Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Araújo, Wanderson Souza
Orientador(a): Piotrowski, Maurício Jeomar
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Pelotas
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Física
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
DFT
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/19145
Resumo: A crescente demanda do setor agrícola atrelada ao aumento da renda per capita, da população global e do consumo de alimentos, faz com que seja crucial o uso de técnicas, maquinários e substâncias que propiciam o aumento da eficiência da produção. Nesta direção, defensivos agrícolas como o glifosato surgiram como uma excelente alternativa, por ser um herbicida não seletivo de amplo espectro de ação, eliminando ervas daninhas que competem por nutrientes com a cultura alvo. Introduzido na década de 1970, o glifosato representa atualmente cerca de 70% do uso de pesticida no Brasil. O seu uso exacerbado pode vir a ocasionar problemas ambientais tanto na flora quanto na fauna, além de estudos recentes indicarem ser um possível causador de câncer em seres humanos. Por se tratar de uma molécula polar e altamente solúvel em água, o glifosato apresenta grande risco de contaminação da biota aquática. Neste sentido, técnicas que detectem e/ou removam o glifosato da água são de grande interesse. Este trabalho tem como objetivo elucidar uma possível rota de detecção e remoção de glifosato a partir de substratos baseados em grafeno. Para isso, utilizamos a Teoria do Funcional da Densidade por meio do funcional de troca e correlação PBE juntamente com as correções de van der Waals D3 a partir do método do projetor de ondas aumentadas conforme implementado no pacote computacional VASP. Estudamos seis substratos: grafeno pristino, grafeno com monovacância, grafeno dopado com nitrogênio, grafeno dopado com oxigênio, grafeno adsorvido com nitrogênio e grafeno adsorvido com oxigênio. Adsorvemos o glifosato nos seis substratos através de configurações tentativas, as quais selecionamos as mais promissoras e realizamos Ab-Initio Molecular Dynamics (AIMD) em dois processos: termalização (realizada à temperatura constante de 300 K) e simulated annealing (iniciada em 300 K e decrescendo até 0 K). Posteriormente selecionamos snapshots de configurações de menores energias não equivalentes e realizamos otimização estrutural de maior precisão de onde extraímos as propriedades. Das adsorções podemos separar os resultados em três classes: (i) sistemas onde tivemos uma adsorção fraca caracterizada por uma fisissorção, que foram as adsorções feitas nos substratos pristino e dopados com N e O; (ii) sistema caracterizado por uma forte adsorção, do tipo quimissorção, com a energia de adsorção de magnitude maior que 2 eV, que foi a adsorção realizada no grafeno com monovacância; (iii) sistemas em que houve uma forte adsorção, caracterizando uma quimissorção também, porém com a formação de novos compostos, que ocorreram nos casos das adsorções no grafeno adsorvido (N e O). Realizamos também uma análise da diferença de densidade de carga onde podemos observar que a molécula tem tendência a ficar aniônica e o substrato catiônico. Nossos resultados indicam qual é a melhor utilização de cada substrato baseado em grafeno para remoção e/ou detecção de glifosato em água, servindo como um guia para o desenvolvimento de nanomateriais baseados em grafeno para estes fins.
id UFPL_2fc085d5cfd89cea740c536f0001a333
oai_identifier_str oai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/19145
network_acronym_str UFPL
network_name_str Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca
repository_id_str
spelling 2025-12-29T21:18:18Z2025-12-292025-12-29T21:18:18Z2024-02-27ARAÚJO, Wanderson Souza. Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade. 2024. 72 f. Dissertação (Mestrado em Física) - Instituto de Física e Matemática, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2024.http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/19145A crescente demanda do setor agrícola atrelada ao aumento da renda per capita, da população global e do consumo de alimentos, faz com que seja crucial o uso de técnicas, maquinários e substâncias que propiciam o aumento da eficiência da produção. Nesta direção, defensivos agrícolas como o glifosato surgiram como uma excelente alternativa, por ser um herbicida não seletivo de amplo espectro de ação, eliminando ervas daninhas que competem por nutrientes com a cultura alvo. Introduzido na década de 1970, o glifosato representa atualmente cerca de 70% do uso de pesticida no Brasil. O seu uso exacerbado pode vir a ocasionar problemas ambientais tanto na flora quanto na fauna, além de estudos recentes indicarem ser um possível causador de câncer em seres humanos. Por se tratar de uma molécula polar e altamente solúvel em água, o glifosato apresenta grande risco de contaminação da biota aquática. Neste sentido, técnicas que detectem e/ou removam o glifosato da água são de grande interesse. Este trabalho tem como objetivo elucidar uma possível rota de detecção e remoção de glifosato a partir de substratos baseados em grafeno. Para isso, utilizamos a Teoria do Funcional da Densidade por meio do funcional de troca e correlação PBE juntamente com as correções de van der Waals D3 a partir do método do projetor de ondas aumentadas conforme implementado no pacote computacional VASP. Estudamos seis substratos: grafeno pristino, grafeno com monovacância, grafeno dopado com nitrogênio, grafeno dopado com oxigênio, grafeno adsorvido com nitrogênio e grafeno adsorvido com oxigênio. Adsorvemos o glifosato nos seis substratos através de configurações tentativas, as quais selecionamos as mais promissoras e realizamos Ab-Initio Molecular Dynamics (AIMD) em dois processos: termalização (realizada à temperatura constante de 300 K) e simulated annealing (iniciada em 300 K e decrescendo até 0 K). Posteriormente selecionamos snapshots de configurações de menores energias não equivalentes e realizamos otimização estrutural de maior precisão de onde extraímos as propriedades. Das adsorções podemos separar os resultados em três classes: (i) sistemas onde tivemos uma adsorção fraca caracterizada por uma fisissorção, que foram as adsorções feitas nos substratos pristino e dopados com N e O; (ii) sistema caracterizado por uma forte adsorção, do tipo quimissorção, com a energia de adsorção de magnitude maior que 2 eV, que foi a adsorção realizada no grafeno com monovacância; (iii) sistemas em que houve uma forte adsorção, caracterizando uma quimissorção também, porém com a formação de novos compostos, que ocorreram nos casos das adsorções no grafeno adsorvido (N e O). Realizamos também uma análise da diferença de densidade de carga onde podemos observar que a molécula tem tendência a ficar aniônica e o substrato catiônico. Nossos resultados indicam qual é a melhor utilização de cada substrato baseado em grafeno para remoção e/ou detecção de glifosato em água, servindo como um guia para o desenvolvimento de nanomateriais baseados em grafeno para estes fins.The growing demand in the agricultural sector, coupled with an increase in per capita income, global population, and food consumption, makes the use of techniques, machinery, and substances that enhance production efficiency crucial. In this context, agricultural pesticides such as glyphosate have emerged as an excellent alternative. Glyphosate is a non-selective herbicide with a broad spectrum of action, eliminating weeds that compete for nutrients with the target crop. Introduced in the 1970s, glyphosate currently represents approximately 70% of pesticide use in Brazil. Its excessive use may lead to environmental issues in both flora and fauna, with recent studies suggesting a potential link to cancer in humans. Being a polar and highly water-soluble molecule, glyphosate poses a significant risk of contamination to aquatic biota. Therefore, there is considerable interest in techniques for detecting and/or removing glyphosate from water. This study aims to elucidate a possible route for the detection and removal of glyphosate using graphene-based substrates. The Density Functional Theory, employing the PBE exchange-correlation functional along with van der Waals D3 corrections from the projector-augmented wave method implemented in the VASP computational package, was utilized. Six substrates were studied: pristine graphene, graphene with monovacancy, nitrogen-doped graphene, oxygen-doped graphene, nitrogen-adsorbed graphene, and oxygen-adsorbed graphene. Glyphosate was adsorbed onto these substrates through tentative configurations, and the most promising ones were subjected to Ab-Initio Molecular Dynamics (AIMD) in two processes: thermalization (performed at a constant temperature of 300 K) and simulated annealing (initiated at 300 K and decreasing to 0 K). Subsequently, we selected snapshots of configurations with the lowest non-equivalent energies and conducted a more precise structural optimization to extract properties. The results of the adsorptions can be classified into three categories: (i) systems with weak adsorption characterized by physisorption, observed in adsorptions on pristine and N- and O-doped substrates; (ii) a system characterized by strong chemisorption with an adsorption energy greater than 2 eV, found in the adsorption on monovacancy graphene; (iii) systems with strong chemisorption, resulting in the formation of new compounds, observed in adsorptions on adsorbed graphene (N and O). We also conducted an analysis of charge density differences, revealing the molecule’s tendency to become anionic and the substrate cationic. Our results indicate the suitability of each graphenebased substrate for the removal and/or detection of glyphosate in water, serving as a guide for the development of graphene-based nanomaterials for these purposes.Sem bolsaporUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em FísicaUFPelBrasilCC BY-NC-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessCIENCIAS EXATAS E DA TERRAFISICADFTGrafenoGlifosatoVASPGrapheneGlyphosateEstudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidadeStudy of glyphosate adsorption on graphene and some of its functionalizations via density functional theoryinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttps://orcid.org/0000-0003-1106-7350http://lattes.cnpq.br/4163477313535721https://orcid.org/0000-0003-3477-4437http://lattes.cnpq.br/1132803048214294Bordin, José Rafaelhttp://lattes.cnpq.br/9477024092198309Piotrowski, Maurício JeomarAraújo, Wanderson Souzareponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELORIGINALdissertacao_wanderson_araujo.pdfdissertacao_wanderson_araujo.pdfapplication/pdf11756183http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/19145/1/dissertacao_wanderson_araujo.pdfabb5f201200e6d7fb0710735d01debdbMD51open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-867http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/19145/2/license.txtfbd6c74465857056e3ca572d7586661bMD52open accessTEXTdissertacao_wanderson_araujo.pdf.txtdissertacao_wanderson_araujo.pdf.txtExtracted texttext/plain168937http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/19145/3/dissertacao_wanderson_araujo.pdf.txt98072a2e1634de99855ebbb0cc16eb72MD53open accessTHUMBNAILdissertacao_wanderson_araujo.pdf.jpgdissertacao_wanderson_araujo.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1443http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/19145/4/dissertacao_wanderson_araujo.pdf.jpg1f0500e4e0076c348f8a0a2bd96c5feeMD54open accessprefix/191452025-12-30 03:00:28.527open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/19145VG9kb3Mgb3MgaXRlbnMgZGVzc2EgY29tdW5pZGFkZSBzZWd1ZW0gYSBsaWNlbsOnYSBDcmVhdGl2ZSBDb21tb25zLg==Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2025-12-30T06:00:28Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv Study of glyphosate adsorption on graphene and some of its functionalizations via density functional theory
title Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade
spellingShingle Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade
Araújo, Wanderson Souza
CIENCIAS EXATAS E DA TERRA
DFT
Grafeno
Glifosato
VASP
Graphene
Glyphosate
FISICA
title_short Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade
title_full Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade
title_fullStr Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade
title_full_unstemmed Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade
title_sort Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade
author Araújo, Wanderson Souza
author_facet Araújo, Wanderson Souza
author_role author
dc.contributor.authorID.pt_BR.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0003-1106-7350
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4163477313535721
dc.contributor.advisorID.pt_BR.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0003-3477-4437
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1132803048214294
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Bordin, José Rafael
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9477024092198309
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Piotrowski, Maurício Jeomar
dc.contributor.author.fl_str_mv Araújo, Wanderson Souza
contributor_str_mv Bordin, José Rafael
Piotrowski, Maurício Jeomar
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CIENCIAS EXATAS E DA TERRA
topic CIENCIAS EXATAS E DA TERRA
DFT
Grafeno
Glifosato
VASP
Graphene
Glyphosate
FISICA
dc.subject.por.fl_str_mv DFT
Grafeno
Glifosato
VASP
Graphene
Glyphosate
dc.subject.cnpq1.pt_BR.fl_str_mv FISICA
description A crescente demanda do setor agrícola atrelada ao aumento da renda per capita, da população global e do consumo de alimentos, faz com que seja crucial o uso de técnicas, maquinários e substâncias que propiciam o aumento da eficiência da produção. Nesta direção, defensivos agrícolas como o glifosato surgiram como uma excelente alternativa, por ser um herbicida não seletivo de amplo espectro de ação, eliminando ervas daninhas que competem por nutrientes com a cultura alvo. Introduzido na década de 1970, o glifosato representa atualmente cerca de 70% do uso de pesticida no Brasil. O seu uso exacerbado pode vir a ocasionar problemas ambientais tanto na flora quanto na fauna, além de estudos recentes indicarem ser um possível causador de câncer em seres humanos. Por se tratar de uma molécula polar e altamente solúvel em água, o glifosato apresenta grande risco de contaminação da biota aquática. Neste sentido, técnicas que detectem e/ou removam o glifosato da água são de grande interesse. Este trabalho tem como objetivo elucidar uma possível rota de detecção e remoção de glifosato a partir de substratos baseados em grafeno. Para isso, utilizamos a Teoria do Funcional da Densidade por meio do funcional de troca e correlação PBE juntamente com as correções de van der Waals D3 a partir do método do projetor de ondas aumentadas conforme implementado no pacote computacional VASP. Estudamos seis substratos: grafeno pristino, grafeno com monovacância, grafeno dopado com nitrogênio, grafeno dopado com oxigênio, grafeno adsorvido com nitrogênio e grafeno adsorvido com oxigênio. Adsorvemos o glifosato nos seis substratos através de configurações tentativas, as quais selecionamos as mais promissoras e realizamos Ab-Initio Molecular Dynamics (AIMD) em dois processos: termalização (realizada à temperatura constante de 300 K) e simulated annealing (iniciada em 300 K e decrescendo até 0 K). Posteriormente selecionamos snapshots de configurações de menores energias não equivalentes e realizamos otimização estrutural de maior precisão de onde extraímos as propriedades. Das adsorções podemos separar os resultados em três classes: (i) sistemas onde tivemos uma adsorção fraca caracterizada por uma fisissorção, que foram as adsorções feitas nos substratos pristino e dopados com N e O; (ii) sistema caracterizado por uma forte adsorção, do tipo quimissorção, com a energia de adsorção de magnitude maior que 2 eV, que foi a adsorção realizada no grafeno com monovacância; (iii) sistemas em que houve uma forte adsorção, caracterizando uma quimissorção também, porém com a formação de novos compostos, que ocorreram nos casos das adsorções no grafeno adsorvido (N e O). Realizamos também uma análise da diferença de densidade de carga onde podemos observar que a molécula tem tendência a ficar aniônica e o substrato catiônico. Nossos resultados indicam qual é a melhor utilização de cada substrato baseado em grafeno para remoção e/ou detecção de glifosato em água, servindo como um guia para o desenvolvimento de nanomateriais baseados em grafeno para estes fins.
publishDate 2024
dc.date.issued.fl_str_mv 2024-02-27
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2025-12-29T21:18:18Z
dc.date.available.fl_str_mv 2025-12-29
2025-12-29T21:18:18Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv ARAÚJO, Wanderson Souza. Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade. 2024. 72 f. Dissertação (Mestrado em Física) - Instituto de Física e Matemática, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2024.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/19145
identifier_str_mv ARAÚJO, Wanderson Souza. Estudo da adsorção de glifosato em grafeno e algumas de suas funcionalizações via teoria do funcional da densidade. 2024. 72 f. Dissertação (Mestrado em Física) - Instituto de Física e Matemática, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2024.
url http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/19145
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv CC BY-NC-SA
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv CC BY-NC-SA
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pelotas
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Física
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFPel
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pelotas
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca
instname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)
instacron:UFPEL
instname_str Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)
instacron_str UFPEL
institution UFPEL
reponame_str Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca
collection Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca
bitstream.url.fl_str_mv http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/19145/1/dissertacao_wanderson_araujo.pdf
http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/19145/2/license.txt
http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/19145/3/dissertacao_wanderson_araujo.pdf.txt
http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/19145/4/dissertacao_wanderson_araujo.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv abb5f201200e6d7fb0710735d01debdb
fbd6c74465857056e3ca572d7586661b
98072a2e1634de99855ebbb0cc16eb72
1f0500e4e0076c348f8a0a2bd96c5fee
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)
repository.mail.fl_str_mv rippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.br
_version_ 1862741399852548096