla OXA-23 in specimens of A. baumannii (n = 26; 56 .5%). On the other hand, seven samples showed the coexistence of three genes simultaneously. Therefore, these data could be useful for gen erating important information to control the spread of these pathogens in the hospital environment, directly affecting patient safety and improving the quality of care.
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spelling Oliveira, Maria Walcleanes Magalhães deMartins, Maria Gleiciane de QueirozBarbosa, Francisco César Barroso2024-03-11T18:27:30Z2024-03-11T18:27:30Z2024-03-07OLIVEIRA, Maria Walcleanes Magalhães de. Avaliação do perfil de sensibilidade antimicrobiana e detecção de genes de resistência em bactérias gram-negativas isoladas de pacientes com covid-19 assistidos num hospital terciário da região norte do Ceará. 2024. 91 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Ciências da Saúde) - Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, Campus Sobral, Universidade Federal do Ceará, Sobral, 2024http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/76460Patients with COVID-19 may be at risk of concomitant bacterial infections, including hospital acquired multidrug resistant (MDR) gram-negative bacteria, and prompt administration of antibiotics in accordance with antimicrobial susceptibility reports is essential to reduce severity, complications and morbidity and mortality. The aim of this study was to evaluate the antimicrobial sensitivity profile and detect the presence of resistance genes in gram -negative bacilli (GNB) isolated from patients diagnosed with COVID -19 treated at a tertiary hospital in the Northern Region of Ceará. Microbiological data from patients with bacterial co -infections were collected by the Hospital Infection Control Committee of the aforementioned hospital from April/2021 to March/2022 and a total of 46 GN B were isolated. Bacterial identification and sensitivity profile were performed by the automated system VITEK®2 (bioMérieux) and molecular analysis to detect the genes bla KPC, bla NDM-1, bla OXA-23 and bla OXA-48 was performed by Chain Reaction Polymerase (PCR), followed by electrophoretic run in agarose gel Of the total GNB analyzed, the highest frequency was Klebsiella pneumoniae (n = 18; 39.1%), followed by Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa with 12 (26.1%) isolates of each. Regarding hospitalization, 58.7% were in the Intensive Care Unit (ICU) sector and half of the isolates were characterized as agents of Healthcare -Associated Infections (HAIs). For antimicrobial sensitivity, the highest resistance rate was found for Imipenem (60.9%), followed by Piperacillin/Tazobactam (54.3%). However, 58.7% of GNB were sensitive to Aztreonam. Among the genes encoding ESBLs, bla KPC was the most frequent, detected in 31 (67.4%) of the isolates prevalent in K. pneumoniae, and bla OXA-23 in specimens of A. baumannii (n = 26; 56 .5%). On the other hand, seven samples showed the coexistence of three genes simultaneously. Therefore, these data could be useful for gen erating important information to control the spread of these pathogens in the hospital environment, directly affecting patient safety and improving the quality of care.Pacientes com COVID-19 podem estar em risco de infecções bacterianas concomitantes, incluindo bactérias gram-negativas multidroga resistentes (MDR) adquiridas em ambiente hospitalar, e a administração imediata de antibióticos de acordo com os relatórios de sensibilidade antimicrobiana são essenciais para reduzir a gravidade, complicações e a morbimortalidade. O objetivo desse estudo foi avaliar o perfil de sensibilidade antimicrobiana e detectar a presença de genes de resistência em bacilos gram-negativos (BGN) isolados de pacientes com diagnóstico de COVID -19 assistidos em um hospital terciário da Região Norte do Ceará. Dados microbiológicos de pacientes com coinfecções bacterianas foram coletados pela Comissão de Controle de Infecção Hospitalar do referido hospital no período de abril/2021 a março/2022 e um total de 46 BGN foram isolados. A identificação bacteriana e o perfil de sensibilidade foram realizados pelo sistema automatizado VITEK®2 (bioMérieux) e a análise molecular para detecção dos genes bla KPC, bla NDM-1, bla OXA-23 e bla OXA-48 foi feita por Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), seguida de corrida eletroforética em gel de agarose. Do total de BGN analisados, a maior frequência foi de Klebsiella pneumoniae (n = 18; 39,1%), seguida de Acinetobacter baumannii e Pseudomonas aeruginosa com 12 (26,1%) isolados de cada . Quanto à hospitalização, 58,7% se encontravam no setor da Unidade de Terapia Intensiva ( UTI) e metade dos isolados foram caraterizados como agentes de Infecções Relacionadas à Assistência à Saúde (IRAS). Para à sensibilidade antimicrobiana, a maior taxa de resistência foi encontrada para Imipenem (60,9%), seguido d e Piperacilina/Tazobactam (54,3%). Entretanto, 58,7% dos BGN foram sensíveis ao Aztreonam. Dentre os genes que codificam Betalactamases de espectro Estendido (ESBL), o blaKPC foi o mais frequente, detectado em 31 (67,4%) dos isolados com prevalência em K. pneumoniae, e o bla OXA-23 em espécimes de A. baumannii (n = 26; 56,5%). Por outro lado, sete amostras apresentaram a coexistência de três genes simultaneamente. Portanto, esses dados poderão ser úteis para a geração de informações importantes no controle da disseminação desses patógenos no ambiente hospitalar, implicando diretamente nos eixos de segurança do paciente e melhorando a qualidade da assistência .Este documento está disponível online com base na Portaria nº 348, de 08 de dezembro de 2022, disponível em: https://biblioteca.ufc.br/wp-content/uploads/2022/12/portaria348-2022.pdf, que autoriza a digitalização e a disponibilização no Repositório Institucional (RI) da coleção retrospectiva de TCC, dissertações e teses da UFC, sem o termo de anuência prévia dos autores. Em caso de trabalhos com pedidos de patente e/ou de embargo, cabe, exclusivamente, ao autor(a) solicitar a restrição de acesso ou retirada de seu trabalho do RI, mediante apresentação de documento comprobatório à Direção do Sistema de Bibliotecas.Avaliação do perfil de sensibilidade antimicrobiana e detecção de genes de resistência em bactérias gram-negativas isoladas de pacientes com covid-19 assistidos num hospital terciário da região norte do CearáAssessment of the antimicrobial sensitivity profile and detection of resistance genes in gram-negative bacteria isolated from patients with covid-19 treated at a tertiary hospital in the northern region of CearáEvaluación del perfil de sensibilidad antimicrobiana y detección de genes de resistencia en bacterias gramnegativas aisladas de pacientes con covid-19 atendidos en un hospital terciario de la región norte de CearáÉvaluation du profil de sensibilité aux antimicrobiens et détection de gènes de résistance chez les bactéries à Gram négatif isolées de patients atteints de covid-19 traités dans un hôpital tertiaire de la région nord du Cearáinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisSARS-CoV -2Coinfecções bacterianasMultidroga resistente (MDR)Resistência antimicrobianaBetalactamasesSARS-CoV -2Bacterial co-infectionsMultidrug resistant (MDR)Antimicrobia l resistanceBetalactamasesCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)instname:Universidade Federal do Ceará (UFC)instacron:UFChttp://lattes.cnpq.br/6723377423468264https://orcid.org/0000-0002-3444-6997http://lattes.cnpq.br/32516700031328290000-0001-6966-8840http://lattes.cnpq.br/16334922394514772024-02-28ORIGINAL2024_dis_mwmoliveira.pdf2024_dis_mwmoliveira.pdfapplication/pdf2448429http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/76460/1/2024_dis_mwmoliveira.pdf74be4c970d597a441c9d30b9b62f0d25MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/76460/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52riufc/764602024-03-11 15:27:30.567oai:repositorio.ufc.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufc.br/ri-oai/requestbu@ufc.br || repositorio@ufc.bropendoar:2024-03-11T18:27:30Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC) - Universidade Federal do Ceará (UFC)false
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