Caracterização das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 de função desconhecida em diferentes espécies de Leishmania

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2019
Autor(a) principal: Andreza Geisiane Maia Souza lattes
Orientador(a): Hélida Monteiro de Andrade lattes
Banca de defesa: Nelder de Figueiredo Gontijo, Thiago de Castro Gomes
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Minas Gerais
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Parasitologia
Departamento: ICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/1843/35398
Resumo: As Leishmanioses são doenças causadas por protozoários tripanosomatídeos do gênero Leishmania e, no Brasil, as espécies Leishmania amazonensis e Leishmania braziliensis são predominantemente associadas à Leishmaniose Tegumentar Americana (LTA) enquanto Leishmania infantum, é agente da Leishmaniose Visceral (LV). Estas espécies foram utilizadas neste estudo por sua importância clínica e epidemiológica no nosso país. O sequenciamento do genoma de algumas espécies de Leishmania mostrou que cada genoma pode conter cerca de oito mil genes que codificam proteínas, dos quais mais da metade são genes hipotéticos. Apesar desse grande número, existem poucos dados acerca das proteínas hipotéticas e suas funções biológicas, sendo indispensáveis estudos para caracterização. Em um trabalho anterior do nosso grupo, foi realizada uma análise proteômica comparativa entre cepas de L. infantum com diferença de virulência. Dentre as proteínas com diferença de abundância, foram selecionadas as proteínas de função desconhecida LmxM.36.6760, aumentada na cepa mais virulenta, e LinJ.30.3360, aumentada na cepa menos virulenta. Assim, no presente estudo, foi nosso objetivo caracterizar essas duas proteínas de função desconhecida. Inicialmente, utilizamos análises de bioinformática através dos servidores NCBI, ProtParam, UniProtKB, Expasy, que indicaram presença de sequências similares as das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 nas espécies L. braziliensis, L. donovani, L. major, L. mexicana e L. infantum, e estas não apresentam peptídeo sinal, domínio transmembrana ou âncora GPI. A estrutura secundária predita para LmxM.36.6760 é de alfa-hélice enquanto para a proteína LinJ.30.3360 é de folha-beta. Observamos similaridade dos resultados obtidos entre os três preditores de localização celular: TargetP, WOLF PSORT e DeepLoc-1.0, que indicaram localização na mitocôndria para proteína LmxM.36.6760 e localização no citoplasma do parasito para proteína LinJ.30.3360. Os resultados de microscopia confocal mostraram-se inconclusivos quanto a localização celular das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360. Foi possível observar que ambas as proteínas apresentam abundancia similar entre as espécies L. amazonensis, L. braziliensis e L. infantum.
id UFMG_73bdc3bb8041a33081883c8a943907e4
oai_identifier_str oai:repositorio.ufmg.br:1843/35398
network_acronym_str UFMG
network_name_str Repositório Institucional da UFMG
repository_id_str
spelling Hélida Monteiro de Andradehttp://lattes.cnpq.br/9446050242071321Simone da Fonseca PiresNelder de Figueiredo GontijoThiago de Castro Gomeshttp://lattes.cnpq.br/1250422854568022Andreza Geisiane Maia Souza2021-03-25T14:56:18Z2021-03-25T14:56:18Z2019-02-26http://hdl.handle.net/1843/35398As Leishmanioses são doenças causadas por protozoários tripanosomatídeos do gênero Leishmania e, no Brasil, as espécies Leishmania amazonensis e Leishmania braziliensis são predominantemente associadas à Leishmaniose Tegumentar Americana (LTA) enquanto Leishmania infantum, é agente da Leishmaniose Visceral (LV). Estas espécies foram utilizadas neste estudo por sua importância clínica e epidemiológica no nosso país. O sequenciamento do genoma de algumas espécies de Leishmania mostrou que cada genoma pode conter cerca de oito mil genes que codificam proteínas, dos quais mais da metade são genes hipotéticos. Apesar desse grande número, existem poucos dados acerca das proteínas hipotéticas e suas funções biológicas, sendo indispensáveis estudos para caracterização. Em um trabalho anterior do nosso grupo, foi realizada uma análise proteômica comparativa entre cepas de L. infantum com diferença de virulência. Dentre as proteínas com diferença de abundância, foram selecionadas as proteínas de função desconhecida LmxM.36.6760, aumentada na cepa mais virulenta, e LinJ.30.3360, aumentada na cepa menos virulenta. Assim, no presente estudo, foi nosso objetivo caracterizar essas duas proteínas de função desconhecida. Inicialmente, utilizamos análises de bioinformática através dos servidores NCBI, ProtParam, UniProtKB, Expasy, que indicaram presença de sequências similares as das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 nas espécies L. braziliensis, L. donovani, L. major, L. mexicana e L. infantum, e estas não apresentam peptídeo sinal, domínio transmembrana ou âncora GPI. A estrutura secundária predita para LmxM.36.6760 é de alfa-hélice enquanto para a proteína LinJ.30.3360 é de folha-beta. Observamos similaridade dos resultados obtidos entre os três preditores de localização celular: TargetP, WOLF PSORT e DeepLoc-1.0, que indicaram localização na mitocôndria para proteína LmxM.36.6760 e localização no citoplasma do parasito para proteína LinJ.30.3360. Os resultados de microscopia confocal mostraram-se inconclusivos quanto a localização celular das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360. Foi possível observar que ambas as proteínas apresentam abundancia similar entre as espécies L. amazonensis, L. braziliensis e L. infantum.Leishmaniasis is a disease caused by trypanosomatid protozoa of the genus Leishmania, and in Brazil the species Leishmania amazonensis and Leishmania braziliensis are predominantly associated with American Cutaneous Leishmaniasis (ACL) while Leishmania infantum is an agent of Visceral Leishmaniasis (VL). These species were used in this study because of their clinical and epidemiological importance in our country. Sequencing the genome of some Leishmania species has shown that each genome can contain about 8,000 genes encoding proteins, of which more than half are hypothetical genes. Despite this large number, there are few data on hypothetical proteins and their biological functions, and studies for characterization are indispensable. In a previous study of our group, a comparative proteomic analysis was performed between L. infantum strains with virulence difference. Among proteins with difference in abundance, proteins of unknown function LmxM.36.6760, which increased in the most virulent strain, and LinJ.30.3360, which increased in the less virulent strain, were selected. Thus, in the present study, it was our aim to characterize these two proteins of unknown function. Initially, we used bioinformatics analysis through the serves NCBI, ProtParam, UniProtKB, Expasy which indicated the presence of sequences similar to those of LmxM.36.6760 and LinJ.30.3360 in L. braziliensis, L. donovani, L. major, L. mexicana and L. infantum, and these do not present signal peptide, transmembrane domain or GPI anchor. The secondary structure predicted for LmxM.36.6760 is alpha-helix whereas for LinJ.30.3360 protein is beta-pleated. We observed similarity in the results obtained among the three cell localization predictors: TargetP, WOLF PSORT and DeepLoc-1.0, which indicated localization in the mitochondria for LmxM.36.6760 protein and localization in the cytoplasm of the parasite for protein LinJ.30.3360. Confocal microscopy results were inconclusive as to the cellular localization of LmxM.36.6760 and LinJ.30.3360 proteins. It was possible to observe that both proteins present similar abundance among the species L. amazonensis, L. braziliensis and L. infantum.CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisCAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorporUniversidade Federal de Minas GeraisPrograma de Pós-Graduação em ParasitologiaUFMGBrasilICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAShttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/pt/info:eu-repo/semantics/openAccessLeishmaniaPrevisõesProteínasCaracterizaçãoLeishmaniaPrediçõesProteínasProteínas hipotéticasCaracterização das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 de função desconhecida em diferentes espécies de Leishmaniainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMGORIGINALversão corrigida dissertação 19.03.pdfversão corrigida dissertação 19.03.pdfapplication/pdf1686805https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/35398/1/vers%c3%a3o%20corrigida%20disserta%c3%a7%c3%a3o%2019.03.pdfec51808e4694244675308fd3030f7551MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/35398/2/license_rdfcfd6801dba008cb6adbd9838b81582abMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82119https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/35398/3/license.txt34badce4be7e31e3adb4575ae96af679MD531843/353982021-03-25 11:56:18.99oai:repositorio.ufmg.br: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Repositório de PublicaçõesPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oaiopendoar:2021-03-25T14:56:18Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Caracterização das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 de função desconhecida em diferentes espécies de Leishmania
title Caracterização das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 de função desconhecida em diferentes espécies de Leishmania
spellingShingle Caracterização das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 de função desconhecida em diferentes espécies de Leishmania
Andreza Geisiane Maia Souza
Caracterização
Leishmania
Predições
Proteínas
Proteínas hipotéticas
Leishmania
Previsões
Proteínas
title_short Caracterização das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 de função desconhecida em diferentes espécies de Leishmania
title_full Caracterização das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 de função desconhecida em diferentes espécies de Leishmania
title_fullStr Caracterização das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 de função desconhecida em diferentes espécies de Leishmania
title_full_unstemmed Caracterização das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 de função desconhecida em diferentes espécies de Leishmania
title_sort Caracterização das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 de função desconhecida em diferentes espécies de Leishmania
author Andreza Geisiane Maia Souza
author_facet Andreza Geisiane Maia Souza
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Hélida Monteiro de Andrade
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9446050242071321
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Simone da Fonseca Pires
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Nelder de Figueiredo Gontijo
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Thiago de Castro Gomes
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1250422854568022
dc.contributor.author.fl_str_mv Andreza Geisiane Maia Souza
contributor_str_mv Hélida Monteiro de Andrade
Simone da Fonseca Pires
Nelder de Figueiredo Gontijo
Thiago de Castro Gomes
dc.subject.por.fl_str_mv Caracterização
Leishmania
Predições
Proteínas
Proteínas hipotéticas
topic Caracterização
Leishmania
Predições
Proteínas
Proteínas hipotéticas
Leishmania
Previsões
Proteínas
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv Leishmania
Previsões
Proteínas
description As Leishmanioses são doenças causadas por protozoários tripanosomatídeos do gênero Leishmania e, no Brasil, as espécies Leishmania amazonensis e Leishmania braziliensis são predominantemente associadas à Leishmaniose Tegumentar Americana (LTA) enquanto Leishmania infantum, é agente da Leishmaniose Visceral (LV). Estas espécies foram utilizadas neste estudo por sua importância clínica e epidemiológica no nosso país. O sequenciamento do genoma de algumas espécies de Leishmania mostrou que cada genoma pode conter cerca de oito mil genes que codificam proteínas, dos quais mais da metade são genes hipotéticos. Apesar desse grande número, existem poucos dados acerca das proteínas hipotéticas e suas funções biológicas, sendo indispensáveis estudos para caracterização. Em um trabalho anterior do nosso grupo, foi realizada uma análise proteômica comparativa entre cepas de L. infantum com diferença de virulência. Dentre as proteínas com diferença de abundância, foram selecionadas as proteínas de função desconhecida LmxM.36.6760, aumentada na cepa mais virulenta, e LinJ.30.3360, aumentada na cepa menos virulenta. Assim, no presente estudo, foi nosso objetivo caracterizar essas duas proteínas de função desconhecida. Inicialmente, utilizamos análises de bioinformática através dos servidores NCBI, ProtParam, UniProtKB, Expasy, que indicaram presença de sequências similares as das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360 nas espécies L. braziliensis, L. donovani, L. major, L. mexicana e L. infantum, e estas não apresentam peptídeo sinal, domínio transmembrana ou âncora GPI. A estrutura secundária predita para LmxM.36.6760 é de alfa-hélice enquanto para a proteína LinJ.30.3360 é de folha-beta. Observamos similaridade dos resultados obtidos entre os três preditores de localização celular: TargetP, WOLF PSORT e DeepLoc-1.0, que indicaram localização na mitocôndria para proteína LmxM.36.6760 e localização no citoplasma do parasito para proteína LinJ.30.3360. Os resultados de microscopia confocal mostraram-se inconclusivos quanto a localização celular das proteínas LmxM.36.6760 e LinJ.30.3360. Foi possível observar que ambas as proteínas apresentam abundancia similar entre as espécies L. amazonensis, L. braziliensis e L. infantum.
publishDate 2019
dc.date.issued.fl_str_mv 2019-02-26
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2021-03-25T14:56:18Z
dc.date.available.fl_str_mv 2021-03-25T14:56:18Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1843/35398
url http://hdl.handle.net/1843/35398
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/pt/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/pt/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Parasitologia
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFMG
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv ICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFMG
instname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
instacron:UFMG
instname_str Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
instacron_str UFMG
institution UFMG
reponame_str Repositório Institucional da UFMG
collection Repositório Institucional da UFMG
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/35398/1/vers%c3%a3o%20corrigida%20disserta%c3%a7%c3%a3o%2019.03.pdf
https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/35398/2/license_rdf
https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/35398/3/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv ec51808e4694244675308fd3030f7551
cfd6801dba008cb6adbd9838b81582ab
34badce4be7e31e3adb4575ae96af679
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1803589703467794432