Perfil de metilação e expressão do gene CDKN2a em carcinoma epidermóide oral

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2018
Autor(a) principal: Eduardo, Vinicius Mendes
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal do Espírito Santo
BR
Mestrado em Biotecnologia
Centro de Ciências da Saúde
UFES
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
P16
61
Link de acesso: http://repositorio.ufes.br/handle/10/7126
Resumo: Determination and validation of tumor biomarkers are important to evaluate the prognosis of cancer patients. This study aimed to evaluate the methylation and expression profile of the CDKN2a gene as a possible prognostic biomarker in patients with oral squamous cell carcinoma (OSCC). We selected 115 cases with conclusive diagnosis of OSCC of these 70 with frozen tumor tissue available. Clinical-pathological data were obtained by interview and analysis of medical records. Fifty-five quality DNA samples were obtained and submitted to methylation-specific PCR, and the positive cases were submitted to Sanger sequencing to evaluate hypermethylated cytosineguanine dinucleotides. Expression of the p16 protein was assessed by immunohistochemistry. Statistical analyzes relating the results were made and the Global Survival and Disease-Free Survival curves were elaborated using the KaplanMeier method. The frequency of hypermethylation of CDKN2a in the study population was 36.4%, and most of the cytosines located in CpG regions were hypermethylated and cytosines outside the CG region also presented methylation. The expression of p16 was predominantly low (76.7%) in these samples. The methylation profile showed no association with the prognostic indicators, nor did it interfere with the Global and Disease-Free Survival. However, prognostic indicators of tumor size, clinical stage, lymph node metastasis and modality of treatment were shown to be associated with Global Survival. We conclude that the hypermethylation of the CDKN2a gene did not prove to be a good prognostic biomarker in the group analyzed in this study, but it seems to play an important role in the early stages of OSCC's carcinogenesis.
id UFES_7e832a9298792f7cb2f946d49fe01438
oai_identifier_str oai:repositorio.ufes.br:10/7126
network_acronym_str UFES
network_name_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
repository_id_str
spelling Perfil de metilação e expressão do gene CDKN2a em carcinoma epidermóide oralHypermethylationEpigeneticsOral cavityHipermetilaçãoP16EpigenéticaCavidade bucalGenesCâncerBiotecnologia farmacêuticaBiotecnologia61Determination and validation of tumor biomarkers are important to evaluate the prognosis of cancer patients. This study aimed to evaluate the methylation and expression profile of the CDKN2a gene as a possible prognostic biomarker in patients with oral squamous cell carcinoma (OSCC). We selected 115 cases with conclusive diagnosis of OSCC of these 70 with frozen tumor tissue available. Clinical-pathological data were obtained by interview and analysis of medical records. Fifty-five quality DNA samples were obtained and submitted to methylation-specific PCR, and the positive cases were submitted to Sanger sequencing to evaluate hypermethylated cytosineguanine dinucleotides. Expression of the p16 protein was assessed by immunohistochemistry. Statistical analyzes relating the results were made and the Global Survival and Disease-Free Survival curves were elaborated using the KaplanMeier method. The frequency of hypermethylation of CDKN2a in the study population was 36.4%, and most of the cytosines located in CpG regions were hypermethylated and cytosines outside the CG region also presented methylation. The expression of p16 was predominantly low (76.7%) in these samples. The methylation profile showed no association with the prognostic indicators, nor did it interfere with the Global and Disease-Free Survival. However, prognostic indicators of tumor size, clinical stage, lymph node metastasis and modality of treatment were shown to be associated with Global Survival. We conclude that the hypermethylation of the CDKN2a gene did not prove to be a good prognostic biomarker in the group analyzed in this study, but it seems to play an important role in the early stages of OSCC's carcinogenesis.Determinação e validação de biomarcadores tumorais são importantes para avaliar o prognóstico de pacientes com câncer. Este estudo teve como objetivo avaliar o perfil de metilação e de expressão do gene CDKN2a como possível a biomarcador de prognóstico em pacientes com carcinoma epidermóide oral (CEO). Foram selecionados 115 casos com diagnóstico conclusivo de CEO destes 70 apresentavam tecido tumoral congelado. Dados clínico-patológicos foram obtidos por meio de entrevista e análise de prontuários. Cinquenta e cinco amostras de DNA com qualidade obtidas foram submetidas a PCR específica para metilação, e os casos positivos foram submetidos ao sequenciamento de Sanger para avaliar os dinucleotídeos citosina-guanina hipermetilados. Expressão da proteína p16 foi avaliada por imunohistoquímica. As análises estatísticas relacionando os resultados foram feitas e as curvas de Sobrevida Global e Sobrevida Livre de Doença foram elaboradas pelo método de Kaplan-Meier. A frequência de hipermetilação do CDKN2a na população estudada foi de 36,4%, sendo que a maior parte das citosinas localizadas em regiões CpG estavam hipermetiladas e citosinas fora da região CG também apresentaram metilação. A expressão de p16 foi predominantemente baixa (76,7%) nestas amostras. O perfil de metilação não mostrou associação com os indicadores de prognóstico, bem como não interferiu na Sobrevida Global e Livre de Doença. No entanto, os indicadores de prognóstico tamanho do tumor, estádio clínico, metástase linfonodal e modalidade de tratamento mostraram estar associados à Sobrevida Global. Concluímos que a hipermetilação do gene CDKN2a não se mostrou um bom biomarcador de prognóstico no grupo analisado neste estudo, mas parece desempenhar papel importante na carcinogênese do CEO.Universidade Federal do Espírito SantoBRMestrado em BiotecnologiaCentro de Ciências da SaúdeUFESPrograma de Pós-Graduação em BiotecnologiaVon Zeidler, Sandra VentorinPaula, Flávia deMendonça, Elismauro Francisco deEduardo, Vinicius Mendes2018-08-01T21:35:05Z2018-08-012018-08-01T21:35:05Z2018-03-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisTextapplication/pdfhttp://repositorio.ufes.br/handle/10/7126porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)instname:Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)instacron:UFES2024-07-16T17:08:31Zoai:repositorio.ufes.br:10/7126Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufes.br/oai/requestriufes@ufes.bropendoar:21082024-07-16T17:08:31Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes) - Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)false
dc.title.none.fl_str_mv Perfil de metilação e expressão do gene CDKN2a em carcinoma epidermóide oral
title Perfil de metilação e expressão do gene CDKN2a em carcinoma epidermóide oral
spellingShingle Perfil de metilação e expressão do gene CDKN2a em carcinoma epidermóide oral
Eduardo, Vinicius Mendes
Hypermethylation
Epigenetics
Oral cavity
Hipermetilação
P16
Epigenética
Cavidade bucal
Genes
Câncer
Biotecnologia farmacêutica
Biotecnologia
61
title_short Perfil de metilação e expressão do gene CDKN2a em carcinoma epidermóide oral
title_full Perfil de metilação e expressão do gene CDKN2a em carcinoma epidermóide oral
title_fullStr Perfil de metilação e expressão do gene CDKN2a em carcinoma epidermóide oral
title_full_unstemmed Perfil de metilação e expressão do gene CDKN2a em carcinoma epidermóide oral
title_sort Perfil de metilação e expressão do gene CDKN2a em carcinoma epidermóide oral
author Eduardo, Vinicius Mendes
author_facet Eduardo, Vinicius Mendes
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Von Zeidler, Sandra Ventorin
Paula, Flávia de
Mendonça, Elismauro Francisco de
dc.contributor.author.fl_str_mv Eduardo, Vinicius Mendes
dc.subject.por.fl_str_mv Hypermethylation
Epigenetics
Oral cavity
Hipermetilação
P16
Epigenética
Cavidade bucal
Genes
Câncer
Biotecnologia farmacêutica
Biotecnologia
61
topic Hypermethylation
Epigenetics
Oral cavity
Hipermetilação
P16
Epigenética
Cavidade bucal
Genes
Câncer
Biotecnologia farmacêutica
Biotecnologia
61
description Determination and validation of tumor biomarkers are important to evaluate the prognosis of cancer patients. This study aimed to evaluate the methylation and expression profile of the CDKN2a gene as a possible prognostic biomarker in patients with oral squamous cell carcinoma (OSCC). We selected 115 cases with conclusive diagnosis of OSCC of these 70 with frozen tumor tissue available. Clinical-pathological data were obtained by interview and analysis of medical records. Fifty-five quality DNA samples were obtained and submitted to methylation-specific PCR, and the positive cases were submitted to Sanger sequencing to evaluate hypermethylated cytosineguanine dinucleotides. Expression of the p16 protein was assessed by immunohistochemistry. Statistical analyzes relating the results were made and the Global Survival and Disease-Free Survival curves were elaborated using the KaplanMeier method. The frequency of hypermethylation of CDKN2a in the study population was 36.4%, and most of the cytosines located in CpG regions were hypermethylated and cytosines outside the CG region also presented methylation. The expression of p16 was predominantly low (76.7%) in these samples. The methylation profile showed no association with the prognostic indicators, nor did it interfere with the Global and Disease-Free Survival. However, prognostic indicators of tumor size, clinical stage, lymph node metastasis and modality of treatment were shown to be associated with Global Survival. We conclude that the hypermethylation of the CDKN2a gene did not prove to be a good prognostic biomarker in the group analyzed in this study, but it seems to play an important role in the early stages of OSCC's carcinogenesis.
publishDate 2018
dc.date.none.fl_str_mv 2018-08-01T21:35:05Z
2018-08-01
2018-08-01T21:35:05Z
2018-03-19
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://repositorio.ufes.br/handle/10/7126
url http://repositorio.ufes.br/handle/10/7126
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv Text
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Espírito Santo
BR
Mestrado em Biotecnologia
Centro de Ciências da Saúde
UFES
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Espírito Santo
BR
Mestrado em Biotecnologia
Centro de Ciências da Saúde
UFES
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
instname:Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)
instacron:UFES
instname_str Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)
instacron_str UFES
institution UFES
reponame_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
collection Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes) - Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)
repository.mail.fl_str_mv riufes@ufes.br
_version_ 1834479067137572864