Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Anjos, Isabela Vera dos
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Mato Grosso
Brasil
Instituto de Biociências (IB)
UFMT CUC - Cuiabá
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biodiversidade – Rede Pró-Centro-Oeste - PPGBB
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Genotipagem
SNP
GWAS
Murcha de Ceratocystis
Tectona grandis
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Genotyping
Ceratocystis wilt
Link de acesso: http://ri.ufmt.br/handle/1/6659
Resumo: Some factors such as wood color, durability, high commercial value, and versatility of use, make teak (Tectona grandis Linn. f.) appreciated all over the world, mainly for the shipbuilding industry. Parallel to the constant growth in planted areas, there are also reports on the appearance of biotic and abiotic problems in teak cultivation. Among these, Ceratocystis wilt caused by the fungus Ceratocystis fimbriata currently stands out, this disease can cause symptoms such as wilting, wood darkening, wood stains and plant mortality, directly influencing the quality of the wood. Given the above, this work aimed to study the population structure and genetic diversity of a diverse collection of teak genotypes and perform associative mapping for resistance to Ceratocystis wilt. Based on genotyping data via sequencing of 211 genotypes and approximately 1.4 million SNPs, it was possible to identify four subpopulations with genetic divergence among them and to identify three candidate genomic regions associated with resistance to Ceratocystis wilt. This was the study using GWAS in teak for resistance to Ceratocystis wilt, contributing to advances in scientific and technical knowledge of teak culture, revealing information about the genetic diversity of genotypes and adding technological value to the culture, introducing a pioneering and innovative approach.
id UFMT_1084809a7388915923146a2af421af82
oai_identifier_str oai:localhost:1/6659
network_acronym_str UFMT
network_name_str Repositório Institucional da UFMT
repository_id_str
spelling Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genéticaGenotipagemSNPGWASMurcha de CeratocystisTectona grandisCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASGenotypingSNPGWASCeratocystis wiltTectona grandisSome factors such as wood color, durability, high commercial value, and versatility of use, make teak (Tectona grandis Linn. f.) appreciated all over the world, mainly for the shipbuilding industry. Parallel to the constant growth in planted areas, there are also reports on the appearance of biotic and abiotic problems in teak cultivation. Among these, Ceratocystis wilt caused by the fungus Ceratocystis fimbriata currently stands out, this disease can cause symptoms such as wilting, wood darkening, wood stains and plant mortality, directly influencing the quality of the wood. Given the above, this work aimed to study the population structure and genetic diversity of a diverse collection of teak genotypes and perform associative mapping for resistance to Ceratocystis wilt. Based on genotyping data via sequencing of 211 genotypes and approximately 1.4 million SNPs, it was possible to identify four subpopulations with genetic divergence among them and to identify three candidate genomic regions associated with resistance to Ceratocystis wilt. This was the study using GWAS in teak for resistance to Ceratocystis wilt, contributing to advances in scientific and technical knowledge of teak culture, revealing information about the genetic diversity of genotypes and adding technological value to the culture, introducing a pioneering and innovative approach.Alguns fatores como a coloração da madeira, a durabilidade, o alto valor comercial, e versatilidade de utilização, tornam a teca (Tectona grandis Linn. f.) apreciada no mundo todo, principalmente para a indústria naval. Paralelo ao constante crescimento em áreas plantadas cresce também relatos sobre o aparecimento de problemas bióticos e abióticos no cultivo de teca. Dentre estes, atualmente destaca-se a murcha de Ceratocystis causada pelo fungo Ceratocystis fimbriata, esta doença pode causar sintomas como murcha, escurecimento do lenho, manchas na madeira e mortalidade das plantas, influenciando diretamente na qualidade da madeira. Diante do exposto, este trabalho teve como objetivo estudar a estrutura populacional e a diversidade genética de uma coleção diversa de genótipos de teca, e realizar o mapeamento associativo quanto a resistência à murcha de Ceratocystis. Com base em dados de genotipagem via sequenciamento de 211 genótipos e aproximadamente 1.4 milhões de SNPs, foi possível identificar quatro subpopulações com divergência genética entre elas e identificar três regiões genômicas candidatas associadas a resistência à murcha de Ceratocystis. Este foi o estudo utilizando GWAS em teca quanto a resistência à murcha de Ceratocystis, contribuindo para avanços no conhecimento científico e técnico da cultura da teca, revelando informações sobre a diversidade genética dos genótipos e agregando valor tecnológico à cultura, introduzindo uma abordagem pioneira e inovadora.Universidade Federal de Mato GrossoBrasilInstituto de Biociências (IB)UFMT CUC - CuiabáPrograma de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biodiversidade – Rede Pró-Centro-Oeste - PPGBBNeves, Leonarda GrilloAragão, Francisco José Limahttp://lattes.cnpq.br/6121745125946782http://lattes.cnpq.br/3946495636938478Neves, Leonarda Grillo035.679.447-46http://lattes.cnpq.br/3946495636938478Valentini, Giseli056.390.199-30http://lattes.cnpq.br/7744263088443824035.679.447-46308.609.971-20Gilio, Thiago Alexandre Santanahttp://lattes.cnpq.br/5822315006105369369.206.898-04Gilio, Thiago Alexandre Santana369.206.898-04http://lattes.cnpq.br/5822315006105369Contreras Soto, Rodrigo Iván012.957.029-08http://lattes.cnpq.br/3300961366240937Anjos, Isabela Vera dos2025-03-26T11:45:49Z2023-08-112025-03-26T11:45:49Z2023-07-31info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisANJOS, Isabela Vera dos. Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética. 2023. 104 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade) - Rede Pró-Centro-Oeste, Universidade Federal de Mato Grosso, Instituto de Biociências, Cuiabá, 2023.http://ri.ufmt.br/handle/1/6659porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFMTinstname:Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT)instacron:UFMT2025-03-29T07:02:19Zoai:localhost:1/6659Repositório InstitucionalPUBhttp://ri.ufmt.br/oai/requestjordanbiblio@gmail.comopendoar:2025-03-29T07:02:19Repositório Institucional da UFMT - Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT)false
dc.title.none.fl_str_mv Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética
title Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética
spellingShingle Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética
Anjos, Isabela Vera dos
Genotipagem
SNP
GWAS
Murcha de Ceratocystis
Tectona grandis
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Genotyping
SNP
GWAS
Ceratocystis wilt
Tectona grandis
title_short Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética
title_full Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética
title_fullStr Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética
title_full_unstemmed Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética
title_sort Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética
author Anjos, Isabela Vera dos
author_facet Anjos, Isabela Vera dos
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Neves, Leonarda Grillo
Aragão, Francisco José Lima
http://lattes.cnpq.br/6121745125946782
http://lattes.cnpq.br/3946495636938478
Neves, Leonarda Grillo
035.679.447-46
http://lattes.cnpq.br/3946495636938478
Valentini, Giseli
056.390.199-30
http://lattes.cnpq.br/7744263088443824
035.679.447-46
308.609.971-20
Gilio, Thiago Alexandre Santana
http://lattes.cnpq.br/5822315006105369
369.206.898-04
Gilio, Thiago Alexandre Santana
369.206.898-04
http://lattes.cnpq.br/5822315006105369
Contreras Soto, Rodrigo Iván
012.957.029-08
http://lattes.cnpq.br/3300961366240937
dc.contributor.author.fl_str_mv Anjos, Isabela Vera dos
dc.subject.por.fl_str_mv Genotipagem
SNP
GWAS
Murcha de Ceratocystis
Tectona grandis
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Genotyping
SNP
GWAS
Ceratocystis wilt
Tectona grandis
topic Genotipagem
SNP
GWAS
Murcha de Ceratocystis
Tectona grandis
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Genotyping
SNP
GWAS
Ceratocystis wilt
Tectona grandis
description Some factors such as wood color, durability, high commercial value, and versatility of use, make teak (Tectona grandis Linn. f.) appreciated all over the world, mainly for the shipbuilding industry. Parallel to the constant growth in planted areas, there are also reports on the appearance of biotic and abiotic problems in teak cultivation. Among these, Ceratocystis wilt caused by the fungus Ceratocystis fimbriata currently stands out, this disease can cause symptoms such as wilting, wood darkening, wood stains and plant mortality, directly influencing the quality of the wood. Given the above, this work aimed to study the population structure and genetic diversity of a diverse collection of teak genotypes and perform associative mapping for resistance to Ceratocystis wilt. Based on genotyping data via sequencing of 211 genotypes and approximately 1.4 million SNPs, it was possible to identify four subpopulations with genetic divergence among them and to identify three candidate genomic regions associated with resistance to Ceratocystis wilt. This was the study using GWAS in teak for resistance to Ceratocystis wilt, contributing to advances in scientific and technical knowledge of teak culture, revealing information about the genetic diversity of genotypes and adding technological value to the culture, introducing a pioneering and innovative approach.
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-08-11
2023-07-31
2025-03-26T11:45:49Z
2025-03-26T11:45:49Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv ANJOS, Isabela Vera dos. Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética. 2023. 104 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade) - Rede Pró-Centro-Oeste, Universidade Federal de Mato Grosso, Instituto de Biociências, Cuiabá, 2023.
http://ri.ufmt.br/handle/1/6659
identifier_str_mv ANJOS, Isabela Vera dos. Regiões genômicas relacionadas a resistência da teca e novas abordagens para a variabilidade genética. 2023. 104 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade) - Rede Pró-Centro-Oeste, Universidade Federal de Mato Grosso, Instituto de Biociências, Cuiabá, 2023.
url http://ri.ufmt.br/handle/1/6659
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Mato Grosso
Brasil
Instituto de Biociências (IB)
UFMT CUC - Cuiabá
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biodiversidade – Rede Pró-Centro-Oeste - PPGBB
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Mato Grosso
Brasil
Instituto de Biociências (IB)
UFMT CUC - Cuiabá
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biodiversidade – Rede Pró-Centro-Oeste - PPGBB
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFMT
instname:Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT)
instacron:UFMT
instname_str Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT)
instacron_str UFMT
institution UFMT
reponame_str Repositório Institucional da UFMT
collection Repositório Institucional da UFMT
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFMT - Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT)
repository.mail.fl_str_mv jordanbiblio@gmail.com
_version_ 1856657567117213696

Registros relacionados