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Filogenia do gênero Chomelia (Rubiaceae) e revisão taxonômica das espécies brasileiras

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2016
Autor(a) principal: PESSOA, Maria do Céo Rodrigues
Orientador(a): BARBOSA, Maria Regina de Vasconcellos
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Pernambuco
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pos Graduacao em Biologia Vegetal
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Rubiaceae
Botânica- classificação
Filogenia
Link de acesso: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/27096
Resumo: Chomelia Jaq., um dos gêneros neotropicais mais diversos de Rubiaceae, está subordinado a tribo Guettardeae, que apresenta delimitações genéricas controversas e é carente de tratamentos modernos para seus gêneros. Análises filogenéticas realizadas para a família, outras tribos e/ou gêneros, mostraram pouco elucidativas do ponto de vista intergenérico para Guettardeae. Chomelia apresenta uma grande variação morfológica intraespecífica tornando difícil a delimitação de suas espécies. Diante disso, este trabalho teve como principais objetivos investigar as relações filogenéticas de Chomelia e gêneros relacionados, bem como testar o seu monofiletismo, contribuindo para uma melhor compreensão da tribo Guettardeae, e também realizar o tratamento taxonômico das espécies brasileiras de Chomelia. A metodologia incluiu trabalhos de campo, revisão de material de herbários brasileiros e estrangeiros, análises morfológicas e nomenclaturais, bem como análises moleculares utilizando técnicas de Sequenciamento de Nova Geração (Next Generation Sequencing) e métodos de captura de sequências. Para o tratamento taxonômico foram analisados cerca de 4 mil espécimes de Chomelia e gêneros relacionados e estudados os tipos nomenclaturais e protólogos dos 177 binômios publicados. No estudo filogenético foram incluídos 92 acessos englobando as três subfamílias de Rubiaceae e todos os gêneros de Guettardeae. Os resultados estão apresentados na forma de três capítulos: 1) Ensaio filogenético para a tribo Guettardeae com ênfase em Chomelia; 2) Revisão Taxonômica do gênero Chomelia no Brasil; 3) Novo registro de uma espécie amazônica de Chomelia para o Brasil. No tratamento taxonômico são reconhecidas 15 espécies de Chomelia para o Brasil, incluindo uma nova ocorrência, e são propostas 17 sinonimizações e 11 lectotipificações. Os resultados do estudo filogenético molecular permitiram reconhecer Chomelia s. str. como um gênero monofilético e distinto de Guettarda, e irmão de Tournefortiopsis.
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spelling PESSOA, Maria do Céo Rodrigueshttp://lattes.cnpq.br/2206582263136550http://lattes.cnpq.br/7317817178235471BARBOSA, Maria Regina de Vasconcellos2018-09-28T18:01:01Z2018-09-28T18:01:01Z2016-08-24https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/27096Chomelia Jaq., um dos gêneros neotropicais mais diversos de Rubiaceae, está subordinado a tribo Guettardeae, que apresenta delimitações genéricas controversas e é carente de tratamentos modernos para seus gêneros. Análises filogenéticas realizadas para a família, outras tribos e/ou gêneros, mostraram pouco elucidativas do ponto de vista intergenérico para Guettardeae. Chomelia apresenta uma grande variação morfológica intraespecífica tornando difícil a delimitação de suas espécies. Diante disso, este trabalho teve como principais objetivos investigar as relações filogenéticas de Chomelia e gêneros relacionados, bem como testar o seu monofiletismo, contribuindo para uma melhor compreensão da tribo Guettardeae, e também realizar o tratamento taxonômico das espécies brasileiras de Chomelia. A metodologia incluiu trabalhos de campo, revisão de material de herbários brasileiros e estrangeiros, análises morfológicas e nomenclaturais, bem como análises moleculares utilizando técnicas de Sequenciamento de Nova Geração (Next Generation Sequencing) e métodos de captura de sequências. Para o tratamento taxonômico foram analisados cerca de 4 mil espécimes de Chomelia e gêneros relacionados e estudados os tipos nomenclaturais e protólogos dos 177 binômios publicados. No estudo filogenético foram incluídos 92 acessos englobando as três subfamílias de Rubiaceae e todos os gêneros de Guettardeae. Os resultados estão apresentados na forma de três capítulos: 1) Ensaio filogenético para a tribo Guettardeae com ênfase em Chomelia; 2) Revisão Taxonômica do gênero Chomelia no Brasil; 3) Novo registro de uma espécie amazônica de Chomelia para o Brasil. No tratamento taxonômico são reconhecidas 15 espécies de Chomelia para o Brasil, incluindo uma nova ocorrência, e são propostas 17 sinonimizações e 11 lectotipificações. Os resultados do estudo filogenético molecular permitiram reconhecer Chomelia s. str. como um gênero monofilético e distinto de Guettarda, e irmão de Tournefortiopsis.CAPESChomelia Jacq., one of the most diverse Neotropical genera of Rubiaceae, is positioned within the tribe Guettardeae, which has controversial generic boundaries and is lacking modern treatments of its genera. Chomelia presents a large intraspecific morphological variation that difficults the delimitation of its species. Phylogenetic analyzes within the family, other tribes and/or genera, showed little intergeneric resolution to Guettardeae. Thus, this work had as main objectives investigate the phylogenetic relationship of Chomelia and related genera, test its monophyly, contributing to a better understanding of Guettardeae, and conduct the taxonomic revision of the Brazilian species of Chomelia. The methodology included field work, review of Brazilian and foreign herbaria material, morphological, nomenclatural and molecular analysis, the latter using Next Generation Sequencing techniques and methods of sequence capture. For the taxonomic treatment about 4000 specimens of Chomelia and related genera were analyzed and studied the nomenclatural types and protologues of 177 published binomials. The phylogenetic study included 92 accessions representing the three subfamilies of Rubiaceae and all genera of Guettardeae. The results are presented as three chapters: 1) A phylogenetic analysis of Guettardeae with emphasis on Chomelia; 2) The taxonomic treatment of Brazilian species of Chomelia; 3) A new record of a Brazilian Amazonian species of Chomelia. In the taxonomic treatment 15 species of Chomelia are recognized within Brazil, including the new reference, and 17 synonymous and 11 lectotypes are proposed. The results of the molecular phylogenetic study allowed recognizing Chomelia s. str. as monophyletic and distinct from Guettarda, and sister to Tournefortiopsis.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pos Graduacao em Biologia VegetalUFPEBrasilAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessRubiaceaeBotânica- classificaçãoFilogeniaFilogenia do gênero Chomelia (Rubiaceae) e revisão taxonômica das espécies brasileirasFilogenia do gênero Chomelia Jacq. (Rubiaceae) e revisão taxonômica das espécies brasileirasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisdoutoradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPETHUMBNAILTESE Maria do Céo Rodrigues Pessoa.pdf.jpgTESE Maria do Céo Rodrigues Pessoa.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1128https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/27096/5/TESE%20Maria%20do%20C%c3%a9o%20Rodrigues%20Pessoa.pdf.jpgfa9ac4eba7c8beb4d49aa00e93aff080MD55ORIGINALTESE Maria do Céo Rodrigues Pessoa.pdfTESE Maria do Céo Rodrigues Pessoa.pdfapplication/pdf2139173https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/27096/1/TESE%20Maria%20do%20C%c3%a9o%20Rodrigues%20Pessoa.pdf6020beeb24a69f4529a47eaafdff4562MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/27096/2/license_rdfe39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82311https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/27096/3/license.txt4b8a02c7f2818eaf00dcf2260dd5eb08MD53TEXTTESE Maria do Céo Rodrigues Pessoa.pdf.txtTESE Maria do Céo Rodrigues Pessoa.pdf.txtExtracted texttext/plain290456https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/27096/4/TESE%20Maria%20do%20C%c3%a9o%20Rodrigues%20Pessoa.pdf.txtaf6a01ba80522b5b6af8ee68ee64cb1cMD54123456789/270962019-10-25 08:30:57.685oai:repositorio.ufpe.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212019-10-25T11:30:57Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false
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