Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil
| Ano de defesa: | 2014 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal da Paraíba
Brasil Biologia Celular e Molecular Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular UFPB |
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3658 |
Resumo: | The MTHFR 677C>T variant (rs1801133) has been analysed as a putative genetic risk factor for oral clefts within various populations worldwide. To test the role of the MTHFR 677C>T variant in nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) predisposition in the Brazilian population, we conducted a study combining a family-based association test (transmission disequilibrium test-TDT) and a structured association analysis (case-control study) based on the individual ancestry proportions. The rs1801133 polimorphism was genotyped in 197 trios with NSCL/P, 318 isolated samples of NSCL/P and 598 healthy controls using the TaqMan 5′- exonuclease allelic discrimination assay. Genomic ancestry was characterized by a set of 40 biallelic short insertion/deletion markers. TDT revealed a strong association of rs1801133 polymorphism with case-parent trios of NSCL/P (p=0.002) and non-syndromic cleft lip and palate (NSCLP, p=0.001), but not with non-syndromic cleft lip (NSCL). Analyses of parent-oforigin effects demonstrated modest excess transmission of the risk allele from mothers of NSCLP (OR: 1.47, 95% CI: 1.10-2.14, p=0.04). The structured case-control analysis supported these findings, revealing that the risk T allele was significantly more frequent in NSCL/P group (OR: 1.37, 95% CI: 1.12-1.69, p=0.002) and NSCLP (OR: 1.41, 95% CI: 1.12-1.79, p=0.01) than the control group. Our findings provide evidence for the involvement of rs1801133 in the development of NSCL/P in the Brazilian population, and reinforce the importance of genetic screening in populations at risk in order to optimize the implementation of preventive strategies. |
| id |
UFPB-2_27a6ea06232b370b0a41dbe75f3773cc |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufpb.br:tede/3658 |
| network_acronym_str |
UFPB-2 |
| network_name_str |
Repositório Institucional da UFPB |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no BrasilFissura Labial e Labiopalatina não sindrômicasPolimorfismo do Gene MTHFREstudo Caso-ControleTeste de Desequilíbrio de Transmissão - TDTMonsyndromic cleft lip palateMTHFR polymorphismCase-Control StudiesTransmission disequilibrium testCIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALThe MTHFR 677C>T variant (rs1801133) has been analysed as a putative genetic risk factor for oral clefts within various populations worldwide. To test the role of the MTHFR 677C>T variant in nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) predisposition in the Brazilian population, we conducted a study combining a family-based association test (transmission disequilibrium test-TDT) and a structured association analysis (case-control study) based on the individual ancestry proportions. The rs1801133 polimorphism was genotyped in 197 trios with NSCL/P, 318 isolated samples of NSCL/P and 598 healthy controls using the TaqMan 5′- exonuclease allelic discrimination assay. Genomic ancestry was characterized by a set of 40 biallelic short insertion/deletion markers. TDT revealed a strong association of rs1801133 polymorphism with case-parent trios of NSCL/P (p=0.002) and non-syndromic cleft lip and palate (NSCLP, p=0.001), but not with non-syndromic cleft lip (NSCL). Analyses of parent-oforigin effects demonstrated modest excess transmission of the risk allele from mothers of NSCLP (OR: 1.47, 95% CI: 1.10-2.14, p=0.04). The structured case-control analysis supported these findings, revealing that the risk T allele was significantly more frequent in NSCL/P group (OR: 1.37, 95% CI: 1.12-1.69, p=0.002) and NSCLP (OR: 1.41, 95% CI: 1.12-1.79, p=0.01) than the control group. Our findings provide evidence for the involvement of rs1801133 in the development of NSCL/P in the Brazilian population, and reinforce the importance of genetic screening in populations at risk in order to optimize the implementation of preventive strategies.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESEntre os prováveis fatores de risco genético para as fissuras orais, está o polimorfismo rs1801133 do gene MTHFR (677C>T). O papel desse polimorfismo com relação à predisposição para fissuras não-sindrômicas do lábio com ou sem o envolvimento do palato (FL/P) foi analisado na população Brasileira. Utilizou-se duas abordagens, um teste de associação de base familiar (teste de desequilíbrio de transmissão TDT) e um estudo casocontrole baseado nas proporções individuais de ancestralidade. Na análise TDT o polimorfismo rs1801133 foi genotipado em 197 trios (o afetado e seus respectivos pais). No estudo casocontrole foram incluídos 318 indivíduos fissurados e 598 controles não portadores de fissuras ou qualquer outra anomalia. Realizou-se ensaio de discriminação alélica TaqMan 5′- exonuclease. A ancestralidade genômica foi caracterizada por um conjunto de 40 marcadores bialélicos de curta inserção / deleção. O TDT revelou uma forte associação entre o polimorfismo rs1801133 nos trios de portadores de FL/P (p=0,002) como também nos trios de fissuras labiopalatinas (FLP, p=0,001), mas não apresentou associação com fissuras labiais isoladas (FL). A análise da origem parental do alelo T mostrou excesso de transmissão, por parte das mães, nos trios de portadores de FLP (OR: 1.47, 95%CI: 1.10-2.14, p=0,04). O estudo caso-controle corroborou com os resultados obtidos no TDT, demonstrando que o alelo polimórfico 677T foi significantemente mais frequente no grupo de portadores de FL/P (OR: 1.37, 95% CI: 1.12-1.69, p=0,002) e de FLP (OR: 1.41, 95% CI 1.12-1.79, p=0,01) quando comparada ao grupo controle. Em conclusão, o presente estudo sugere correlação entre o polimorfismo rs1801133 e o desenvolvimento de FL/P na população brasileira, e reforça a importância da triagem genética nas famílias dos afetados para otimizar a aplicação de medidas preventivas.Universidade Federal da ParaíbaBrasilBiologia Celular e MolecularPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularUFPBPersuhn, Darlene Camatihttp://lattes.cnpq.br/0123092798297250Aguiar, Pamella Kelly Farias de2015-04-01T14:16:05Z2018-07-20T23:36:01Z2014-11-112018-07-20T23:36:01Z2014-08-27info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfAGUIAR, Pamella Kelly Farias de. Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil. 2014. 65 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal da Paraíba, João Pessoa, 2014.https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3658porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPBinstname:Universidade Federal da Paraíba (UFPB)instacron:UFPB2018-09-05T23:36:53Zoai:repositorio.ufpb.br:tede/3658Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpb.br/oai/requestdiretoria@ufpb.br||bdtd@biblioteca.ufpb.bropendoar:25462018-09-05T23:36:53Repositório Institucional da UFPB - Universidade Federal da Paraíba (UFPB)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil |
| title |
Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil |
| spellingShingle |
Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil Aguiar, Pamella Kelly Farias de Fissura Labial e Labiopalatina não sindrômicas Polimorfismo do Gene MTHFR Estudo Caso-Controle Teste de Desequilíbrio de Transmissão - TDT Monsyndromic cleft lip palate MTHFR polymorphism Case-Control Studies Transmission disequilibrium test CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
| title_short |
Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil |
| title_full |
Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil |
| title_fullStr |
Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil |
| title_full_unstemmed |
Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil |
| title_sort |
Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil |
| author |
Aguiar, Pamella Kelly Farias de |
| author_facet |
Aguiar, Pamella Kelly Farias de |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Persuhn, Darlene Camati http://lattes.cnpq.br/0123092798297250 |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Aguiar, Pamella Kelly Farias de |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Fissura Labial e Labiopalatina não sindrômicas Polimorfismo do Gene MTHFR Estudo Caso-Controle Teste de Desequilíbrio de Transmissão - TDT Monsyndromic cleft lip palate MTHFR polymorphism Case-Control Studies Transmission disequilibrium test CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
| topic |
Fissura Labial e Labiopalatina não sindrômicas Polimorfismo do Gene MTHFR Estudo Caso-Controle Teste de Desequilíbrio de Transmissão - TDT Monsyndromic cleft lip palate MTHFR polymorphism Case-Control Studies Transmission disequilibrium test CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
| description |
The MTHFR 677C>T variant (rs1801133) has been analysed as a putative genetic risk factor for oral clefts within various populations worldwide. To test the role of the MTHFR 677C>T variant in nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) predisposition in the Brazilian population, we conducted a study combining a family-based association test (transmission disequilibrium test-TDT) and a structured association analysis (case-control study) based on the individual ancestry proportions. The rs1801133 polimorphism was genotyped in 197 trios with NSCL/P, 318 isolated samples of NSCL/P and 598 healthy controls using the TaqMan 5′- exonuclease allelic discrimination assay. Genomic ancestry was characterized by a set of 40 biallelic short insertion/deletion markers. TDT revealed a strong association of rs1801133 polymorphism with case-parent trios of NSCL/P (p=0.002) and non-syndromic cleft lip and palate (NSCLP, p=0.001), but not with non-syndromic cleft lip (NSCL). Analyses of parent-oforigin effects demonstrated modest excess transmission of the risk allele from mothers of NSCLP (OR: 1.47, 95% CI: 1.10-2.14, p=0.04). The structured case-control analysis supported these findings, revealing that the risk T allele was significantly more frequent in NSCL/P group (OR: 1.37, 95% CI: 1.12-1.69, p=0.002) and NSCLP (OR: 1.41, 95% CI: 1.12-1.79, p=0.01) than the control group. Our findings provide evidence for the involvement of rs1801133 in the development of NSCL/P in the Brazilian population, and reinforce the importance of genetic screening in populations at risk in order to optimize the implementation of preventive strategies. |
| publishDate |
2014 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2014-11-11 2014-08-27 2015-04-01T14:16:05Z 2018-07-20T23:36:01Z 2018-07-20T23:36:01Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
AGUIAR, Pamella Kelly Farias de. Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil. 2014. 65 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal da Paraíba, João Pessoa, 2014. https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3658 |
| identifier_str_mv |
AGUIAR, Pamella Kelly Farias de. Análise da influência do polimorfismo rs1801133 (677c>t) no gene mthfr em fissuras labiais com ou sem fissura palatina não sindrômicas: estudo de base familiar e populacional pareado por ancestralidade no Brasil. 2014. 65 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal da Paraíba, João Pessoa, 2014. |
| url |
https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3658 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal da Paraíba Brasil Biologia Celular e Molecular Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular UFPB |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal da Paraíba Brasil Biologia Celular e Molecular Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular UFPB |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFPB instname:Universidade Federal da Paraíba (UFPB) instacron:UFPB |
| instname_str |
Universidade Federal da Paraíba (UFPB) |
| instacron_str |
UFPB |
| institution |
UFPB |
| reponame_str |
Repositório Institucional da UFPB |
| collection |
Repositório Institucional da UFPB |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFPB - Universidade Federal da Paraíba (UFPB) |
| repository.mail.fl_str_mv |
diretoria@ufpb.br||bdtd@biblioteca.ufpb.br |
| _version_ |
1863378944653262848 |