Contagem automática de ovos do mosquito Aedes aegypti utilizando métodos de aprendizagem profunda e dispositivo de baixo custo

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: SILVA, Rodrigo Emerson Valentim da
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Pernambuco
UFPE
Brasil
Programa de Pos Graduacao em Ciencia da Computacao
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/44637
Resumo: O mosquito Aedes aegypti causa grandes transtornos ao ser humano, por ser o principal vetor de transmissão de arboviroses como: Dengue, Febre Amarela, Zika e Chikungunya que infectam mais de 400 milhões de pessoas a cada ano no mundo. Uma forma eficiente de evitar o crescimento no número de casos das arboviroses citadas é com programas de vigilância vetorial que ajuda no monitoramento de propagação de doenças causadas pelo Ae. aegypti. Entre os indicadores como quantidade de ovos, larvas, pupas ou quantidade fêmeas de mosquitos que a vigilância vetorial utiliza, os dispositivos utilizados para coleta de ovos de Ae. aegypti (ovitrampas), é um dos métodos mais eficientes na capacidade de detecção da presença de mosquitos mesmo em situação de baixa infestação. As ovitrampas consistem em recipientes escuros com entradas largas preenchidas parcialmente com água e uma palheta áspera de madeira instalada verticalmente em seu interior. Elas são colocadas em pontos estratégicos e depois de um tempo, a palheta é retirada do recipiente e levada para laboratório para ser possível fazer a contagem de ovos. Esta contagem é extremamente importante, pois as ovitrampas de regiões que apresentam o maior número de ovos recebem atenção especial de órgãos públicos em campanhas de combate ao mosquito. Entretanto, a contagem desses ovos em palhetas é feita manualmente, sendo uma atividade exaustiva e repetitiva para os técnicos que precisam realizar esta tarefa. Dado o contexto, neste trabalho foi construído um dispositivo que auxilia a contagem de ovos de Ae. aegypti com menos intervenção humana. Este dispositivo capta imagens da palheta, essas imagens são dadas como entrada para algoritmos de reconhecimento automatizado possibilitando o reconhecimento de ovos e consequentemente a sua contagem. Para alcançar os objetivos da automatização desta tarefa de contagem de ovos, foi utilizado o conceito de aprendizagem profunda com Redes Neurais Convolucionais (CNNs) que configuram o estado da arte em problemas de visão computacional. Para a utilização de CNNs, foi realizado um estudo de quais modelos poderiam ser adaptados ao problema de contagem de ovos, após escolhidos os modelos foi aplicado o processo de Transferência de Aprendizado destes modelos, visto que, os melhores modelos na literatura são treinados em grandes bases de dados e o que eles aprendem nessas bases pode ser reaproveitado em outras tarefas, de modo que se consegue treiná-los em outros conjuntos de dados, tornando o processo de treinamento mais rápido e mais efetivo em outros dados. Para treinar esses modelos foi construída uma base de dados própria com imagens de ovos de Ae. aegypti, visto que, uma das dificuldades encontradas em trabalhos da literatura que abordam a contagem automática de ovos é falta de dados para treinar algoritmos para realizar esta tarefa. Os modelos de CNNs utilizados nesta dissertação apresentaram uma acurácia média no reconhecimento de ovos de 92%. Por fim, o estudo realizado servirá como base para construir uma ferramenta completa que auxilie todo o processo de contagem e tomada de decisão dos técnicos.
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As ovitrampas consistem em recipientes escuros com entradas largas preenchidas parcialmente com água e uma palheta áspera de madeira instalada verticalmente em seu interior. Elas são colocadas em pontos estratégicos e depois de um tempo, a palheta é retirada do recipiente e levada para laboratório para ser possível fazer a contagem de ovos. Esta contagem é extremamente importante, pois as ovitrampas de regiões que apresentam o maior número de ovos recebem atenção especial de órgãos públicos em campanhas de combate ao mosquito. Entretanto, a contagem desses ovos em palhetas é feita manualmente, sendo uma atividade exaustiva e repetitiva para os técnicos que precisam realizar esta tarefa. Dado o contexto, neste trabalho foi construído um dispositivo que auxilia a contagem de ovos de Ae. aegypti com menos intervenção humana. Este dispositivo capta imagens da palheta, essas imagens são dadas como entrada para algoritmos de reconhecimento automatizado possibilitando o reconhecimento de ovos e consequentemente a sua contagem. Para alcançar os objetivos da automatização desta tarefa de contagem de ovos, foi utilizado o conceito de aprendizagem profunda com Redes Neurais Convolucionais (CNNs) que configuram o estado da arte em problemas de visão computacional. Para a utilização de CNNs, foi realizado um estudo de quais modelos poderiam ser adaptados ao problema de contagem de ovos, após escolhidos os modelos foi aplicado o processo de Transferência de Aprendizado destes modelos, visto que, os melhores modelos na literatura são treinados em grandes bases de dados e o que eles aprendem nessas bases pode ser reaproveitado em outras tarefas, de modo que se consegue treiná-los em outros conjuntos de dados, tornando o processo de treinamento mais rápido e mais efetivo em outros dados. Para treinar esses modelos foi construída uma base de dados própria com imagens de ovos de Ae. aegypti, visto que, uma das dificuldades encontradas em trabalhos da literatura que abordam a contagem automática de ovos é falta de dados para treinar algoritmos para realizar esta tarefa. Os modelos de CNNs utilizados nesta dissertação apresentaram uma acurácia média no reconhecimento de ovos de 92%. Por fim, o estudo realizado servirá como base para construir uma ferramenta completa que auxilie todo o processo de contagem e tomada de decisão dos técnicos.CNPqThe Aedes aegypti mosquito causes great disturbances to humans, as it is the main vector of transmission of arboviruses such as: Dengue, Yellow Fever, Zika and Chikungunya that infect more than 400 million people each year in the world. An efficient way to prevent the increase in the number of cases of the arboviruses mentioned is with vector surveillance programs that helps the monitoring the spread of diseases caused by Ae. aegypti. Among the indicators such as number of eggs, larvae, pupae or number of female mosquitoes that vector surveillance uses are the devices used to collect Ae. aegypti eggs (ovitraps), it is one of the most efficient methods in the capacity of detecting the presence of mosquitoes even in situations of low infestation. Ovitraps consist of dark containers with wide inlets partially filled with water and a rough wooden reed installed vertically inside. They are placed at strategic points and after some time, the straw is removed from the pool and taken to the laboratory in order to count the eggs. This count is extremely important, as ovitraps from regions with high numbers of eggs receive special attention from public agencies in campaigns to combat the mosquito. However, counting eggs in straws is done manually, being an exhausting and repetitive activity for technicians who need to perform this task. Given the context, in this work, a device has been built to help to count Ae. aegypti eggs with less human intervention. This device captures images from the straw, these images are used as input to automated recognition algorithms enabling the recognition of eggs and consequently their counting. To achieve the goal of automating this task of egg counting, the concept of deep learning with Convolutional Neural Networks (CNNs) was used, which configures the state of the art in computer vision problems. In order to use CNNs, a study of which models could be adapted to the egg counting problem was carried out. After choosing the models, the Learning Transfer process of these models was applied, since the best models in the literature are trained in large databases and what they learn in these databases can be reused in other tasks, so that they can be trained in other data sets, making the training process faster and more effective on other data. In order to train these models, a database was built with images of Ae. aegypti eggs, since one of the difficulties found in studies in the literature that address the automatic counting of eggs is the lack of data to train algorithms to perform this task. The CNN models used in this work achieved an average accuracy in egg recognition of 92%. Finally, the study carried out will serve as the basis for building a complete tool that will assist the entire counting and decision-making process of technicians.Universidade Federal de PernambucoUFPEBrasilPrograma de Pos Graduacao em Ciencia da ComputacaoALMEIDA, Leandro Macielhttp://lattes.cnpq.br/5833912156208207http://lattes.cnpq.br/8513145553846486SILVA, Rodrigo Emerson Valentim da2022-06-01T16:34:00Z2022-06-01T16:34:00Z2021-12-17info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfSILVA, Rodrigo Emerson Valentim da. Contagem automática de ovos do mosquito Aedes aegypti utilizando métodos de aprendizagem profunda e dispositivo de baixo custo. 2021. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2021.https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/44637porAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPE2022-06-02T05:15:25Zoai:repositorio.ufpe.br:123456789/44637Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212022-06-02T05:15:25Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false
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