Variabilidade, seleção e associação genômica ampla para características de produção em café conilon

• Ano de defesa: 2025
• Autor(a) principal: Couto, Diego Pereira do
• Orientador(a): Feirreira, Adésio
• Banca de defesa: Zaidan, Iasmine Ramos , Souza, Elaine Manelli Riva , Amaral Júnior, Antônio Teixeira do , Senra, João Felipe de Brites
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal do Espírito Santo; Doutorado em Genética e Melhoramento
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento
• Departamento: Centro de Ciências Agrárias e Engenharias
• País: BR
• Palavras-chave em Português: Coffea canephora; SNPs; Melhoramento genético; Genes candidatos
• Área do conhecimento CNPq: Melhoramento Vegetal
• Link de acesso: http://repositorio.ufes.br/handle/10/20596

O Brasil é importante produtor global de Coffea canephora e o estado do Espírito Santo é o maior produtor nacional entregando cerca de 70% do total produzido no país. Este estudo avaliou 441 genótipos ao longo de dois anos, combinando análises fenotípicas e genômicas com o objetivo de realizar a seleção genômica e identificar associações genômicas amplas para características de produção em café conilon, a fim de contribuir para o desenvolvimento sustentável da cafeicultura, melhorar a produtividade dos genótipos dessa variedade e, assim, fortalecer a economia agrícola. Dentre estes genótipos 436 são de origem seminal e cinco são clones comerciais (A1, RO, P2, Verdin e RBS). As sementes foram coletadas de lavouras antigas no sul do Espírito Santo nos municípios de Alegre, Jerônimo Monteiro, Muqui, Mimoso do Sul e São Jose do Calçado. A fenotipagem foi realizada para sete características de produção, por dois anos, em um experimento no município de Mimoso do Sul, enquanto a genotipagem, baseada no método DArTseq™, permitiu a identificação de SNPs. O experimento foi implantado em 2018 em delineamento de Blocos Aumentados de Federer. Modelos mistos via REML/BLUP foram utilizados para estimar parâmetros genéticos, prever valores genotípicos e explorar a variabilidade. A análise de associação genômica ampla (GWAS) identificou 385 SNPs significativamente associados as características produtivas, sendo que 283 estavam inseridos ou próximos a genes candidatos. Esses SNPs revelaram relações com o desenvolvimento da planta e respostas a estresses, evidenciando o potencial da seleção assistida por marcadores nos programas de melhoramento do cafeeiro. A aplicação da Seleção Genômica Ampla (GWS) confirmou a eficiência da predição genômica na seleção de genótipos produtivos. Características como comprimento de ramos plagiotrópicos e peso de cem grãos apresentaram alta herdabilidade, garantindo maior precisão na seleção. Os genótipos 173.7.5, G114.5, G114.4 e G133.3 destacaram-se com ganhos expressivos, superando clones comerciais. Assim, a integração de análises fenotípicas e genômicas reforça o potencial das ferramentas (GWS e GWAS) para acelerar o melhoramento do C. canephora, contribuindo para a obtenção de cultivares mais produtivas e adaptadas