Identificação e diversidade genética de rotylenchulus reniformis em áreas de cultivos de meloeiro (cucumis melo l.)

• Ano de defesa: 2018
• Autor(a) principal: Barreto, Alcileide Vieira
• Orientador(a): Holanda, Ioná Santos Araújo
• Banca de defesa: Ambrósio, Márcia Michelle de Queiroz , Bordallo, Patrícia do Nascimento , Holanda, Ioná Santos Araújo
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal Rural do Semi-Árido
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-graduação em Ambiente, Tecnologia e Sociedade
• Departamento: Departamento de Ciências Sociais Aplicadas - DCSA
• País: Brasil
• Palavras-chave em Português: Nematoide; RAPD; Variabilidade genética; Nematode; Genetic variability
• Área do conhecimento CNPq: CNPQ::CIENCIAS SOCIAIS APLICADAS
• Link de acesso: http://repositorio.ufersa.edu.br/handle/prefix/847

Este trabalho objetivou identificar através de análises microscópicas e moleculares a presença do nematoide Rotylenchulus reniformis em diferentes áreas produtoras de melão e verificar a diversidade genética. Foram coletadas 30 amostras de solos em diferentes áreas de cada fazenda, são elas: cinco do estado do Rio Grande do Norte (Dinamarca, Brazil Melon, CY Matsumoto, Itaueira e Agrícola Famosa) e uma do Ceará (Mata Fresca). Onde, as amostras foram levadas para casa de vegetação e semeadas com a cultivar de melão Vedrantais. Após 35 dias da semeadura, as plantas foram coletadas e suas raízes submetidas ao processo de coloração para identificação microscópica de R. reniformis. O DNA das raízes do meloeiro foi extraído visando as análises moleculares com os primers universais para nematoides e genes específicos para R. reniformis. Para o estudo da diversidade genética, R. reniformis foi isolado de suspensões de amostras do solo em microscópio óptico. Em seguida o DNA dos mesmos foi extraído através do kit de extração NucleoSpin Tissue (Macherey-Nagel)®. As análises do DNA foram realizadas a partir da triagem de 20 iniciadores RAPD. Os dados gerados foram analisados pelo programa Genes. Das 22 amostras de raízes avaliadas microscopicamente, apenas três revelaram a presença de fêmeas de R. reniformis. No que tange as análises moleculares com o primer universal, 15 áreas pertencentes a cinco fazendas foram positivas para a presença do DNA de nematoides. Já as análises com primers genes específicos revelaram que seis áreas, restritas a duas fazendas (Itaueira e Mata Fresca), foram confirmadas com a presença de R. reniformis. Apenas nove dos 20 iniciadores RAPD foram selecionados para a análise de diversidade, os quais geraram 67 bandas polimórficas (95,71 %) e três monomórficas (4,29%), evidenciando assim um alto polimorfismo, perfazendo uma média de 7,4 bandas polimórficas por iniciador. O iniciador com maior número de bandas polimórficas foi o OPAA-04 com 11 bandas enquanto o OPA-03 foi o iniciador que apresentou o menor número (5). Um dendrograma foi construído pelo método hierárquico UPGMA. Utilizando um ponto de corte de 0,55, verificou-se dois grupos. O primeiro formado pelas fazendas Iraueira e Mata Fresca e o segundo grupo pelas demais fazendas. As estimativas de correlação cofenética, estresse e distorção indicaram que o agrupamento foi eficiente e com pequena perda de informação. Já para o dendrograma obtido a partir de 51 amostras de R. reniformis, observou-se a formação de seis grupos. O maior grupo formado foi o V, contemplando 34 amostras, aproximadamente 66,7%. A correlação cofenética foi estimada em 0,77%. Verificou-se que o estudo não indicou nenhuma associação entre as magnitudes das dissimilaridades e a origem das amostras. Verificou-se que o maior (0,92) e o menor (0,27) valor de similaridade encontrado foi entre amostras pertencentes à Fazenda Itaueira. O estudo indica que há variabilidade entre as amostras com um coeficiente médio de dissimilaridade de 0,63 e um coeficiente de variação 14,88%. Este é o primeiro estudo da variabilidade genética com marcadores moleculares realizado com amostras oriundas de campos de produção da principal região exportadora de melão no Brasil