Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2011
Autor(a) principal: Barreto, Horllys Gomes
Orientador(a): Chalfun Junior, Antonio
Banca de defesa: Paiva, Luciano Vilela, Benedito, Vagner Augusto
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
Programa de Pós-Graduação: PPBV - Programa de Pós-graduação em Biotecnologia Vegetal
Departamento: Não Informado pela instituição
País: BRASIL
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/2051
Resumo: Apesar dos vários estudos que abordaram a fisiologia e os processos de desenvolvimento do café, muitos aspectos diretamente relacionados com a qualidade do café ainda requerem uma melhor compreensão, como o processo de regulação do florescimento. A maturação desuniforme dos frutos do cafeeiro, gerada pelo florescimento sequencial encontrado nessa espécie, afeta diretamente a sua produtividade e leva a aumentos nos custos de produção e também a uma bebida de menor qualidade. Assim, objetivando uma melhor compreensão do processo de florescimento do café (Coffea arabica), realizou-se neste trabalho a identificação e caracterização dos genes FLOWERING LOCUS C, FRIGIDA, REDUCED VERNALIZATION RESPONSE 2 e VERNALIZATION INSENSITIVE 3 em café. Análises in silico realizadas no banco de ESTs (Expressed Sequence Tags) CAFEST permitiram a identificação dos genes estudados, os quais tiveram suas sequências confirmadas. As análises de expressão realizadas pela técnica da PCR quantitativa em tempo-real (qPCR) mostraram que os quatro genes foram expressos em todos os tecidos analisados (raízes, folhas de plantas submetidas ao estresse hídrico, folhas, e flores) e sugeriram que todos estejam envolvidos na regulação do florescimento em café. Estudos futuros que envolvam mutantes para esses genes em plantas- modelo e em café possibilitarão um melhor entendimento das funções desempenhadas por cada um desses genes no florescimento, assim como uma melhor compreensão desse processo como um todo.
id UFLA_aa6fbcea29b74f6fb6e046695c013d7e
oai_identifier_str oai:repositorio.ufla.br:1/2051
network_acronym_str UFLA
network_name_str Repositório Institucional da UFLA
repository_id_str
spelling 2014-08-02T14:19:33Z2011-02-232014-08-02T14:19:33Z2011-02-232014-08-022011-02-23BARRETO, H. G. Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica. 2011. 73 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2011.https://repositorio.ufla.br/handle/1/2051Apesar dos vários estudos que abordaram a fisiologia e os processos de desenvolvimento do café, muitos aspectos diretamente relacionados com a qualidade do café ainda requerem uma melhor compreensão, como o processo de regulação do florescimento. A maturação desuniforme dos frutos do cafeeiro, gerada pelo florescimento sequencial encontrado nessa espécie, afeta diretamente a sua produtividade e leva a aumentos nos custos de produção e também a uma bebida de menor qualidade. Assim, objetivando uma melhor compreensão do processo de florescimento do café (Coffea arabica), realizou-se neste trabalho a identificação e caracterização dos genes FLOWERING LOCUS C, FRIGIDA, REDUCED VERNALIZATION RESPONSE 2 e VERNALIZATION INSENSITIVE 3 em café. Análises in silico realizadas no banco de ESTs (Expressed Sequence Tags) CAFEST permitiram a identificação dos genes estudados, os quais tiveram suas sequências confirmadas. As análises de expressão realizadas pela técnica da PCR quantitativa em tempo-real (qPCR) mostraram que os quatro genes foram expressos em todos os tecidos analisados (raízes, folhas de plantas submetidas ao estresse hídrico, folhas, e flores) e sugeriram que todos estejam envolvidos na regulação do florescimento em café. Estudos futuros que envolvam mutantes para esses genes em plantas- modelo e em café possibilitarão um melhor entendimento das funções desempenhadas por cada um desses genes no florescimento, assim como uma melhor compreensão desse processo como um todo.Although extensive studies have been carried out on coffee physiology and developmental processes, many aspects directly associated to coffee quality require better understanding, such as the flowering regulation process. The asynchronous fruit ripening showed by coffee trees, which is triggered by the sequential flowering found in this species, greatly affects its productivity and leads to higher production costs and a lower cup quality. Thus, in order to get a better understanding of the coffee flowering process, this work identified and characterized the coffee (Coffea arabica L.) FLOWERING LOCUS C, FRIGIDA, REDUCED VERNALIZATION RESPONSE 2 e VERNALIZATION INSENSITIVE 3 in coffee. In silico analysis in the coffee expressed sequence tag database (CAFEST) database allowed the identification of the genes studied in this work, which had their identity confirmed by sequencing. Expression analysis performed by quantitative real-time PCR (qPCR) showed that the four genes studied are expressed in all tissues analyzed (roots, leaves of plants subjected to water stress, leaves and flowers), and suggested that they are directly involved in the coffee flowering process. Further functional studies comprising mutants for these genes in a model species and in coffee trees will lead to a better understanding of the specific functions displayed by each one of these genes in the coffee flowering induction, as well as a better understanding of this process as a whole.Biotecnologia VegetalUNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASPPBV - Programa de Pós-graduação em Biotecnologia VegetalUFLABRASILCNPQ_NÃO_INFORMADOBioinformáticaCoffea arabicaExpressão gênicaMADS-boxRegulação do florescimentoBioinformaticsFlowering regulationGene expressionCiências biológicasAnálise dos genes homólogos de florescimento em café arábicaAnalysis of coffee arabica flowering homologous genesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisChalfun Junior, AntonioPaiva, Luciano VilelaBenedito, Vagner AugustoBarreto, Horllys Gomesinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLAORIGINALDISSERTAÇÃO_Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica.pdfDISSERTAÇÃO_Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica.pdfapplication/pdf1311234https://repositorio.ufla.br/bitstreams/603a2e87-db1a-4386-aedc-eb5bc4f6ce81/download6d6acbb5f685c1806d8557e660ddd4f6MD51trueAnonymousREADLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/9d173807-1616-4e4f-aca3-595083af6d35/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD52falseAnonymousREADTEXTDISSERTAÇÃO_Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica.pdf.txtDISSERTAÇÃO_Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica.pdf.txtExtracted texttext/plain86681https://repositorio.ufla.br/bitstreams/29d161f7-cf2a-4ae0-9f49-508b588b099c/download51ea172474cf574a9e5b78f352c93bbdMD53falseAnonymousREADTHUMBNAILDISSERTAÇÃO_Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica.pdf.jpgDISSERTAÇÃO_Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2617https://repositorio.ufla.br/bitstreams/0230fb74-e6a7-428f-b070-6d012b6db069/download971904336ac78d1967fad968d07a5f1eMD54falseAnonymousREAD1/20512025-08-07 09:56:38.4open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/2051https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-07T12:56:38Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv Analysis of coffee arabica flowering homologous genes
title Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica
spellingShingle Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica
Barreto, Horllys Gomes
CNPQ_NÃO_INFORMADO
Bioinformática
Coffea arabica
Expressão gênica
MADS-box
Regulação do florescimento
Bioinformatics
Flowering regulation
Gene expression
Ciências biológicas
title_short Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica
title_full Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica
title_fullStr Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica
title_full_unstemmed Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica
title_sort Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica
author Barreto, Horllys Gomes
author_facet Barreto, Horllys Gomes
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Chalfun Junior, Antonio
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Paiva, Luciano Vilela
Benedito, Vagner Augusto
dc.contributor.author.fl_str_mv Barreto, Horllys Gomes
contributor_str_mv Chalfun Junior, Antonio
Paiva, Luciano Vilela
Benedito, Vagner Augusto
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ_NÃO_INFORMADO
topic CNPQ_NÃO_INFORMADO
Bioinformática
Coffea arabica
Expressão gênica
MADS-box
Regulação do florescimento
Bioinformatics
Flowering regulation
Gene expression
Ciências biológicas
dc.subject.por.fl_str_mv Bioinformática
Coffea arabica
Expressão gênica
MADS-box
Regulação do florescimento
Bioinformatics
Flowering regulation
Gene expression
Ciências biológicas
description Apesar dos vários estudos que abordaram a fisiologia e os processos de desenvolvimento do café, muitos aspectos diretamente relacionados com a qualidade do café ainda requerem uma melhor compreensão, como o processo de regulação do florescimento. A maturação desuniforme dos frutos do cafeeiro, gerada pelo florescimento sequencial encontrado nessa espécie, afeta diretamente a sua produtividade e leva a aumentos nos custos de produção e também a uma bebida de menor qualidade. Assim, objetivando uma melhor compreensão do processo de florescimento do café (Coffea arabica), realizou-se neste trabalho a identificação e caracterização dos genes FLOWERING LOCUS C, FRIGIDA, REDUCED VERNALIZATION RESPONSE 2 e VERNALIZATION INSENSITIVE 3 em café. Análises in silico realizadas no banco de ESTs (Expressed Sequence Tags) CAFEST permitiram a identificação dos genes estudados, os quais tiveram suas sequências confirmadas. As análises de expressão realizadas pela técnica da PCR quantitativa em tempo-real (qPCR) mostraram que os quatro genes foram expressos em todos os tecidos analisados (raízes, folhas de plantas submetidas ao estresse hídrico, folhas, e flores) e sugeriram que todos estejam envolvidos na regulação do florescimento em café. Estudos futuros que envolvam mutantes para esses genes em plantas- modelo e em café possibilitarão um melhor entendimento das funções desempenhadas por cada um desses genes no florescimento, assim como uma melhor compreensão desse processo como um todo.
publishDate 2011
dc.date.copyright.none.fl_str_mv 2011-02-23
dc.date.submitted.none.fl_str_mv 2011-02-23
dc.date.available.fl_str_mv 2011-02-23
2014-08-02T14:19:33Z
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2014-08-02T14:19:33Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2014-08-02
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv BARRETO, H. G. Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica. 2011. 73 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2011.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufla.br/handle/1/2051
identifier_str_mv BARRETO, H. G. Análise dos genes homólogos de florescimento em café arábica. 2011. 73 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2011.
url https://repositorio.ufla.br/handle/1/2051
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
dc.publisher.program.fl_str_mv PPBV - Programa de Pós-graduação em Biotecnologia Vegetal
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFLA
dc.publisher.country.fl_str_mv BRASIL
publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFLA
instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron:UFLA
instname_str Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron_str UFLA
institution UFLA
reponame_str Repositório Institucional da UFLA
collection Repositório Institucional da UFLA
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufla.br/bitstreams/603a2e87-db1a-4386-aedc-eb5bc4f6ce81/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/9d173807-1616-4e4f-aca3-595083af6d35/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/29d161f7-cf2a-4ae0-9f49-508b588b099c/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/0230fb74-e6a7-428f-b070-6d012b6db069/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 6d6acbb5f685c1806d8557e660ddd4f6
760884c1e72224de569e74f79eb87ce3
51ea172474cf574a9e5b78f352c93bbd
971904336ac78d1967fad968d07a5f1e
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)
repository.mail.fl_str_mv nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br
_version_ 1854947828593328128