Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2018
Autor(a) principal: Mattos, Nathália Gomes lattes
Orientador(a): Andrade, Alan Carvalho
Banca de defesa: Paiva, Luciano Vilela, Veiga, Adriano Delly
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal
Departamento: Não especifica vinculação com nenhum departamento
País: brasil
Palavras-chave em Português:
Marcadores SNPs
Café - Clones
Compatibilidade de clones
SNPs markers
Coffee - Clones
Compatibility of clones
Área do conhecimento CNPq:
Melhoramento vegetal
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/31985
Resumo: Coffea canephora é uma planta perene, pertencente à família Rubiaceae, diploide (2n = 2 × = 22), alógama, que apresenta alta variabilidade genética, e por consequência, sua lavoura é formada a partir de clones. No cenário mundial, o café é uma das commodities agrícolas mais importantes e o Brasil é o maior produtor, com cerca de 30% da produção mundial. C. canephora corresponde a 37% da produção mundial e 24% da brasileira. A espécie C. canephora apresenta autoincompatibilidade do tipo gametofítica, onde o grão de pólen não deve compartilhar o mesmo alelo da planta receptora. O presente trabalho estudou a compatibilidade existente entre 13 clones de C. canephora, denominados CCEs, por meio de marcadores SNPs. A metodologia utilizada foi eficiente em reconstruir o pedigree de progênies de 10 clones CCE, identificando corretamente o parental materno na quase totalidade das plantas analisadas. Os resultados obtidos, também sugerem uma similaridade genotípica de 99,8 % entre os clones CCE04 e CCE11, sugerindo que essas plantas podem ser idênticas. As análises de parentais realizadas com o programa Cervus, mostrou-se eficiente em inferir sobre a compatibilidade entre os clones testados, no qual o clone CCE07 se mostrou compatível com todos os outros CCEs testados, o que poderia indicar um alto potencial produtivo deste clone, o que foi confirmado com dados experimentais.
id UFLA_5b564c581359ae408e9a90c8dca41222
oai_identifier_str oai:repositorio.ufla.br:1/31985
network_acronym_str UFLA
network_name_str Repositório Institucional da UFLA
repository_id_str
spelling 2018-11-29T14:51:32Z2018-11-29T14:51:32Z2018-11-292018-03-01MATTOS, N. G. Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs. 2018. 70 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal)-Universidade Federal de Lavras, 2018.https://repositorio.ufla.br/handle/1/31985Coffea canephora é uma planta perene, pertencente à família Rubiaceae, diploide (2n = 2 × = 22), alógama, que apresenta alta variabilidade genética, e por consequência, sua lavoura é formada a partir de clones. No cenário mundial, o café é uma das commodities agrícolas mais importantes e o Brasil é o maior produtor, com cerca de 30% da produção mundial. C. canephora corresponde a 37% da produção mundial e 24% da brasileira. A espécie C. canephora apresenta autoincompatibilidade do tipo gametofítica, onde o grão de pólen não deve compartilhar o mesmo alelo da planta receptora. O presente trabalho estudou a compatibilidade existente entre 13 clones de C. canephora, denominados CCEs, por meio de marcadores SNPs. A metodologia utilizada foi eficiente em reconstruir o pedigree de progênies de 10 clones CCE, identificando corretamente o parental materno na quase totalidade das plantas analisadas. Os resultados obtidos, também sugerem uma similaridade genotípica de 99,8 % entre os clones CCE04 e CCE11, sugerindo que essas plantas podem ser idênticas. As análises de parentais realizadas com o programa Cervus, mostrou-se eficiente em inferir sobre a compatibilidade entre os clones testados, no qual o clone CCE07 se mostrou compatível com todos os outros CCEs testados, o que poderia indicar um alto potencial produtivo deste clone, o que foi confirmado com dados experimentais.Conilon coffee belongs to the Coffea canephora species, which is a diploid (2n = 2 × = 22), perennial, allogamous plant with a high genetic variability. Accordingly, the production of clonal varieties is of great value for the success of crop. Coffee is one of the most important agricultural commodities in the world. Brazil is the largest producer, responding by 30% of the world production. C. canephora comprises 37% of the world production and 24% of the Brazilian coffee production. C. canephora has gametophytic self-incompatibility, when haploid pollen matches one of the same allele present in the diploid style causing pollen rejection. Therefore, the objective of this work was to study the compatibility between 13 clones of C. canephora, denominated CCEs, by SNPs markers. Our methodology was efficient to reconstruct the pedigree of 10 CCEs progenies, identifying correctly the maternal parent in most analyzed plants for all CCEs, with the use of SNPs markers. Results have also shown a genotypic similarity of 99.8% between CCE04 and CCE11 clones, suggesting that these plants may be identical. Parental analyzes performed with the Cervus Software proved to be efficient to inferring the compatibility between all tested clones, and the CCE07 clone was compatible with all other CCEs tested, which could indicate a high productive potential for this clone, which was experimentally confirmed.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Universidade Federal de LavrasPrograma de Pós-Graduação em Biotecnologia VegetalUFLAbrasilNão especifica vinculação com nenhum departamentoMelhoramento vegetalMarcadores SNPsCafé - ClonesCompatibilidade de clonesSNPs markersCoffee - ClonesCompatibility of clonesEstudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPsStudy of compatibility between Coffea canephora clones by SNPs markersinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisAndrade, Alan CarvalhoPaiva, Luciano VilelaVeiga, Adriano Dellyhttp://lattes.cnpq.br/2577201490304253Mattos, Nathália Gomesinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLAORIGINALDISSERTAÇÃO_Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs.pdfDISSERTAÇÃO_Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs.pdfapplication/pdf1250377https://repositorio.ufla.br/bitstreams/7dfdbb43-a258-4c4d-b53b-785ff96d738d/download0d17f6381e91334305ab4aa67aeba8c0MD51trueAnonymousREADLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/53e2c598-4d58-4f40-a329-5fae78093cda/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD52falseAnonymousREADTEXTDISSERTAÇÃO_Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs.pdf.txtDISSERTAÇÃO_Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs.pdf.txtExtracted texttext/plain102248https://repositorio.ufla.br/bitstreams/22146845-4d1d-49b1-b0c9-0f6230774f7b/downloadcaa39cc5b9c001a3bd0f5bb58e1b67f9MD53falseAnonymousREADTHUMBNAILDISSERTAÇÃO_Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs.pdf.jpgDISSERTAÇÃO_Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3155https://repositorio.ufla.br/bitstreams/a06ce20a-bf68-4fe0-a3d2-2010cb27dabe/downloadc4fe55480610200c11a398a5ba650088MD54falseAnonymousREAD1/319852025-08-07 09:15:26.01open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/31985https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-07T12:15:26Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv Study of compatibility between Coffea canephora clones by SNPs markers
title Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs
spellingShingle Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs
Mattos, Nathália Gomes
Melhoramento vegetal
Marcadores SNPs
Café - Clones
Compatibilidade de clones
SNPs markers
Coffee - Clones
Compatibility of clones
title_short Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs
title_full Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs
title_fullStr Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs
title_full_unstemmed Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs
title_sort Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs
author Mattos, Nathália Gomes
author_facet Mattos, Nathália Gomes
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Andrade, Alan Carvalho
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Paiva, Luciano Vilela
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Veiga, Adriano Delly
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/2577201490304253
dc.contributor.author.fl_str_mv Mattos, Nathália Gomes
contributor_str_mv Andrade, Alan Carvalho
Paiva, Luciano Vilela
Veiga, Adriano Delly
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Melhoramento vegetal
topic Melhoramento vegetal
Marcadores SNPs
Café - Clones
Compatibilidade de clones
SNPs markers
Coffee - Clones
Compatibility of clones
dc.subject.por.fl_str_mv Marcadores SNPs
Café - Clones
Compatibilidade de clones
SNPs markers
Coffee - Clones
Compatibility of clones
description Coffea canephora é uma planta perene, pertencente à família Rubiaceae, diploide (2n = 2 × = 22), alógama, que apresenta alta variabilidade genética, e por consequência, sua lavoura é formada a partir de clones. No cenário mundial, o café é uma das commodities agrícolas mais importantes e o Brasil é o maior produtor, com cerca de 30% da produção mundial. C. canephora corresponde a 37% da produção mundial e 24% da brasileira. A espécie C. canephora apresenta autoincompatibilidade do tipo gametofítica, onde o grão de pólen não deve compartilhar o mesmo alelo da planta receptora. O presente trabalho estudou a compatibilidade existente entre 13 clones de C. canephora, denominados CCEs, por meio de marcadores SNPs. A metodologia utilizada foi eficiente em reconstruir o pedigree de progênies de 10 clones CCE, identificando corretamente o parental materno na quase totalidade das plantas analisadas. Os resultados obtidos, também sugerem uma similaridade genotípica de 99,8 % entre os clones CCE04 e CCE11, sugerindo que essas plantas podem ser idênticas. As análises de parentais realizadas com o programa Cervus, mostrou-se eficiente em inferir sobre a compatibilidade entre os clones testados, no qual o clone CCE07 se mostrou compatível com todos os outros CCEs testados, o que poderia indicar um alto potencial produtivo deste clone, o que foi confirmado com dados experimentais.
publishDate 2018
dc.date.submitted.none.fl_str_mv 2018-03-01
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2018-11-29T14:51:32Z
dc.date.available.fl_str_mv 2018-11-29T14:51:32Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2018-11-29
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv MATTOS, N. G. Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs. 2018. 70 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal)-Universidade Federal de Lavras, 2018.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufla.br/handle/1/31985
identifier_str_mv MATTOS, N. G. Estudo da compatibilidade entre clones de Coffea canephora por meio de marcadores SNPs. 2018. 70 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal)-Universidade Federal de Lavras, 2018.
url https://repositorio.ufla.br/handle/1/31985
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Lavras
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFLA
dc.publisher.country.fl_str_mv brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv Não especifica vinculação com nenhum departamento
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Lavras
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFLA
instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron:UFLA
instname_str Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron_str UFLA
institution UFLA
reponame_str Repositório Institucional da UFLA
collection Repositório Institucional da UFLA
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufla.br/bitstreams/7dfdbb43-a258-4c4d-b53b-785ff96d738d/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/53e2c598-4d58-4f40-a329-5fae78093cda/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/22146845-4d1d-49b1-b0c9-0f6230774f7b/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/a06ce20a-bf68-4fe0-a3d2-2010cb27dabe/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 0d17f6381e91334305ab4aa67aeba8c0
760884c1e72224de569e74f79eb87ce3
caa39cc5b9c001a3bd0f5bb58e1b67f9
c4fe55480610200c11a398a5ba650088
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)
repository.mail.fl_str_mv nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br
_version_ 1854947709237067776

Registros relacionados