Análise de expressão gênica de membros da família SAUR durante a embriogênese somática de Coffea arabica

• Ano de defesa: 2017
• Autor(a) principal: Zanin, Fabiana Couto
• Orientador(a): Diniz, Leandro Eugenio Cardamone
• Banca de defesa: Barreto, Horllys Gomes, Paiva, Luciano Vilela, Diniz, Leandro Eugenio Cardamone
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal
• Departamento: Não especifica vinculação com nenhum departamento
• País: brasil
• Palavras-chave em Português: Café - Embriogênese somática; RNA-seq; Café - Melhoramento genético; Coffee - Somatic embryogenesis; Coffee - Genetic Improvment
• Área do conhecimento CNPq: Tecnologia e Utilização de Produtos Florestais
• Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/13436

Tendo em vista a importância do processo de embriogênese somática para a obtenção em larga escala de embriões produtivos selecionados e para pesquisas de melhoramento genético, o presente trabalho objetivou-se por caracterizar os genes SAUR em Coffea canephora e analisar a expressão gênica de alguns membros da família durante a embriogênese somática, além de especular suas possíveis funções. A análise in silico da família gênica foi realizada a partir da comparação de proteínas SAUR já caracterizadas em outras espécies com sequências de café distribuídas no banco de dados Coffee Genome Hub, que passaram por análise de redundância e presença do domínio conservado característico dos genes. Foi construída uma biblioteca de transcritos de C. arabica a partir de amostras de cDNA de calos não embriogênicos (CNE), calos embriogênicos (CE) e suspensões celulares (ECS) sequenciadas, onde foram identificados genes SAUR diferencialmente expressos. O perfil de expressão foi então analisado por RT-qPCR em amostras de C. arabica. Em C. canephora foram encontrados 31 membros da família SAUR, destes, 8 encontraram-se diferencialmente expressos nas bibliotecas sequenciadas e o perfil dos genes SAUR5, 12, 13, 18 e 20 foram analisados in vivo no presente trabalho. Ainda são necessários estudos mais aprofundados para determinar as funções de cada um dos genes analisados durante a embriogênese somática, mas os resultados obtidos parecem estar de acordo com outros estudos de que os genes SAUR são induzidos por auxina e estão, em grande parte, envolvidos com expansão e elongação celular.