Aplicação de modelos funcionais na seleção genômica ampla

• Ano de defesa: 2017
• Autor(a) principal: Moura, Ernandes Guedes
• Orientador(a): Balestre, Marcio
• Banca de defesa: Bueno Filho, Julio Silvio de Sousa, Silva, Fabyano Fonseca e
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Estatística e Experimentação Agropecuária
• Departamento: Departamento de Ciências Exatas
• País: brasil
• Palavras-chave em Português: Genomas – Seleção – Métodos estatísticos; Marcadores genéticos; Regressão (Estatística); Teoria bayesiana de decisão estatística; Genomes – Selection – Statistical methods; Genetic markers; Regression (Statistics); Bayesian statistical decision theory
• Área do conhecimento CNPq: Estatística; Genética
• Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/12270

Com o surgimento de marcadores de alta densidade SNPs, ao mesmo tempo em que surge um grande avanço no que diz respeito ao aumento da capacidade preditiva dos modelos, agravaramse os problemas de multicolinearidade e alta dimensionalidade dos modelos na seleção genômica, gerando desafios estatísticos e computacionais. Objetivou-se neste trabalho propor um método e verificar sua eficiência na seleção genômica usando modelos funcionais. Dessa forma, propôs-se que os efeitos de um loco genético é função de sua respectiva localização no genoma. Para verificar a palpabilidade do modelo, simulou-se 300 indivíduos a três populações F2, conforme três herdabilidades (0,2; 0,5 e 0,8), em um total de 12150 marcadores SNPs, distribuídos em dez grupos de ligação. O modelo proposto no presente estudo obteve destaque nos cenários oligogênico e poligênico, e pode ser recomendado a estudos posteriores a dados reais e com diversas arquiteturas genéticas para conclusões mais consistentes.