Análise das estruturas nativa e mutante Gly96Ala da 5-enolpiruvil shikimato-3-fosfato sintase (EPSPs) via ancoramento molecular in silico com inibidores e estudo mecanístico

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2009
Autor(a) principal: Caetano, Melissa Soares
Orientador(a): Ramalho, Teodorico de Castro
Banca de defesa: Sousa, Raimundo Vicente de, Oliveira, Luiz Carlos Alves de, Franca, Tanos Celmar Costa
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
Programa de Pós-Graduação: DQI - Programa de Pós-graduação
Departamento: Não Informado pela instituição
País: BRASIL
Palavras-chave em Português:
Glifosato
EPSP sintase
Modelagem molecular
Glyphosate
EPSP synthase
Molecular docking
Área do conhecimento CNPq:
CNPQ_NÃO_INFORMADO
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/1600
Resumo: Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agroquímica, área de concentração em Agroquímica, para a obtenção do título de Mestre.
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spelling 2014-01-30T11:25:03Z2014-01-30T11:25:03Z201420142009-03-19CAETANO, M. S. Análise das estruturas nativa e mutante Gly96Ala da 5-enolpiruvil shikimato-3-fosfato sintase (EPSPs) via ancoramento molecular in silico com inibidores e estudo mecanístico. 2009. 103 p. Dissertação (Mestrado em Agroquímica)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009.https://repositorio.ufla.br/handle/1/1600Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agroquímica, área de concentração em Agroquímica, para a obtenção do título de Mestre.AgroquímicaA alta freqüência de contaminação do solo por herbicidas sugere a necessidade de herbicidas mais ativos e mais seletivos. Glifosato é o componente ativo de um dos herbicidas mais utilizados, o qual é também um potente inibidor da EPSP sintase. Ela é a enzima chave na via do ácido chiquímico, o qual é encontrado apenas em plantas e alguns microorganismos. Então, EPSP sintase é tida como um alvo promissor para herbicidas. Nesta linha, foram realizados no presente trabalho estudos de modelagem molecular usando simulações de dinâmica molecular e técnicas DFT para entender a interação entre glifosato e análogos com as enzimas EPSP sintase nativa e mutante Gli96Ala. Em adição, foi investigado o mecanismo de reação do substrato natural. Os resultados indicam alguns pontos chave para o desenvolvimento de novos derivados seletivos do glifosato.The high frequency of contamination by herbicides suggests the need for more active and selective herbicides. Glyphosate is the active component of one of the top-selling herbicides, which is also a potent EPSP synthase inhibitor. That is a key enzyme in the shikimic acid pathway, which is found only in plants and some microorganisms. Thus, EPSP synthase is regarded as a promissing target for herbicides. In this line, molecular modeling studies using molecular dynamics simulations and DFT techniques were performed in the present work, in order to understand the interaction of glyphosate and its analogs with the wild type enzyme and Gly96Ala mutant EPSP synthase. In addition, we also investigated the reaction mechanism of the natural substrate. Our findings indicate some key points for the designing of new selective glyphosate derivates.UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASDQI - Programa de Pós-graduaçãoUFLABRASILCNPQ_NÃO_INFORMADOGlifosatoEPSP sintaseModelagem molecularGlyphosateEPSP synthaseMolecular dockingAnálise das estruturas nativa e mutante Gly96Ala da 5-enolpiruvil shikimato-3-fosfato sintase (EPSPs) via ancoramento molecular in silico com inibidores e estudo mecanísticoAnalysis of wild type and mutant Gly96Ala structures of EPSP synthase by molecular docking in silico with inhibitors and mechanistic studyinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisRamalho, Teodorico de CastroSousa, Raimundo Vicente deOliveira, Luiz Carlos Alves deFranca, Tanos Celmar CostaCaetano, Melissa Soaresinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLAORIGINALDISSERTAÇÃO Análise das estruturas nativa e mutante....pdfDISSERTAÇÃO Análise das estruturas nativa e mutante....pdfapplication/pdf1210131https://repositorio.ufla.br/bitstreams/1f02940f-f3b2-4b97-9f78-48aa0d8d69bb/downloadf4b2d76262ca5079ef2351eaa3ad7c7bMD51trueAnonymousREADLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/f6599ad0-7ac9-48f5-9933-ad74a9ef07ea/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD52falseAnonymousREADTEXTDISSERTAÇÃO Análise das estruturas nativa e mutante....pdf.txtDISSERTAÇÃO Análise das estruturas nativa e mutante....pdf.txtExtracted texttext/plain102914https://repositorio.ufla.br/bitstreams/a4e24576-446d-4010-8fc8-9c9c9b3a515e/download0853683496bf3774af7c3ca22e43e0a1MD53falseAnonymousREADTHUMBNAILDISSERTAÇÃO Análise das estruturas nativa e mutante....pdf.jpgDISSERTAÇÃO Análise das estruturas nativa e mutante....pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2744https://repositorio.ufla.br/bitstreams/fdfe1cfb-fb0e-48b7-8d2d-efb3368626c0/downloadafd9a841016821761884834fd871600cMD54falseAnonymousREAD1/16002025-08-05 16:01:32.939open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/1600https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-05T19:01:32Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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