Desenvolvimento de vetor para carreamento de RNA de interferência utilizando Pichia pastoris como sistema de entrega

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2026
Autor(a) principal: MELO, Karina Mayumi Tani Bezerra de
Orientador(a): PITA, Will de Barros
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Pernambuco
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pos Graduacao em Biotecnologia
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/71461
Resumo: O microambiente tumoral (TME) é um ambiente heterogêneo e apresenta um papel importante no desenvolvimento tumoral. É constituído por componentes celulares e extracelulares que interagem entre si, favorecendo diferentes processos carcinogênicos. Devido ao seu papel, modular seus componentes se mostra uma alternativa interessante para gerar respostas antitumorais. Dentre esses componentes, macrófagos associados ao tumor (TAMs), mais especificamente do perfil M2, se tornam potenciais alvos de estudo. Esta classe de macrófagos apresenta um perfil pró-tumoral, estimulando a imunossupressão e a carcinogênese. Um receptor responsável pela polarização e manutenção de M2, é o receptor do fator estimulante de colônia 1 (CSF1R). O bloqueio desta via de sinalização demonstra potencial na diminuição de M2 e reversão do TME. Assim, esse bloqueio se torna uma estratégia interessante para cânceres com uma alta expressão do CSF1R, como o câncer cervical. Uma maneira de modular a expressão desse receptor é usando o RNA de interferência (RNAi). Entretanto, uma das dificuldades para estabelecer abordagens de imunomodulação é a garantia de um delivery específico para as células adequadas. Leveduras, como a Pichia pastoris, têm se mostrado carreadores interessantes devido a sua interação com receptores de macrófagos e células dendríticas, e tem emergido como potenciais vetores para entrega de DNA, RNAm e RNAi. Desse modo, o presente trabalho visa o desenvolvimento de um vetor contendo o shRNA para ser carreado pela levedura P. pastoris, tendo como alvo o CSF1R para modular a expressão de macrófagos M2, visando induzir um perfil antitumoral nos macrófagos associados a tumores HPV-positivos. Para isso, diferentes sequências de short hairpin RNA (shRNA) foram selecionadas, tendo como alvo a sequência do CSF1R de Mus musculus de acordo com o seu potencial de se ligar ao RNAm e de não interferir na expressão de outros genes. Durante a execução do trabalho, uma sequência foi inserida no vetor de expressão pLT-hU6-miR30. Esse vetor construído, além de ser utilizado para verificação da sua funcionalidade em modular a expressão do CSF1R, foi inserido na P. pastoris através do processo de eletroporação. Além disso, um vetor, o pEGFP-mCSF1R, foi construído para verificação da modulação da expressão do CSF1R através da fluorescência do gene da GFP (Green Fluorescent Protein) e citometria de fluxo. Na análise da citometria de fluxo foi observado o potencial da sequência inserida no vetor de expressão em silenciar o gene mCSF1R, mais especificamente, na proporção 3:1 (pLT-hU6-miR30-shRNA3:pEGFP-mCSF1R). No estudo também foi realizada a inserção dos vetores na P. pastoris, porém a confirmação foi realizada, apenas, pelo antibiótico marcador de seleção Zeocina, podendo ser complementada por PCR. Após as confirmações, novos estudos devem ser realizados para confirmação da modulação da expressão do mCSF1R e do perfil de macrófagos, a partir da utilização da levedura como vetor de entrega, bem como o potencial antitumoral do produto gerado.
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É constituído por componentes celulares e extracelulares que interagem entre si, favorecendo diferentes processos carcinogênicos. Devido ao seu papel, modular seus componentes se mostra uma alternativa interessante para gerar respostas antitumorais. Dentre esses componentes, macrófagos associados ao tumor (TAMs), mais especificamente do perfil M2, se tornam potenciais alvos de estudo. Esta classe de macrófagos apresenta um perfil pró-tumoral, estimulando a imunossupressão e a carcinogênese. Um receptor responsável pela polarização e manutenção de M2, é o receptor do fator estimulante de colônia 1 (CSF1R). O bloqueio desta via de sinalização demonstra potencial na diminuição de M2 e reversão do TME. Assim, esse bloqueio se torna uma estratégia interessante para cânceres com uma alta expressão do CSF1R, como o câncer cervical. Uma maneira de modular a expressão desse receptor é usando o RNA de interferência (RNAi). Entretanto, uma das dificuldades para estabelecer abordagens de imunomodulação é a garantia de um delivery específico para as células adequadas. Leveduras, como a Pichia pastoris, têm se mostrado carreadores interessantes devido a sua interação com receptores de macrófagos e células dendríticas, e tem emergido como potenciais vetores para entrega de DNA, RNAm e RNAi. Desse modo, o presente trabalho visa o desenvolvimento de um vetor contendo o shRNA para ser carreado pela levedura P. pastoris, tendo como alvo o CSF1R para modular a expressão de macrófagos M2, visando induzir um perfil antitumoral nos macrófagos associados a tumores HPV-positivos. Para isso, diferentes sequências de short hairpin RNA (shRNA) foram selecionadas, tendo como alvo a sequência do CSF1R de Mus musculus de acordo com o seu potencial de se ligar ao RNAm e de não interferir na expressão de outros genes. Durante a execução do trabalho, uma sequência foi inserida no vetor de expressão pLT-hU6-miR30. Esse vetor construído, além de ser utilizado para verificação da sua funcionalidade em modular a expressão do CSF1R, foi inserido na P. pastoris através do processo de eletroporação. Além disso, um vetor, o pEGFP-mCSF1R, foi construído para verificação da modulação da expressão do CSF1R através da fluorescência do gene da GFP (Green Fluorescent Protein) e citometria de fluxo. Na análise da citometria de fluxo foi observado o potencial da sequência inserida no vetor de expressão em silenciar o gene mCSF1R, mais especificamente, na proporção 3:1 (pLT-hU6-miR30-shRNA3:pEGFP-mCSF1R). No estudo também foi realizada a inserção dos vetores na P. pastoris, porém a confirmação foi realizada, apenas, pelo antibiótico marcador de seleção Zeocina, podendo ser complementada por PCR. Após as confirmações, novos estudos devem ser realizados para confirmação da modulação da expressão do mCSF1R e do perfil de macrófagos, a partir da utilização da levedura como vetor de entrega, bem como o potencial antitumoral do produto gerado.Tumor microenvironment (TME) is a heterogeneous environment that plays an important role in tumor development. It consists of cellular and extracellular components that interact with one another promoting several carcinogenic processes. Given its role, modulating its components is an interesting approach for inducing antitumor responses. Among these components, tumor associated macrophages (TAMs), specifically M2 phenotype, are promising targets. This class of macrophage exhibits a pro-tumoral profile, promoting immunosuppression and carcinogenesis. One receptor responsible for the polarization and maintenance of M2 macrophage is the colony-stimulating factor 1 receptor (CSF1R). Blocking this signaling pathway shows potential for reducing M2 macrophage and reversing the TME profile. Thus, this blockage represents an interesting strategy for cancers with high CSF1R expression, such as cervical cancer. One way to modulate the expression of CSF1R is through the use of RNA interference (RNAi). However, one of the challenges in establishing immunomodulatory approaches is ensuring specific delivery to the cells. Yeast has proven to be a promising carrier due to their interaction with macrophage and dendritic cell receptors and have emerged as potential vectors for delivering DNA, mRNA and RNAi. Thus, this study proposes the development of a gene therapy product using Pichia pastoris as a delivery system for RNAi targeting the CSF1R to modulate the expression of M2 macrophage, aiming the induction of an antitumor profile in macrophages associated with HPV positive tumors. To this end, different short hairpin RNA (shRNA) sequences were selected, targeting the Mus musculus CSF1R sequence based on their potential to bind to the mRNA and not interfere with other genes. During the course of the study, one sequence was inserted into the pLT-hU6-miR30 expression vector. This created vector, in addition to being used to verify its ability to modulate CSF1R expression, was introduced into P. pastoris via electroporation. In addition, pEGFP-mCSF1R was constructed to verify the modulation of CSF1R expression through the fluorescence of GFP (Green Fluorescent Protein) gene and flow cytometry. Flow cytometry analysis revealed the potential of the shRNA inserted into the expression vector to lower the expression of the mCSF1R gene, specifically at a 3:1 ratio (pLT-hU6-miR30-shRNA3:pEGFP-mCSF1R). The study also involved the insertion of the vector into P. pastoris, however confirmation was performed only using selection marker antibiotic Zeocin, which could be complemented by PCR. Following these confirmations, further studies should be conducted to confirm the modulation of CSF1R expression and the macrophage profile using yeast as a delivery vector, as well as the antitumor potential of the resulting product.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pos Graduacao em BiotecnologiaUFPEBrasilhttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessRNA de interferênciaDelivery gênicoPichia pastorisDesenvolvimento de vetor para carreamento de RNA de interferência utilizando Pichia pastoris como sistema de entregainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesismestradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPEORIGINALDISSERTAÇÃO Karina Mayumi Tani Bezerra de Melo.pdfDISSERTAÇÃO Karina Mayumi Tani Bezerra de Melo.pdfapplication/pdf6939570https://attena.ufpe.br/bitstream/123456789/71461/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Karina%20Mayumi%20Tani%20Bezerra%20de%20Melo.pdffe548b1e8a0b1d6fcfa6c399becc72d8MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82379https://attena.ufpe.br/bitstream/123456789/71461/2/license.txtb7489d4e327029c4d04d213294bf53f2MD52123456789/714612026-10-19 10:31:18.821oai:attena.ufpe.br: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ório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212026-10-19T13:31:18Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false
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