Variabilidade do CYP2D6 em cinco municípios endêmicos de malária por Plasmodium vivax na Amazônia brasileira
Ano de defesa: | 2020 |
---|---|
Autor(a) principal: | |
Orientador(a): | |
Banca de defesa: | |
Tipo de documento: | Dissertação |
Tipo de acesso: | Acesso aberto |
Idioma: | por |
Instituição de defesa: |
Universidade Federal Fluminense
Niterói |
Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
País: |
Não Informado pela instituição
|
Palavras-chave em Português: | |
Link de acesso: | https://app.uff.br/riuff/handle/1/15809 http://dx.doi.org/10.22409/PPGMPA.2020.m.10182828743 |
Resumo: | Vários estudos têm relatado falha terapêutica da associação das drogas cloroquina (CQ) e primaquina (PQ) contra a malária em municípios endêmicos. A falha terapêutica pode estar relacionada com os fatores genéticos do hospedeiro, principalmente aqueles envolvendo seu biometabolismo, onde as enzimas do sistema citocromo P450 humana desempenham importante papel. Estudos em populações africanas e asiáticas vêm caracterizando variantes alélicas nos genes CYP450/ Famílias CYP2 envolvidas no surgimento de diferentes fenótipos de biotransformação, contribuindo para a eficácia e alterando a toxicidade dos antimaláricos. O presente estudo objetiva quantificar a freqüência dos alelos variantes da CYP2D6 (2D6*4, 2D6*10 e 2D6*41) de amostras sanguíneas de pacientes infectados pelo Plasmodium vivax. Foram analisadas 220 amostras sanguíneas diagnosticadas como mono infecção pelo Plasmodium vivax, provenientes de cinco municípios da Amazônia brasileira. Foram genotipados três SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) do CYP2D6 pela técnica de “SnaPshot”. As análises estatísticas foram realizadas no ambiente R, usando o pacote “gap”. O teste do χ2 foi realizado para avaliar possíveis desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg. Para o alelo CYP2D6*10 em todos os municípios foram observadas freqüências baixas para o genótipo homozigoto polimórfico T/T. O alelo C apresentou as maiores freqüências. Para o alelo CYP2D*41 em todos os municípios foram observadas freqüências baixas genótipo homozigoto polimórfico A/A. O alelo G apresentou maiores freqüências (entre 83.3% a 94.4%) em todos os municípios estudados. Já para o alelo CYP2D6*4 foi observado maior freqüência para o genótipo heterozigoto polimórfico C/T em dois municípios. Os municípios de Porto Velho, Novo Repartimento e Goianésia do Pará a freqüência do genótipo heterozigoto polimórfico foi menor do que a do genótipo homozigoto selvagem. O alelo C apresentou as maiores freqüências. As freqüências alélicas e genotípicas dos três SNPs do CYP2D6 estudados, quando comparados entre os cinco municípios incluídos neste estudo, não mostraram associação significativa. As freqüências genotípicas para os três SNPs estavam de acordo com Equilíbrio de Hardy-Weinberg nos municípios investigadas, exceto em Goianésia do Pará para o alelo CYP2D6*4. Com base nos resultados aqui apresentados, podemos dizer que o alelo CYP2D6*4 pode alterar o risco de recaída da malária por Plasmodium vivax estabelecendo uma barreira para o sucesso do programa de controle de malária no Brasil. |
id |
UFF-2_6aaa6cc44e8ebff7765c486b82ff1423 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:app.uff.br:1/15809 |
network_acronym_str |
UFF-2 |
network_name_str |
Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) |
repository_id_str |
|
spelling |
Variabilidade do CYP2D6 em cinco municípios endêmicos de malária por Plasmodium vivax na Amazônia brasileiraMaláriaPlasmodium vivaxFarmacogenéticaPrimaquinaCYPMaláriaPlasmodium vivaxPrimaquinaCloroquinaFarmacogenéticaCitocromo P-450 CYP2D6MalariaPlasmodium vivaxPharmacogeneticsPrimaquineCYPVários estudos têm relatado falha terapêutica da associação das drogas cloroquina (CQ) e primaquina (PQ) contra a malária em municípios endêmicos. A falha terapêutica pode estar relacionada com os fatores genéticos do hospedeiro, principalmente aqueles envolvendo seu biometabolismo, onde as enzimas do sistema citocromo P450 humana desempenham importante papel. Estudos em populações africanas e asiáticas vêm caracterizando variantes alélicas nos genes CYP450/ Famílias CYP2 envolvidas no surgimento de diferentes fenótipos de biotransformação, contribuindo para a eficácia e alterando a toxicidade dos antimaláricos. O presente estudo objetiva quantificar a freqüência dos alelos variantes da CYP2D6 (2D6*4, 2D6*10 e 2D6*41) de amostras sanguíneas de pacientes infectados pelo Plasmodium vivax. Foram analisadas 220 amostras sanguíneas diagnosticadas como mono infecção pelo Plasmodium vivax, provenientes de cinco municípios da Amazônia brasileira. Foram genotipados três SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) do CYP2D6 pela técnica de “SnaPshot”. As análises estatísticas foram realizadas no ambiente R, usando o pacote “gap”. O teste do χ2 foi realizado para avaliar possíveis desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg. Para o alelo CYP2D6*10 em todos os municípios foram observadas freqüências baixas para o genótipo homozigoto polimórfico T/T. O alelo C apresentou as maiores freqüências. Para o alelo CYP2D*41 em todos os municípios foram observadas freqüências baixas genótipo homozigoto polimórfico A/A. O alelo G apresentou maiores freqüências (entre 83.3% a 94.4%) em todos os municípios estudados. Já para o alelo CYP2D6*4 foi observado maior freqüência para o genótipo heterozigoto polimórfico C/T em dois municípios. Os municípios de Porto Velho, Novo Repartimento e Goianésia do Pará a freqüência do genótipo heterozigoto polimórfico foi menor do que a do genótipo homozigoto selvagem. O alelo C apresentou as maiores freqüências. As freqüências alélicas e genotípicas dos três SNPs do CYP2D6 estudados, quando comparados entre os cinco municípios incluídos neste estudo, não mostraram associação significativa. As freqüências genotípicas para os três SNPs estavam de acordo com Equilíbrio de Hardy-Weinberg nos municípios investigadas, exceto em Goianésia do Pará para o alelo CYP2D6*4. Com base nos resultados aqui apresentados, podemos dizer que o alelo CYP2D6*4 pode alterar o risco de recaída da malária por Plasmodium vivax estabelecendo uma barreira para o sucesso do programa de controle de malária no Brasil.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroSeveral studies have related therapeutic failure of the association of drugs chloroquine (CQ) and primaquine (PQ) against malaria in endemic municipalities. A therapeutic failure may be compromised by the host's genetic factors, especially those involved in its biometabolism, where the enzymes of the cytochrome P450 system play an important role. Studies in African and Asian populations show allelic characteristics of the CYP450 / CYP2 families that do not carry out different types of biotransformation phenotypes, contributing to the effectiveness and alteration of the antimalarial toxicity. The present study aims to quantify the variation of CYP2D6 variables (2D6 * 4, 2D6 * 10 and 2D6 * 41) from blood samples from patients infected with Plasmodium vivax. 220 blood samples diagnosed as Plasmodium vivax infection, five states in the Brazilian Amazon, were analyzed. Three SNPs (single nucleotide polymorphism) of the CYP2D6 were genotyped by the “SnaPshot” technique. Since statistical statistics were not performed in the R environment, use the “gap” package. The χ2 test was performed to assess possible deviations from the Hardy-Weinberg balance. For the CYP2D6 * 10 allele in all municipalities, low frequencies were observed for the homozygous T / T polymorphic genotype. The C allele had the highest frequencies. For the CYP2D * 41 allele in all municipalities, low frequencies were observed with homozygous polymorphic A / A genotype. The G allele showed higher frequencies (between 83.3% and 94.4%) in all the studied municipalities for the CYP2D6 allele. CYP2D6* 4 a higher frequency was observed for the heterozygous C / T polymorphic genotype in two cities. The municipalities of Porto Velho, Novo Departamento and Goianésia do Pará, with a frequency of polymorphic heterozygous genotype were smaller than the wild homozygous genotype. The C allele had the highest frequencies. As allele and genotype frequencies of three CYP2D6 SNPs studied, when compared between the five municipalities included in this study, without specific association. As genetic frequencies for the three SNPs were in accordance with the Hardy-Weinberg Balance in the investigated municipalities, except in Goianésia do Pará for the CYP2D6 * 4 allele. Based on the results presented here, we can say that the CYP2D6 * 4 allele can alter the risk of Plasmodium vivax malaria relapse, establishing a barrier to the success of the malaria control program in Brazil.115f.Universidade Federal FluminenseNiteróiMachado, Ricardo Luiz DantasBaptista, Andrea Regina de SouzaMattos, Danuza P. Bastos Garcia deMuthis, MartaBanic, Dalma Mariahttp://lattes.cnpq.br/1048710810813383http://lattes.cnpq.br/0307356330748427http://lattes.cnpq.br/0048817262338815Salles, Paula Ferreira2020-11-05T18:44:47Z2020-11-05T18:44:47Z2020info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://app.uff.br/riuff/handle/1/15809Aluno de Mestradohttp://dx.doi.org/10.22409/PPGMPA.2020.m.10182828743Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 BrazilopenAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/CC-BY-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)instacron:UFF2021-07-13T03:08:28Zoai:app.uff.br:1/15809Repositório InstitucionalPUBhttps://app.uff.br/oai/requestriuff@id.uff.bropendoar:21202024-08-19T11:11:31.037199Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Variabilidade do CYP2D6 em cinco municípios endêmicos de malária por Plasmodium vivax na Amazônia brasileira |
title |
Variabilidade do CYP2D6 em cinco municípios endêmicos de malária por Plasmodium vivax na Amazônia brasileira |
spellingShingle |
Variabilidade do CYP2D6 em cinco municípios endêmicos de malária por Plasmodium vivax na Amazônia brasileira Salles, Paula Ferreira Malária Plasmodium vivax Farmacogenética Primaquina CYP Malária Plasmodium vivax Primaquina Cloroquina Farmacogenética Citocromo P-450 CYP2D6 Malaria Plasmodium vivax Pharmacogenetics Primaquine CYP |
title_short |
Variabilidade do CYP2D6 em cinco municípios endêmicos de malária por Plasmodium vivax na Amazônia brasileira |
title_full |
Variabilidade do CYP2D6 em cinco municípios endêmicos de malária por Plasmodium vivax na Amazônia brasileira |
title_fullStr |
Variabilidade do CYP2D6 em cinco municípios endêmicos de malária por Plasmodium vivax na Amazônia brasileira |
title_full_unstemmed |
Variabilidade do CYP2D6 em cinco municípios endêmicos de malária por Plasmodium vivax na Amazônia brasileira |
title_sort |
Variabilidade do CYP2D6 em cinco municípios endêmicos de malária por Plasmodium vivax na Amazônia brasileira |
author |
Salles, Paula Ferreira |
author_facet |
Salles, Paula Ferreira |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Machado, Ricardo Luiz Dantas Baptista, Andrea Regina de Souza Mattos, Danuza P. Bastos Garcia de Muthis, Marta Banic, Dalma Maria http://lattes.cnpq.br/1048710810813383 http://lattes.cnpq.br/0307356330748427 http://lattes.cnpq.br/0048817262338815 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Salles, Paula Ferreira |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Malária Plasmodium vivax Farmacogenética Primaquina CYP Malária Plasmodium vivax Primaquina Cloroquina Farmacogenética Citocromo P-450 CYP2D6 Malaria Plasmodium vivax Pharmacogenetics Primaquine CYP |
topic |
Malária Plasmodium vivax Farmacogenética Primaquina CYP Malária Plasmodium vivax Primaquina Cloroquina Farmacogenética Citocromo P-450 CYP2D6 Malaria Plasmodium vivax Pharmacogenetics Primaquine CYP |
description |
Vários estudos têm relatado falha terapêutica da associação das drogas cloroquina (CQ) e primaquina (PQ) contra a malária em municípios endêmicos. A falha terapêutica pode estar relacionada com os fatores genéticos do hospedeiro, principalmente aqueles envolvendo seu biometabolismo, onde as enzimas do sistema citocromo P450 humana desempenham importante papel. Estudos em populações africanas e asiáticas vêm caracterizando variantes alélicas nos genes CYP450/ Famílias CYP2 envolvidas no surgimento de diferentes fenótipos de biotransformação, contribuindo para a eficácia e alterando a toxicidade dos antimaláricos. O presente estudo objetiva quantificar a freqüência dos alelos variantes da CYP2D6 (2D6*4, 2D6*10 e 2D6*41) de amostras sanguíneas de pacientes infectados pelo Plasmodium vivax. Foram analisadas 220 amostras sanguíneas diagnosticadas como mono infecção pelo Plasmodium vivax, provenientes de cinco municípios da Amazônia brasileira. Foram genotipados três SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) do CYP2D6 pela técnica de “SnaPshot”. As análises estatísticas foram realizadas no ambiente R, usando o pacote “gap”. O teste do χ2 foi realizado para avaliar possíveis desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg. Para o alelo CYP2D6*10 em todos os municípios foram observadas freqüências baixas para o genótipo homozigoto polimórfico T/T. O alelo C apresentou as maiores freqüências. Para o alelo CYP2D*41 em todos os municípios foram observadas freqüências baixas genótipo homozigoto polimórfico A/A. O alelo G apresentou maiores freqüências (entre 83.3% a 94.4%) em todos os municípios estudados. Já para o alelo CYP2D6*4 foi observado maior freqüência para o genótipo heterozigoto polimórfico C/T em dois municípios. Os municípios de Porto Velho, Novo Repartimento e Goianésia do Pará a freqüência do genótipo heterozigoto polimórfico foi menor do que a do genótipo homozigoto selvagem. O alelo C apresentou as maiores freqüências. As freqüências alélicas e genotípicas dos três SNPs do CYP2D6 estudados, quando comparados entre os cinco municípios incluídos neste estudo, não mostraram associação significativa. As freqüências genotípicas para os três SNPs estavam de acordo com Equilíbrio de Hardy-Weinberg nos municípios investigadas, exceto em Goianésia do Pará para o alelo CYP2D6*4. Com base nos resultados aqui apresentados, podemos dizer que o alelo CYP2D6*4 pode alterar o risco de recaída da malária por Plasmodium vivax estabelecendo uma barreira para o sucesso do programa de controle de malária no Brasil. |
publishDate |
2020 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2020-11-05T18:44:47Z 2020-11-05T18:44:47Z 2020 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://app.uff.br/riuff/handle/1/15809 Aluno de Mestrado http://dx.doi.org/10.22409/PPGMPA.2020.m.10182828743 |
url |
https://app.uff.br/riuff/handle/1/15809 http://dx.doi.org/10.22409/PPGMPA.2020.m.10182828743 |
identifier_str_mv |
Aluno de Mestrado |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ CC-BY-SA info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ CC-BY-SA |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal Fluminense Niterói |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal Fluminense Niterói |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) instname:Universidade Federal Fluminense (UFF) instacron:UFF |
instname_str |
Universidade Federal Fluminense (UFF) |
instacron_str |
UFF |
institution |
UFF |
reponame_str |
Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) |
collection |
Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF) |
repository.mail.fl_str_mv |
riuff@id.uff.br |
_version_ |
1811823850176905216 |