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Predição genômica do desempenho de híbridos de milho considerando a interação genótipos por ambientes

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2017
Autor(a) principal: Pires, Luiz Paulo Miranda lattes
Orientador(a): Von Pinho, Renzo Garcia
Banca de defesa: Balestre, Marcio, Bruzi, Adriano Teodoro, Teodoro, Adriano, Carvalho, Samuel Pereira
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Agronomia/Fitotecnia
Departamento: Departamento de Agricultura
País: brasil
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/29463
Resumo: No melhoramento de plantas, especialmente na cultura do milho, o efeito da interação genótipos por ambientes está presente em todas as etapas de avaliação de híbridos, desde as etapas iniciais até as pré-comerciais. Trata-se de uma dificuldade importante na recomendação de cultivares em múltiplos ambientes e também na predição de híbridos, pois este cenário corresponde a um dos principais desafios para os profissionais envolvidos no processo de obtenção de novas cultivares. Em programas de melhoramento de milho, genótipos de diversos backgrounds são naturalmente incorporados a cada ciclo , ao passo que tantos outros são descartados, dificultando ainda mais a realização de predições acuradas como resultado do aumento da complexidade do germoplasma comercial, a lém de perdas substanciais relacionadas à diminuição da herdabilidade por meio do aumento da variância fenotípica pelo componente da interação. Isso afasta circunstancialmente o valor fenotípico do valor genético real dos híbridos em avaliação. Nesse cenár io, vários estudos t êm sido realizados no sentido de aumentar as contribuições da predição genômica no contexto da interação genótipos por ambientes. Predizer com eficiência híbridos no contexto da interação , pode aproximar o que é produzido pela pesquisa com as necessidades de programas de melhoramento comerciais, uma vez que os custos relacionados à genotipagem de materiais de interesse t êm decrescido nos últimos anos, ao passo que os gastos relacionados à fenotipagem são crescentes e limitantes para o crescimento dos programas de melhoramento. Adicionalmente, diversos fatores promovem o desbalanceamento em ensaios multiambientes, não apenas relacionados à perda de parcelas, mas também, perda de ambientes inteiros de avaliação por fatores climáticos, quant idades insuficientes de sementes de determinados híbridos para que os mesmos sejam testados em todos os ambientes, ou mesmo inclusão e exclusão derivadas de critérios dos melhoristas durante as etapas de avaliação dos híbridos. Assim, novas propostas de modelos que sejam eficientes em condições de desbalanceamento e aplicações de processos de predição com informações de marcadores moleculares podem contribuir na redução de gastos financeiros e identificações de genótipos superiores em programas de melhoramento de milho. Com esse estudo procurou-se criar informações acerca da eficiência da incorporação de informações de parentesco genômico para predição de híbridos utilizando modelo GBLUP-AMMI com abordagem bayesiana, além de estudar a interação de genótipos com ambientes e realização de inferência acerca da contribuição dos genótipos para a interação.
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Em programas de melhoramento de milho, genótipos de diversos backgrounds são naturalmente incorporados a cada ciclo , ao passo que tantos outros são descartados, dificultando ainda mais a realização de predições acuradas como resultado do aumento da complexidade do germoplasma comercial, a lém de perdas substanciais relacionadas à diminuição da herdabilidade por meio do aumento da variância fenotípica pelo componente da interação. Isso afasta circunstancialmente o valor fenotípico do valor genético real dos híbridos em avaliação. Nesse cenár io, vários estudos t êm sido realizados no sentido de aumentar as contribuições da predição genômica no contexto da interação genótipos por ambientes. Predizer com eficiência híbridos no contexto da interação , pode aproximar o que é produzido pela pesquisa com as necessidades de programas de melhoramento comerciais, uma vez que os custos relacionados à genotipagem de materiais de interesse t êm decrescido nos últimos anos, ao passo que os gastos relacionados à fenotipagem são crescentes e limitantes para o crescimento dos programas de melhoramento. Adicionalmente, diversos fatores promovem o desbalanceamento em ensaios multiambientes, não apenas relacionados à perda de parcelas, mas também, perda de ambientes inteiros de avaliação por fatores climáticos, quant idades insuficientes de sementes de determinados híbridos para que os mesmos sejam testados em todos os ambientes, ou mesmo inclusão e exclusão derivadas de critérios dos melhoristas durante as etapas de avaliação dos híbridos. Assim, novas propostas de modelos que sejam eficientes em condições de desbalanceamento e aplicações de processos de predição com informações de marcadores moleculares podem contribuir na redução de gastos financeiros e identificações de genótipos superiores em programas de melhoramento de milho. Com esse estudo procurou-se criar informações acerca da eficiência da incorporação de informações de parentesco genômico para predição de híbridos utilizando modelo GBLUP-AMMI com abordagem bayesiana, além de estudar a interação de genótipos com ambientes e realização de inferência acerca da contribuição dos genótipos para a interação.In plant breeding, especially in maize, the genotype interaction effect by environment is present in all stages of hybrid evaluation, from the initial to the pre-commercial stages. This is an important difficulty in the cultivar recommendation in multiple environments and also in the hybr ids prediction. It means one of the main challenges for the professionals involved in the process of obtaining new cultivars. In maize breeding programs, genotypes from various backgrounds are naturally incorporated into each cycle, while so many others ar e discarded, making further accurate predictions is more difficult as a result of increased commercial germplasm complexity. In addition to substantial losses related to heritability decline, just because the phenotypic variance can increase by the interaction component. This circunstantially removes the phenotypic value of the actual genetic value of the hybrids under evaluate. At this scenario, several studies have been carried out in order to increase the contributions of genomic prediction in the genotypes interaction context by environments. Effectively predicting hybrids in the interaction context can approximate what are produced by the research with the needs of commercial breeding programs, since the costs related to genotyping of materials have declined in recent years, while costs related to phenotyping are increasing and limiting for increase breeding programs. In addition, several factors promote the umbalance in multienvironment trials, not only related to loss of plots, but also loss of whole environments of evaluation by climatic factors, insufficient amounts of seeds from some hybrids, so that they are tested in all environments, or even inclusion and exclusion derived from breeders criteria during the hybrids evaluation. Thus, new model proposals that are efficient in conditions of umbalance and applications of prediction processes with molecular markers information can contribute in the reduction of financial expenses and identifications of superior genotypes in maize breeding programs. With this study, we will try to create information about the efficiency of the genomic kinship information for hybrids prediction using GBLUP-AMMI model with Bayesian approach, besides studying the genotypes interaction with environments and realization of inference about the contribution of genotypes to the interaction.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Universidade Federal de LavrasPrograma de Pós-Graduação em Agronomia/FitotecniaUFLAbrasilDepartamento de AgriculturaFitotecniaAMMI-BayesianoMilho - Melhoramento genéticoParentesco genéticoEnsaios multiambientesAMMI-BayesianCorn - Genetic improvementGenetic kinshipMulti-environment trialsPredição genômica do desempenho de híbridos de milho considerando a interação genótipos por ambientesGenomic prediction of the maize hybrids performance considering the interaction genotypes by environmentsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisVon Pinho, Renzo GarciaBalestre, MarcioBruzi, Adriano TeodoroTeodoro, AdrianoCarvalho, Samuel Pereirahttp://lattes.cnpq.br/8446810009094955Pires, Luiz Paulo Mirandaporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLAinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALTESE_Predição genômica do desempenho de híbridos de milho considerando a interação genótipos por ambientes.pdfTESE_Predição genômica do desempenho de híbridos de milho considerando a interação genótipos por ambientes.pdfapplication/pdf1993695https://repositorio.ufla.br/bitstreams/fa0caf72-d963-4f3c-8755-25e5cce63cab/downloadfb528591671a2c25585793d726ef2e3dMD51trueAnonymousREADLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/60553f9b-5724-44bb-b9b5-94752f07a322/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD52falseAnonymousREADTEXTTESE_Predição genômica do desempenho de híbridos de milho considerando a interação genótipos por ambientes.pdf.txtTESE_Predição genômica do desempenho de híbridos de milho considerando a interação genótipos por ambientes.pdf.txtExtracted texttext/plain102552https://repositorio.ufla.br/bitstreams/d0f7e2ab-bbb6-4c6d-b5b9-73ec004f9d36/downloadc8188939d6df7bd91bf98e33921e0d46MD53falseAnonymousREADTHUMBNAILTESE_Predição genômica do desempenho de híbridos de milho considerando a interação genótipos por ambientes.pdf.jpgTESE_Predição genômica do desempenho de híbridos de milho considerando a interação genótipos por ambientes.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3141https://repositorio.ufla.br/bitstreams/6529a08a-5f80-4313-a936-0007a70419f6/downloadc7d9060f556e2cb3fcbf7c6886811491MD54falseAnonymousREAD1/294632025-08-11 09:04:15.342open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/29463https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-11T12:04:15Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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