Análise de genes associados a regiões promotoras de expressão de caráter tecido-específico em bananeiras (Musa spp)

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2011
Autor(a) principal: Ribeiro, Luciene de Oliveira
Orientador(a): Paiva, Luciano Vilela
Banca de defesa: Bordallo, Patrícia do Nascimento, Diniz, Leandro Eugenio Cardamone
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
Escola de Ciências Agrárias de Lavras (ESAL)
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Agronomia/Fisiologia Vegetal
Departamento: Departamento de Biologia (DBI)
País: BRASIL
Palavras-chave em Português:
Promotores
Expressão tecido-específica
RT-PCR
Tissue-specific expression
Promoters
Área do conhecimento CNPq:
Ciências Agrárias
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/2426
Resumo: Biologia Molecular
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spelling 2014-08-08T12:53:33Z2014-08-08T12:53:33Z2014-08-082011-07-18RIBEIRO, L. de O. Análise de genes associados a regiões promotoras de expressão de caráter tecido-específico em bananeiras (Musa spp.). 2011. 66 p. Dissertação (Mestrado em Agronomia/Fisiologia Vegetal)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2011.https://repositorio.ufla.br/handle/1/2426Universidade Federal de LavrasEscola de Ciências Agrárias de Lavras (ESAL)Programa de Pós-Graduação em Agronomia/Fisiologia VegetalUFLABRASILDepartamento de Biologia (DBI)Ciências AgráriasPromotoresExpressão tecido-específicaRT-PCRTissue-specific expressionPromotersAnálise de genes associados a regiões promotoras de expressão de caráter tecido-específico em bananeiras (Musa spp)Analysis of genes associated with expression promoter regions of tissue-specific type in banana (Musa spp.)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisPaiva, Luciano VilelaBordallo, Patrícia do NascimentoDiniz, Leandro Eugenio CardamoneDiniz, Leandro Eugenio CardamoneRibeiro, Luciene de OliveiraBiologia MolecularA bananeira é uma espécie pertencente à família Musaceae típica de regiões tropicais e subtropicais, que apresenta grande importância econômica e social no mundo, uma vez que constitui fonte de renda e alimento para milhões de pessoas. O cultivo da bananeira é afetado por diversos problemas causados por fungos, bactérias, vírus, nematóides e insetos, além de estresses abióticos. Uma das estratégias para a solução desses problemas é a geração de novas variedades com resistência a doenças e pragas e mais tolerantes às adversidades climáticas. Isto se dá mediante o desenvolvimento de programas de melhoramento genético, baseados em métodos convencionais ou biotecnológicos, que possibilitam a obtenção de genótipos superiores. Neste contexto, o emprego de técnicas de engenharia genética como a caracterização de promotores tecido-específicos favorece a aplicação de técnicas mais refinadas de manipulação do genoma como a cisgenia, a qual visa o manejo dos genes da própria espécie em questão. No presente trabalho, foram utilizadas sequências gênicas com potencial para expressão tecido-específica previamente selecionadas em um virtual screening realizado no banco de dados DATAmusa. A partir destas sequências foram desenhados primers que posteriormente foram submetidos a análise qualitativa (RT-PCR) e quantitativa (qPCR) em sete tecidos diferentes (Polpa verde, Polpa madura, Casca verde, Casca madura, Folha, Flor e Raiz) de duas cultivares de bananeira (Prata Anã e Grande Naine), pertencentes a grupos genéticos distintos (AAB e AAA, respectivamente). Dos 23 genes previamente selecionados, foi possível identificar após análise qualitativa, seis genes que apresentaram expressão tecido-específica. Estes foram avaliados quantitativamente (qPCR) e ao final foi possível identificar um gene tecido-específico para raiz de Prata Anã. Desta forma, identificando a seqüência gênica deduz-se a presença do promotor tecido-específico.The banana tree is a species of the family Musaceae typical of tropical and subtropical regions, which has an economic and social importance to the world, as a source of income and food for millions of people. The cultivation of bananas is affected by various problems caused by fungi, bacteria, viruses, nematodes and insects, and abiotic stresses. One of the strategies for solving these problems is the generation of new varieties with resistance to diseases and pests and more tolerant to adverse weather. This is done through the development of breeding programs based on conventional or biotechnological methods, which enable the achievement of superior genotypes. In this context, the use of genetic engineering techniques such as characterization of tissue-specific promoters favors the application of more refined techniques of manipulation of the genome as cisgenia, which aims at the management of the genes of their own species. In this study, we used gene sequences with potential for tissue-specific expression in a previously selected virtual screening performed in the database DATAmusa. From these sequences were designed primers that were subsequently subjected to qualitative analysis (RT-PCR) and quantitative (qPCR) in seven different tissues (Green pulp, Pulp ripe, Green bark, Mature bark, Leaves, Flowers and Root) of two cultivars banana (Prata Anã and Grande Naine), belonging to different genetic groups (AAA and AAB, respectively). From the 23 genes previously selected, it was possible to identify after the qualitative analysis, six genes that showed tissue-specific expression. They were evaluated quantitatively (qPCR) and in the end it was possible to identify a gene tissue-specific root Prata Anã. Thus, identifying the gene sequence we can deduce the presence of tissue-specific promoter.info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLAORIGINALDISSERTAÇÃO_Análise de genes associados a regiões promotoras de expressão de caráter tecido-específico em bananeiras (Musa spp).pdfDISSERTAÇÃO_Análise de genes associados a regiões promotoras de expressão de caráter tecido-específico em bananeiras (Musa spp).pdfapplication/pdf3284580https://repositorio.ufla.br/bitstreams/67f6124f-a447-402c-b2f2-021ae7cdf6dd/download88c34622333b8f71604156b6d34c19feMD51trueAnonymousREADLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/3f4733b1-8dec-48f4-9e8a-a29407ebe965/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD52falseAnonymousREADTEXTDISSERTAÇÃO_Análise de genes associados a regiões promotoras de expressão de caráter tecido-específico em bananeiras (Musa spp).pdf.txtDISSERTAÇÃO_Análise de genes associados a regiões promotoras de expressão de caráter tecido-específico em bananeiras (Musa spp).pdf.txtExtracted texttext/plain94758https://repositorio.ufla.br/bitstreams/8aebe792-5842-43bc-a4f5-f7b247b6673f/downloada15341101ef5f9d5349303722e6bded8MD53falseAnonymousREADTHUMBNAILDISSERTAÇÃO_Análise de genes associados a regiões promotoras de expressão de caráter tecido-específico em bananeiras (Musa spp).pdf.jpgDISSERTAÇÃO_Análise de genes associados a regiões promotoras de expressão de caráter tecido-específico em bananeiras (Musa spp).pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3237https://repositorio.ufla.br/bitstreams/84105d3a-ade0-4e1b-9370-6e3cbd71e9ca/downloadf264dfaa5e86eba6095a8f506c0db6b5MD54falseAnonymousREAD1/24262025-08-06 08:30:02.315open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/2426https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-06T11:30:02Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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