Inteligência artificial aplicada a simulação cinética de processos químicos e metabólicos

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2011
Autor(a) principal: Geison Voga Pereira
Orientador(a): Jadson Claudio Belchior
Banca de defesa: Aparecida Emiko Hirata, Helio Ferreira dos Santos, Rita de Cassia de Oliveira Sebastiao, Heitor Avelino De Abreu
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Minas Gerais
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/1843/SFSA-AUHMJ3
Resumo: A simulação cinética de processos químicos e metabólicos contribui para o entendimento dos mecanismos de reações presentes em diversos sistemas químicos ou bioquímicos. Pois auxilia na determinação de alterações causadas pela inclusão de substancias diferentes, mas com atividade biológica, como pode ocorrer com compostos farmacológicos ou compostos tóxicos. Fundamentalmente, a presente tese de doutorado consiste em desenvolver e aplicar técnicascomputacionais de inteligência artificial, tais como: algoritmos genéticos e lógica fuzzy acoplados a técnica de simulação de sistema dinâmicos denominada redes de Petri. Neste trabalho o sistema inteligente foi aplicado em duas situações diferentes. A primeira aplicacão corresponde a determinação dos parâmetros de Arrhenius (energia de ativação e fator pre-exponencial) para um processo de sintese de materiais semicondutores. Neste caso, o sistema inteligente utilizou dados de curvas termogravimétricas como base de referência para o processo de síntese de semicondutores constituídos de TiO2-SnO2. Os resultados demonstraram o comportamento cinético das etapasdo processo químico através da determinação dos parâmetros de Arrhenius como funções da temperatura. A segunda aplicação corresponde a determinação e parametrização de rotas metabólicasatravés de dados de concentração por tempo, gerados experimentalmente ou a partir de outros modelos cinéticos. A otimização da estrutura da rede de Petri pode ser diretamente relacionada coma evolução da rota metabólica. Neste trabalho foram utilizados dois sistemas biológicos, sendo que a primeira rota corresponde a síntese do 1,2-diacilglicerol que é constituída por 4 reações. O segundosistema biológico, o ciclo do ácido cítrico, apresenta uma complexidade mais elevada, pois contém 21 reações acopladas. Para cada reação dos sistemas biológicos foram obtidos os dados de concentraçãode cada espécie com um erro relativo médio de 1% e as respectivas constantes cinéticas.
id UFMG_25ef977f8056572ea2091c2bb66ea2ec
oai_identifier_str oai:repositorio.ufmg.br:1843/SFSA-AUHMJ3
network_acronym_str UFMG
network_name_str Repositório Institucional da UFMG
repository_id_str
spelling Jadson Claudio BelchiorAparecida Emiko HirataHelio Ferreira dos SantosRita de Cassia de Oliveira SebastiaoHeitor Avelino De AbreuGeison Voga Pereira2019-08-11T11:55:20Z2019-08-11T11:55:20Z2011-12-28http://hdl.handle.net/1843/SFSA-AUHMJ3A simulação cinética de processos químicos e metabólicos contribui para o entendimento dos mecanismos de reações presentes em diversos sistemas químicos ou bioquímicos. Pois auxilia na determinação de alterações causadas pela inclusão de substancias diferentes, mas com atividade biológica, como pode ocorrer com compostos farmacológicos ou compostos tóxicos. Fundamentalmente, a presente tese de doutorado consiste em desenvolver e aplicar técnicascomputacionais de inteligência artificial, tais como: algoritmos genéticos e lógica fuzzy acoplados a técnica de simulação de sistema dinâmicos denominada redes de Petri. Neste trabalho o sistema inteligente foi aplicado em duas situações diferentes. A primeira aplicacão corresponde a determinação dos parâmetros de Arrhenius (energia de ativação e fator pre-exponencial) para um processo de sintese de materiais semicondutores. Neste caso, o sistema inteligente utilizou dados de curvas termogravimétricas como base de referência para o processo de síntese de semicondutores constituídos de TiO2-SnO2. Os resultados demonstraram o comportamento cinético das etapasdo processo químico através da determinação dos parâmetros de Arrhenius como funções da temperatura. A segunda aplicação corresponde a determinação e parametrização de rotas metabólicasatravés de dados de concentração por tempo, gerados experimentalmente ou a partir de outros modelos cinéticos. A otimização da estrutura da rede de Petri pode ser diretamente relacionada coma evolução da rota metabólica. Neste trabalho foram utilizados dois sistemas biológicos, sendo que a primeira rota corresponde a síntese do 1,2-diacilglicerol que é constituída por 4 reações. O segundosistema biológico, o ciclo do ácido cítrico, apresenta uma complexidade mais elevada, pois contém 21 reações acopladas. Para cada reação dos sistemas biológicos foram obtidos os dados de concentraçãode cada espécie com um erro relativo médio de 1% e as respectivas constantes cinéticas.The kinetic simulation of chemical and metabolic processes can contribute for the understanding of several reactions that are present in all chemical and biochemical processes and hence, one can propose the corresponding mechanisms of such systems. All these processes can contribute, in principle, in determining modifications due to different compounds that also have biological activity, for instance, drugs or toxic substances. Accordingly, the present thesis will deal with the development and applications of computational artificial intelligence (AI) techniques such as genetic algorithms (GA) and fuzzy logic (FL) both coupled to Petri Nets. The proposed approach will be tested to study chemical and metabolic processes. In order to analyze this AI methodology for studying metabolic systems two different applications will be used. The first case corresponds to the determination of Arrhenius parameters (activation energy and pre exponential factor) for the processof semiconductors systems. Thermogravimetric experimental data will be used as the input data and TiO2-SnO2 system was used. The results demonstrated an efficient approach to determine the kinetic behavior of the whole chemical process and this produces a procedure to obtain the Arrhenius parameters as a function of temperature. The second application corresponds to the determination and parametrization of metabolic routes using as the input data either experimental or modeling data of species concentrations as a function of time. As demonstrated the Petri Nets are directly correlated to the time evolution of all simultaneous reactions of a specified system. In the present case two biological systems were used namely, 1,2-diacilglycerol, in which there are 4 coupled reactions, and another one more complex, the citric acid cycle, that there are 21 coupled reactions. The results in this particular case (constant temperature) were: all routes of both biochemistry processes, the final product concentrations of all species and the corresponding kinetic constants. The relative average error of both cases is of the order of 1%.Universidade Federal de Minas GeraisUFMGCinética químicaFísico químicaInteligência artificialSistemas de comando e controleModelagem de processosLógica difusaSimulação cinéticainteligência artificialrota químicaInteligência artificial aplicada a simulação cinética de processos químicos e metabólicosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMGORIGINALtese_geison_voga.pdfapplication/pdf28475018https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/SFSA-AUHMJ3/1/tese_geison_voga.pdf7b3ba066f8a23e4e89460b41063fe420MD51TEXTtese_geison_voga.pdf.txttese_geison_voga.pdf.txtExtracted texttext/plain251170https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/SFSA-AUHMJ3/2/tese_geison_voga.pdf.txtb490b67c910d021c54b467e3b00346ebMD521843/SFSA-AUHMJ32019-11-14 04:09:26.672oai:repositorio.ufmg.br:1843/SFSA-AUHMJ3Repositório de PublicaçõesPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oaiopendoar:2019-11-14T07:09:26Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Inteligência artificial aplicada a simulação cinética de processos químicos e metabólicos
title Inteligência artificial aplicada a simulação cinética de processos químicos e metabólicos
spellingShingle Inteligência artificial aplicada a simulação cinética de processos químicos e metabólicos
Geison Voga Pereira
Simulação cinética
inteligência artificial
rota química
Cinética química
Físico química
Inteligência artificial
Sistemas de comando e controle
Modelagem de processos
Lógica difusa
title_short Inteligência artificial aplicada a simulação cinética de processos químicos e metabólicos
title_full Inteligência artificial aplicada a simulação cinética de processos químicos e metabólicos
title_fullStr Inteligência artificial aplicada a simulação cinética de processos químicos e metabólicos
title_full_unstemmed Inteligência artificial aplicada a simulação cinética de processos químicos e metabólicos
title_sort Inteligência artificial aplicada a simulação cinética de processos químicos e metabólicos
author Geison Voga Pereira
author_facet Geison Voga Pereira
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Jadson Claudio Belchior
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Aparecida Emiko Hirata
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Helio Ferreira dos Santos
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Rita de Cassia de Oliveira Sebastiao
dc.contributor.referee4.fl_str_mv Heitor Avelino De Abreu
dc.contributor.author.fl_str_mv Geison Voga Pereira
contributor_str_mv Jadson Claudio Belchior
Aparecida Emiko Hirata
Helio Ferreira dos Santos
Rita de Cassia de Oliveira Sebastiao
Heitor Avelino De Abreu
dc.subject.por.fl_str_mv Simulação cinética
inteligência artificial
rota química
topic Simulação cinética
inteligência artificial
rota química
Cinética química
Físico química
Inteligência artificial
Sistemas de comando e controle
Modelagem de processos
Lógica difusa
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv Cinética química
Físico química
Inteligência artificial
Sistemas de comando e controle
Modelagem de processos
Lógica difusa
description A simulação cinética de processos químicos e metabólicos contribui para o entendimento dos mecanismos de reações presentes em diversos sistemas químicos ou bioquímicos. Pois auxilia na determinação de alterações causadas pela inclusão de substancias diferentes, mas com atividade biológica, como pode ocorrer com compostos farmacológicos ou compostos tóxicos. Fundamentalmente, a presente tese de doutorado consiste em desenvolver e aplicar técnicascomputacionais de inteligência artificial, tais como: algoritmos genéticos e lógica fuzzy acoplados a técnica de simulação de sistema dinâmicos denominada redes de Petri. Neste trabalho o sistema inteligente foi aplicado em duas situações diferentes. A primeira aplicacão corresponde a determinação dos parâmetros de Arrhenius (energia de ativação e fator pre-exponencial) para um processo de sintese de materiais semicondutores. Neste caso, o sistema inteligente utilizou dados de curvas termogravimétricas como base de referência para o processo de síntese de semicondutores constituídos de TiO2-SnO2. Os resultados demonstraram o comportamento cinético das etapasdo processo químico através da determinação dos parâmetros de Arrhenius como funções da temperatura. A segunda aplicação corresponde a determinação e parametrização de rotas metabólicasatravés de dados de concentração por tempo, gerados experimentalmente ou a partir de outros modelos cinéticos. A otimização da estrutura da rede de Petri pode ser diretamente relacionada coma evolução da rota metabólica. Neste trabalho foram utilizados dois sistemas biológicos, sendo que a primeira rota corresponde a síntese do 1,2-diacilglicerol que é constituída por 4 reações. O segundosistema biológico, o ciclo do ácido cítrico, apresenta uma complexidade mais elevada, pois contém 21 reações acopladas. Para cada reação dos sistemas biológicos foram obtidos os dados de concentraçãode cada espécie com um erro relativo médio de 1% e as respectivas constantes cinéticas.
publishDate 2011
dc.date.issued.fl_str_mv 2011-12-28
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-08-11T11:55:20Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-08-11T11:55:20Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1843/SFSA-AUHMJ3
url http://hdl.handle.net/1843/SFSA-AUHMJ3
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFMG
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFMG
instname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
instacron:UFMG
instname_str Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
instacron_str UFMG
institution UFMG
reponame_str Repositório Institucional da UFMG
collection Repositório Institucional da UFMG
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/SFSA-AUHMJ3/1/tese_geison_voga.pdf
https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/SFSA-AUHMJ3/2/tese_geison_voga.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 7b3ba066f8a23e4e89460b41063fe420
b490b67c910d021c54b467e3b00346eb
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801677312253493248