"Draft" genoma e análise filogenética do Trypanosoma caninum

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2020
Autor(a) principal: Moreira, Janaina Marcela Assunção Rosa
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Mato Grosso
Brasil
Faculdade de Agronomia, Medicina Veterinária e Zootecnia (FAMEVZ)
UFMT CUC - Cuiabá
Programa de Pós-Graduação em Ciências Veterinárias
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Cão
Filogenia
Sequenciamento de nova geração
Trypanosoma caninum
Tripanosomatídeo
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::MEDICINA VETERINARIA
Dog
Next generation
Sequencing phylogeny
Trypanosomatid
Link de acesso: http://ri.ufmt.br/handle/1/4524
Resumo: Described in the last decade, infecting dogs in several Brazilian regions, biological and epidemiological aspects of Trypanosoma caninum infection are still unknown. Accept advances in New Generation Sequencing (SNG) techniques, the study of an evolutionary biology of trypanosomatids that had a substantial increase in genetic information. Thus, the objective of this study was to present information about the genome of this species and to carry out a genetic comparison with other trypanosomatids, using the Miseq platform for partial genome sequencing. Phylogenetically, T. caninum demonstrated proximity to T. cruzi and T. rangeli. The adaptation of this parasite to the domestic dog and a probable reduction in its genome may be related to its evolutionary process. In addition, genome sequencing also made it possible to investigate target genes / proteins for their specific diagnosis. Thus, the 5 '-AGCCAATAGCAAGGGTGGAA-3' and 5 '- GCGTCATCCATTTTCGAGGC-3' oligonucleotides were designed in the 18S region of the T. caninum rDNA that amplifies a 248 bp product. These oligonucleotides are the most sensitive and sensitive to T. caninum, but the minimum detection limit was 10 DNA records of the parasite.
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