Utilização de redes em cápsulas para classificação de regiões promotoras em sequências de DNA.

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2018
Autor(a) principal: Moraes, Lauro Ângelo Gonçalves de
Orientador(a): Moreira, Gladston Juliano Prates
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Reconhecimento de padrões
Bioinformática
Link de acesso: http://www.repositorio.ufop.br/handle/123456789/10106
Resumo: Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação. Departamento de Ciência da Computação, Instituto de Ciências Exatas e Biológicas, Universidade Federal de Ouro Preto.
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Uma importante tarefa é a anotação genômica funcional, que necessita para seu êxito, identificar corretamente as chamadas regiões promotoras, que exercem importantes funções regulatórias de transcrição genética. Apesar de diversas metodologias terem sido propostas na literatura para a identificação destas regiões, este ainda não é um problema bem resolvido. Alguns trabalhos foram realizados utilizando diferentes arquiteturas de redes neurais artificiais. Em 2017 foi apresentada para o mundo uma arquitetura baseada em cápsulas, bastante diferente das tradicionais, que se mostrou bastante eficiente em processar imagens de dígitos. Entretanto, ainda faltam aplicações e validações deste modelo em outras áreas. Na área de bioinformática ainda não há registros do uso de redes em cápsulas, assim, este trabalho realiza uma experimentação deste novo modelo para o problema de classificação de regiões promotoras em DNA. Utilizando duas bases de dados de organismos procariontes e cinco de eucariontes, foram testadas uma arquitetura convolucional retirada da literatura e uma arquitetura em cápsulas desenvolvida neste trabalho. Os modelos foram testados e suas capacidades preditivas descritas, segundo diferentes tipos de métricas. Os resultados mostram que as redes em cápsulas obtiveram bons resultados nos testes e são comparáveis com a rede convolucional da literatura atual.Autorização concedida ao Repositório Institucional da UFOP pelo(a) autor(a) em 07/08/2018 com as seguintes condições: disponível sob Licença Creative Commons 4.0 que permite copiar, distribuir e transmitir o trabalho desde que sejam citados o autor e o licenciante.info:eu-repo/semantics/openAccessReconhecimento de padrõesBioinformáticaUtilização de redes em cápsulas para classificação de regiões promotoras em sequências de DNA.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFOPinstname:Universidade Federal de Ouro Preto (UFOP)instacron:UFOPLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8924https://www.repositorio.ufop.br/bitstreams/ec2d2be4-cf74-46be-87eb-d5eef2918373/download62604f8d955274beb56c80ce1ee5dcaeMD55falseAnonymousREADCC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-846https://www.repositorio.ufop.br/bitstreams/2e817d60-607d-4cea-a638-b0fcf8531c6d/download6f1da3ff281999354d4abd56d1551468MD52falseAnonymousREADlicense_textlicense_texttext/html; charset=utf-80https://www.repositorio.ufop.br/bitstreams/6010f3a0-d9ae-4564-bbc8-17260de23db0/downloadd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53falseAnonymousREADlicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-80https://www.repositorio.ufop.br/bitstreams/a15e03c3-5d06-484f-8660-c23f1fbe2156/downloadd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54falseAnonymousREADORIGINALDISSERTAÇÃO_UtilizaçãoRedesCápsulas.pdfDISSERTAÇÃO_UtilizaçãoRedesCápsulas.pdfapplication/pdf4405189https://www.repositorio.ufop.br/bitstreams/61a9b375-044a-47ae-a4e1-e7b81676514d/download5f9679e6b382dfb1629da736b5c271bcMD51trueAnonymousREADTHUMBNAILDISSERTAÇÃO_UtilizaçãoRedesCápsulas.pdf.jpgDISSERTAÇÃO_UtilizaçãoRedesCápsulas.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2381https://www.repositorio.ufop.br/bitstreams/5e57ac4f-22b9-49e1-9228-e79af661f28a/downloade9a1984b046ccc7755e7e765743b4504MD56falseAnonymousREAD123456789/101062024-11-11 02:04:21.479open.accessoai:repositorio.ufop.br:123456789/10106https://www.repositorio.ufop.brRepositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufop.br/oai/requestrepositorio@ufop.edu.bropendoar:32332024-11-11T05:04:21Repositório Institucional da UFOP - Universidade Federal de Ouro Preto (UFOP)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