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Caracterização morfológica, molecular e patogênica de espécies de Phytophthora associadas aos citros

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2008
Autor(a) principal: Oliveira, Janine Mendes de
Orientador(a): Pfenning, Ludwig Heinrich
Banca de defesa: Lima, Cristiano Souza, Mizubuti, Eduardo Seiti Gomide, Figueira, Antonia dos Reis
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
Escola de Ciências Agrárias de Lavras (ESAL)
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Agronomia/Fitopatologia
Departamento: Departamento de Fitopatologia
País: BRASIL
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/2687
Resumo: Phytophthora root rot is one of the most important diseases of citrus in Brazil and other countries. The causal agents are species of Phytophthora, being the most important P. nicotianae, the prevalent and widely distributed species, and P. citrophthora, less frequent in tropical regions. As the first step to develop a PCR based detection method of the disease, the variability of a population of P. nicotianae from citrus and other host was evaluated by morphological characters, phylogeny and pathogenicity tests. Isolates of P. nicotianae were identified from citrus, tobacco, black acacia and Kalanchoe, showing characteristics such as predominantly spherical to, terminal or intercalary, persistent and papillate, with numerous chlamydospores, and amphigynous antheridia. Isolates from citrus, identified as P. citrophthora showed oval or variable, papillate sporangia, frequently bipapillate and persistent, without chlamydospores and oogonium. All isolates of P. nicotianae were pathogenic to citrus and tobacco seedlings, as well as to citrus fruits. P. citrophthora was pathogenic only to seedling and fruits of citrus. Phytophthora capsici did not show pathogenicity to citrus nor tobacco. In the phylogenetic analysis all isolates of P. nicotianae grouped together in a unique clade, together with sequences recovered from Genbank, with 100% bootstrap support. These results indicate low infra-specific variability in this species and lack of specificity towards host plants. This information will be useful to develop a rapid PCR detection method for these citrus pathogens.
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spelling 2014-08-13T15:45:06Z2014-08-13T15:45:06Z2014-08-132008-06-20OLIVEIRA, J. M. de. Caracterização morfológica, molecular e patogênica de espécies de Phytophthora associadas aos citros. 2008. 51 p. Dissertação (Mestrado em Agronomia)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2008.https://repositorio.ufla.br/handle/1/2687Phytophthora root rot is one of the most important diseases of citrus in Brazil and other countries. The causal agents are species of Phytophthora, being the most important P. nicotianae, the prevalent and widely distributed species, and P. citrophthora, less frequent in tropical regions. As the first step to develop a PCR based detection method of the disease, the variability of a population of P. nicotianae from citrus and other host was evaluated by morphological characters, phylogeny and pathogenicity tests. Isolates of P. nicotianae were identified from citrus, tobacco, black acacia and Kalanchoe, showing characteristics such as predominantly spherical to, terminal or intercalary, persistent and papillate, with numerous chlamydospores, and amphigynous antheridia. Isolates from citrus, identified as P. citrophthora showed oval or variable, papillate sporangia, frequently bipapillate and persistent, without chlamydospores and oogonium. All isolates of P. nicotianae were pathogenic to citrus and tobacco seedlings, as well as to citrus fruits. P. citrophthora was pathogenic only to seedling and fruits of citrus. Phytophthora capsici did not show pathogenicity to citrus nor tobacco. In the phylogenetic analysis all isolates of P. nicotianae grouped together in a unique clade, together with sequences recovered from Genbank, with 100% bootstrap support. These results indicate low infra-specific variability in this species and lack of specificity towards host plants. This information will be useful to develop a rapid PCR detection method for these citrus pathogens.A gomose-de-Phytophthora é uma das doenças mais preocupantes da cultura dos citros no Brasil e em outros países produtores. Esta doença é causada por espécies do gênero Phytophthora, sendo as principais P. nicotianae, de maior predominância e distribuição, e P. citrophthora, com menor freqüência nas regiões tropicais. Como primeiro passo visando o estabelecimento de um método de diagnose da doença por PCR, foi estudada a variabilidade de uma população de P. nicotianae dos citros e de outros hospedeiros no Brasil por meio de caracteres morfológicos, filogenia e patogenicidade. Foram identificados como P. nicotianae os isolados de citros, fumo, acácia-negra e Kalanchoe, que apresentaram os seguintes caracteres: esporângios predominantemente esféricos e ovóides, terminais e intercalados, persistentes e papilados, os clamidósporos foram abundantes e o oogônio apresentou anterídio anfígeno. Os isolados de citros identificados como P. citrophthora apresentaram esporângios ovóides e de formas variáveis, papilados, freqüentemente bipapilados e persistentes, clamidósporos e oogônios ausentes. Todos os isolados de P. nicotianae provenientes de diferentes hospedeiros foram patogênicos a plantas de citros e fumo, assim como aos frutos de laranja. A espécie P. citrophthora foi patogênica apenas a mudas de citros e nos frutos de laranja. Phytophthora capsici não foi patogênico aos citros e fumo. Na análise filogenética, todos os isolados de P. nicotianae dos citros formaram um clado juntamente com os isolados de P. nicotianae do GenBank, com suporte de 100% na análise de bootstrap. Estes resultados evidenciaram a inespecificidade da espécie em relação ao hospedeiro e uma baixa variação intra-específica entre os isolados dos citros. Estas informações podem servir como base na elaboração de métodos de PCR para a detecção e identificação rápida destes patógenos em citros no país.FitopatologiaUniversidade Federal de LavrasEscola de Ciências Agrárias de Lavras (ESAL)Programa de Pós-Graduação em Agronomia/FitopatologiaBRASILDepartamento de FitopatologiaCiências AgráriasPhytophthora nicotianaePhytophthora citrophthoraPeronosporalesOomycotaITS rDNAAnálise filogenéticaGomosePhylogenetic analysisRoot rot.Caracterização morfológica, molecular e patogênica de espécies de Phytophthora associadas aos citrosMorphological, molecular and pathogenic characterization of Phytophthora species associated with citrus root rot.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisPfenning, Ludwig HeinrichLima, Cristiano SouzaMizubuti, Eduardo Seiti GomideFigueira, Antonia dos ReisOliveira, Janine Mendes deinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLALICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/91227c2c-78e5-472c-ad03-eee9aa18e009/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD52falseAnonymousREADORIGINALDISSERTAÇÃO_Caracterização morfológica, molecular e patogênica de espécies de Phytophthora associadas aos citros.pdfDISSERTAÇÃO_Caracterização morfológica, molecular e patogênica de espécies de Phytophthora associadas aos citros.pdfapplication/pdf1240347https://repositorio.ufla.br/bitstreams/8b9a338e-bc52-48c1-8217-e898a260b627/download59fb507ffb5d9724d23041a8c204c30bMD51trueAnonymousREADTEXTDISSERTAÇÃO_Caracterização morfológica, molecular e patogênica de espécies de Phytophthora associadas aos citros.pdf.txtDISSERTAÇÃO_Caracterização morfológica, molecular e patogênica de espécies de Phytophthora associadas aos citros.pdf.txtExtracted texttext/plain83025https://repositorio.ufla.br/bitstreams/42b30333-f54d-4567-9f53-abdd4e38aeac/download58d7c921d90f0453aff8e351a8de3ce1MD53falseAnonymousREADTHUMBNAILDISSERTAÇÃO_Caracterização morfológica, molecular e patogênica de espécies de Phytophthora associadas aos citros.pdf.jpgDISSERTAÇÃO_Caracterização morfológica, molecular e patogênica de espécies de Phytophthora associadas aos citros.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2866https://repositorio.ufla.br/bitstreams/8d590003-c611-4478-ae7d-20572e7d0f6b/downloada9476201e6c6d506e5a9ad68498868ceMD54falseAnonymousREAD1/26872025-08-05 15:37:00.023open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/2687https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-05T18:37Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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