Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2013
Autor(a) principal: Silva, Keila Sousa lattes
Orientador(a): Oliveira, Leandro Luís Galdino de lattes
Banca de defesa: Oliveira, Leandro Luís Galdino de, Oikawa, Márcio Katsumi, Spoto, Edmundo Sérgio
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Goiás
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-graduação em Ciência da Computação (INF)
Departamento: Instituto de Informática - INF (RG)
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/3136
Resumo: This study aims to optimize runtime performance of a system developed to aid the diagnosis of childhood pneumonia by computer. This system, called Pneumocad according Macedo (2012), aims to identify chest radiographs consistent with the disease using computational techniques for recognizing patterns in textures through decomposition of the transformed wavelets, features extracted from the decomposition and classi cation applied to radiographs. In pursuit of this optimization in terms of performance at runtime, insertion of new rays and the recovery of their radiographs similar, we used the proposed deployment of a cluster architecture of radiographs already stored in the database Pneumocad. In parallel , functionality, responsible for de ning how a radiograph is similar to another , were transferred from the source code Java to views in the database. The experiments were performed on databases that contained 183, 2.568 and 10.200 radiographs and using the Pneumo- cad of Macedo (2012) , the Pneumocad Optimized with views and without grouping and Pneumocad Optimized with views and grouping. The experiments and results show that the proposed optimization contributed to the evolution of Pneumocad and enhanced this tool to support the diagnosis of pneumonia in childhood.
id UFG-2_69b2be00cf6b09762456d9201f8c84b2
oai_identifier_str oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/3136
network_acronym_str UFG-2
network_name_str Repositório Institucional da UFG
repository_id_str
spelling Oliveira, Leandro Luís Galdino dehttp://lattes.cnpq.br/5899392002875573Oliveira, Leandro Luís Galdino deOikawa, Márcio KatsumiSpoto, Edmundo Sérgiohttp://lattes.cnpq.br/0216004271150982Silva, Keila Sousa2014-09-23T15:39:04Z2013-09-23SILVA, Keila Sousa. Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância. 2013. 148 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2013.http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/3136This study aims to optimize runtime performance of a system developed to aid the diagnosis of childhood pneumonia by computer. This system, called Pneumocad according Macedo (2012), aims to identify chest radiographs consistent with the disease using computational techniques for recognizing patterns in textures through decomposition of the transformed wavelets, features extracted from the decomposition and classi cation applied to radiographs. In pursuit of this optimization in terms of performance at runtime, insertion of new rays and the recovery of their radiographs similar, we used the proposed deployment of a cluster architecture of radiographs already stored in the database Pneumocad. In parallel , functionality, responsible for de ning how a radiograph is similar to another , were transferred from the source code Java to views in the database. The experiments were performed on databases that contained 183, 2.568 and 10.200 radiographs and using the Pneumo- cad of Macedo (2012) , the Pneumocad Optimized with views and without grouping and Pneumocad Optimized with views and grouping. The experiments and results show that the proposed optimization contributed to the evolution of Pneumocad and enhanced this tool to support the diagnosis of pneumonia in childhood.O presente estudo propõe a otimizaçao de desempenho de tempo de execu ção de um sistema desenvolvido para auxiliar o diagn ostico de pneumonia infantil por computador. Esse sistema, denominado Pneumocad, segundo Macedo (2012), visa identi car radiografi as de t órax compatí veis com a doen ça utilizando t écnicas de reconhecimento computacional de padrões em texturas por meio da decomposi ção das transformadas wavelets, das caracter sticas extra das das decomposi ções e da classi ca ção aplicadas as radiogra as. Em busca dessa otimiza ção, em termos de desempenho em tempo de execu ção, na inser ção de novas radiogra fias e na recupera ção de suas radiogra fias similares, utilizou-se a proposta da implanta c~ao de uma arquitetura de agrupamento das radiogra fias j a armazenadas na base de dados do Pneumocad. Em paralelo, as funcionalidades, respons aveis por de finir o quanto uma radiogra fia e similar a outra, foram transferidas do c odigo-fonte Java para views na base de dados. Os experimentos foram executados sobre bases de dados que continham 183, 2.568 e 10.200 radiogra fias e utilizando o Pneumocad de Macedo (2012), o Pneumocad Otimizado com views e sem agrupamento e o Pneumocad Otimizado com views e com agrupamento. Os experimentos e resultados mostram que a otimiza c~ao proposta contribuiu para a evolu ção do Pneumocad e aprimorou essa ferramenta que visa apoiar os diagn osticos de pneumonias na infância.Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-09-22T21:46:54Z No. of bitstreams: 2 Keila Sousa Silva.pdf: 7076994 bytes, checksum: b2ae0f0393e80451a0c468e865f49847 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2014-09-23T15:39:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Keila Sousa Silva.pdf: 7076994 bytes, checksum: b2ae0f0393e80451a0c468e865f49847 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)Made available in DSpace on 2014-09-23T15:39:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Keila Sousa Silva.pdf: 7076994 bytes, checksum: b2ae0f0393e80451a0c468e865f49847 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-09-23application/pdfhttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/retrieve/8385/Keila%20Sousa%20Silva.pdf.jpgporUniversidade Federal de GoiásPrograma de Pós-graduação em Ciência da Computação (INF)UFGBrasilInstituto de Informática - INF (RG)ANDRADE, A. D.; ANDRADE, J. D.; MARTELLI, C.; OLIVEIRA, R. D.; COSTA, M.; LAVAL, C.; RIBEIRO, L.; FABIO, J. E ectiveness of haemophilus in uenzae b conjugate vaccine on childhood pneumonia: a case-control study in brazil. International journal of epidemiology, 2004. BONTRAGER, K. L.; LAMPIGNANO, J. P. Tratado de Posicionamento Radiogr a co e Anatomia Associada. 6rd. ed. [S.l.]: Elsevier Editora Ltda, 2009. CARIT a, E. C.; SERAPHIM, E.; HONDA, M. O.; AZEVEDO-MARQUES, P. M. d. Implementa c~ao e avalia c~ao de um sistema de gerenciamento de imagens m edicas com suporte a recupera c~ao baseada em conte udo. Radiologia Brasileira, Scielo, v. 41, p. 331 { 336, 10 2008. ISSN 0100-3984. Dispon vel em: <http://www.scielo.br/scielo.php? script=sci arttext&pid=S0100-39842008000500012&nrm=iso>. CASTANON, C. A. B. Recupera c~ao de Imagens por Conte udo Atrav es de An alise Multiresolu c~ao por Wavelets. Tese (Doutorado) | Universidade S~ao Paulo - USP, 2003. DEITEL, H. P. D. Java How to Program. 9rd. ed. [S.l.]: Prentice Hall, 2011. DELAMARO, M. E.; NUNES, F. L. S.; SANTOS, A. P. O. Implementa c~ao de uma ferramenta para recupera c~ao de imagens mamogr a cas baseada em conte udo. In: . [S.l.]: Centro Universit ario Eur pides de Mar lia { UNIVEM, 2006. DELFINO, S. R.; NUNES, F. L. S.; SPOTO, E. S. Avalia c~ao de desempenho de sgbds gratuitos para constru c~ao de bases de imagens m edicas. In: . [S.l.]: IV SBQS - V Workshop de Inform atica M edica, 2005. DREMIN, I. M. Wavelets: Mathematics and applications. Wavelets Mathematics and Applications, CRC Press, v. 22, n. 3, p. 16, 2004. Dispon vel em: <http://arxiv.org/abs/hep-ph/0403206>. ELMASRI, R. A.; NAVATHE, S. B. Sistemas de Banco de Dados: Banco de dados e usu arios de banco de dados. 6rd. ed. S~ao Paulo, Brasil: Pearson Addison Wesley, 2011. ISBN 9788579360855. FERREIRA, J. P.; CANANI, S. F.; JOHN, n. B.; NOAL, R. B. Pediatria: Diagn ostico e Tratamento: Pneumonia. Brazil: Artmed Editora S.A., 2006. FERREIRA, T.; RASBAND, W. Imagej user guide ij 1.46r. In: . [s.n.], 2012. Dispon vel em: <http://rsbweb.nih.gov/ij/>. GONZALEZ, R. C.; WOODS, R. E. Processamento de Imagens Digitais. Brazil: Edgard Blucher, 2000. J uNIOR, W. D. B.; HORII, S. C.; PRIOR, F. W.; Van Syckle, D. E. Understanding and using dicom, the data interchange standard for biomedical imaging. Journal of the American Medical Informatics Association : JAMIA, Journal of the American Medical Informatics Association, v. 4, n. 3, p. 199{212, 1997. ISSN 1067-5027. JOHNSON, R. et al. Spring framework reference documentation table of contents. In: . SpringSource.org, 2013. Dispon vel em: <http://www.springsource.org/>. JUNIT.ORG. Junit 4. In: . JUnit.org, 2013. Dispon vel em: <http://junit.org/>. KING, G.; BAUER, C.; ANDERSEN, M. R.; BERNARD, E.; EBERSOLE, S. Hibernate - relational persistence for idiomatic java - reference documentation 3.5.6- nal. In: . Hibernate.org, 2013. Dispon vel em: <http://www.hibernate.org/>. KOBAYASHI, L. O. M. Seguran ca em imagens m edicas: uma revis~ao. p. 773{778, 2006. Dispon vel em: <http://www.incor.usp.br/spdweb/prodcient/ lesTrabalhos2006/ CBIS2006LK2.pdf>. LOZANO, C.; KUSMANTO, D.; CHUTATAPE, O. Web-based design for medical image database. In: Control, Automation, Robotics and Vision, 2002. ICARCV 2002. 7th International Conference on. [s.n.], 2002. v. 3, p. 1700{1705 vol.3. Dispon vel em: <http: //ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=1235031&isnumber=27684>. MACEDO, S. O. D. Desenvolvimento de um Sistema de Aux lio ao Diagn ostico de Pneumonia na Inf^ancia Utilizando Vis~ao Computacional. Tese (Doutorado) | Instituto de Inform atica, 2012. MATSUMOTO, l. Y. MATLAB 7 Fundamentos. 2rd. ed. Brazil: Editora Erica Ltda, 2006. MILDENBERGER, P.; EICHELBERG, M.; MARTIN, E. The dicom standard. European Radiology, v. 12, n. 4, p. 920{927, 2002. Dispon vel em: <http://medical.nema.org/>. M uLLER, H.; MICHOUX, N.; BANDON, D.; A., G. A review of content-based image retrieval systems in medical applications { clinical bene ts and future directions. Elsevier Ireland Ltda, 2004. MUCHERONI, M.; TAMAE, R.; CORREIA, V. M. Sisprodimex { um sistema distribu do de transporte de imagens m edicas. Sociedade Brasileira de Inform atica em Sa ude - SBIS, 2006. NETO, G. H.; OLIVEIRA, W. D.; VALERI, F. V. Armazenamento de imagens m edicas com interbase. In: . [S.l.]: CUML { Centro Universit ario Moura Lacerda, Bacharelado em Ci^encia da Computa c~ao. Instituto Vit orio Valeri de Diagn osticos M edicos. Ribeir~ao Preto { SP, 2004. NUNES, F. L. S. Introdu c~ao ao processamento de imagens m edicas para aux lio ao diagn ostico { uma vis~ao pr atica. In: . [S.l.]: JAI - Jornadas de Atualiza c~ao em Inform atica - XXVI Congresso da Sociedade Brasileira de Computa c~ao, 2006. OLIVEIRA, L. L. G. D. Diagn ostico Auxiliado por Computador na Detec c~ao de Pneumonias na Inf^ancia. Tese (Doutorado) | Instituto de Patologia Tropical e Sa ude P ublica, 2007. Oracle. Java. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://www.oracle.com/br/ technologies/java/overview/index.html>. PADILHA, F. D.; COTRIM, S.; MARIA, A. Inpacs - ambiente distribu do de alta disponibilidade para o armazenamento e recupera c~ao de imagens m edicas. Communications, 2008. PAULA, L. B. D.; PINHEIRO, M. G.; ROSA, N. A.; FIGUEIREDO, L. R. D.; AZEVEDO-MARQUES, P. M. D. Sistema para recupera c~ao de mamogra as com base em conte udo: Extra c~ao do vetor de caracter sticas. Revista Iluminart, v. 1, p. 124{137, 2009. PETRAKIS, E. G. M.; ORPHANOUDAKIS, S. C. Tools and Methodologies for the Indexing, Storage and Retrieval of Medical Images. [S.l.: s.n.], 1992. pgAdmin Development Team. pgadmin postgresql tools. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://www.pgadmin.org/>. PHP Group. Php. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://php.net/>. SILVA, L. M. O. da. Uma Aplica c~ao de Arvores de Decis~ao, Redes Neurais e KNN para a Identi ca c~ao de Modelos ARMA N~ao-Sazonais e Sazonais. Tese (Doutorado) | Pont ce Universidade Cat olica do Rio de Janeiro, 2005. Dispon vel em: <http://www. maxwell.lambda.ele.puc-rio.br/Busca etds.php?strSecao=resultado&nrSeq=7587@2>. SILVIO, R. P.; MEDEIROS, R. B.; ELIAS, S. Qualim : Software para treinamento na interpreta c~ao de imagens m edicas digitais. Radiol Bras, v. 41, n. 6, p. 391{395, 2008. The Apache Software Foundation. Apache tomcat. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://tomcat.apache.org/>. The Eclipse Foundation. Eclipse foundation. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://www.eclipse.org/>. The PostgreSQL Global Development Group. Postgresql 9.2.4 documentation. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://www.postgresql.org/docs/9.2/interactive/index.html>. WARDLAW, T. M.; JOHANSSON, E. W.; HODGE, M. Pneumonia: the Killer of Children. UNICEF, WHO, 2006. Dispon vel em: <http: //www.who.int/child adolescent health/documents/9280640489/en/index.html>. WHO, W. H. O. Standarization of interpretation of chest radiographs for the diagnosis of pneumonia in children. In: . [S.l.]: World Health Organization: Geneve, 2001. WHO, W. H. O. Pneumonia. In: . [S.l.]: World Health Organization: Geneve, 2012.-3303550325223384799600600600-77122667346336447683671711205811204509http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessPneumonia infantilRadiografiaImagem digitalCBIRPneumocadPostgreSQLChild pneumoniaRadiographyDigital imagingCIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAOOtimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infânciaPerformance optimization in an image retrieval system to aid diagnosis of pneumonia in childreninfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:Repositório Institucional da UFGinstname:Universidade Federal de Goiás (UFG)instacron:UFGLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82165http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/90b7d545-ffdd-44f4-998a-ec3290f77824/downloadbd3efa91386c1718a7f26a329fdcb468MD51CC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/eae11136-9949-4f1a-8aba-a3b9f164d817/download4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2fMD52license_textlicense_texttext/html; charset=utf-822302http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/c548a3e1-bd0d-4002-ada0-60483ac25d4c/download1e0094e9d8adcf16b18effef4ce7ed83MD53license_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-823148http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/002c942d-172c-4c2b-acfc-cd19c6027f8e/download9da0b6dfac957114c6a7714714b86306MD54ORIGINALKeila Sousa Silva.pdfKeila Sousa Silva.pdfDissertaçãoapplication/pdf7076994http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/75449301-7a4b-4d1b-a601-a5977c5825c4/downloadb2ae0f0393e80451a0c468e865f49847MD55TEXTKeila Sousa Silva.pdf.txtKeila Sousa Silva.pdf.txtExtracted Texttext/plain198136http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/c4db8d89-abd1-4188-a8dd-f01ea0711c6e/downloadcd34c2ef058a0d78c43932ef6936442cMD56THUMBNAILKeila Sousa Silva.pdf.jpgKeila Sousa Silva.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3817http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/9f52a2a2-77ec-4a0f-8eb8-8d66b59d315a/download6dbd791943d8384d33df1af80a36e521MD57tede/31362014-09-24 03:02:17.325http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Acesso Abertoopen.accessoai:repositorio.bc.ufg.br:tede/3136http://repositorio.bc.ufg.br/tedeRepositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.bc.ufg.br/oai/requesttasesdissertacoes.bc@ufg.bropendoar:2014-09-24T06:02:17Repositório Institucional da UFG - Universidade Federal de Goiás (UFG)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
dc.title.por.fl_str_mv Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv Performance optimization in an image retrieval system to aid diagnosis of pneumonia in children
title Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância
spellingShingle Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância
Silva, Keila Sousa
Pneumonia infantil
Radiografia
Imagem digital
CBIR
Pneumocad
PostgreSQL
Child pneumonia
Radiography
Digital imaging
CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
title_short Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância
title_full Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância
title_fullStr Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância
title_full_unstemmed Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância
title_sort Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância
author Silva, Keila Sousa
author_facet Silva, Keila Sousa
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Oliveira, Leandro Luís Galdino de
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/5899392002875573
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Oliveira, Leandro Luís Galdino de
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Oikawa, Márcio Katsumi
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Spoto, Edmundo Sérgio
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/0216004271150982
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Keila Sousa
contributor_str_mv Oliveira, Leandro Luís Galdino de
Oliveira, Leandro Luís Galdino de
Oikawa, Márcio Katsumi
Spoto, Edmundo Sérgio
dc.subject.por.fl_str_mv Pneumonia infantil
Radiografia
Imagem digital
CBIR
Pneumocad
PostgreSQL
topic Pneumonia infantil
Radiografia
Imagem digital
CBIR
Pneumocad
PostgreSQL
Child pneumonia
Radiography
Digital imaging
CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
dc.subject.eng.fl_str_mv Child pneumonia
Radiography
Digital imaging
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
description This study aims to optimize runtime performance of a system developed to aid the diagnosis of childhood pneumonia by computer. This system, called Pneumocad according Macedo (2012), aims to identify chest radiographs consistent with the disease using computational techniques for recognizing patterns in textures through decomposition of the transformed wavelets, features extracted from the decomposition and classi cation applied to radiographs. In pursuit of this optimization in terms of performance at runtime, insertion of new rays and the recovery of their radiographs similar, we used the proposed deployment of a cluster architecture of radiographs already stored in the database Pneumocad. In parallel , functionality, responsible for de ning how a radiograph is similar to another , were transferred from the source code Java to views in the database. The experiments were performed on databases that contained 183, 2.568 and 10.200 radiographs and using the Pneumo- cad of Macedo (2012) , the Pneumocad Optimized with views and without grouping and Pneumocad Optimized with views and grouping. The experiments and results show that the proposed optimization contributed to the evolution of Pneumocad and enhanced this tool to support the diagnosis of pneumonia in childhood.
publishDate 2013
dc.date.issued.fl_str_mv 2013-09-23
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2014-09-23T15:39:04Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SILVA, Keila Sousa. Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância. 2013. 148 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2013.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/3136
identifier_str_mv SILVA, Keila Sousa. Otimização de desempenho na recuperação de imagens de um sistema de auxílio ao diagnóstico de pneumonias na infância. 2013. 148 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2013.
url http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/3136
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.program.fl_str_mv -3303550325223384799
dc.relation.confidence.fl_str_mv 600
600
600
dc.relation.department.fl_str_mv -7712266734633644768
dc.relation.cnpq.fl_str_mv 3671711205811204509
dc.relation.references.por.fl_str_mv ANDRADE, A. D.; ANDRADE, J. D.; MARTELLI, C.; OLIVEIRA, R. D.; COSTA, M.; LAVAL, C.; RIBEIRO, L.; FABIO, J. E ectiveness of haemophilus in uenzae b conjugate vaccine on childhood pneumonia: a case-control study in brazil. International journal of epidemiology, 2004. BONTRAGER, K. L.; LAMPIGNANO, J. P. Tratado de Posicionamento Radiogr a co e Anatomia Associada. 6rd. ed. [S.l.]: Elsevier Editora Ltda, 2009. CARIT a, E. C.; SERAPHIM, E.; HONDA, M. O.; AZEVEDO-MARQUES, P. M. d. Implementa c~ao e avalia c~ao de um sistema de gerenciamento de imagens m edicas com suporte a recupera c~ao baseada em conte udo. Radiologia Brasileira, Scielo, v. 41, p. 331 { 336, 10 2008. ISSN 0100-3984. Dispon vel em: <http://www.scielo.br/scielo.php? script=sci arttext&pid=S0100-39842008000500012&nrm=iso>. CASTANON, C. A. B. Recupera c~ao de Imagens por Conte udo Atrav es de An alise Multiresolu c~ao por Wavelets. Tese (Doutorado) | Universidade S~ao Paulo - USP, 2003. DEITEL, H. P. D. Java How to Program. 9rd. ed. [S.l.]: Prentice Hall, 2011. DELAMARO, M. E.; NUNES, F. L. S.; SANTOS, A. P. O. Implementa c~ao de uma ferramenta para recupera c~ao de imagens mamogr a cas baseada em conte udo. In: . [S.l.]: Centro Universit ario Eur pides de Mar lia { UNIVEM, 2006. DELFINO, S. R.; NUNES, F. L. S.; SPOTO, E. S. Avalia c~ao de desempenho de sgbds gratuitos para constru c~ao de bases de imagens m edicas. In: . [S.l.]: IV SBQS - V Workshop de Inform atica M edica, 2005. DREMIN, I. M. Wavelets: Mathematics and applications. Wavelets Mathematics and Applications, CRC Press, v. 22, n. 3, p. 16, 2004. Dispon vel em: <http://arxiv.org/abs/hep-ph/0403206>. ELMASRI, R. A.; NAVATHE, S. B. Sistemas de Banco de Dados: Banco de dados e usu arios de banco de dados. 6rd. ed. S~ao Paulo, Brasil: Pearson Addison Wesley, 2011. ISBN 9788579360855. FERREIRA, J. P.; CANANI, S. F.; JOHN, n. B.; NOAL, R. B. Pediatria: Diagn ostico e Tratamento: Pneumonia. Brazil: Artmed Editora S.A., 2006. FERREIRA, T.; RASBAND, W. Imagej user guide ij 1.46r. In: . [s.n.], 2012. Dispon vel em: <http://rsbweb.nih.gov/ij/>. GONZALEZ, R. C.; WOODS, R. E. Processamento de Imagens Digitais. Brazil: Edgard Blucher, 2000. J uNIOR, W. D. B.; HORII, S. C.; PRIOR, F. W.; Van Syckle, D. E. Understanding and using dicom, the data interchange standard for biomedical imaging. Journal of the American Medical Informatics Association : JAMIA, Journal of the American Medical Informatics Association, v. 4, n. 3, p. 199{212, 1997. ISSN 1067-5027. JOHNSON, R. et al. Spring framework reference documentation table of contents. In: . SpringSource.org, 2013. Dispon vel em: <http://www.springsource.org/>. JUNIT.ORG. Junit 4. In: . JUnit.org, 2013. Dispon vel em: <http://junit.org/>. KING, G.; BAUER, C.; ANDERSEN, M. R.; BERNARD, E.; EBERSOLE, S. Hibernate - relational persistence for idiomatic java - reference documentation 3.5.6- nal. In: . Hibernate.org, 2013. Dispon vel em: <http://www.hibernate.org/>. KOBAYASHI, L. O. M. Seguran ca em imagens m edicas: uma revis~ao. p. 773{778, 2006. Dispon vel em: <http://www.incor.usp.br/spdweb/prodcient/ lesTrabalhos2006/ CBIS2006LK2.pdf>. LOZANO, C.; KUSMANTO, D.; CHUTATAPE, O. Web-based design for medical image database. In: Control, Automation, Robotics and Vision, 2002. ICARCV 2002. 7th International Conference on. [s.n.], 2002. v. 3, p. 1700{1705 vol.3. Dispon vel em: <http: //ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=1235031&isnumber=27684>. MACEDO, S. O. D. Desenvolvimento de um Sistema de Aux lio ao Diagn ostico de Pneumonia na Inf^ancia Utilizando Vis~ao Computacional. Tese (Doutorado) | Instituto de Inform atica, 2012. MATSUMOTO, l. Y. MATLAB 7 Fundamentos. 2rd. ed. Brazil: Editora Erica Ltda, 2006. MILDENBERGER, P.; EICHELBERG, M.; MARTIN, E. The dicom standard. European Radiology, v. 12, n. 4, p. 920{927, 2002. Dispon vel em: <http://medical.nema.org/>. M uLLER, H.; MICHOUX, N.; BANDON, D.; A., G. A review of content-based image retrieval systems in medical applications { clinical bene ts and future directions. Elsevier Ireland Ltda, 2004. MUCHERONI, M.; TAMAE, R.; CORREIA, V. M. Sisprodimex { um sistema distribu do de transporte de imagens m edicas. Sociedade Brasileira de Inform atica em Sa ude - SBIS, 2006. NETO, G. H.; OLIVEIRA, W. D.; VALERI, F. V. Armazenamento de imagens m edicas com interbase. In: . [S.l.]: CUML { Centro Universit ario Moura Lacerda, Bacharelado em Ci^encia da Computa c~ao. Instituto Vit orio Valeri de Diagn osticos M edicos. Ribeir~ao Preto { SP, 2004. NUNES, F. L. S. Introdu c~ao ao processamento de imagens m edicas para aux lio ao diagn ostico { uma vis~ao pr atica. In: . [S.l.]: JAI - Jornadas de Atualiza c~ao em Inform atica - XXVI Congresso da Sociedade Brasileira de Computa c~ao, 2006. OLIVEIRA, L. L. G. D. Diagn ostico Auxiliado por Computador na Detec c~ao de Pneumonias na Inf^ancia. Tese (Doutorado) | Instituto de Patologia Tropical e Sa ude P ublica, 2007. Oracle. Java. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://www.oracle.com/br/ technologies/java/overview/index.html>. PADILHA, F. D.; COTRIM, S.; MARIA, A. Inpacs - ambiente distribu do de alta disponibilidade para o armazenamento e recupera c~ao de imagens m edicas. Communications, 2008. PAULA, L. B. D.; PINHEIRO, M. G.; ROSA, N. A.; FIGUEIREDO, L. R. D.; AZEVEDO-MARQUES, P. M. D. Sistema para recupera c~ao de mamogra as com base em conte udo: Extra c~ao do vetor de caracter sticas. Revista Iluminart, v. 1, p. 124{137, 2009. PETRAKIS, E. G. M.; ORPHANOUDAKIS, S. C. Tools and Methodologies for the Indexing, Storage and Retrieval of Medical Images. [S.l.: s.n.], 1992. pgAdmin Development Team. pgadmin postgresql tools. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://www.pgadmin.org/>. PHP Group. Php. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://php.net/>. SILVA, L. M. O. da. Uma Aplica c~ao de Arvores de Decis~ao, Redes Neurais e KNN para a Identi ca c~ao de Modelos ARMA N~ao-Sazonais e Sazonais. Tese (Doutorado) | Pont ce Universidade Cat olica do Rio de Janeiro, 2005. Dispon vel em: <http://www. maxwell.lambda.ele.puc-rio.br/Busca etds.php?strSecao=resultado&nrSeq=7587@2>. SILVIO, R. P.; MEDEIROS, R. B.; ELIAS, S. Qualim : Software para treinamento na interpreta c~ao de imagens m edicas digitais. Radiol Bras, v. 41, n. 6, p. 391{395, 2008. The Apache Software Foundation. Apache tomcat. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://tomcat.apache.org/>. The Eclipse Foundation. Eclipse foundation. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://www.eclipse.org/>. The PostgreSQL Global Development Group. Postgresql 9.2.4 documentation. In: . [s.n.], 2013. Dispon vel em: <http://www.postgresql.org/docs/9.2/interactive/index.html>. WARDLAW, T. M.; JOHANSSON, E. W.; HODGE, M. Pneumonia: the Killer of Children. UNICEF, WHO, 2006. Dispon vel em: <http: //www.who.int/child adolescent health/documents/9280640489/en/index.html>. WHO, W. H. O. Standarization of interpretation of chest radiographs for the diagnosis of pneumonia in children. In: . [S.l.]: World Health Organization: Geneve, 2001. WHO, W. H. O. Pneumonia. In: . [S.l.]: World Health Organization: Geneve, 2012.
dc.rights.driver.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Goiás
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-graduação em Ciência da Computação (INF)
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFG
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv Instituto de Informática - INF (RG)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Goiás
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFG
instname:Universidade Federal de Goiás (UFG)
instacron:UFG
instname_str Universidade Federal de Goiás (UFG)
instacron_str UFG
institution UFG
reponame_str Repositório Institucional da UFG
collection Repositório Institucional da UFG
bitstream.url.fl_str_mv http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/90b7d545-ffdd-44f4-998a-ec3290f77824/download
http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/eae11136-9949-4f1a-8aba-a3b9f164d817/download
http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/c548a3e1-bd0d-4002-ada0-60483ac25d4c/download
http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/002c942d-172c-4c2b-acfc-cd19c6027f8e/download
http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/75449301-7a4b-4d1b-a601-a5977c5825c4/download
http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/c4db8d89-abd1-4188-a8dd-f01ea0711c6e/download
http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/9f52a2a2-77ec-4a0f-8eb8-8d66b59d315a/download
bitstream.checksum.fl_str_mv bd3efa91386c1718a7f26a329fdcb468
4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2f
1e0094e9d8adcf16b18effef4ce7ed83
9da0b6dfac957114c6a7714714b86306
b2ae0f0393e80451a0c468e865f49847
cd34c2ef058a0d78c43932ef6936442c
6dbd791943d8384d33df1af80a36e521
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFG - Universidade Federal de Goiás (UFG)
repository.mail.fl_str_mv tasesdissertacoes.bc@ufg.br
_version_ 1798044983412916224