Um estudo sobre o uso da geometria poligonal da cadeia principal como uma assinatura estrutural mais conservada que o empacotamento de resíduos
| Ano de defesa: | 2017 |
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Universidade Federal de Minas Gerais
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2019-08-14T06:31:05Z2025-09-09T00:55:25Z2019-08-14T06:31:05Z2017-07-06https://hdl.handle.net/1843/BUOS-B5MKJ3Universidade Federal de Minas GeraisAssinatura EstruturalBioinformáticaClassicador EstruturalBioinformáticaProteinas AnáliseProteinas EstruturaUm estudo sobre o uso da geometria poligonal da cadeia principal como uma assinatura estrutural mais conservada que o empacotamento de resíduosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisJoao Arthur Ferreira Gadelha Campeloinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMGRaquel Cardoso de MeloSabrina de Azevedo SilveiraMesmo que a função não possa ser diretamente inferida puramente a partir do padrão de enovelamento especíco adotado por uma determinada proteína, os dados estruturais podem ser usados para detectar proteínas com funções semelhantes. Neste contexto, uma estratégia possível é a denição de assinaturas estruturais, que são conjuntos de características capazes de identicar inequivocamente um tipo de enovelamento proteico. O objetivo do corrente trabalho é encontrar possíveis padrões estruturais conservados em proteínas de mesma família. Para demonstrar que um modelo que utiliza as informações posicionais em nível atômico é conservado e discriminativo entre famílias, construiu-se classicadores estruturais. A partir deste estudo, foi possível discriminar os átomos do backbone como a melhor assinatura estrutural estudada. Inserindo pontos intermediários ctícios entre os carbonos alfa, obtêm-se uma poligonal geométrica, similar à poligonal geométrica obtida pela inclusão dos átomos da cadeia principal. Dessa forma, consegue-se um efeito similar à poligonal geométrica da cadeia principal sem a inuência do posicionamento dos átomos CeNe, indiretamente, sem a inuência dos ângulos phi e psi. O corrente estudo sugere que não são as posições desses átomos os fatores determinantes no incremento da precisão da classicação, mas o fortalecimento do caráter geométrico linear da cadeia principal. Portanto, a principal contribuição do presente trabalho é a investigação do uso da disposição geométrica poligonal da cadeia principal (ou dos próprios Cá, caso sejam adicionados pontos intermediários ctícios entre esses) como uma assinatura estrutural discriminativa.UFMGORIGINALtese.pdfapplication/pdf15546348https://repositorio.ufmg.br//bitstreams/59e4394d-9c88-46fe-9c38-89b56c7f6437/downloadee1e08d2f1e66ec37548c99627e2986dMD51trueAnonymousREADTEXTtese.pdf.txttext/plain243339https://repositorio.ufmg.br//bitstreams/c6601417-8c32-4438-9b2d-aedefd99a72f/downloada3683b6e377129d3d910afbc6a03c45cMD52falseAnonymousREAD1843/BUOS-B5MKJ32025-09-08 21:55:25.906open.accessoai:repositorio.ufmg.br:1843/BUOS-B5MKJ3https://repositorio.ufmg.br/Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oairepositorio@ufmg.bropendoar:2025-09-09T00:55:25Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)false |
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