Fatores do hospedeiro associados à morte celular na recuperação imunológica de indivíduos HIV-1 positivos submetidos à terapia antirretroviral

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2022
Autor(a) principal: SANTOS, José Leandro de Andrade
Orientador(a): GUIMARÃES, Rafael Lima
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Pernambuco
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pos Graduacao em Genetica e Biologia Molecular
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/66966
Resumo: A não-recuperação imune (NRI) é uma característica clínica observada em indivíduos que fazem uso da terapia antirretroviral (TARV), onde estes alcançam a supressão da carga viral, porém, não conseguem recuperar os níveis de linfócitos T CD4+. Dentro de um aspecto multifatorial, as variáveis associadas à ocorrência da NRI são categorizadas em fatores associados à deficiência na produção de células T CD4+ e àqueles ligados à destruição exacerbada. No contexto da morte celular, a piroptose é responsável pela depleção substancial destas células. O objetivo do trabalho foi avaliar se fatores do hospedeiro podem influenciar na não recuperação imune (NRI) de indivíduos HIV-positivos sob terapia no contexto da morte celular. Variantes dos genes da via da piroptose IL18, IL1B, NLRP3, CARD8 e IFI16 foram avaliadas por sondas TaqMan alelo-específicas. Realizou-se uma análise genótipo-guiada com o gene IL18, considerando o aspecto imunofenotípico de linfócitos T CD4+ gerais (CD3+CD4+) e recém-emigradas do timo (RTE) (CD4+CD31+) em piroptose (FLICA Caspase1+). Foi analisado o perfil imunofenotípico utilizando o sexo como variável de risco à NRI em relação aos níveis de células T CD4+ RTE em piroptose. Foi realizada uma meta-análise com dados de RNA-seq, avaliando o perfil de expressão diferencial de células T CD4+ entre pacientes infectados e não-infectados com o HIV-1, seguido por análise de ontologia gênica (OG). O polimorfismo C>G no gene IL18 demonstrou uma menor susceptibilidade à não resposta imune tanto do alelo G (P=0.10) quanto do genótipo GG (P=0.022). Foi demonstrada a associação entre o polimorfismo rs187238 com os níveis de morte celular por caspase-1 (P=0.020). Observou-se que indivíduos com o genótipo GG possuem menores níveis de células T CD4+ RTE piroptóticas em comparação com o ancestral homozigoto CC (P=0.029) e o heterozigoto CG (P=0.018). O sexo masculino apresentou um maior nível de células T CD4+ RTE em comparação ao sexo feminino (P=0.035). A meta-análise evidenciou a expressão diferencial de 64 genes relacionados à dinâmica da infecção pelo HIV-1. A análise de OG encontrou dados relacionados às vias de resposta imune, migração e adesão celular, inflamação e apoptose, além das vias de sinalização Wnt, Notch e ERK/MAPK. Os dados encontrados neste estudo fornecem subsídios para uma melhor compreensão dos aspectos envolvidos com a morte celular em indivíduos HIV positivos não respondedores imunológicos.
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Dentro de um aspecto multifatorial, as variáveis associadas à ocorrência da NRI são categorizadas em fatores associados à deficiência na produção de células T CD4+ e àqueles ligados à destruição exacerbada. No contexto da morte celular, a piroptose é responsável pela depleção substancial destas células. O objetivo do trabalho foi avaliar se fatores do hospedeiro podem influenciar na não recuperação imune (NRI) de indivíduos HIV-positivos sob terapia no contexto da morte celular. Variantes dos genes da via da piroptose IL18, IL1B, NLRP3, CARD8 e IFI16 foram avaliadas por sondas TaqMan alelo-específicas. Realizou-se uma análise genótipo-guiada com o gene IL18, considerando o aspecto imunofenotípico de linfócitos T CD4+ gerais (CD3+CD4+) e recém-emigradas do timo (RTE) (CD4+CD31+) em piroptose (FLICA Caspase1+). Foi analisado o perfil imunofenotípico utilizando o sexo como variável de risco à NRI em relação aos níveis de células T CD4+ RTE em piroptose. Foi realizada uma meta-análise com dados de RNA-seq, avaliando o perfil de expressão diferencial de células T CD4+ entre pacientes infectados e não-infectados com o HIV-1, seguido por análise de ontologia gênica (OG). O polimorfismo C>G no gene IL18 demonstrou uma menor susceptibilidade à não resposta imune tanto do alelo G (P=0.10) quanto do genótipo GG (P=0.022). Foi demonstrada a associação entre o polimorfismo rs187238 com os níveis de morte celular por caspase-1 (P=0.020). Observou-se que indivíduos com o genótipo GG possuem menores níveis de células T CD4+ RTE piroptóticas em comparação com o ancestral homozigoto CC (P=0.029) e o heterozigoto CG (P=0.018). O sexo masculino apresentou um maior nível de células T CD4+ RTE em comparação ao sexo feminino (P=0.035). A meta-análise evidenciou a expressão diferencial de 64 genes relacionados à dinâmica da infecção pelo HIV-1. A análise de OG encontrou dados relacionados às vias de resposta imune, migração e adesão celular, inflamação e apoptose, além das vias de sinalização Wnt, Notch e ERK/MAPK. Os dados encontrados neste estudo fornecem subsídios para uma melhor compreensão dos aspectos envolvidos com a morte celular em indivíduos HIV positivos não respondedores imunológicos.Immune non-recovery (NRI) is a clinical feature observed in individuals who use antiretroviral therapy (ART) that achieve viral load suppression but are unable to recover CD4+ T lymphocyte levels. In a multifactorial aspect, variables associated with NRI occurrence are categorized into factors associated with deficiency in CD4+ T cells production and linked to exacerbated destruction. In cell death context, pyroptosis is responsible for substantial depletion of T CD4+ cells.The aim of this study was to evaluate whether host factors can influence the non-recovery immune (NRI) of HIV positive individuals undergoing therapy in cell death context. Variants of pyroptosis pathway genes IL18, IL1B, NLRP3, CARD8 and IFI16 were evaluated by allele-specific TaqMan probes. A genotype-guided analysis was performed with IL18 gene, considering the immunophenotypic aspect of general CD4+ T lymphocytes (CD3+CD4+) and recently emigrated from thymus (RTE) (CD4+CD31+) in pyroptosis (FLICA-Caspase1+). Immunophenotypic profile was analyzed using sex as a risk variable to NRI in relation to CD4+ RTE T cell levels in pyroptosis. A meta-analysis was performed with RNA-seq data evaluating the differential expression profile of CD4+ T cells between HIV-1 infected and non-infected patients followed by gene ontology (GO) analysis. C>G polymorphism in IL18 gene demonstrated a lower susceptibility to non-immune response of both G allele (P=0.10) and GG genotype (P=0.022). Association between rs187238 polymorphism and levels of cell death by caspase-1 (P=0.020) was demonstrated. It was observed that individuals with GG genotype have lower levels of pyroptotic RTE CD4+ T cells compared to homozygous CC ancestor (P=0.029) and CG heterozygote (P=0.018). Males had a higher level of CD4+ RTE T cells compared to females (P=0.035). Meta-analysis showed the differential expression of 64 genes related to HIV-1 infection dynamics. OG analysis found data related to immune response pathways, cell migration and adhesion, inflammation and apoptosis, in addition to Wnt, Notch and ERK/MAPK signaling pathways. The data found in this study provide subsidies for a better understanding of aspects involved with cell death in HIV-positive individuals non-immune responders.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pos Graduacao em Genetica e Biologia MolecularUFPEBrasilhttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessImunogenéticaAntirretroviraisPiroptoseFatores do hospedeiro associados à morte celular na recuperação imunológica de indivíduos HIV-1 positivos submetidos à terapia antirretroviralinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisdoutoradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPEORIGINALTESE Jose Leandro de Andrade Santos.pdfTESE Jose Leandro de Andrade Santos.pdfapplication/pdf5414517https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/66966/1/TESE%20Jose%20Leandro%20de%20Andrade%20Santos.pdf20cc9548368c8db442def8c672209fd2MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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