Estudo molecular e biológico de um isolado viral de Physalis peruviana proveniente do Estado de Santa Catarina

• Ano de defesa: 2018
• Autor(a) principal: Fernandes, Sérgio Bruno
• Orientador(a): Figueira, Antonia dos Reis
• Banca de defesa: Souza, Ricardo Magela de, Costa, Suellen Bárbara Ferreira Galvino
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal
• Departamento: Não especifica vinculação com nenhum departamento
• País: brasil
• Palavras-chave em Português: Detecção viral; Physalis peruviana - Doenças virais; Velvet tobacco mottle virus; Sobemovirus; Viral detection; Physalis peruviana - Viral diseases
• Área do conhecimento CNPq: Melhoramento Vegetal
• Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/29271

A physalis (Physalis peruviana L.) têm se mostrado uma boa alternativa para os pequenos produtores da região sul brasileira, que apresenta condições climáticas favoráveis, por possuir um fruto com alto valor de mercado e baixo custo de produção. A fruta possui qualidades nutracêuticas, que torna a cultura promissora para alcançar diversos nichos de mercado. O grande desafio dessa cultura é que, devido à sua introdução recente no Brasil, existem poucas informações sobre o controle de fitopatógenos que podem afetá-la como, por exemplo, as doenças de etiologia viral. Recentemente um isolado viral denominado de BRSC2017 foi detectado em plantas de Physalis peruviana cultivadas na região sul do Brasil, apresentando sintomas de mosaico, deformação foliar e enfezamento, que sugeria a presença de Potato virus Y (PVY), vírus comum em solanáceas. Entretanto, amostras encaminhadas para o Laboratório de Virologia Molecular, com a finalidade de fazer a identificação do agente causal, reagiram negativamente quando testadas por DAS-ELISA e RT-PCR, empregando-se antissoros e primers específicos para o PVY. Inoculação em plantas hospedeiras também induziram sintomas diferentes daqueles observados para o PVY. Posterior observação ao microscópio eletrônico mostrou partículas isométricas com cerca de 30nm de diâmetro, confirmando esses resultados. Com o auxílio de random primers, um fragmento contendo 673pb foi amplificado por RT-PCR, sequenciado e analisado. Quando os nucleotídeos e os aminoácidos do BRSC2017 foram comparados com isolados virais disponíveis no GenBank, observou-se que a maior identidade ocorreu com a ORF 2B, que codifica uma RNA polimerase dependente de RNA (RdRp), do Velvet tobacco mottle virus (VTMoV), pertencente ao gênero Sobemovirus. Esse vírus, encontrado na Austrália, ainda não descrito no Brasil. No entanto, seguindo os critérios de taxonomia para o gênero, a maior identidade ficou abaixo dos 75% necessários para que sejam considerados da mesma espécie. O sequenciamento completo do genoma do BRSC2017 permitirá chegar a uma identificação definitiva desse isolado viral.