O uso da amostragem não invasiva para Tayassuidae: da coleta de amostras biológicas à genética de populações

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Nodari, Joana Zorzal
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal do Espírito Santo
BR
Doutorado em Biologia Animal
Centro de Ciências Humanas e Naturais
UFES
Programa de Pós-Graduação
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://repositorio.ufes.br/handle/10/17388
Resumo: The rapid advance of anthropogenic activities, resulting in the accelerated conversion of natural habitats, represents a significant threat to global biodiversity. This impact affects species, including large herbivores, whose habitat loss and fragmentation lead to population declines and local or global extinctions. Due to their large size, ungulates are crucial for conservation strategies such as “umbrella species”. White-lipped peccaries (Tayassu pecari) and collared peccaries (Dicotyles tajacu), belonging to the Tayassuidae family, are important subjects of study objects due to their vulnerability and overexploitation. Understanding their genetic diversity is crucial, especially when considering the use of non-invasive samples for genetic analysis. This thesis is structured in two chapters. The first evaluates the efficiency of hair traps and active search as methods of collecting hair of peccaries, and it highlights the advantages and challenges of both methods. The second chapter assesses the feasibility of using hair for genetic studies of peccary species, and it also discusses the challenges in obtaining good-quality DNA from the hair samples. The results indicate significant differences in the effectiveness of capture methods for the two species, with hair traps being more effective for white-lipped peccaries and active search for collared peccaries. Despite the high number of hairs collected and greater amplification success, we found no consensus genotypes for collared peccaries. On the other hand, four genetic markers proved promising for white-lipped peccaries, allowing preliminary analysis of their genetic diversity. Finally, this study recommends both non-invasive sampling methods for Tayassuidae and the use of hairs for genetic analysis. We also encourage further studies to improve collection techniques and molecular biology, which are essential for the conservation of both species.
id UFES_968cc57087e3f8efd6b164afd0803d34
oai_identifier_str oai:repositorio.ufes.br:10/17388
network_acronym_str UFES
network_name_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
repository_id_str
spelling O uso da amostragem não invasiva para Tayassuidae: da coleta de amostras biológicas à genética de populaçõestitle.alternativeArmadilha de pelosbusca ativaDicotyles tajacuMata AtlânticamicrosatélitesTayassu pecarisubject.br-rjbnCiências Biológicas > Genética > Genética AnimalThe rapid advance of anthropogenic activities, resulting in the accelerated conversion of natural habitats, represents a significant threat to global biodiversity. This impact affects species, including large herbivores, whose habitat loss and fragmentation lead to population declines and local or global extinctions. Due to their large size, ungulates are crucial for conservation strategies such as “umbrella species”. White-lipped peccaries (Tayassu pecari) and collared peccaries (Dicotyles tajacu), belonging to the Tayassuidae family, are important subjects of study objects due to their vulnerability and overexploitation. Understanding their genetic diversity is crucial, especially when considering the use of non-invasive samples for genetic analysis. This thesis is structured in two chapters. The first evaluates the efficiency of hair traps and active search as methods of collecting hair of peccaries, and it highlights the advantages and challenges of both methods. The second chapter assesses the feasibility of using hair for genetic studies of peccary species, and it also discusses the challenges in obtaining good-quality DNA from the hair samples. The results indicate significant differences in the effectiveness of capture methods for the two species, with hair traps being more effective for white-lipped peccaries and active search for collared peccaries. Despite the high number of hairs collected and greater amplification success, we found no consensus genotypes for collared peccaries. On the other hand, four genetic markers proved promising for white-lipped peccaries, allowing preliminary analysis of their genetic diversity. Finally, this study recommends both non-invasive sampling methods for Tayassuidae and the use of hairs for genetic analysis. We also encourage further studies to improve collection techniques and molecular biology, which are essential for the conservation of both species.O rápido avanço das atividades antrópicas, que resulta na conversão acelerada de habitats naturais, representa uma ameaça significativa à biodiversidade global. Este impacto afeta espécies, incluindo grandes herbívoros, cuja perda e fragmentação de habitat levam a declínios populacionais e extinções locais ou globais. Devido ao seu grande tamanho corporal, os ungulados são cruciais para estratégias de conservação como "espécies guarda-chuva". Notavelmente, queixadas (Tayassu pecari) e catetos (Dicotyles tajacu), pertencentes à família Tayassuidae, são importantes objetos de estudo devido a sua vulnerabilidade e superexploração. Compreender a diversidade genética dessas espécies é fundamental, principalmente quando se considera o uso de amostras não invasivas. A tese estrutura-se em dois capítulos: o primeiro avalia a eficiência de cercados e da busca ativa, como métodos de coleta de pelos de taiaçuídeos, destacando vantagens e desafios. O segundo capítulo avalia a viabilidade do uso dos pelos para estudos genéticos de ambas as espécies e os desafios na obtenção de DNA de boa qualidade. Os resultados indicam diferenças significativas na eficácia dos métodos de captura para as duas espécies, sendo os cercados mais eficazes para queixadas e busca ativa para catetos. Apesar do alto número de pelos coletados e do maior sucesso de amplificação, não foi possível obter genótipos consensos para catetos. No entanto, para queixadas, quatro marcadores genéticos mostraram-se promissores, permitindo uma análise preliminar da diversidade genética da população. Finalmente, este estudo recomenda métodos de amostragem não invasivos para Tayassuidae e o uso de pelos para análises genéticas. Também incentivamos a realização de novos estudos para aprimorar as técnicas de coleta e de biologia molecular, essenciais à conservação das espécies.Agência(s) de fomentoUniversidade Federal do Espírito SantoBRDoutorado em Biologia AnimalCentro de Ciências Humanas e NaturaisUFESPrograma de Pós-GraduaçãoBiondo, Cibelehttps://orcid.org/0000-0003-4020-4246http://lattes.cnpq.br/6879425085998990Leite, Yuri Luiz Reishttps://orcid.org/0000-0002-0248-8738http://lattes.cnpq.br/8973606745193293https://orcid.org/0000-0002-7200-7178http://lattes.cnpq.br/7399408100661099Keuroghlian, Alexinehttps://orcid.org/0000-0002-1415-4276http://lattes.cnpq.br/6215163270184930Sanches, Alexandrahttps://orcid.org/0000-0002-0349-9228http://lattes.cnpq.br/4999886032379825Rodrigues, Ana Carolina Losshttps://orcid.org/0000-0002-8298-8555http://lattes.cnpq.br/8415444657040950Kaizer, Mariane da Cruzhttps://orcid.org/0000-0001-9105-9478http://lattes.cnpq.br/2226954394104410Nodari, Joana Zorzal2024-06-19T11:45:18Z2024-06-19T11:45:18Z2024-03-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisTextapplication/pdfhttp://repositorio.ufes.br/handle/10/17388porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)instname:Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)instacron:UFES2024-08-29T11:25:04Zoai:repositorio.ufes.br:10/17388Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufes.br/oai/requestriufes@ufes.bropendoar:21082024-08-29T11:25:04Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes) - Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)false
dc.title.none.fl_str_mv O uso da amostragem não invasiva para Tayassuidae: da coleta de amostras biológicas à genética de populações
title.alternative
title O uso da amostragem não invasiva para Tayassuidae: da coleta de amostras biológicas à genética de populações
spellingShingle O uso da amostragem não invasiva para Tayassuidae: da coleta de amostras biológicas à genética de populações
Nodari, Joana Zorzal
Armadilha de pelos
busca ativa
Dicotyles tajacu
Mata Atlântica
microsatélites
Tayassu pecari
subject.br-rjbn
Ciências Biológicas > Genética > Genética Animal
title_short O uso da amostragem não invasiva para Tayassuidae: da coleta de amostras biológicas à genética de populações
title_full O uso da amostragem não invasiva para Tayassuidae: da coleta de amostras biológicas à genética de populações
title_fullStr O uso da amostragem não invasiva para Tayassuidae: da coleta de amostras biológicas à genética de populações
title_full_unstemmed O uso da amostragem não invasiva para Tayassuidae: da coleta de amostras biológicas à genética de populações
title_sort O uso da amostragem não invasiva para Tayassuidae: da coleta de amostras biológicas à genética de populações
author Nodari, Joana Zorzal
author_facet Nodari, Joana Zorzal
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Biondo, Cibele
https://orcid.org/0000-0003-4020-4246
http://lattes.cnpq.br/6879425085998990
Leite, Yuri Luiz Reis
https://orcid.org/0000-0002-0248-8738
http://lattes.cnpq.br/8973606745193293
https://orcid.org/0000-0002-7200-7178
http://lattes.cnpq.br/7399408100661099
Keuroghlian, Alexine
https://orcid.org/0000-0002-1415-4276
http://lattes.cnpq.br/6215163270184930
Sanches, Alexandra
https://orcid.org/0000-0002-0349-9228
http://lattes.cnpq.br/4999886032379825
Rodrigues, Ana Carolina Loss
https://orcid.org/0000-0002-8298-8555
http://lattes.cnpq.br/8415444657040950
Kaizer, Mariane da Cruz
https://orcid.org/0000-0001-9105-9478
http://lattes.cnpq.br/2226954394104410
dc.contributor.author.fl_str_mv Nodari, Joana Zorzal
dc.subject.por.fl_str_mv Armadilha de pelos
busca ativa
Dicotyles tajacu
Mata Atlântica
microsatélites
Tayassu pecari
subject.br-rjbn
Ciências Biológicas > Genética > Genética Animal
topic Armadilha de pelos
busca ativa
Dicotyles tajacu
Mata Atlântica
microsatélites
Tayassu pecari
subject.br-rjbn
Ciências Biológicas > Genética > Genética Animal
description The rapid advance of anthropogenic activities, resulting in the accelerated conversion of natural habitats, represents a significant threat to global biodiversity. This impact affects species, including large herbivores, whose habitat loss and fragmentation lead to population declines and local or global extinctions. Due to their large size, ungulates are crucial for conservation strategies such as “umbrella species”. White-lipped peccaries (Tayassu pecari) and collared peccaries (Dicotyles tajacu), belonging to the Tayassuidae family, are important subjects of study objects due to their vulnerability and overexploitation. Understanding their genetic diversity is crucial, especially when considering the use of non-invasive samples for genetic analysis. This thesis is structured in two chapters. The first evaluates the efficiency of hair traps and active search as methods of collecting hair of peccaries, and it highlights the advantages and challenges of both methods. The second chapter assesses the feasibility of using hair for genetic studies of peccary species, and it also discusses the challenges in obtaining good-quality DNA from the hair samples. The results indicate significant differences in the effectiveness of capture methods for the two species, with hair traps being more effective for white-lipped peccaries and active search for collared peccaries. Despite the high number of hairs collected and greater amplification success, we found no consensus genotypes for collared peccaries. On the other hand, four genetic markers proved promising for white-lipped peccaries, allowing preliminary analysis of their genetic diversity. Finally, this study recommends both non-invasive sampling methods for Tayassuidae and the use of hairs for genetic analysis. We also encourage further studies to improve collection techniques and molecular biology, which are essential for the conservation of both species.
publishDate 2024
dc.date.none.fl_str_mv 2024-06-19T11:45:18Z
2024-06-19T11:45:18Z
2024-03-01
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://repositorio.ufes.br/handle/10/17388
url http://repositorio.ufes.br/handle/10/17388
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv Text
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Espírito Santo
BR
Doutorado em Biologia Animal
Centro de Ciências Humanas e Naturais
UFES
Programa de Pós-Graduação
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Espírito Santo
BR
Doutorado em Biologia Animal
Centro de Ciências Humanas e Naturais
UFES
Programa de Pós-Graduação
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
instname:Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)
instacron:UFES
instname_str Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)
instacron_str UFES
institution UFES
reponame_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
collection Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes) - Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)
repository.mail.fl_str_mv riufes@ufes.br
_version_ 1834479111998799872