Prospecção de transcritos codificadores de quitinases em dados de RNA-Seq da formiga cortadeira Atta sexdens

• Ano de defesa: 2023
• Autor(a) principal: Flores, Lorrana Verdi
• Orientador(a): Nunes, José Airton Rodrigues
• Banca de defesa: Soares, Filippe Elias de Freitas, Macedo, Leonardo Lima Pepino de, Bueno Filho, Júlio Sílvio de Sousa, Marçal, Tiago de Souza
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-graduação em Biotecnologia Vegetal
• Departamento: Departamento de Biologia
• País: brasil
• Palavras-chave em Português: Formigas cultivadoras de fungo; Transcritoma; 18-glicosil-hidrolases; Saúva-limão; Fungus-farming ants; Transcriptome; Leaf-cutting ants; Leucoagaricus gongylophorus
• Área do conhecimento CNPq: Fitossanidade
• Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/56405

A formiga cortadeira Atta sexdens apresenta ampla distribuição no Brasil e é considerada um importante inseto-praga de diversas culturas agrícolas devido à sua intensa atividade de forrageio de material vegetal fresco. A intensa desfolhação dessas formigas ocorre em virtude da necessidade de fornecerem alimentos para cultivo do fungo (Leucoagaricus gongylophorus) com o qual vivem em simbiose e do qual também se alimentam. Embora muito se saiba sobre a bioecologia destes insetos, ainda são poucos os estudos de validação da função gênica de famílias proteicas que desempenham funções importantes no desenvolvimento das formigas cortadeiras, uma vez que são quase inexistentes os dados moleculares disponíveis para estas espécies. O objetivo deste trabalho consistiu em obter o transcritoma da formiga cortadeira A. sexdens proveniente do sequenciamento de RNA de cinco amostras biológicas (larva inteira, intestino de larva, formiga forrageadora inteira, cabeça e intestino de formiga forrageadora), visando identificar transcritos codificadores de quitinases, que são enzimas envolvidas na rota de degradação da quitina - um importante polissacarídeo componente de matrizes extracelulares e que desempenha diversas funções nos insetos. A partir dos dados brutos do sequenciamento das amostras foi conduzida análise de qualidade e, posteriormente, as leituras processadas foram utilizadas na montagem de novo do transcritoma por meio da ferramenta Trinity. A predição de ORFs (do inglês - Open Reading Frames) ocorreu a partir de dados de similaridade e identificação de domínios proteicos, com identificação de 45.253 sequências candidatas a transcritos codificadores. Deste total, 36.639 sequências apresentaram ao menos um domínio depositado no banco de dados Pfam, sendo que foi possível anotar 24.392 sequências contendo ortólogos diretos nos bancos de dados disponíveis no eggNOG. De maneira geral, os transcritos presentes em maior quantidade no transcritoma de A. sexdens se enquadraram na categoria de mecanismos de transdução de sinais. Após a análise filogenética foram identificados 23 transcritos codificadores de quitinases, divididos em 11 grupos de quitinases comumente encontradas em insetos. De modo geral, quinze das quitinases identificadas em A. sexdens apresentaram todos os domínios esperados. Portanto, com a identificação in silico de potenciais candidatas a quitinases no transcritoma de A. sexdens será possível ampliar o conhecimento molecular e fisiológico acerca da espécie e contribuir com estudos posteriores que visem elucidar o papel destas enzimas no desenvolvimento da formiga cortadeira Atta sexdens.