Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: Graças, Larissa Estefane Cruz das lattes
Orientador(a): Danés, Marina de Arruda Camargo
Banca de defesa: Danés, Marina de Arruda Camargo, Casagrande, Daniela Rume, Dórea, João Ricardo Rebouças
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Zootecnia
Departamento: Departamento de Zootecnia
País: brasil
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/46470
Resumo: A ingestão individual de nutrientes, bem como variáveis relacionadas a esta caracteristica são essenciais dentro de um sistema de nutrição de precisão e ainda assim díficeis de medir individualmente quando se tem animais criados em grupo. Foi proposto que as informações químicas contidas nas fezes são representativas da dieta consumida e estão relacionadas à ingestão e digestibilidade. A espectroscopia no infravermelho próximo (NIRS) para analisar 234 amostras fecais de 64 vacas leiteiras em lactação alimentadas com TMR, de 5 experimentos realizados em condições semelhantes, nos quais foram analisados o CMS individual medido em um tie-stall, digestibilidade e composição da dieta consumida (PB, FDN e amido) e seleção de partículas de alimentos. Foram utilizados dois softwares para as análises estatísticas dos dados, os software The Unscrambler e Python. Os espectros foram analisados com regressor de mínimos quadrados parciais (PLSR), support vector machine (SVR), k-nearest neighbors regressor (KNNR) e gradient boosting regressor (GBR) com ou sem pré-tratamento do conjunto de dados (MSC ou SNV). Duas estratégias de validação foram testadas: remover do conjunto de treinamento todos os pontos de dados de um animal (deixar um animal de fora - LOAO) ou de um experimento (LOEO) e usar o conjunto de dados excluído para testar o algoritmo. Não foram encontradas grandes diferenças entre os algortimos, o melhor algoritimo variou de acordo com a variável estudada. A melhor estratégia de validação foi a LOAO. Para valiação dos modelos utilizamos o RMSE. O CMS apresentou erro de 2,98 Kg/d, acompanhado e valores inferiores a 0,5% para composição da dieta consumida. Para digestibilidades foram obtidos valores de RMSE inferiores a 8,71%. A melhor acurácia para seleção de partículas foi da peneira de 8mm, com erro médio de 8,85%. Para EUN a média foi de 2,65% e para EA igual a 0,23 Kg leite/ Kg MS. Concluímos que a análise de dados espectrais recebe influência de diversos fatores externos que irão determinar qual melhor método a ser utilizado para se obter melhores resultados. É importante notar que, embora os resultados sejam promissores e as estratégias de validação visem minimizar o emaranhamento biológico dentro de uma vaca ou ensaio, o conjunto de dados veio inteiramente do mesmo rebanho. Assim, é possível que o modelo seja menos preciso quando usado em um rebanho e ambientes completamente diferentes. É necessário que estes algoritmos sejam explorados, buscando pelos melhores hiperparâmetros, utilizando conjunto de dados maiores e com validação externa para verificar a aplicabilidade desses modelos.
id UFLA_0c3287794b7c3ab3d67a118e488ea3a6
oai_identifier_str oai:repositorio.ufla.br:1/46470
network_acronym_str UFLA
network_name_str Repositório Institucional da UFLA
repository_id_str
spelling 2021-06-08T16:44:27Z2021-06-08T16:44:27Z2021-06-082021-03-30GRAÇAS, L. E. C. das. Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas. 2021. 57 p. Dissertação (Mestrado em Zootecnia) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2021.https://repositorio.ufla.br/handle/1/46470A ingestão individual de nutrientes, bem como variáveis relacionadas a esta caracteristica são essenciais dentro de um sistema de nutrição de precisão e ainda assim díficeis de medir individualmente quando se tem animais criados em grupo. Foi proposto que as informações químicas contidas nas fezes são representativas da dieta consumida e estão relacionadas à ingestão e digestibilidade. A espectroscopia no infravermelho próximo (NIRS) para analisar 234 amostras fecais de 64 vacas leiteiras em lactação alimentadas com TMR, de 5 experimentos realizados em condições semelhantes, nos quais foram analisados o CMS individual medido em um tie-stall, digestibilidade e composição da dieta consumida (PB, FDN e amido) e seleção de partículas de alimentos. Foram utilizados dois softwares para as análises estatísticas dos dados, os software The Unscrambler e Python. Os espectros foram analisados com regressor de mínimos quadrados parciais (PLSR), support vector machine (SVR), k-nearest neighbors regressor (KNNR) e gradient boosting regressor (GBR) com ou sem pré-tratamento do conjunto de dados (MSC ou SNV). Duas estratégias de validação foram testadas: remover do conjunto de treinamento todos os pontos de dados de um animal (deixar um animal de fora - LOAO) ou de um experimento (LOEO) e usar o conjunto de dados excluído para testar o algoritmo. Não foram encontradas grandes diferenças entre os algortimos, o melhor algoritimo variou de acordo com a variável estudada. A melhor estratégia de validação foi a LOAO. Para valiação dos modelos utilizamos o RMSE. O CMS apresentou erro de 2,98 Kg/d, acompanhado e valores inferiores a 0,5% para composição da dieta consumida. Para digestibilidades foram obtidos valores de RMSE inferiores a 8,71%. A melhor acurácia para seleção de partículas foi da peneira de 8mm, com erro médio de 8,85%. Para EUN a média foi de 2,65% e para EA igual a 0,23 Kg leite/ Kg MS. Concluímos que a análise de dados espectrais recebe influência de diversos fatores externos que irão determinar qual melhor método a ser utilizado para se obter melhores resultados. É importante notar que, embora os resultados sejam promissores e as estratégias de validação visem minimizar o emaranhamento biológico dentro de uma vaca ou ensaio, o conjunto de dados veio inteiramente do mesmo rebanho. Assim, é possível que o modelo seja menos preciso quando usado em um rebanho e ambientes completamente diferentes. É necessário que estes algoritmos sejam explorados, buscando pelos melhores hiperparâmetros, utilizando conjunto de dados maiores e com validação externa para verificar a aplicabilidade desses modelos.The individual intake of nutrients, as well as variables related to this characteristic are essential within a system of precision nutrition and yet difficult to measure individually when you have group-raised animals. It has been proposed that the chemical information contained in the faeces is representative of the diet consumed and is related to ingestion and digestibility. Near infrared spectroscopy (NIRS) was used to analyze 234 faecal samples from 64 lactating dairy cows fed with TMR, from 5 experiments carried out under similar conditions, in which the individual CMS measured in a tie-stall, digestibility and composition of the consumed diet (CP, NDF and starch) and food selection (Sorting starch and NDF). Two softwares were used for the statistical analysis of the data, the software The Unscrambler and Python. The spectra were analyzed with partial least squares regressor (PLSR), support vector machine regression (SVR), K- nearest neighbor regression (KNNR) and gradient boosting regression (GBR) with or without pretreatment of the set of data (MSC or SNV). Two validation strategies were tested: remove from the training set all data points of an animal (leaving an animal out - LOAO) or an experiment (LOEO) and use the excluded data set to test the algorithm. The results demonstrate that the most used analysis for NIR spectra (PLSR with pretreatments) was not adequate to deal with the complex interaction existing between the analyzed parameters and the faecal spectra. No major differences were found between the algorithms, the best algorithm varied according to the variable studied. The best validation strategy was LOAO. To evaluate the models, we used the RMSE. The CMS showed an error of 2.98 kg / d, accompanied by values below 0.5% for the composition of the consumed diet. For digestibility, RMSE values below 8.71% were obtained. The best accuracy for particle selection was the 8mm sieve, with an average error of 8.85%. For EUN the average was 2.65% and for EA equal to 0.23 Kg milk / Kg DM. As conclusion the analysis of spectral data is influenced by several external factors that will determine which method is best to be used to obtain better results. It is important to note that, although the results are promising and the validation strategies are aimed at minimizing biological entanglement within a cow or assay, the data set came entirely from the same herd. Thus, it is possible that the model is less accurate when used in a completely different herd and environment. It is necessary that these algorithms be explored, looking for the best hyperparameters, using a larger data set and with external validation to verify the applicability of these models.Universidade Federal de LavrasPrograma de Pós-Graduação em ZootecniaUFLAbrasilDepartamento de ZootecniaZootecniaMachine learningNutrição de precisãoEspectroscopia no infravermelho próximoGado leiteiro - NutriçãoValidation strategiesNear infrared spectroscopyPrecision nutritionEspectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadasInfrared reflectance spectroscopy near faeces to predict nutritional variables of confined dairy cowsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisDanés, Marina de Arruda CamargoDanés, Marina de Arruda CamargoCasagrande, Daniela RumeDórea, João Ricardo Rebouçashttp://lattes.cnpq.br/3860688376482429Graças, Larissa Estefane Cruz dasinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLAORIGINALDISSERTAÇÃO_Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas.pdfDISSERTAÇÃO_Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas.pdfapplication/pdf1330996https://repositorio.ufla.br/bitstreams/a6fb939d-34e3-4332-9d66-f63cfc1d7f83/download966c417d5e6dd900c21db3bafd4b2946MD51trueAnonymousREADLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/88594f58-99f8-4e22-9325-2238e8e9a9b4/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD52falseAnonymousREADTEXTDISSERTAÇÃO_Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas.pdf.txtDISSERTAÇÃO_Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas.pdf.txtExtracted texttext/plain102953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/5fb40354-99d4-4b9f-a832-f872b6c2be42/downloadb48555ebeea9a3cb1a0df7e36f5305ddMD53falseAnonymousREADTHUMBNAILDISSERTAÇÃO_Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas.pdf.jpgDISSERTAÇÃO_Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3661https://repositorio.ufla.br/bitstreams/1205e16a-7ac8-4b22-a6a4-7e9f5abb63a9/download12427161f3cdc35e8c3dd0c204f44945MD54falseAnonymousREAD1/464702025-08-05 17:40:56.474open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/46470https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-05T20:40:56Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv Infrared reflectance spectroscopy near faeces to predict nutritional variables of confined dairy cows
title Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas
spellingShingle Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas
Graças, Larissa Estefane Cruz das
Zootecnia
Machine learning
Nutrição de precisão
Espectroscopia no infravermelho próximo
Gado leiteiro - Nutrição
Validation strategies
Near infrared spectroscopy
Precision nutrition
title_short Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas
title_full Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas
title_fullStr Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas
title_full_unstemmed Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas
title_sort Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas
author Graças, Larissa Estefane Cruz das
author_facet Graças, Larissa Estefane Cruz das
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Danés, Marina de Arruda Camargo
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Danés, Marina de Arruda Camargo
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Casagrande, Daniela Rume
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Dórea, João Ricardo Rebouças
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3860688376482429
dc.contributor.author.fl_str_mv Graças, Larissa Estefane Cruz das
contributor_str_mv Danés, Marina de Arruda Camargo
Danés, Marina de Arruda Camargo
Casagrande, Daniela Rume
Dórea, João Ricardo Rebouças
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Zootecnia
topic Zootecnia
Machine learning
Nutrição de precisão
Espectroscopia no infravermelho próximo
Gado leiteiro - Nutrição
Validation strategies
Near infrared spectroscopy
Precision nutrition
dc.subject.por.fl_str_mv Machine learning
Nutrição de precisão
Espectroscopia no infravermelho próximo
Gado leiteiro - Nutrição
Validation strategies
Near infrared spectroscopy
Precision nutrition
description A ingestão individual de nutrientes, bem como variáveis relacionadas a esta caracteristica são essenciais dentro de um sistema de nutrição de precisão e ainda assim díficeis de medir individualmente quando se tem animais criados em grupo. Foi proposto que as informações químicas contidas nas fezes são representativas da dieta consumida e estão relacionadas à ingestão e digestibilidade. A espectroscopia no infravermelho próximo (NIRS) para analisar 234 amostras fecais de 64 vacas leiteiras em lactação alimentadas com TMR, de 5 experimentos realizados em condições semelhantes, nos quais foram analisados o CMS individual medido em um tie-stall, digestibilidade e composição da dieta consumida (PB, FDN e amido) e seleção de partículas de alimentos. Foram utilizados dois softwares para as análises estatísticas dos dados, os software The Unscrambler e Python. Os espectros foram analisados com regressor de mínimos quadrados parciais (PLSR), support vector machine (SVR), k-nearest neighbors regressor (KNNR) e gradient boosting regressor (GBR) com ou sem pré-tratamento do conjunto de dados (MSC ou SNV). Duas estratégias de validação foram testadas: remover do conjunto de treinamento todos os pontos de dados de um animal (deixar um animal de fora - LOAO) ou de um experimento (LOEO) e usar o conjunto de dados excluído para testar o algoritmo. Não foram encontradas grandes diferenças entre os algortimos, o melhor algoritimo variou de acordo com a variável estudada. A melhor estratégia de validação foi a LOAO. Para valiação dos modelos utilizamos o RMSE. O CMS apresentou erro de 2,98 Kg/d, acompanhado e valores inferiores a 0,5% para composição da dieta consumida. Para digestibilidades foram obtidos valores de RMSE inferiores a 8,71%. A melhor acurácia para seleção de partículas foi da peneira de 8mm, com erro médio de 8,85%. Para EUN a média foi de 2,65% e para EA igual a 0,23 Kg leite/ Kg MS. Concluímos que a análise de dados espectrais recebe influência de diversos fatores externos que irão determinar qual melhor método a ser utilizado para se obter melhores resultados. É importante notar que, embora os resultados sejam promissores e as estratégias de validação visem minimizar o emaranhamento biológico dentro de uma vaca ou ensaio, o conjunto de dados veio inteiramente do mesmo rebanho. Assim, é possível que o modelo seja menos preciso quando usado em um rebanho e ambientes completamente diferentes. É necessário que estes algoritmos sejam explorados, buscando pelos melhores hiperparâmetros, utilizando conjunto de dados maiores e com validação externa para verificar a aplicabilidade desses modelos.
publishDate 2021
dc.date.submitted.none.fl_str_mv 2021-03-30
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2021-06-08T16:44:27Z
dc.date.available.fl_str_mv 2021-06-08T16:44:27Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2021-06-08
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv GRAÇAS, L. E. C. das. Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas. 2021. 57 p. Dissertação (Mestrado em Zootecnia) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2021.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufla.br/handle/1/46470
identifier_str_mv GRAÇAS, L. E. C. das. Espectroscopia de reflectância no infravermelho próximo de fezes para predizer variáveis nutricionais de vacas leiteiras confinadas. 2021. 57 p. Dissertação (Mestrado em Zootecnia) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2021.
url https://repositorio.ufla.br/handle/1/46470
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Lavras
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Zootecnia
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFLA
dc.publisher.country.fl_str_mv brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv Departamento de Zootecnia
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Lavras
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFLA
instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron:UFLA
instname_str Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron_str UFLA
institution UFLA
reponame_str Repositório Institucional da UFLA
collection Repositório Institucional da UFLA
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufla.br/bitstreams/a6fb939d-34e3-4332-9d66-f63cfc1d7f83/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/88594f58-99f8-4e22-9325-2238e8e9a9b4/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/5fb40354-99d4-4b9f-a832-f872b6c2be42/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/1205e16a-7ac8-4b22-a6a4-7e9f5abb63a9/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 966c417d5e6dd900c21db3bafd4b2946
760884c1e72224de569e74f79eb87ce3
b48555ebeea9a3cb1a0df7e36f5305dd
12427161f3cdc35e8c3dd0c204f44945
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)
repository.mail.fl_str_mv nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br
_version_ 1854947767165648896